FuNGI

C0NB42

Protein Details

Accession

C0NB42

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-71	IDSVPVSPERKRKNREKDGHSAKKRKHEVSNYAAQPEAEESSPKPKKKEKKDREHKKHKHHDDFEPSAP	Basic
76-97	SPNPRSQITKKHKHQSPATQDD	Hydrophilic
471-503	EPDAEIPVRRKKGKEKEKEKEKKKKKKEKKTTL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-29	ERKRKNREKDGHSAKKRKH
44-62	SPKPKKKEKKDREHKKHKH
479-501	RRKKGKEKEKEKEKKKKKKEKKT

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MDIDSVPVSPERKRKNREKDGHSAKKRKHEVSNYAAQPEAEESSPKPKKKEKKDREHKKHKHHDDFEPSAPTLPASPNPRSQITKKHKHQSPATQDDEEEEPPTTSRKPLTKASASRLESTSTDSMESSPFHLITATLYVPLSPISISPTHALSSLQAEHLSPLLLTYFPPVRGIVLAYSNASISSTPPSPSSPSTPHNPDESPKPQPLTLAMSAGEYGVLYVYLTATFLVFRPERGQPLEGWINVQSDGFLGAVVYNLFSVGIERRRLPADWRWVAPGQESTTSTSEAVAPKDRGGSVGVGVDDDDDDDDEDKSSDFDSDKENFRPLPASSAAMLDHSTQYQSNGGLEPPFEAFEDASAGYFQTRSGRRVRGMVRFRVRDVDVIPGAEHDKGFISIEGTMLSPEEEAKLVEEERKRAGFAPSSSSSAVAAAAAGVSGGSGNAAPRQAVMSGGLGTSSASTASAAVETEEEPDAEIPVRRKKGKEKEKEKEKKKKKKEKKTTL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.77
3	0.86
4	0.9
5	0.89
6	0.89
7	0.9
8	0.91
9	0.92
10	0.9
11	0.86
12	0.87
13	0.88
14	0.84
15	0.83
16	0.82
17	0.8
18	0.78
19	0.81
20	0.73
21	0.66
22	0.59
23	0.49
24	0.4
25	0.33
26	0.28
27	0.18
28	0.17
29	0.17
30	0.27
31	0.35
32	0.39
33	0.44
34	0.52
35	0.62
36	0.71
37	0.8
38	0.81
39	0.84
40	0.91
41	0.95
42	0.96
43	0.97
44	0.96
45	0.96
46	0.96
47	0.96
48	0.95
49	0.91
50	0.89
51	0.87
52	0.83
53	0.76
54	0.69
55	0.58
56	0.49
57	0.42
58	0.32
59	0.25
60	0.21
61	0.23
62	0.25
63	0.28
64	0.33
65	0.37
66	0.42
67	0.46
68	0.48
69	0.53
70	0.57
71	0.64
72	0.68
73	0.74
74	0.75
75	0.78
76	0.82
77	0.81
78	0.81
79	0.79
80	0.74
81	0.65
82	0.59
83	0.53
84	0.47
85	0.38
86	0.28
87	0.21
88	0.16
89	0.16
90	0.18
91	0.17
92	0.17
93	0.21
94	0.25
95	0.29
96	0.36
97	0.43
98	0.49
99	0.53
100	0.57
101	0.61
102	0.58
103	0.57
104	0.51
105	0.45
106	0.37
107	0.37
108	0.31
109	0.23
110	0.21
111	0.17
112	0.17
113	0.16
114	0.16
115	0.13
116	0.14
117	0.13
118	0.12
119	0.12
120	0.11
121	0.1
122	0.12
123	0.1
124	0.09
125	0.09
126	0.08
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.06
131	0.06
132	0.08
133	0.09
134	0.11
135	0.12
136	0.13
137	0.13
138	0.13
139	0.13
140	0.11
141	0.13
142	0.13
143	0.12
144	0.12
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.1
149	0.07
150	0.06
151	0.06
152	0.05
153	0.05
154	0.08
155	0.1
156	0.1
157	0.11
158	0.11
159	0.11
160	0.11
161	0.12
162	0.1
163	0.09
164	0.1
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.08
169	0.08
170	0.07
171	0.06
172	0.09
173	0.1
174	0.1
175	0.12
176	0.13
177	0.16
178	0.18
179	0.22
180	0.23
181	0.25
182	0.3
183	0.34
184	0.35
185	0.35
186	0.34
187	0.32
188	0.35
189	0.37
190	0.35
191	0.34
192	0.33
193	0.3
194	0.29
195	0.29
196	0.26
197	0.22
198	0.18
199	0.15
200	0.13
201	0.13
202	0.12
203	0.1
204	0.05
205	0.04
206	0.03
207	0.03
208	0.02
209	0.02
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.04
216	0.04
217	0.08
218	0.08
219	0.09
220	0.12
221	0.14
222	0.16
223	0.18
224	0.19
225	0.15
226	0.2
227	0.21
228	0.18
229	0.18
230	0.16
231	0.15
232	0.14
233	0.14
234	0.09
235	0.06
236	0.07
237	0.05
238	0.04
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.06
250	0.1
251	0.11
252	0.12
253	0.14
254	0.16
255	0.17
256	0.2
257	0.24
258	0.3
259	0.31
260	0.31
261	0.33
262	0.32
263	0.32
264	0.29
265	0.25
266	0.17
267	0.16
268	0.17
269	0.16
270	0.16
271	0.17
272	0.16
273	0.14
274	0.15
275	0.14
276	0.15
277	0.15
278	0.15
279	0.15
280	0.16
281	0.15
282	0.14
283	0.13
284	0.12
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.04
295	0.04
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.07
305	0.08
306	0.12
307	0.15
308	0.19
309	0.2
310	0.22
311	0.21
312	0.21
313	0.23
314	0.19
315	0.2
316	0.17
317	0.17
318	0.15
319	0.16
320	0.15
321	0.13
322	0.14
323	0.11
324	0.1
325	0.09
326	0.1
327	0.09
328	0.1
329	0.11
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.11
334	0.1
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.1
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.07
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.13
352	0.16
353	0.19
354	0.26
355	0.31
356	0.33
357	0.4
358	0.45
359	0.48
360	0.53
361	0.59
362	0.61
363	0.59
364	0.59
365	0.57
366	0.52
367	0.45
368	0.38
369	0.35
370	0.27
371	0.24
372	0.22
373	0.19
374	0.19
375	0.17
376	0.16
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.1
382	0.09
383	0.08
384	0.09
385	0.09
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.08
396	0.1
397	0.11
398	0.17
399	0.2
400	0.22
401	0.27
402	0.28
403	0.27
404	0.28
405	0.31
406	0.31
407	0.29
408	0.34
409	0.31
410	0.34
411	0.33
412	0.31
413	0.26
414	0.21
415	0.19
416	0.11
417	0.09
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.02
426	0.03
427	0.03
428	0.05
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.11
437	0.1
438	0.1
439	0.1
440	0.09
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.07
451	0.06
452	0.07
453	0.08
454	0.08
455	0.1
456	0.11
457	0.1
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.16
463	0.21
464	0.29
465	0.38
466	0.43
467	0.5
468	0.6
469	0.69
470	0.75
471	0.8
472	0.82
473	0.85
474	0.9
475	0.94
476	0.95
477	0.95
478	0.95
479	0.95
480	0.95
481	0.96
482	0.96
483	0.96

C0NB42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer