Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J5WKK4

Protein Details
Accession A0A1J5WKK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-69AGADRKKKEASPRKSLKRRLSELCFGHydrophilic
338-357TTETRETKKRMKTAEKVDGYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-62RRAGADRKKKEASPRKSLKRR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, pero 3, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MRFGDLFAKDGPVLSPLDGSLGMAVRYLDDNLEQFYVGREQRRAGADRKKKEASPRKSLKRRLSELCFGSLHQPRDGSSESFSKENVPGSIGLSRLKEIPSVITIRIYQGFVAFWDFQLFLPINVPIVADILTAINERRIPVYLGMLLNDLGFSFYYDGSIVVSILDCRTRVRKHKALLRPSSASISCNMHSLVFSELSSEVFSEFEKNVVLRTEEPLFLEPNINAMLLLNYFYYDSQKDVLFSEKFVSEVCSDAMGKSDVIKNLGGEDTLAVKLKRIRGREGEQHAVSEFRVWKKTELLAVSREGFELIFEVVVHIVEHCQDCFEIILKERSVWGETTETRETKKRMKTAEKVDGYLKQLYKSLKEQYRNIVFVGQRERA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.1
4 0.12
5 0.11
6 0.11
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.13
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.13
23 0.19
24 0.21
25 0.26
26 0.26
27 0.27
28 0.33
29 0.38
30 0.41
31 0.43
32 0.5
33 0.55
34 0.61
35 0.67
36 0.67
37 0.66
38 0.72
39 0.74
40 0.72
41 0.73
42 0.76
43 0.79
44 0.84
45 0.89
46 0.88
47 0.88
48 0.87
49 0.84
50 0.81
51 0.78
52 0.7
53 0.65
54 0.55
55 0.46
56 0.46
57 0.44
58 0.39
59 0.32
60 0.3
61 0.27
62 0.31
63 0.33
64 0.26
65 0.23
66 0.25
67 0.26
68 0.26
69 0.25
70 0.24
71 0.23
72 0.23
73 0.2
74 0.17
75 0.15
76 0.16
77 0.18
78 0.16
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.18
94 0.17
95 0.14
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.13
100 0.11
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.14
106 0.14
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.07
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.13
157 0.19
158 0.28
159 0.36
160 0.42
161 0.47
162 0.56
163 0.63
164 0.67
165 0.67
166 0.64
167 0.57
168 0.52
169 0.49
170 0.4
171 0.32
172 0.25
173 0.21
174 0.17
175 0.15
176 0.14
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.16
229 0.14
230 0.14
231 0.15
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.15
236 0.1
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.09
245 0.11
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.15
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.12
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.11
259 0.1
260 0.12
261 0.16
262 0.24
263 0.29
264 0.3
265 0.36
266 0.41
267 0.48
268 0.54
269 0.58
270 0.58
271 0.53
272 0.5
273 0.44
274 0.38
275 0.31
276 0.27
277 0.25
278 0.22
279 0.26
280 0.26
281 0.28
282 0.31
283 0.33
284 0.33
285 0.32
286 0.31
287 0.29
288 0.3
289 0.3
290 0.27
291 0.24
292 0.2
293 0.16
294 0.13
295 0.11
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.13
313 0.13
314 0.15
315 0.2
316 0.2
317 0.21
318 0.22
319 0.23
320 0.23
321 0.21
322 0.2
323 0.21
324 0.22
325 0.28
326 0.33
327 0.33
328 0.35
329 0.42
330 0.45
331 0.48
332 0.55
333 0.56
334 0.6
335 0.68
336 0.73
337 0.76
338 0.81
339 0.76
340 0.7
341 0.67
342 0.62
343 0.56
344 0.54
345 0.46
346 0.37
347 0.38
348 0.39
349 0.39
350 0.41
351 0.47
352 0.48
353 0.54
354 0.58
355 0.63
356 0.67
357 0.63
358 0.58
359 0.55
360 0.48
361 0.47