Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J5WLK4

Protein Details
Accession A0A1J5WLK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-386AEQETKKKIKQEEKTPKKRKRKGTQAEEEKEKKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
358-389KKKIKQEEKTPKKRKRKGTQAEEEKEKKVSKK
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 7, plas 6, E.R. 4, cyto 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
IPR013137  Znf_TFIIB  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF08271  TF_Zn_Ribbon  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51134  ZF_TFIIB  
CDD cd20553  CYCLIN_TFIIIB90_rpt1  
cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MECPHCTSTSLQTDPAQGHTVCTDCGSVLEENTVVTEVQFTDKSGGGAAVQGQFVSATTGHAAVSKMFGKKIYLTESRETTIYNARNKISAIGTAVGISQKNIDLAVRWFSLALQHGFTRGRPSELVVASCLYIECRRDRTAHMLVDFANILCVSVFSIGSVFLKLVILLKVQVPLIDPAFYLQRFAARLEFGERSKEVVDLASDITGRMQRDWLHVGRRPAGVCCAALIIAAKLSGFRRTEHDLAEIVSIAPDTIRRRIAEFCNTPAGKMTPAGFRESRGELGEEDPPAYKKGLLAIEQKKESRCQPAPLRLKAETLSDTETDDETSAAILSKEEAELKTELWMDEHEEYIAEQETKKKIKQEEKTPKKRKRKGTQAEEEKEKKVSKKINYKVLENLFQKETSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.39
3 0.35
4 0.27
5 0.26
6 0.25
7 0.24
8 0.2
9 0.2
10 0.17
11 0.12
12 0.13
13 0.14
14 0.13
15 0.12
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.09
22 0.08
23 0.09
24 0.08
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.14
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.1
34 0.11
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.08
44 0.07
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.13
52 0.16
53 0.18
54 0.18
55 0.19
56 0.2
57 0.23
58 0.26
59 0.3
60 0.32
61 0.35
62 0.39
63 0.41
64 0.4
65 0.37
66 0.34
67 0.3
68 0.32
69 0.33
70 0.35
71 0.36
72 0.35
73 0.36
74 0.36
75 0.36
76 0.29
77 0.24
78 0.19
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.1
93 0.14
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.15
99 0.17
100 0.16
101 0.14
102 0.14
103 0.17
104 0.18
105 0.18
106 0.22
107 0.2
108 0.21
109 0.2
110 0.22
111 0.25
112 0.25
113 0.25
114 0.19
115 0.19
116 0.16
117 0.16
118 0.14
119 0.09
120 0.1
121 0.12
122 0.15
123 0.19
124 0.21
125 0.23
126 0.26
127 0.31
128 0.35
129 0.35
130 0.32
131 0.29
132 0.27
133 0.26
134 0.24
135 0.16
136 0.11
137 0.07
138 0.07
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.08
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.09
176 0.1
177 0.13
178 0.15
179 0.13
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.11
186 0.09
187 0.09
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.06
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.13
200 0.17
201 0.19
202 0.22
203 0.25
204 0.27
205 0.28
206 0.29
207 0.27
208 0.24
209 0.23
210 0.19
211 0.16
212 0.14
213 0.11
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.06
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.17
227 0.22
228 0.24
229 0.24
230 0.25
231 0.21
232 0.2
233 0.2
234 0.16
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.05
239 0.04
240 0.07
241 0.09
242 0.12
243 0.15
244 0.16
245 0.18
246 0.23
247 0.28
248 0.33
249 0.33
250 0.33
251 0.39
252 0.38
253 0.36
254 0.34
255 0.3
256 0.22
257 0.22
258 0.21
259 0.17
260 0.19
261 0.23
262 0.21
263 0.22
264 0.25
265 0.25
266 0.25
267 0.21
268 0.2
269 0.17
270 0.18
271 0.19
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.13
279 0.11
280 0.15
281 0.17
282 0.2
283 0.29
284 0.35
285 0.4
286 0.44
287 0.47
288 0.44
289 0.46
290 0.46
291 0.46
292 0.42
293 0.45
294 0.49
295 0.56
296 0.63
297 0.65
298 0.66
299 0.57
300 0.56
301 0.48
302 0.44
303 0.35
304 0.29
305 0.25
306 0.2
307 0.2
308 0.19
309 0.18
310 0.16
311 0.14
312 0.12
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.1
323 0.1
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.14
331 0.15
332 0.16
333 0.16
334 0.16
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.13
339 0.15
340 0.12
341 0.12
342 0.18
343 0.25
344 0.31
345 0.35
346 0.4
347 0.48
348 0.57
349 0.65
350 0.7
351 0.74
352 0.79
353 0.87
354 0.91
355 0.93
356 0.94
357 0.94
358 0.93
359 0.93
360 0.93
361 0.93
362 0.93
363 0.94
364 0.93
365 0.92
366 0.92
367 0.85
368 0.77
369 0.72
370 0.67
371 0.61
372 0.59
373 0.6
374 0.6
375 0.66
376 0.71
377 0.75
378 0.74
379 0.73
380 0.73
381 0.71
382 0.7
383 0.63
384 0.59
385 0.52