FuNGI

A0A1J5X8Q8

Protein Details

Accession

A0A1J5X8Q8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
162-191	GFLHIRSESKRKHDKKQKKKIETLNPCFVL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
169-181	ESKRKHDKKQKKK

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto 7.5, cyto_nucl 7, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

MEAMSRKKIISKITFGVLSTEQILNMSETEIFCRDLYNKETHSPMENGCLDRRLGVSDRLGKCTSCGKGVMDCPGHFGHIKLSRPVFHIGFFRKTLDILQSVCKQCGSILLSEETKIALVGKMKRRLDKKTAEKIAGYVKKEQRCFSCHYPNGLVKKGEGLGFLHIRSESKRKHDKKQKKKIETLNPCFVLNLFQKIKDIDIRLLGMDPAISRPESLVITHLPVPPACIRPSVQLMSGDGTNEDDLTIKLADIVFANTVLKNAALRGENTKYFLDDWEFLQTQCCLYINSNLPGVQSALKAKVDKGAGIIQRLSGKRGRFRGNLSGKRADFTSRTVISPDPNLRIGEVGVPFHVAKILTYPEKVTETNCEKMRRLVENGIDVHPGANYIQKKNGVKIYLKYGKKNIIAGKLEAGDVVERHLQTGDIVLFNRQPSLHRMSIMAHRAVVLPHNTFRFNPCECSPFNADFDGDEMNIHFPQTVGAMAEAKTLLGTTKNIISPRSGQVVISPLQDIITAVYLLTSKDVFYTREEFGCVCGMFSDGKRHAVYPRAAVVSPKELWTGKQVIGALLRLGAGPVPVFLETRTRSFGSCNKDIFHPIEGYFVMHGGDIMQGRLDKTIVGGDAKETSMVYHLEKEMGGEYAAECLSRLARLAARWLSEIGFSVGIEDVMSTEKMKHWKGEMIKEGYRKCEGLALDTADGNEGEIRQTLNKIREDMGRLCVEQLARTNPLNIMQECGSKGSKINIAQMVGCVGQQVFGGERVRGGYTRKTLSQFPDTSSPSSCGFVRNSFYDGLTPTEFFFHAVSGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKVLEDFCVQYDGTVRDSEGTLVQYRYGEDGTDPMETEYKSHPINFATMEKKIARIQGSPLTKTQKSRTVQNTKEKYNECFFTRLSEWASKSELNTGQLRAALETADRKYDRSRSEPGTPCGAIAGQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITQGVPRLKEIINGVRNISTPITVLETHAGTLEEARRLKGVVGVVYLRDILHSMTTELNAQCCEILLSFNTATIEHRRLSLSLASIKNTLLTKRFKLKKENIEIVDERGLKGLRIRPDVQEGENILAVMNNIARQLPDVRISRAGDVKKTAISEKEGDTDCLVLFVEGGRLSTMSTLLGVRPETIKSNDVLAVEEVFGVEAARETIIKEITTTMNSHGISVDPRHVMLLADTMTQKGNVLGITRFGIAKMKESVLMLSSFEKTAEHLFSAGIGAKTDNLLGVSESVIVGKPGKIGTGLFSVLSQPSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.44
3	0.43
4	0.35
5	0.29
6	0.26
7	0.23
8	0.18
9	0.17
10	0.18
11	0.14
12	0.13
13	0.13
14	0.12
15	0.12
16	0.15
17	0.16
18	0.17
19	0.16
20	0.19
21	0.2
22	0.23
23	0.27
24	0.31
25	0.33
26	0.35
27	0.39
28	0.38
29	0.41
30	0.39
31	0.36
32	0.36
33	0.37
34	0.36
35	0.36
36	0.36
37	0.31
38	0.3
39	0.29
40	0.26
41	0.26
42	0.27
43	0.32
44	0.39
45	0.41
46	0.45
47	0.46
48	0.41
49	0.4
50	0.43
51	0.38
52	0.32
53	0.31
54	0.28
55	0.32
56	0.35
57	0.41
58	0.39
59	0.36
60	0.37
61	0.35
62	0.36
63	0.3
64	0.28
65	0.28
66	0.3
67	0.34
68	0.36
69	0.4
70	0.4
71	0.43
72	0.48
73	0.4
74	0.37
75	0.42
76	0.4
77	0.42
78	0.4
79	0.39
80	0.34
81	0.34
82	0.33
83	0.3
84	0.27
85	0.24
86	0.29
87	0.35
88	0.37
89	0.37
90	0.34
91	0.3
92	0.27
93	0.31
94	0.27
95	0.21
96	0.21
97	0.24
98	0.25
99	0.25
100	0.25
101	0.19
102	0.16
103	0.14
104	0.12
105	0.1
106	0.16
107	0.24
108	0.32
109	0.41
110	0.47
111	0.55
112	0.61
113	0.67
114	0.7
115	0.73
116	0.74
117	0.76
118	0.78
119	0.74
120	0.68
121	0.63
122	0.63
123	0.59
124	0.52
125	0.51
126	0.51
127	0.55
128	0.59
129	0.61
130	0.56
131	0.54
132	0.59
133	0.58
134	0.61
135	0.58
136	0.6
137	0.62
138	0.63
139	0.64
140	0.62
141	0.55
142	0.44
143	0.43
144	0.39
145	0.33
146	0.27
147	0.22
148	0.22
149	0.23
150	0.23
151	0.21
152	0.19
153	0.2
154	0.23
155	0.31
156	0.32
157	0.4
158	0.51
159	0.56
160	0.67
161	0.76
162	0.83
163	0.85
164	0.9
165	0.91
166	0.9
167	0.93
168	0.92
169	0.92
170	0.92
171	0.89
172	0.87
173	0.78
174	0.68
175	0.58
176	0.48
177	0.43
178	0.35
179	0.35
180	0.27
181	0.26
182	0.28
183	0.29
184	0.31
185	0.3
186	0.3
187	0.24
188	0.24
189	0.25
190	0.23
191	0.23
192	0.2
193	0.14
194	0.12
195	0.1
196	0.09
197	0.11
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.13
205	0.13
206	0.15
207	0.19
208	0.2
209	0.2
210	0.19
211	0.23
212	0.24
213	0.26
214	0.24
215	0.24
216	0.23
217	0.26
218	0.31
219	0.29
220	0.27
221	0.25
222	0.25
223	0.24
224	0.23
225	0.19
226	0.14
227	0.14
228	0.12
229	0.1
230	0.09
231	0.08
232	0.07
233	0.09
234	0.09
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.09
239	0.08
240	0.1
241	0.08
242	0.08
243	0.1
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.11
251	0.11
252	0.13
253	0.19
254	0.23
255	0.24
256	0.27
257	0.27
258	0.24
259	0.24
260	0.24
261	0.22
262	0.19
263	0.18
264	0.22
265	0.22
266	0.21
267	0.22
268	0.2
269	0.17
270	0.16
271	0.16
272	0.11
273	0.12
274	0.19
275	0.21
276	0.23
277	0.24
278	0.23
279	0.23
280	0.22
281	0.22
282	0.17
283	0.14
284	0.15
285	0.16
286	0.18
287	0.19
288	0.19
289	0.23
290	0.22
291	0.2
292	0.2
293	0.23
294	0.23
295	0.24
296	0.24
297	0.21
298	0.27
299	0.27
300	0.29
301	0.27
302	0.3
303	0.35
304	0.42
305	0.47
306	0.45
307	0.49
308	0.56
309	0.62
310	0.65
311	0.64
312	0.65
313	0.58
314	0.55
315	0.51
316	0.44
317	0.35
318	0.31
319	0.32
320	0.25
321	0.25
322	0.26
323	0.26
324	0.25
325	0.3
326	0.3
327	0.26
328	0.26
329	0.26
330	0.24
331	0.23
332	0.21
333	0.19
334	0.16
335	0.13
336	0.11
337	0.13
338	0.12
339	0.12
340	0.13
341	0.09
342	0.08
343	0.1
344	0.13
345	0.14
346	0.15
347	0.15
348	0.16
349	0.19
350	0.19
351	0.18
352	0.23
353	0.26
354	0.32
355	0.36
356	0.38
357	0.37
358	0.41
359	0.46
360	0.41
361	0.41
362	0.39
363	0.36
364	0.37
365	0.38
366	0.34
367	0.29
368	0.25
369	0.21
370	0.16
371	0.14
372	0.09
373	0.12
374	0.15
375	0.16
376	0.2
377	0.27
378	0.28
379	0.32
380	0.36
381	0.35
382	0.35
383	0.36
384	0.41
385	0.44
386	0.46
387	0.47
388	0.47
389	0.5
390	0.48
391	0.51
392	0.46
393	0.45
394	0.43
395	0.39
396	0.36
397	0.3
398	0.28
399	0.22
400	0.18
401	0.11
402	0.09
403	0.1
404	0.11
405	0.1
406	0.1
407	0.1
408	0.1
409	0.09
410	0.11
411	0.1
412	0.08
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.12
417	0.13
418	0.12
419	0.12
420	0.16
421	0.22
422	0.22
423	0.21
424	0.22
425	0.23
426	0.29
427	0.32
428	0.27
429	0.2
430	0.2
431	0.19
432	0.19
433	0.2
434	0.16
435	0.14
436	0.17
437	0.18
438	0.19
439	0.19
440	0.22
441	0.24
442	0.23
443	0.26
444	0.24
445	0.26
446	0.25
447	0.3
448	0.31
449	0.28
450	0.28
451	0.23
452	0.22
453	0.18
454	0.19
455	0.15
456	0.1
457	0.08
458	0.07
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.07
463	0.06
464	0.06
465	0.07
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.07
473	0.06
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.06
479	0.07
480	0.09
481	0.12
482	0.14
483	0.14
484	0.16
485	0.18
486	0.2
487	0.23
488	0.2
489	0.18
490	0.18
491	0.2
492	0.19
493	0.17
494	0.14
495	0.1
496	0.1
497	0.1
498	0.09
499	0.06
500	0.06
501	0.05
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.06
507	0.05
508	0.05
509	0.06
510	0.08
511	0.09
512	0.11
513	0.15
514	0.15
515	0.16
516	0.16
517	0.15
518	0.15
519	0.16
520	0.13
521	0.09
522	0.08
523	0.09
524	0.09
525	0.1
526	0.15
527	0.14
528	0.18
529	0.18
530	0.2
531	0.21
532	0.25
533	0.26
534	0.22
535	0.23
536	0.22
537	0.21
538	0.21
539	0.21
540	0.19
541	0.18
542	0.17
543	0.16
544	0.14
545	0.15
546	0.18
547	0.19
548	0.15
549	0.17
550	0.16
551	0.15
552	0.16
553	0.15
554	0.11
555	0.08
556	0.08
557	0.05
558	0.05
559	0.04
560	0.04
561	0.03
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.05
566	0.05
567	0.1
568	0.11
569	0.13
570	0.16
571	0.16
572	0.16
573	0.19
574	0.24
575	0.26
576	0.29
577	0.29
578	0.27
579	0.28
580	0.3
581	0.29
582	0.25
583	0.19
584	0.15
585	0.15
586	0.14
587	0.13
588	0.1
589	0.09
590	0.07
591	0.05
592	0.05
593	0.04
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.06
599	0.06
600	0.07
601	0.06
602	0.05
603	0.05
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.05
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.05
614	0.06
615	0.07
616	0.07
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.08
621	0.09
622	0.08
623	0.07
624	0.06
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.04
631	0.04
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.06
637	0.07
638	0.1
639	0.11
640	0.12
641	0.13
642	0.13
643	0.12
644	0.11
645	0.11
646	0.08
647	0.07
648	0.06
649	0.06
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.04
654	0.03
655	0.04
656	0.05
657	0.04
658	0.05
659	0.08
660	0.13
661	0.14
662	0.15
663	0.16
664	0.21
665	0.24
666	0.3
667	0.33
668	0.33
669	0.36
670	0.4
671	0.4
672	0.38
673	0.35
674	0.29
675	0.24
676	0.22
677	0.19
678	0.16
679	0.16
680	0.14
681	0.14
682	0.13
683	0.13
684	0.1
685	0.09
686	0.07
687	0.06
688	0.04
689	0.04
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.08
694	0.12
695	0.16
696	0.17
697	0.19
698	0.2
699	0.22
700	0.26
701	0.26
702	0.26
703	0.22
704	0.21
705	0.2
706	0.2
707	0.17
708	0.14
709	0.15
710	0.13
711	0.15
712	0.15
713	0.16
714	0.14
715	0.17
716	0.2
717	0.17
718	0.17
719	0.15
720	0.16
721	0.16
722	0.18
723	0.15
724	0.12
725	0.13
726	0.13
727	0.16
728	0.16
729	0.2
730	0.19
731	0.19
732	0.19
733	0.18
734	0.16
735	0.12
736	0.11
737	0.07
738	0.05
739	0.05
740	0.05
741	0.05
742	0.05
743	0.07
744	0.09
745	0.08
746	0.09
747	0.09
748	0.1
749	0.11
750	0.13
751	0.15
752	0.18
753	0.21
754	0.24
755	0.25
756	0.28
757	0.31
758	0.36
759	0.32
760	0.31
761	0.35
762	0.34
763	0.33
764	0.31
765	0.29
766	0.22
767	0.23
768	0.2
769	0.17
770	0.17
771	0.18
772	0.2
773	0.19
774	0.2
775	0.19
776	0.19
777	0.17
778	0.16
779	0.16
780	0.14
781	0.13
782	0.11
783	0.12
784	0.12
785	0.12
786	0.11
787	0.08
788	0.09
789	0.1
790	0.1
791	0.1
792	0.1
793	0.09
794	0.09
795	0.08
796	0.08
797	0.07
798	0.06
799	0.06
800	0.06
801	0.06
802	0.06
803	0.06
804	0.07
805	0.07
806	0.1
807	0.13
808	0.19
809	0.2
810	0.23
811	0.23
812	0.24
813	0.24
814	0.24
815	0.24
816	0.21
817	0.22
818	0.2
819	0.2
820	0.18
821	0.19
822	0.16
823	0.12
824	0.13
825	0.12
826	0.12
827	0.12
828	0.11
829	0.11
830	0.11
831	0.12
832	0.1
833	0.1
834	0.11
835	0.11
836	0.12
837	0.11
838	0.12
839	0.12
840	0.11
841	0.1
842	0.08
843	0.09
844	0.09
845	0.09
846	0.09
847	0.08
848	0.1
849	0.1
850	0.12
851	0.13
852	0.15
853	0.15
854	0.16
855	0.17
856	0.16
857	0.17
858	0.17
859	0.2
860	0.2
861	0.2
862	0.24
863	0.22
864	0.24
865	0.25
866	0.27
867	0.24
868	0.23
869	0.26
870	0.3
871	0.33
872	0.32
873	0.35
874	0.37
875	0.38
876	0.41
877	0.42
878	0.43
879	0.42
880	0.49
881	0.54
882	0.58
883	0.63
884	0.69
885	0.71
886	0.67
887	0.72
888	0.66
889	0.61
890	0.56
891	0.51
892	0.43
893	0.39
894	0.35
895	0.32
896	0.31
897	0.29
898	0.27
899	0.28
900	0.27
901	0.26
902	0.29
903	0.25
904	0.24
905	0.27
906	0.26
907	0.24
908	0.25
909	0.24
910	0.22
911	0.23
912	0.22
913	0.17
914	0.15
915	0.12
916	0.11
917	0.14
918	0.14
919	0.19
920	0.19
921	0.2
922	0.25
923	0.31
924	0.35
925	0.36
926	0.41
927	0.41
928	0.5
929	0.55
930	0.53
931	0.52
932	0.47
933	0.41
934	0.35
935	0.3
936	0.21
937	0.15
938	0.12
939	0.07
940	0.07
941	0.07
942	0.06
943	0.06
944	0.05
945	0.05
946	0.06
947	0.07
948	0.07
949	0.08
950	0.11
951	0.11
952	0.13
953	0.13
954	0.12
955	0.12
956	0.12
957	0.12
958	0.1
959	0.1
960	0.09
961	0.09
962	0.09
963	0.09
964	0.09
965	0.07
966	0.1
967	0.13
968	0.13
969	0.13
970	0.17
971	0.17
972	0.2
973	0.24
974	0.3
975	0.3
976	0.31
977	0.31
978	0.29
979	0.29
980	0.29
981	0.25
982	0.16
983	0.12
984	0.12
985	0.13
986	0.12
987	0.13
988	0.13
989	0.12
990	0.12
991	0.12
992	0.12
993	0.09
994	0.12
995	0.13
996	0.17
997	0.18
998	0.18
999	0.18
1000	0.18
1001	0.19
1002	0.19
1003	0.18
1004	0.13
1005	0.15
1006	0.15
1007	0.15
1008	0.15
1009	0.15
1010	0.11
1011	0.1
1012	0.09
1013	0.08
1014	0.08
1015	0.08
1016	0.09
1017	0.1
1018	0.1
1019	0.15
1020	0.15
1021	0.15
1022	0.15
1023	0.14
1024	0.13
1025	0.12
1026	0.12
1027	0.08
1028	0.09
1029	0.08
1030	0.12
1031	0.11
1032	0.13
1033	0.13
1034	0.13
1035	0.15
1036	0.2
1037	0.22
1038	0.19
1039	0.21
1040	0.21
1041	0.21
1042	0.23
1043	0.23
1044	0.21
1045	0.26
1046	0.27
1047	0.27
1048	0.27
1049	0.26
1050	0.27
1051	0.27
1052	0.26
1053	0.25
1054	0.3
1055	0.34
1056	0.43
1057	0.51
1058	0.54
1059	0.63
1060	0.69
1061	0.73
1062	0.77
1063	0.79
1064	0.71
1065	0.71
1066	0.66
1067	0.59
1068	0.56
1069	0.46
1070	0.36
1071	0.31
1072	0.29
1073	0.22
1074	0.26
1075	0.28
1076	0.29
1077	0.34
1078	0.36
1079	0.36
1080	0.43
1081	0.46
1082	0.41
1083	0.4
1084	0.35
1085	0.3
1086	0.28
1087	0.25
1088	0.17
1089	0.14
1090	0.13
1091	0.09
1092	0.09
1093	0.07
1094	0.08
1095	0.08
1096	0.08
1097	0.1
1098	0.13
1099	0.15
1100	0.21
1101	0.23
1102	0.26
1103	0.31
1104	0.32
1105	0.34
1106	0.39
1107	0.39
1108	0.36
1109	0.37
1110	0.36
1111	0.33
1112	0.34
1113	0.33
1114	0.29
1115	0.31
1116	0.3
1117	0.29
1118	0.33
1119	0.32
1120	0.31
1121	0.28
1122	0.26
1123	0.22
1124	0.19
1125	0.16
1126	0.1
1127	0.08
1128	0.07
1129	0.09
1130	0.08
1131	0.08
1132	0.08
1133	0.08
1134	0.08
1135	0.09
1136	0.09
1137	0.07
1138	0.08
1139	0.08
1140	0.09
1141	0.11
1142	0.12
1143	0.13
1144	0.14
1145	0.16
1146	0.2
1147	0.22
1148	0.23
1149	0.21
1150	0.24
1151	0.24
1152	0.23
1153	0.23
1154	0.19
1155	0.17
1156	0.15
1157	0.14
1158	0.11
1159	0.09
1160	0.08
1161	0.06
1162	0.05
1163	0.05
1164	0.05
1165	0.06
1166	0.06
1167	0.07
1168	0.1
1169	0.11
1170	0.11
1171	0.12
1172	0.14
1173	0.16
1174	0.18
1175	0.19
1176	0.18
1177	0.23
1178	0.23
1179	0.23
1180	0.21
1181	0.2
1182	0.21
1183	0.23
1184	0.25
1185	0.2
1186	0.21
1187	0.21
1188	0.21
1189	0.19
1190	0.16
1191	0.17
1192	0.13
1193	0.15
1194	0.15
1195	0.15
1196	0.16
1197	0.16
1198	0.15
1199	0.12
1200	0.13
1201	0.11
1202	0.13
1203	0.13
1204	0.14
1205	0.16
1206	0.17
1207	0.16
1208	0.15
1209	0.21
1210	0.19
1211	0.23
1212	0.24
1213	0.24
1214	0.24
1215	0.25
1216	0.25
1217	0.21
1218	0.21
1219	0.18
1220	0.17
1221	0.18
1222	0.16
1223	0.16
1224	0.15
1225	0.15
1226	0.18
1227	0.19
1228	0.17
1229	0.16
1230	0.15
1231	0.15
1232	0.17
1233	0.19
1234	0.15
1235	0.13
1236	0.12
1237	0.13
1238	0.13
1239	0.13
1240	0.12
1241	0.09
1242	0.09
1243	0.09
1244	0.1
1245	0.09
1246	0.09
1247	0.09
1248	0.09
1249	0.09
1250	0.1
1251	0.11
1252	0.11
1253	0.13
1254	0.13
1255	0.14
1256	0.14
1257	0.14
1258	0.16
1259	0.18
1260	0.18
1261	0.16
1262	0.16
1263	0.17

A0A1J5X8Q8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer