FuNGI

A0A1J5WF53

Protein Details

Accession

A0A1J5WF53

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
170-193	KQAVLPSKERKKPTCNFCKKVGHV	Hydrophilic
1097-1118	INRVNPSGKKKLLKKWIGPYII	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 8, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13975 gag-asp_proteas PF17917 RT_RNaseH PF00665 rve PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

GDSRVATLAECPQQAEVPTFSGERWEDVEHWLEQIQLGRTAADAFTIAKLKLTGQALIALKTAEEQAKNWKQLREWASMEFKQPESKKAAEFFSFLYQRKSHCSLADFIATAIDLGLAANLAQYEMTLAIKGKLPSKMQQEATAVVDLKSLCAFTKDLTSKGKLHWGEPKQAVLPSKERKKPTCNFCKKVGHVESNCRNKKKDAYSKKDALLCISDAIKVDGTVNGTRAKMLVDTGARDLYISENLADKINATPGEQHNVTVADGRQVLAHRAQHKVEVKFTNTAQRTRPTIVPGLAEEVILGRKPLAKAKVIIDAQRGELTTARPLRVRNEKVSKFSGGADIEDISNIHTATEALPKTLEDSKPILEKIRSKDEFDIGRTSVMECRVDTGKNQPVSKFPYPLTRDKEEYLEKILDELLQRKIIERIKFSRWSSPAILVKNKDKYRLCVDYRALNAITETERHPMPTLQQVFTSLAGARYFSVLDLTKGFWQLPLTPSDADKTTFVTKFGSFKWNVMPFGLKNAPALFQRMIDGVLDPVKGICAMAYIDDIIVYSKTREEHLLHLKTVGNLLHDAGLKISPTKCKFFCKEVLYLGHTISADGVTPPEKKIGEIVRITAPKSTRAVRSFLGMINYYRDYIPGIAQIAGPLYELLQKHTRFKWEPKHDDAFVKLKQALEKNCTLLIPNFEKPFVVYTDASIDGLGGMLAQLDDSGQERIVRTVSRTLAPAERNYGITELECLSVIWTLDKFRYYLVGREFRVITDHKALQWLDQHKDSNSKLMRWALQLQEFGDFEIQYRAGEDHGNADGLSRLPEEICTLDDEETSKALEAHAKLGHANPEITHKYLTRDPGWKGSLKDVQRLIKECQLCQNFGTKYDKFTKKRSVAFRPLEKIAIDIMEISSETDGGNKYIVAAIDYYSKWLFAKAIPDKKGSTIVDFVEKEVIMKKGIPDTIVSDNGKEFTNVQMEALCRKYGIRHSLTTAYYPQANGLIERTNRTILKKLSCGIRETKQDWDNTIPQMLMAYNSSPIKALGYSPFEILHGWTPKIIPRMTKIKGLDIHEIRRDITEKYLAQEEKQASEGDRTDDLEPGTKILLDINRVNPSGKKKLLKKWIGPYIIDARNSSGQYTIRDRSGYSLKANRRQIRPYSGNEPTVAFEEGGDVNPPLSLRLRTSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.26
3	0.22
4	0.19
5	0.2
6	0.2
7	0.19
8	0.23
9	0.22
10	0.21
11	0.22
12	0.23
13	0.22
14	0.25
15	0.29
16	0.23
17	0.24
18	0.22
19	0.19
20	0.18
21	0.21
22	0.2
23	0.19
24	0.19
25	0.18
26	0.18
27	0.19
28	0.17
29	0.13
30	0.11
31	0.09
32	0.12
33	0.15
34	0.15
35	0.15
36	0.15
37	0.16
38	0.21
39	0.22
40	0.2
41	0.18
42	0.25
43	0.25
44	0.25
45	0.25
46	0.19
47	0.17
48	0.17
49	0.2
50	0.18
51	0.17
52	0.18
53	0.28
54	0.36
55	0.45
56	0.49
57	0.49
58	0.47
59	0.55
60	0.59
61	0.56
62	0.5
63	0.49
64	0.52
65	0.5
66	0.54
67	0.49
68	0.45
69	0.47
70	0.46
71	0.45
72	0.44
73	0.44
74	0.43
75	0.43
76	0.46
77	0.39
78	0.39
79	0.35
80	0.38
81	0.41
82	0.38
83	0.4
84	0.38
85	0.38
86	0.44
87	0.47
88	0.41
89	0.39
90	0.41
91	0.38
92	0.39
93	0.39
94	0.32
95	0.27
96	0.23
97	0.19
98	0.16
99	0.12
100	0.08
101	0.04
102	0.04
103	0.04
104	0.03
105	0.03
106	0.04
107	0.04
108	0.04
109	0.04
110	0.04
111	0.04
112	0.05
113	0.06
114	0.07
115	0.08
116	0.09
117	0.14
118	0.16
119	0.2
120	0.25
121	0.29
122	0.35
123	0.42
124	0.48
125	0.45
126	0.48
127	0.46
128	0.43
129	0.41
130	0.38
131	0.31
132	0.23
133	0.24
134	0.18
135	0.17
136	0.15
137	0.13
138	0.1
139	0.12
140	0.12
141	0.11
142	0.2
143	0.22
144	0.26
145	0.31
146	0.35
147	0.36
148	0.38
149	0.46
150	0.38
151	0.4
152	0.45
153	0.45
154	0.49
155	0.49
156	0.49
157	0.43
158	0.45
159	0.45
160	0.4
161	0.44
162	0.45
163	0.53
164	0.57
165	0.63
166	0.67
167	0.73
168	0.77
169	0.79
170	0.8
171	0.81
172	0.78
173	0.79
174	0.82
175	0.76
176	0.77
177	0.74
178	0.72
179	0.66
180	0.72
181	0.72
182	0.74
183	0.78
184	0.73
185	0.68
186	0.64
187	0.68
188	0.68
189	0.7
190	0.7
191	0.71
192	0.75
193	0.79
194	0.78
195	0.74
196	0.63
197	0.56
198	0.47
199	0.39
200	0.32
201	0.25
202	0.21
203	0.17
204	0.18
205	0.15
206	0.12
207	0.12
208	0.11
209	0.14
210	0.14
211	0.15
212	0.16
213	0.16
214	0.16
215	0.16
216	0.15
217	0.12
218	0.12
219	0.14
220	0.13
221	0.15
222	0.16
223	0.16
224	0.15
225	0.15
226	0.15
227	0.12
228	0.12
229	0.11
230	0.09
231	0.11
232	0.12
233	0.13
234	0.13
235	0.12
236	0.11
237	0.14
238	0.14
239	0.12
240	0.18
241	0.19
242	0.25
243	0.25
244	0.24
245	0.22
246	0.22
247	0.22
248	0.19
249	0.17
250	0.14
251	0.14
252	0.14
253	0.15
254	0.15
255	0.17
256	0.18
257	0.23
258	0.24
259	0.28
260	0.28
261	0.34
262	0.4
263	0.4
264	0.43
265	0.42
266	0.42
267	0.42
268	0.42
269	0.44
270	0.41
271	0.42
272	0.4
273	0.4
274	0.42
275	0.42
276	0.42
277	0.37
278	0.37
279	0.34
280	0.31
281	0.27
282	0.26
283	0.22
284	0.19
285	0.15
286	0.12
287	0.12
288	0.1
289	0.1
290	0.07
291	0.1
292	0.11
293	0.17
294	0.2
295	0.22
296	0.25
297	0.27
298	0.35
299	0.34
300	0.35
301	0.33
302	0.31
303	0.29
304	0.28
305	0.26
306	0.18
307	0.18
308	0.16
309	0.2
310	0.22
311	0.22
312	0.23
313	0.25
314	0.31
315	0.4
316	0.44
317	0.46
318	0.53
319	0.55
320	0.58
321	0.6
322	0.54
323	0.45
324	0.41
325	0.36
326	0.26
327	0.23
328	0.19
329	0.16
330	0.14
331	0.13
332	0.12
333	0.08
334	0.08
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.12
344	0.13
345	0.16
346	0.21
347	0.2
348	0.17
349	0.19
350	0.21
351	0.24
352	0.25
353	0.26
354	0.24
355	0.3
356	0.32
357	0.41
358	0.4
359	0.4
360	0.42
361	0.43
362	0.42
363	0.38
364	0.36
365	0.26
366	0.25
367	0.23
368	0.21
369	0.18
370	0.18
371	0.16
372	0.13
373	0.15
374	0.16
375	0.17
376	0.17
377	0.22
378	0.26
379	0.3
380	0.32
381	0.3
382	0.33
383	0.4
384	0.42
385	0.38
386	0.32
387	0.37
388	0.4
389	0.47
390	0.48
391	0.45
392	0.45
393	0.43
394	0.47
395	0.4
396	0.37
397	0.33
398	0.27
399	0.23
400	0.2
401	0.19
402	0.16
403	0.14
404	0.15
405	0.14
406	0.15
407	0.16
408	0.16
409	0.22
410	0.26
411	0.27
412	0.3
413	0.33
414	0.36
415	0.43
416	0.44
417	0.46
418	0.42
419	0.44
420	0.4
421	0.41
422	0.4
423	0.38
424	0.41
425	0.36
426	0.41
427	0.45
428	0.45
429	0.47
430	0.44
431	0.44
432	0.46
433	0.51
434	0.47
435	0.45
436	0.46
437	0.43
438	0.42
439	0.41
440	0.34
441	0.26
442	0.23
443	0.17
444	0.16
445	0.12
446	0.12
447	0.11
448	0.11
449	0.12
450	0.13
451	0.12
452	0.14
453	0.2
454	0.22
455	0.21
456	0.21
457	0.22
458	0.22
459	0.21
460	0.2
461	0.12
462	0.11
463	0.1
464	0.1
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.07
469	0.08
470	0.07
471	0.08
472	0.09
473	0.1
474	0.1
475	0.11
476	0.11
477	0.1
478	0.1
479	0.12
480	0.12
481	0.13
482	0.14
483	0.14
484	0.14
485	0.15
486	0.15
487	0.14
488	0.13
489	0.13
490	0.16
491	0.15
492	0.16
493	0.16
494	0.16
495	0.18
496	0.19
497	0.23
498	0.19
499	0.2
500	0.26
501	0.27
502	0.26
503	0.24
504	0.25
505	0.18
506	0.23
507	0.24
508	0.18
509	0.15
510	0.15
511	0.17
512	0.15
513	0.18
514	0.12
515	0.11
516	0.12
517	0.11
518	0.11
519	0.09
520	0.09
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.06
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.04
530	0.03
531	0.03
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.06
543	0.06
544	0.08
545	0.11
546	0.12
547	0.18
548	0.26
549	0.28
550	0.27
551	0.28
552	0.28
553	0.25
554	0.25
555	0.2
556	0.11
557	0.1
558	0.1
559	0.1
560	0.09
561	0.09
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.09
566	0.1
567	0.15
568	0.17
569	0.21
570	0.23
571	0.29
572	0.32
573	0.34
574	0.39
575	0.36
576	0.36
577	0.35
578	0.36
579	0.32
580	0.29
581	0.25
582	0.2
583	0.16
584	0.13
585	0.1
586	0.08
587	0.06
588	0.05
589	0.06
590	0.06
591	0.07
592	0.08
593	0.1
594	0.1
595	0.1
596	0.14
597	0.16
598	0.19
599	0.19
600	0.2
601	0.22
602	0.23
603	0.24
604	0.22
605	0.21
606	0.18
607	0.21
608	0.22
609	0.23
610	0.24
611	0.26
612	0.24
613	0.25
614	0.24
615	0.22
616	0.21
617	0.16
618	0.14
619	0.14
620	0.15
621	0.13
622	0.12
623	0.11
624	0.1
625	0.1
626	0.1
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.08
632	0.07
633	0.06
634	0.06
635	0.05
636	0.04
637	0.07
638	0.07
639	0.11
640	0.17
641	0.18
642	0.23
643	0.24
644	0.31
645	0.32
646	0.4
647	0.47
648	0.51
649	0.57
650	0.58
651	0.61
652	0.57
653	0.54
654	0.5
655	0.45
656	0.35
657	0.32
658	0.27
659	0.23
660	0.25
661	0.28
662	0.28
663	0.27
664	0.27
665	0.26
666	0.25
667	0.24
668	0.21
669	0.18
670	0.19
671	0.2
672	0.21
673	0.21
674	0.2
675	0.2
676	0.19
677	0.19
678	0.16
679	0.15
680	0.11
681	0.11
682	0.13
683	0.14
684	0.13
685	0.11
686	0.1
687	0.06
688	0.06
689	0.05
690	0.03
691	0.02
692	0.02
693	0.02
694	0.02
695	0.02
696	0.02
697	0.03
698	0.04
699	0.05
700	0.05
701	0.06
702	0.07
703	0.08
704	0.09
705	0.1
706	0.1
707	0.14
708	0.16
709	0.16
710	0.17
711	0.18
712	0.22
713	0.23
714	0.23
715	0.22
716	0.21
717	0.21
718	0.21
719	0.19
720	0.15
721	0.13
722	0.13
723	0.1
724	0.09
725	0.08
726	0.07
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.08
733	0.09
734	0.1
735	0.09
736	0.09
737	0.14
738	0.14
739	0.19
740	0.24
741	0.29
742	0.29
743	0.32
744	0.32
745	0.27
746	0.3
747	0.26
748	0.23
749	0.22
750	0.23
751	0.2
752	0.24
753	0.24
754	0.22
755	0.27
756	0.29
757	0.27
758	0.29
759	0.3
760	0.28
761	0.34
762	0.32
763	0.34
764	0.32
765	0.3
766	0.3
767	0.32
768	0.33
769	0.3
770	0.34
771	0.28
772	0.29
773	0.29
774	0.25
775	0.24
776	0.22
777	0.19
778	0.16
779	0.12
780	0.1
781	0.11
782	0.1
783	0.08
784	0.09
785	0.09
786	0.08
787	0.09
788	0.09
789	0.09
790	0.1
791	0.1
792	0.09
793	0.09
794	0.09
795	0.08
796	0.09
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.07
801	0.08
802	0.08
803	0.09
804	0.09
805	0.1
806	0.1
807	0.11
808	0.12
809	0.11
810	0.11
811	0.1
812	0.09
813	0.08
814	0.08
815	0.12
816	0.11
817	0.14
818	0.15
819	0.15
820	0.16
821	0.18
822	0.21
823	0.18
824	0.18
825	0.15
826	0.21
827	0.23
828	0.23
829	0.24
830	0.21
831	0.24
832	0.27
833	0.31
834	0.29
835	0.33
836	0.34
837	0.38
838	0.4
839	0.4
840	0.38
841	0.4
842	0.42
843	0.38
844	0.42
845	0.41
846	0.43
847	0.44
848	0.47
849	0.44
850	0.43
851	0.43
852	0.38
853	0.41
854	0.39
855	0.35
856	0.33
857	0.37
858	0.31
859	0.33
860	0.38
861	0.3
862	0.33
863	0.41
864	0.5
865	0.47
866	0.54
867	0.61
868	0.61
869	0.69
870	0.72
871	0.72
872	0.72
873	0.76
874	0.76
875	0.71
876	0.65
877	0.59
878	0.5
879	0.41
880	0.32
881	0.23
882	0.16
883	0.11
884	0.09
885	0.07
886	0.07
887	0.07
888	0.06
889	0.05
890	0.05
891	0.07
892	0.07
893	0.08
894	0.08
895	0.07
896	0.08
897	0.09
898	0.09
899	0.08
900	0.08
901	0.08
902	0.12
903	0.12
904	0.14
905	0.13
906	0.13
907	0.13
908	0.13
909	0.14
910	0.12
911	0.22
912	0.28
913	0.37
914	0.39
915	0.42
916	0.43
917	0.43
918	0.48
919	0.39
920	0.33
921	0.28
922	0.26
923	0.3
924	0.29
925	0.28
926	0.24
927	0.22
928	0.2
929	0.2
930	0.2
931	0.14
932	0.15
933	0.16
934	0.18
935	0.19
936	0.19
937	0.17
938	0.2
939	0.23
940	0.27
941	0.26
942	0.22
943	0.22
944	0.23
945	0.22
946	0.19
947	0.16
948	0.14
949	0.17
950	0.16
951	0.15
952	0.17
953	0.17
954	0.21
955	0.23
956	0.19
957	0.16
958	0.16
959	0.21
960	0.26
961	0.34
962	0.34
963	0.34
964	0.39
965	0.44
966	0.44
967	0.42
968	0.37
969	0.31
970	0.28
971	0.26
972	0.22
973	0.19
974	0.19
975	0.16
976	0.16
977	0.2
978	0.2
979	0.23
980	0.25
981	0.27
982	0.3
983	0.32
984	0.37
985	0.37
986	0.42
987	0.42
988	0.44
989	0.47
990	0.47
991	0.49
992	0.47
993	0.48
994	0.5
995	0.48
996	0.53
997	0.49
998	0.49
999	0.48
1000	0.48
1001	0.46
1002	0.4
1003	0.39
1004	0.3
1005	0.25
1006	0.24
1007	0.2
1008	0.15
1009	0.12
1010	0.11
1011	0.14
1012	0.14
1013	0.15
1014	0.14
1015	0.14
1016	0.14
1017	0.13
1018	0.15
1019	0.16
1020	0.21
1021	0.22
1022	0.22
1023	0.22
1024	0.21
1025	0.21
1026	0.21
1027	0.23
1028	0.21
1029	0.21
1030	0.21
1031	0.22
1032	0.26
1033	0.32
1034	0.32
1035	0.29
1036	0.32
1037	0.41
1038	0.43
1039	0.49
1040	0.46
1041	0.48
1042	0.51
1043	0.52
1044	0.55
1045	0.52
1046	0.56
1047	0.54
1048	0.53
1049	0.46
1050	0.44
1051	0.41
1052	0.33
1053	0.31
1054	0.31
1055	0.27
1056	0.29
1057	0.36
1058	0.34
1059	0.33
1060	0.39
1061	0.36
1062	0.32
1063	0.32
1064	0.3
1065	0.24
1066	0.28
1067	0.28
1068	0.24
1069	0.24
1070	0.24
1071	0.24
1072	0.24
1073	0.24
1074	0.23
1075	0.22
1076	0.2
1077	0.18
1078	0.16
1079	0.15
1080	0.17
1081	0.19
1082	0.19
1083	0.24
1084	0.28
1085	0.33
1086	0.34
1087	0.36
1088	0.37
1089	0.42
1090	0.47
1091	0.5
1092	0.54
1093	0.57
1094	0.66
1095	0.75
1096	0.79
1097	0.8
1098	0.81
1099	0.82
1100	0.78
1101	0.7
1102	0.66
1103	0.65
1104	0.6
1105	0.54
1106	0.44
1107	0.4
1108	0.4
1109	0.4
1110	0.35
1111	0.3
1112	0.27
1113	0.3
1114	0.36
1115	0.36
1116	0.34
1117	0.34
1118	0.34
1119	0.36
1120	0.4
1121	0.39
1122	0.4
1123	0.45
1124	0.51
1125	0.6
1126	0.7
1127	0.72
1128	0.72
1129	0.77
1130	0.76
1131	0.78
1132	0.75
1133	0.73
1134	0.71
1135	0.69
1136	0.65
1137	0.58
1138	0.51
1139	0.43
1140	0.39
1141	0.34
1142	0.24
1143	0.17
1144	0.17
1145	0.17
1146	0.16
1147	0.16
1148	0.13
1149	0.11
1150	0.12
1151	0.12
1152	0.12
1153	0.15
1154	0.17

A0A1J5WF53

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer