Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0NBH5

Protein Details
Accession C0NBH5    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-117ICHGVRQVRRVPRNNPGREKKSITGPSKEHKQRTRSPKTTTRREIKIHydrophilic
126-146GHDKREKKGATTKRMKKRDGVBasic
296-316GSSSKQQRVKAKKPQKGKLTTHydrophilic
639-661ATLANRRSPKKRQAKALSKFQEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-149RRVPRNNPGREKKSITGPSKEHKQRTRSPKTTTRREIKIVEGDRLIVGHDKREKKGATTKRMKKRDGVADK
307-308KK
645-651RSPKKRQ
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MDNSAITSQSNPTPLVCSVTPIIVGSPPSPANVIELSSPSTPPTPLTLLASFSKTPSRKTTSPDSNGENTICHGVRQVRRVPRNNPGREKKSITGPSKEHKQRTRSPKTTTRREIKIVEGDRLIVGHDKREKKGATTKRMKKRDGVADKKLYARVSKVKSSENLDLDAKIPSSKVCNNTLPLVGDDMDNESSELQLEQAIKRRHDWTPAREVTTPVVDVAELHSSPCGKAVTRMHGVGTLLSDYGFSGVVETSLGTKSESFRNAPTTKRPMELQKFSTVPAIPTPTESSTTEDIQGSSSKQQRVKAKKPQKGKLTTITSHATAKYCVADQTVDLDYIQNVAPKSPGRKNISNRPSGMKHSNSGRGKSSTLKNDNGPPVFRVVPPLEAFKSFEGQELLFGTSSQLERGHPEYRCDETQDIQNSPSNSAAVSELAVPYRISSEGKNLGSSLFRLSGSKNLWSASARDLTGAVFEVDEIDFQEPSMGLSVLATKSRCHPGNRGPPRRNLVDVDNVPDKKLDIDTTEGENGNHSSVADNIVDRENLNPKISANTSETNLECAPRNKPAFSRFTTSELAKKVAAYGFKPIKSRDNMISLLERCWETQSKTFMPESKPNQGTDDARKNGFRKENHSDVRVRPDSATLANRRSPKKRQAKALSKFQEPNNFLPIENSTTTASMLPIEHVISSHTILINDDQLSDSVGETVSFLPTLDHNGNGTTLQENMLEIKSPATPNARHSRQRSSSTSFSIEPPSLASQITKAIKSQPRIRAFNGLKQPTWYEKILMYDPIQLEDLAAWLNTDGFGRIGEDREVGPGVVREWCESKGVCCVWKKQVSGRSHCLPMVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.23
4 0.23
5 0.22
6 0.22
7 0.22
8 0.18
9 0.19
10 0.15
11 0.17
12 0.14
13 0.17
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.17
18 0.18
19 0.17
20 0.17
21 0.15
22 0.16
23 0.18
24 0.19
25 0.19
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.18
30 0.21
31 0.2
32 0.2
33 0.24
34 0.23
35 0.25
36 0.27
37 0.3
38 0.26
39 0.26
40 0.33
41 0.31
42 0.35
43 0.4
44 0.46
45 0.46
46 0.51
47 0.59
48 0.6
49 0.65
50 0.66
51 0.64
52 0.6
53 0.59
54 0.54
55 0.44
56 0.36
57 0.35
58 0.29
59 0.23
60 0.24
61 0.29
62 0.34
63 0.41
64 0.48
65 0.52
66 0.62
67 0.7
68 0.71
69 0.73
70 0.78
71 0.81
72 0.83
73 0.83
74 0.8
75 0.79
76 0.8
77 0.74
78 0.73
79 0.73
80 0.69
81 0.66
82 0.66
83 0.66
84 0.7
85 0.75
86 0.75
87 0.73
88 0.75
89 0.77
90 0.82
91 0.85
92 0.81
93 0.81
94 0.82
95 0.84
96 0.86
97 0.86
98 0.84
99 0.79
100 0.78
101 0.72
102 0.68
103 0.68
104 0.59
105 0.53
106 0.45
107 0.39
108 0.33
109 0.3
110 0.24
111 0.21
112 0.18
113 0.22
114 0.3
115 0.34
116 0.36
117 0.44
118 0.44
119 0.44
120 0.54
121 0.56
122 0.59
123 0.65
124 0.73
125 0.76
126 0.84
127 0.81
128 0.78
129 0.78
130 0.78
131 0.78
132 0.77
133 0.75
134 0.74
135 0.73
136 0.7
137 0.65
138 0.56
139 0.48
140 0.46
141 0.45
142 0.43
143 0.46
144 0.46
145 0.47
146 0.49
147 0.52
148 0.53
149 0.46
150 0.43
151 0.38
152 0.35
153 0.31
154 0.27
155 0.22
156 0.15
157 0.14
158 0.11
159 0.16
160 0.2
161 0.24
162 0.28
163 0.31
164 0.33
165 0.35
166 0.36
167 0.32
168 0.27
169 0.25
170 0.2
171 0.16
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.11
176 0.11
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.08
181 0.05
182 0.08
183 0.09
184 0.12
185 0.2
186 0.25
187 0.26
188 0.3
189 0.35
190 0.35
191 0.43
192 0.48
193 0.46
194 0.52
195 0.54
196 0.55
197 0.52
198 0.51
199 0.43
200 0.38
201 0.31
202 0.21
203 0.17
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.13
214 0.13
215 0.1
216 0.17
217 0.21
218 0.26
219 0.29
220 0.3
221 0.28
222 0.28
223 0.28
224 0.22
225 0.18
226 0.12
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.1
245 0.15
246 0.18
247 0.19
248 0.2
249 0.28
250 0.3
251 0.33
252 0.39
253 0.42
254 0.41
255 0.42
256 0.43
257 0.45
258 0.5
259 0.53
260 0.48
261 0.45
262 0.44
263 0.43
264 0.43
265 0.33
266 0.26
267 0.22
268 0.22
269 0.17
270 0.18
271 0.2
272 0.18
273 0.2
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.21
278 0.21
279 0.19
280 0.18
281 0.16
282 0.16
283 0.14
284 0.17
285 0.22
286 0.26
287 0.29
288 0.35
289 0.43
290 0.52
291 0.6
292 0.65
293 0.69
294 0.71
295 0.78
296 0.8
297 0.81
298 0.78
299 0.74
300 0.71
301 0.68
302 0.62
303 0.57
304 0.5
305 0.42
306 0.37
307 0.33
308 0.25
309 0.19
310 0.18
311 0.15
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.09
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.1
329 0.12
330 0.18
331 0.22
332 0.3
333 0.35
334 0.43
335 0.49
336 0.58
337 0.62
338 0.62
339 0.59
340 0.56
341 0.52
342 0.5
343 0.5
344 0.41
345 0.38
346 0.37
347 0.44
348 0.42
349 0.41
350 0.39
351 0.35
352 0.34
353 0.36
354 0.38
355 0.38
356 0.39
357 0.39
358 0.39
359 0.42
360 0.45
361 0.41
362 0.36
363 0.28
364 0.26
365 0.24
366 0.22
367 0.21
368 0.16
369 0.17
370 0.17
371 0.19
372 0.17
373 0.17
374 0.18
375 0.15
376 0.16
377 0.13
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.07
392 0.1
393 0.13
394 0.18
395 0.17
396 0.2
397 0.22
398 0.25
399 0.25
400 0.25
401 0.23
402 0.19
403 0.24
404 0.24
405 0.22
406 0.2
407 0.22
408 0.2
409 0.2
410 0.18
411 0.13
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.05
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.11
428 0.16
429 0.16
430 0.16
431 0.16
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.13
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.14
441 0.15
442 0.17
443 0.16
444 0.15
445 0.16
446 0.16
447 0.17
448 0.14
449 0.15
450 0.13
451 0.13
452 0.12
453 0.11
454 0.11
455 0.1
456 0.07
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.06
474 0.07
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.13
479 0.19
480 0.23
481 0.24
482 0.3
483 0.37
484 0.48
485 0.59
486 0.66
487 0.64
488 0.67
489 0.69
490 0.65
491 0.58
492 0.49
493 0.42
494 0.39
495 0.35
496 0.33
497 0.34
498 0.32
499 0.3
500 0.27
501 0.24
502 0.17
503 0.18
504 0.14
505 0.09
506 0.12
507 0.13
508 0.15
509 0.17
510 0.17
511 0.16
512 0.16
513 0.15
514 0.12
515 0.11
516 0.09
517 0.07
518 0.07
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.09
524 0.1
525 0.1
526 0.12
527 0.15
528 0.17
529 0.18
530 0.17
531 0.16
532 0.19
533 0.2
534 0.21
535 0.19
536 0.19
537 0.2
538 0.22
539 0.22
540 0.21
541 0.21
542 0.19
543 0.18
544 0.19
545 0.21
546 0.26
547 0.28
548 0.27
549 0.31
550 0.35
551 0.39
552 0.39
553 0.43
554 0.37
555 0.4
556 0.41
557 0.38
558 0.37
559 0.33
560 0.31
561 0.25
562 0.23
563 0.21
564 0.2
565 0.2
566 0.16
567 0.23
568 0.26
569 0.29
570 0.32
571 0.32
572 0.37
573 0.38
574 0.42
575 0.37
576 0.36
577 0.35
578 0.34
579 0.37
580 0.31
581 0.28
582 0.26
583 0.23
584 0.19
585 0.22
586 0.23
587 0.2
588 0.24
589 0.29
590 0.29
591 0.32
592 0.34
593 0.35
594 0.37
595 0.43
596 0.44
597 0.47
598 0.48
599 0.45
600 0.46
601 0.45
602 0.44
603 0.44
604 0.47
605 0.41
606 0.41
607 0.45
608 0.44
609 0.48
610 0.51
611 0.46
612 0.45
613 0.49
614 0.57
615 0.56
616 0.59
617 0.57
618 0.54
619 0.6
620 0.54
621 0.48
622 0.38
623 0.36
624 0.33
625 0.32
626 0.35
627 0.3
628 0.33
629 0.36
630 0.43
631 0.49
632 0.55
633 0.59
634 0.63
635 0.68
636 0.71
637 0.76
638 0.8
639 0.83
640 0.84
641 0.86
642 0.8
643 0.77
644 0.75
645 0.69
646 0.68
647 0.61
648 0.56
649 0.5
650 0.45
651 0.38
652 0.34
653 0.32
654 0.27
655 0.23
656 0.22
657 0.18
658 0.17
659 0.18
660 0.17
661 0.14
662 0.11
663 0.11
664 0.1
665 0.1
666 0.1
667 0.09
668 0.09
669 0.1
670 0.1
671 0.11
672 0.12
673 0.12
674 0.11
675 0.12
676 0.14
677 0.15
678 0.14
679 0.13
680 0.12
681 0.11
682 0.12
683 0.11
684 0.1
685 0.08
686 0.07
687 0.07
688 0.07
689 0.08
690 0.08
691 0.07
692 0.07
693 0.07
694 0.08
695 0.14
696 0.14
697 0.14
698 0.14
699 0.15
700 0.16
701 0.15
702 0.16
703 0.11
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.11
709 0.12
710 0.11
711 0.11
712 0.12
713 0.14
714 0.15
715 0.19
716 0.23
717 0.25
718 0.32
719 0.42
720 0.49
721 0.54
722 0.59
723 0.65
724 0.67
725 0.72
726 0.7
727 0.67
728 0.65
729 0.61
730 0.59
731 0.5
732 0.45
733 0.43
734 0.37
735 0.3
736 0.27
737 0.25
738 0.22
739 0.21
740 0.19
741 0.15
742 0.22
743 0.25
744 0.23
745 0.23
746 0.31
747 0.37
748 0.45
749 0.53
750 0.55
751 0.6
752 0.64
753 0.65
754 0.67
755 0.64
756 0.65
757 0.67
758 0.62
759 0.54
760 0.53
761 0.54
762 0.5
763 0.5
764 0.43
765 0.35
766 0.32
767 0.35
768 0.34
769 0.34
770 0.28
771 0.3
772 0.29
773 0.29
774 0.27
775 0.22
776 0.2
777 0.16
778 0.15
779 0.09
780 0.09
781 0.07
782 0.06
783 0.07
784 0.07
785 0.07
786 0.07
787 0.07
788 0.07
789 0.1
790 0.11
791 0.13
792 0.14
793 0.15
794 0.15
795 0.17
796 0.18
797 0.15
798 0.15
799 0.14
800 0.14
801 0.17
802 0.18
803 0.18
804 0.2
805 0.21
806 0.24
807 0.24
808 0.24
809 0.28
810 0.3
811 0.34
812 0.37
813 0.43
814 0.49
815 0.55
816 0.58
817 0.58
818 0.63
819 0.66
820 0.69
821 0.71
822 0.67
823 0.65