Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L0BIR2

Protein Details
Accession A0A1L0BIR2    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-281EKDRSDNEAQRRKKPRKKTNVQKGGTVKKDEKKDERKDEKKDEKKDERKDEKKEVKQVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-276KRDRQGRDNKKAGEKDRSDNEAQRRKKPRKKTNVQKGGTVKKDEKKDERKDEKKDEKKDERKDEKKE
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR015966  tRNA_lig_kin_fungi  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003972  F:RNA ligase (ATP) activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08303  tRNA_lig_kinase  
Amino Acid Sequences MKYILVPISTVGCGKSTTFRILTSLHPDWAHVENDSCSSKNNFYHKLSDAIKKTNVVLLDRNNQLRKQRAEITSKFAAPNVCLIALEFVESQMPKKELWDLTYDRMRRRGDNHQQIKSKSNVGMTKMIVSRFVKEYQPFNPENEEDLQYLHLQMTLGGQLSLENARRILQFLHSIDPGIFTGMPSEEALWSAYRQALAFQVPESEKSDSKRDRQGRDNKKAGEKDRSDNEAQRRKKPRKKTNVQKGGTVKKDEKKDERKDEKKDEKKDERKDEKKEVKQVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.19
3 0.2
4 0.25
5 0.25
6 0.25
7 0.27
8 0.28
9 0.31
10 0.34
11 0.33
12 0.31
13 0.3
14 0.3
15 0.31
16 0.32
17 0.29
18 0.21
19 0.2
20 0.18
21 0.22
22 0.24
23 0.21
24 0.21
25 0.24
26 0.28
27 0.33
28 0.39
29 0.42
30 0.42
31 0.48
32 0.47
33 0.5
34 0.49
35 0.51
36 0.48
37 0.47
38 0.46
39 0.42
40 0.4
41 0.36
42 0.33
43 0.27
44 0.28
45 0.28
46 0.32
47 0.36
48 0.42
49 0.43
50 0.45
51 0.49
52 0.52
53 0.5
54 0.49
55 0.52
56 0.51
57 0.56
58 0.55
59 0.55
60 0.5
61 0.48
62 0.43
63 0.37
64 0.31
65 0.23
66 0.23
67 0.18
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.09
73 0.1
74 0.07
75 0.06
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.12
80 0.13
81 0.11
82 0.12
83 0.18
84 0.17
85 0.19
86 0.24
87 0.23
88 0.27
89 0.34
90 0.36
91 0.34
92 0.4
93 0.4
94 0.37
95 0.4
96 0.45
97 0.49
98 0.57
99 0.62
100 0.63
101 0.67
102 0.66
103 0.65
104 0.56
105 0.49
106 0.39
107 0.36
108 0.31
109 0.28
110 0.29
111 0.25
112 0.26
113 0.25
114 0.23
115 0.22
116 0.21
117 0.2
118 0.19
119 0.21
120 0.2
121 0.21
122 0.24
123 0.23
124 0.28
125 0.27
126 0.25
127 0.26
128 0.23
129 0.23
130 0.22
131 0.21
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.11
136 0.11
137 0.09
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.05
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.14
158 0.15
159 0.18
160 0.16
161 0.17
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.1
166 0.09
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.13
188 0.13
189 0.15
190 0.18
191 0.19
192 0.2
193 0.23
194 0.32
195 0.34
196 0.39
197 0.47
198 0.52
199 0.56
200 0.63
201 0.71
202 0.73
203 0.77
204 0.8
205 0.76
206 0.77
207 0.78
208 0.74
209 0.74
210 0.67
211 0.65
212 0.63
213 0.63
214 0.58
215 0.57
216 0.61
217 0.61
218 0.62
219 0.65
220 0.69
221 0.75
222 0.8
223 0.84
224 0.85
225 0.86
226 0.92
227 0.93
228 0.94
229 0.93
230 0.86
231 0.84
232 0.82
233 0.81
234 0.76
235 0.72
236 0.69
237 0.66
238 0.72
239 0.73
240 0.74
241 0.74
242 0.79
243 0.82
244 0.85
245 0.87
246 0.88
247 0.9
248 0.9
249 0.9
250 0.89
251 0.89
252 0.89
253 0.9
254 0.91
255 0.91
256 0.91
257 0.9
258 0.89
259 0.9
260 0.89
261 0.88