FuNGI

C0NSV0

Protein Details

Accession

C0NSV0

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-39	AKKSVFSKPNTYKNGNKKGA	Hydrophilic
356-380	SSSDSSVSKKKRKEQTSNQSNKSAT	Hydrophilic
450-478	LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
456-471	KGFTKEKNKKKRGSYR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, cyto 1.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MARSKDVEKSSETAKPTPSAKKSVFSKPNTYKNGNKKGASISGSAVVSPALIAAISSFLTTYGFDKTSKAFAAERKAKKSIMKAGVKSNDKATTNTPFLVEIFERWELNRNAQHSVEKEGTLRCGDSDKSDTSDSESDSNFSESSDSDVVMESARAPCSVLSLSSSPCSSSESESSDEDVKKAPITQPSNLKRKHDDSSSSSCDSDSDEAHPEVKRTKLTTDKPTLNSLAKSSSTSESSSESFSGSDTGSGSSSDFDCDSSSDSNSSSSTSASVKSKLKPVTKSAEAATVAAQIPLPGSDNKGFSDSSPSSSSPFSASSSITDNSPSCRHSADSSATLKNSSSSSNSSSDSSSNSSSSDSSVSKKKRKEQTSNQSNKSATSSAILKKAASITSTSNVVSARGSNPAASTPPIKHSGTQPTPLALAGQLPHDHPSNAYIPYAYAERAYKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGPGKSFKFED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.41
3	0.44
4	0.51
5	0.51
6	0.54
7	0.52
8	0.56
9	0.59
10	0.65
11	0.67
12	0.64
13	0.69
14	0.7
15	0.77
16	0.77
17	0.78
18	0.76
19	0.78
20	0.82
21	0.79
22	0.72
23	0.66
24	0.63
25	0.62
26	0.56
27	0.47
28	0.38
29	0.34
30	0.33
31	0.29
32	0.23
33	0.16
34	0.13
35	0.11
36	0.09
37	0.04
38	0.03
39	0.03
40	0.03
41	0.05
42	0.05
43	0.05
44	0.05
45	0.05
46	0.06
47	0.07
48	0.08
49	0.11
50	0.13
51	0.13
52	0.15
53	0.17
54	0.2
55	0.2
56	0.22
57	0.22
58	0.26
59	0.36
60	0.44
61	0.49
62	0.52
63	0.55
64	0.56
65	0.58
66	0.6
67	0.6
68	0.59
69	0.6
70	0.58
71	0.63
72	0.68
73	0.67
74	0.61
75	0.57
76	0.53
77	0.46
78	0.45
79	0.4
80	0.38
81	0.37
82	0.35
83	0.31
84	0.25
85	0.23
86	0.25
87	0.21
88	0.15
89	0.16
90	0.17
91	0.17
92	0.17
93	0.24
94	0.22
95	0.28
96	0.31
97	0.3
98	0.31
99	0.33
100	0.36
101	0.3
102	0.34
103	0.3
104	0.26
105	0.27
106	0.25
107	0.25
108	0.22
109	0.21
110	0.16
111	0.17
112	0.16
113	0.18
114	0.21
115	0.2
116	0.22
117	0.23
118	0.22
119	0.24
120	0.25
121	0.23
122	0.21
123	0.2
124	0.18
125	0.18
126	0.19
127	0.14
128	0.13
129	0.12
130	0.09
131	0.13
132	0.12
133	0.11
134	0.1
135	0.1
136	0.1
137	0.09
138	0.09
139	0.07
140	0.08
141	0.09
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.1
146	0.1
147	0.09
148	0.1
149	0.11
150	0.12
151	0.13
152	0.14
153	0.12
154	0.12
155	0.15
156	0.13
157	0.15
158	0.16
159	0.17
160	0.19
161	0.19
162	0.21
163	0.23
164	0.22
165	0.2
166	0.19
167	0.17
168	0.15
169	0.16
170	0.18
171	0.21
172	0.24
173	0.28
174	0.36
175	0.44
176	0.52
177	0.54
178	0.55
179	0.53
180	0.54
181	0.54
182	0.48
183	0.46
184	0.43
185	0.47
186	0.48
187	0.43
188	0.39
189	0.35
190	0.3
191	0.27
192	0.22
193	0.15
194	0.12
195	0.13
196	0.13
197	0.16
198	0.16
199	0.15
200	0.17
201	0.18
202	0.18
203	0.17
204	0.21
205	0.27
206	0.33
207	0.39
208	0.44
209	0.47
210	0.47
211	0.48
212	0.47
213	0.41
214	0.35
215	0.28
216	0.23
217	0.19
218	0.17
219	0.17
220	0.15
221	0.15
222	0.15
223	0.15
224	0.15
225	0.15
226	0.15
227	0.13
228	0.11
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.09
255	0.08
256	0.09
257	0.09
258	0.11
259	0.12
260	0.17
261	0.2
262	0.22
263	0.28
264	0.33
265	0.38
266	0.39
267	0.42
268	0.44
269	0.42
270	0.42
271	0.36
272	0.34
273	0.28
274	0.25
275	0.2
276	0.16
277	0.14
278	0.12
279	0.11
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.06
285	0.09
286	0.11
287	0.12
288	0.13
289	0.15
290	0.15
291	0.13
292	0.21
293	0.18
294	0.2
295	0.22
296	0.21
297	0.21
298	0.22
299	0.22
300	0.16
301	0.16
302	0.14
303	0.13
304	0.13
305	0.13
306	0.16
307	0.16
308	0.14
309	0.16
310	0.15
311	0.17
312	0.19
313	0.18
314	0.16
315	0.17
316	0.18
317	0.18
318	0.22
319	0.21
320	0.24
321	0.28
322	0.29
323	0.28
324	0.27
325	0.25
326	0.23
327	0.2
328	0.16
329	0.15
330	0.16
331	0.19
332	0.21
333	0.22
334	0.22
335	0.23
336	0.22
337	0.21
338	0.21
339	0.19
340	0.17
341	0.17
342	0.17
343	0.16
344	0.16
345	0.17
346	0.15
347	0.18
348	0.26
349	0.34
350	0.41
351	0.48
352	0.56
353	0.63
354	0.72
355	0.79
356	0.81
357	0.83
358	0.87
359	0.89
360	0.85
361	0.81
362	0.71
363	0.62
364	0.54
365	0.44
366	0.33
367	0.26
368	0.27
369	0.25
370	0.29
371	0.28
372	0.24
373	0.25
374	0.27
375	0.25
376	0.2
377	0.18
378	0.17
379	0.18
380	0.2
381	0.18
382	0.18
383	0.17
384	0.16
385	0.15
386	0.14
387	0.13
388	0.16
389	0.16
390	0.15
391	0.16
392	0.17
393	0.18
394	0.18
395	0.21
396	0.19
397	0.23
398	0.28
399	0.28
400	0.29
401	0.34
402	0.42
403	0.43
404	0.46
405	0.42
406	0.38
407	0.38
408	0.35
409	0.29
410	0.19
411	0.17
412	0.12
413	0.14
414	0.14
415	0.15
416	0.17
417	0.19
418	0.19
419	0.17
420	0.2
421	0.2
422	0.2
423	0.2
424	0.17
425	0.16
426	0.18
427	0.19
428	0.15
429	0.15
430	0.16
431	0.17
432	0.19
433	0.2
434	0.19
435	0.2
436	0.24
437	0.26
438	0.32
439	0.33
440	0.34
441	0.38
442	0.39
443	0.44
444	0.48
445	0.52
446	0.56
447	0.64
448	0.71
449	0.77
450	0.85
451	0.87
452	0.9
453	0.91
454	0.9
455	0.9
456	0.89
457	0.89
458	0.88
459	0.82
460	0.72
461	0.62
462	0.61
463	0.54
464	0.47
465	0.37
466	0.3
467	0.28

C0NSV0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer