Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L0BKD5

Protein Details
Accession A0A1L0BKD5    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-182EDPMLPPKFKLRKNRHKNPSPPPPILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-193KFKLRKNRHKNPSPPPPILKAAPAEKITKE
298-304GKRRGSE
306-314YDARKRSRK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12.5, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MISSLLPKPKHATISTIAVVLPKAKTASTALLPNIQNVPNIVNVASLDASNPHEYSKAVVDVSGNKAASQTSYEDSIPLKERYPNLKHHFPRYTLQTCPDDSLQQCLDETRKVVNMLIAHAEGIEEKKDDVDVVELSTGGLSDEGRGRTVEIRNYQEDPMLPPKFKLRKNRHKNPSPPPPILKAAPAEKITKEIKDKWKIPSAVSNWKNNQGFAISLGKRVVAASGGSLGAESSINVEKFGQLSQALEQADRQAREDISIRNEQRKLAAIREQEEKQKKLKSLVEKSREATGSRQYSGKRRGSETYDARKRSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.41
3 0.36
4 0.31
5 0.26
6 0.25
7 0.23
8 0.19
9 0.14
10 0.15
11 0.14
12 0.16
13 0.17
14 0.21
15 0.21
16 0.25
17 0.24
18 0.31
19 0.31
20 0.32
21 0.33
22 0.3
23 0.27
24 0.24
25 0.24
26 0.18
27 0.18
28 0.16
29 0.12
30 0.11
31 0.12
32 0.11
33 0.09
34 0.08
35 0.09
36 0.13
37 0.14
38 0.15
39 0.14
40 0.14
41 0.14
42 0.16
43 0.17
44 0.16
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.18
49 0.22
50 0.24
51 0.21
52 0.19
53 0.2
54 0.19
55 0.18
56 0.16
57 0.15
58 0.12
59 0.15
60 0.15
61 0.16
62 0.16
63 0.19
64 0.21
65 0.2
66 0.2
67 0.22
68 0.27
69 0.35
70 0.39
71 0.46
72 0.49
73 0.58
74 0.6
75 0.65
76 0.65
77 0.6
78 0.6
79 0.59
80 0.55
81 0.47
82 0.48
83 0.42
84 0.38
85 0.37
86 0.33
87 0.29
88 0.25
89 0.28
90 0.23
91 0.2
92 0.19
93 0.18
94 0.18
95 0.15
96 0.16
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.13
136 0.15
137 0.18
138 0.2
139 0.23
140 0.25
141 0.27
142 0.26
143 0.23
144 0.21
145 0.2
146 0.24
147 0.22
148 0.2
149 0.19
150 0.27
151 0.33
152 0.38
153 0.46
154 0.5
155 0.59
156 0.7
157 0.8
158 0.82
159 0.85
160 0.88
161 0.87
162 0.87
163 0.83
164 0.77
165 0.7
166 0.63
167 0.57
168 0.49
169 0.41
170 0.33
171 0.28
172 0.27
173 0.26
174 0.24
175 0.21
176 0.25
177 0.25
178 0.25
179 0.27
180 0.31
181 0.38
182 0.45
183 0.49
184 0.49
185 0.55
186 0.53
187 0.5
188 0.51
189 0.47
190 0.49
191 0.49
192 0.51
193 0.46
194 0.53
195 0.52
196 0.44
197 0.39
198 0.29
199 0.25
200 0.2
201 0.26
202 0.18
203 0.19
204 0.19
205 0.18
206 0.18
207 0.17
208 0.15
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.14
236 0.18
237 0.23
238 0.23
239 0.24
240 0.23
241 0.22
242 0.25
243 0.28
244 0.26
245 0.26
246 0.35
247 0.36
248 0.41
249 0.43
250 0.41
251 0.4
252 0.44
253 0.41
254 0.37
255 0.4
256 0.37
257 0.39
258 0.45
259 0.45
260 0.48
261 0.54
262 0.53
263 0.53
264 0.55
265 0.56
266 0.57
267 0.61
268 0.62
269 0.64
270 0.71
271 0.71
272 0.7
273 0.68
274 0.67
275 0.62
276 0.54
277 0.48
278 0.47
279 0.44
280 0.41
281 0.44
282 0.42
283 0.5
284 0.57
285 0.6
286 0.56
287 0.55
288 0.6
289 0.62
290 0.66
291 0.67
292 0.68
293 0.7
294 0.71