FuNGI

A0A1J5WKG4

Protein Details

Accession

A0A1J5WKG4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-22	GSGKNTKREVVRRKVINRGYE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto 10, cyto_nucl 8.5, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001233 RtcB IPR036025 RtcB-like_sf IPR027513 RtcB_euk
Gene Ontology	GO:0072669 C:tRNA-splicing ligase complex GO:0005525 F:GTP binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0003972 F:RNA ligase (ATP) activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Pfam	View protein in Pfam PF01139 RtcB
PROSITE	View protein in PROSITE PS01288 UPF0027

Amino Acid Sequences

MGSGKNTKREVVRRKVINRGYEGNLKYIEKDPERENAYTIKIGFVPSMRVPAKFYTNEELLPVLLGELKEFIKEEREGFLPSLVQIANVATLPGIVRHSFGLPDIHSGYGFAVGNCAAFDMDDSDAIVSPGGIGFDIGCGVRMVRTNLTLVDLAGKQHELGKEIEKVIPAGVFKNNERGVNDEEINRVLKDGMKWALEKGFCWEEDLAVCEDFGCVALADPSSVSPSAKARGAKQLGTLGSGNHYVEVQAVTDIFDEEKAAAMGITQLEQLCVMVHTGSRGFGHKVCSDMTAKVAQSTTDEYNDRQLSGVRISSELGKTYLAQMACAINFAYTNRTVIVHRLRKVFEKVFGRTAKEMEMEVIYDVSHNTAKVEEHVVDGKKKNLLVHRKGATRSFGPGDERVPEKYRGIGQPVLIGGSMGTCSYVLVGTDSCMKETFGTTCHGAGRVMSRKKAAETVGYKELQKRLARDGIFVAAGYGEDAEKGLVEEAPEAYKDVEEVIKVCQNAGLNEAVFKIKPVCVIKGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.83
3	0.81
4	0.78
5	0.73
6	0.69
7	0.65
8	0.63
9	0.58
10	0.52
11	0.49
12	0.42
13	0.39
14	0.39
15	0.42
16	0.38
17	0.41
18	0.4
19	0.44
20	0.48
21	0.45
22	0.42
23	0.38
24	0.37
25	0.36
26	0.33
27	0.27
28	0.23
29	0.23
30	0.23
31	0.2
32	0.21
33	0.18
34	0.27
35	0.26
36	0.26
37	0.28
38	0.3
39	0.36
40	0.34
41	0.37
42	0.35
43	0.35
44	0.34
45	0.32
46	0.29
47	0.22
48	0.2
49	0.15
50	0.09
51	0.09
52	0.09
53	0.08
54	0.09
55	0.1
56	0.1
57	0.11
58	0.12
59	0.14
60	0.16
61	0.17
62	0.18
63	0.2
64	0.21
65	0.21
66	0.22
67	0.17
68	0.16
69	0.17
70	0.14
71	0.12
72	0.11
73	0.1
74	0.1
75	0.09
76	0.09
77	0.05
78	0.06
79	0.06
80	0.07
81	0.09
82	0.08
83	0.1
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.13
88	0.15
89	0.13
90	0.17
91	0.17
92	0.17
93	0.16
94	0.16
95	0.15
96	0.15
97	0.15
98	0.1
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.06
105	0.05
106	0.05
107	0.06
108	0.07
109	0.06
110	0.07
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.07
115	0.05
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.04
120	0.03
121	0.03
122	0.04
123	0.05
124	0.04
125	0.05
126	0.05
127	0.05
128	0.07
129	0.09
130	0.12
131	0.12
132	0.14
133	0.14
134	0.14
135	0.16
136	0.15
137	0.12
138	0.13
139	0.12
140	0.12
141	0.12
142	0.12
143	0.1
144	0.13
145	0.14
146	0.13
147	0.14
148	0.17
149	0.19
150	0.2
151	0.21
152	0.18
153	0.18
154	0.16
155	0.15
156	0.13
157	0.12
158	0.14
159	0.15
160	0.16
161	0.23
162	0.25
163	0.26
164	0.26
165	0.27
166	0.28
167	0.29
168	0.29
169	0.23
170	0.22
171	0.21
172	0.22
173	0.18
174	0.14
175	0.11
176	0.12
177	0.11
178	0.14
179	0.15
180	0.15
181	0.16
182	0.17
183	0.21
184	0.19
185	0.19
186	0.19
187	0.18
188	0.17
189	0.19
190	0.17
191	0.14
192	0.14
193	0.15
194	0.12
195	0.1
196	0.1
197	0.07
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.04
202	0.03
203	0.03
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.08
214	0.11
215	0.14
216	0.16
217	0.16
218	0.25
219	0.27
220	0.26
221	0.26
222	0.27
223	0.24
224	0.24
225	0.23
226	0.14
227	0.13
228	0.14
229	0.13
230	0.09
231	0.09
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.05
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.06
267	0.08
268	0.09
269	0.11
270	0.14
271	0.14
272	0.15
273	0.15
274	0.17
275	0.17
276	0.16
277	0.16
278	0.15
279	0.15
280	0.14
281	0.14
282	0.12
283	0.11
284	0.14
285	0.14
286	0.14
287	0.15
288	0.14
289	0.2
290	0.2
291	0.19
292	0.16
293	0.16
294	0.15
295	0.16
296	0.16
297	0.11
298	0.11
299	0.11
300	0.14
301	0.13
302	0.12
303	0.11
304	0.11
305	0.1
306	0.11
307	0.14
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.1
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.11
323	0.11
324	0.17
325	0.26
326	0.3
327	0.34
328	0.38
329	0.39
330	0.43
331	0.49
332	0.45
333	0.42
334	0.41
335	0.4
336	0.44
337	0.45
338	0.43
339	0.38
340	0.37
341	0.31
342	0.26
343	0.23
344	0.17
345	0.14
346	0.11
347	0.1
348	0.09
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.13
360	0.11
361	0.13
362	0.18
363	0.2
364	0.25
365	0.27
366	0.28
367	0.28
368	0.29
369	0.32
370	0.36
371	0.44
372	0.45
373	0.51
374	0.54
375	0.57
376	0.59
377	0.57
378	0.53
379	0.44
380	0.42
381	0.36
382	0.32
383	0.3
384	0.29
385	0.27
386	0.26
387	0.27
388	0.27
389	0.28
390	0.29
391	0.26
392	0.27
393	0.31
394	0.31
395	0.34
396	0.32
397	0.28
398	0.28
399	0.27
400	0.25
401	0.19
402	0.15
403	0.1
404	0.08
405	0.07
406	0.05
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.14
417	0.14
418	0.15
419	0.16
420	0.16
421	0.16
422	0.18
423	0.18
424	0.13
425	0.16
426	0.16
427	0.17
428	0.18
429	0.18
430	0.17
431	0.17
432	0.23
433	0.3
434	0.34
435	0.36
436	0.39
437	0.4
438	0.42
439	0.46
440	0.39
441	0.39
442	0.37
443	0.4
444	0.42
445	0.42
446	0.43
447	0.44
448	0.46
449	0.44
450	0.44
451	0.42
452	0.42
453	0.48
454	0.46
455	0.43
456	0.41
457	0.35
458	0.31
459	0.27
460	0.2
461	0.13
462	0.12
463	0.1
464	0.08
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.08
475	0.1
476	0.11
477	0.11
478	0.12
479	0.12
480	0.11
481	0.11
482	0.12
483	0.12
484	0.12
485	0.12
486	0.16
487	0.19
488	0.19
489	0.19
490	0.2
491	0.21
492	0.2
493	0.22
494	0.2
495	0.17
496	0.18
497	0.19
498	0.19
499	0.16
500	0.18
501	0.18
502	0.17
503	0.24
504	0.27

A0A1J5WKG4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer