Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1L0BKM8

Protein Details
Accession A0A1L0BKM8    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-130EGNATRKKIIRKKTKEAPELPNFHydrophilic
336-359DYNKSKFTNKLQSLRKNKTKESKTHydrophilic
402-428MFNRINRKMTNSRKKVVKKSGPSIEGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-122TRKKIIRKKTK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSLEADILQDEQVQQFEVESEQQLQDDQQLPADVNEGNIEDNEDDEILKPNDEAADDAEGNNGVEDAQDADEGAGDEDFDATNTENGNVEQDYDDEDIYSMQSHKTKEGNATRKKIIRKKTKEAPELPNFTAERPSEDIYADNDVIDYSNEDPATRKRRLLEERMTMAVKSKTVRKRKADEDDLERMQDDKIDQLKNLMIEAANLDVEKNSQGQIATEKLKLLKEVMDTLSKADLAISILDNNLLEAVRLWLEPLPDASMPAYQIQKELMQSLTTLPIKTDHLVASGIGKVLVFYQRSKRTEPNLKKIVDRLIGDWTRPILNKSDSYKDRTIRFHDYNKSKFTNKLQSLRKNKTKESKTLYEQQAERRNRAAIPSARTTAYKIAPKVDPSLLMRQQKGSGEMFNRINRKMTNSRKKVVKKSGPSIEGKNLSM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.11
4 0.12
5 0.13
6 0.13
7 0.16
8 0.16
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.2
13 0.22
14 0.2
15 0.19
16 0.19
17 0.2
18 0.19
19 0.21
20 0.15
21 0.11
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.1
26 0.12
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.15
39 0.14
40 0.14
41 0.11
42 0.14
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.13
48 0.12
49 0.1
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.06
68 0.06
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.12
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.08
88 0.1
89 0.14
90 0.15
91 0.19
92 0.22
93 0.24
94 0.32
95 0.42
96 0.49
97 0.54
98 0.59
99 0.62
100 0.65
101 0.72
102 0.71
103 0.72
104 0.73
105 0.73
106 0.77
107 0.79
108 0.83
109 0.83
110 0.82
111 0.81
112 0.79
113 0.75
114 0.67
115 0.63
116 0.53
117 0.44
118 0.42
119 0.33
120 0.28
121 0.25
122 0.26
123 0.21
124 0.21
125 0.21
126 0.17
127 0.2
128 0.16
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.06
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.19
141 0.26
142 0.27
143 0.29
144 0.29
145 0.38
146 0.45
147 0.52
148 0.52
149 0.51
150 0.51
151 0.51
152 0.49
153 0.4
154 0.36
155 0.29
156 0.23
157 0.19
158 0.25
159 0.31
160 0.4
161 0.49
162 0.53
163 0.59
164 0.65
165 0.72
166 0.71
167 0.67
168 0.64
169 0.62
170 0.55
171 0.48
172 0.4
173 0.32
174 0.24
175 0.19
176 0.13
177 0.11
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.16
185 0.12
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.11
219 0.1
220 0.08
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.11
249 0.12
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.12
255 0.13
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.15
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.14
265 0.15
266 0.16
267 0.17
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.11
280 0.11
281 0.14
282 0.22
283 0.31
284 0.34
285 0.39
286 0.43
287 0.49
288 0.59
289 0.64
290 0.66
291 0.66
292 0.64
293 0.62
294 0.6
295 0.57
296 0.5
297 0.43
298 0.34
299 0.35
300 0.34
301 0.32
302 0.3
303 0.25
304 0.23
305 0.23
306 0.23
307 0.19
308 0.22
309 0.27
310 0.3
311 0.38
312 0.39
313 0.45
314 0.5
315 0.51
316 0.53
317 0.53
318 0.55
319 0.55
320 0.57
321 0.58
322 0.61
323 0.65
324 0.65
325 0.67
326 0.65
327 0.59
328 0.6
329 0.6
330 0.61
331 0.6
332 0.63
333 0.66
334 0.71
335 0.78
336 0.82
337 0.83
338 0.79
339 0.8
340 0.82
341 0.79
342 0.78
343 0.77
344 0.74
345 0.72
346 0.75
347 0.72
348 0.69
349 0.65
350 0.65
351 0.66
352 0.63
353 0.6
354 0.54
355 0.51
356 0.44
357 0.44
358 0.44
359 0.4
360 0.41
361 0.43
362 0.43
363 0.42
364 0.41
365 0.4
366 0.37
367 0.38
368 0.38
369 0.34
370 0.37
371 0.39
372 0.41
373 0.43
374 0.39
375 0.37
376 0.35
377 0.42
378 0.44
379 0.48
380 0.47
381 0.45
382 0.47
383 0.45
384 0.45
385 0.38
386 0.37
387 0.33
388 0.38
389 0.42
390 0.44
391 0.48
392 0.46
393 0.49
394 0.44
395 0.5
396 0.53
397 0.58
398 0.62
399 0.65
400 0.72
401 0.77
402 0.84
403 0.86
404 0.87
405 0.86
406 0.85
407 0.86
408 0.87
409 0.84
410 0.8
411 0.75
412 0.74