Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1L0BDZ3

Protein Details
Accession A0A1L0BDZ3    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-61AKERHKTITKHSKNGQPKKILNHydrophilic
303-327GDLPAIGKKKPKNKIRKKMGAMTDTHydrophilic
413-433DSVSKSKLAARRKKQTSMGSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-320GKKKPKNKIRKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MARGKKFDKKTAQTFNIVHRSHEDSLYFDNDASKHVLVPAKERHKTITKHSKNGQPKKILNTAELEQSLTKEELASIRENEGLAAQYGIFFDDSKYDYMQHLRPIGQAANAVFIAKKEDEKPQKKNIEDMIKDALPSEKTRRVTHDTFENIPRELRGFNPDMDPRLREVLEALEDEAYVEGEEKEGPDMFADLLQSGEVEDEEEFYEGSDYDEWDMDNYDDEFDQYALDYEPQDVELINPYGEGEAPEGVVGAAEATGLVSNAWEQDFKKFKHTTRNETNDWDSDDDFDEEDGEVAEENDVVGDLPAIGKKKPKNKIRKKMGAMTDTSAFSMTSSALFRSEGLTLLDDRYEQLVKKFEEDEEEEEPQEFNMKEERQDFEGMLDDFLDNYELERGGRKLVKKDATLHAIRDAADSVSKSKLAARRKKQTSMGSLGGSFGNLRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.73
3 0.73
4 0.64
5 0.56
6 0.49
7 0.51
8 0.45
9 0.45
10 0.36
11 0.29
12 0.32
13 0.33
14 0.3
15 0.23
16 0.24
17 0.21
18 0.23
19 0.23
20 0.2
21 0.17
22 0.21
23 0.25
24 0.22
25 0.3
26 0.38
27 0.44
28 0.48
29 0.49
30 0.51
31 0.56
32 0.59
33 0.62
34 0.64
35 0.63
36 0.68
37 0.73
38 0.77
39 0.79
40 0.85
41 0.83
42 0.82
43 0.79
44 0.77
45 0.77
46 0.69
47 0.61
48 0.55
49 0.48
50 0.43
51 0.38
52 0.32
53 0.25
54 0.23
55 0.23
56 0.19
57 0.17
58 0.12
59 0.12
60 0.13
61 0.16
62 0.18
63 0.17
64 0.18
65 0.19
66 0.18
67 0.17
68 0.16
69 0.13
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.16
85 0.21
86 0.23
87 0.25
88 0.27
89 0.26
90 0.27
91 0.28
92 0.27
93 0.22
94 0.22
95 0.17
96 0.16
97 0.15
98 0.14
99 0.11
100 0.11
101 0.14
102 0.12
103 0.15
104 0.15
105 0.25
106 0.35
107 0.44
108 0.51
109 0.56
110 0.63
111 0.62
112 0.65
113 0.63
114 0.62
115 0.55
116 0.51
117 0.46
118 0.38
119 0.37
120 0.32
121 0.27
122 0.19
123 0.22
124 0.25
125 0.26
126 0.3
127 0.32
128 0.38
129 0.43
130 0.43
131 0.43
132 0.45
133 0.42
134 0.43
135 0.45
136 0.41
137 0.34
138 0.32
139 0.29
140 0.23
141 0.2
142 0.17
143 0.17
144 0.17
145 0.18
146 0.22
147 0.23
148 0.25
149 0.26
150 0.25
151 0.22
152 0.23
153 0.21
154 0.17
155 0.16
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.04
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.04
187 0.03
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.06
252 0.06
253 0.14
254 0.2
255 0.21
256 0.3
257 0.34
258 0.37
259 0.46
260 0.53
261 0.55
262 0.59
263 0.65
264 0.6
265 0.6
266 0.6
267 0.51
268 0.46
269 0.39
270 0.28
271 0.23
272 0.21
273 0.17
274 0.14
275 0.12
276 0.1
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.06
294 0.08
295 0.09
296 0.16
297 0.22
298 0.32
299 0.41
300 0.51
301 0.6
302 0.7
303 0.8
304 0.84
305 0.88
306 0.86
307 0.86
308 0.84
309 0.77
310 0.68
311 0.6
312 0.52
313 0.42
314 0.35
315 0.26
316 0.18
317 0.14
318 0.12
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.1
335 0.11
336 0.13
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.22
341 0.22
342 0.25
343 0.26
344 0.24
345 0.27
346 0.3
347 0.31
348 0.29
349 0.3
350 0.27
351 0.26
352 0.26
353 0.2
354 0.21
355 0.17
356 0.14
357 0.19
358 0.2
359 0.24
360 0.27
361 0.3
362 0.28
363 0.3
364 0.29
365 0.23
366 0.26
367 0.22
368 0.19
369 0.16
370 0.13
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.07
375 0.07
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.13
380 0.13
381 0.19
382 0.25
383 0.29
384 0.35
385 0.43
386 0.5
387 0.5
388 0.56
389 0.57
390 0.6
391 0.58
392 0.53
393 0.48
394 0.43
395 0.4
396 0.34
397 0.28
398 0.21
399 0.2
400 0.2
401 0.18
402 0.19
403 0.19
404 0.18
405 0.23
406 0.29
407 0.37
408 0.46
409 0.54
410 0.63
411 0.7
412 0.78
413 0.8
414 0.82
415 0.8
416 0.76
417 0.7
418 0.62
419 0.54
420 0.48
421 0.39
422 0.31