Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J5WVY7

Protein Details
Accession A0A1J5WVY7    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-88LEKARRTEPKTKKINDIFEEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 11, nucl 6.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036860  SH2_dom_sf  
IPR042066  Spt6_death-like  
IPR032706  Spt6_HHH  
IPR028088  Spt6_HTH_DNA-bd_dom  
IPR035420  Spt6_SH2  
IPR035019  Spt6_SH2_N  
IPR023319  Tex-like_HTH_dom_sf  
IPR017072  TF_Spt6  
IPR037027  YqgF/RNaseH-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF14635  HHH_7  
PF14641  HTH_44  
PF14633  SH2_2  
CDD cd09918  SH2_Nterm_SPT6_like  
Amino Acid Sequences MSAGYETFPKRLLSTACQSKSPSNFQPVCQTPQLFIPAAPRNMGSNEDRDALEQEDRELIEENKLQEELEKARRTEPKTKKINDIFEEKQEADANDETDEYETAPQYGDLFAEIFGDGTEYQETFEETDEAQEELERKQERRLPEYPIDIEDAGKWIHSRLGEAADLVSVFNAVSLMKEDVLEVPFIEQHRKEHVPGLSLQTLWDIYDLCEKYTTLVERREKLAKKENIDCGEIESETELYDAIAHHSQKRVSWGGSITPEQLYENICQKSRLHAPSCPDQPPGKASAAAKSIAAYPPIRKLARRYLAPTARLRITETDTGRVFEKQLDETGGLEYLSLQNDRKRTQKIFLDEAPLTGLLSAFYTGDPSPTIKEAVGVLAGLVEKELHRTRMETASKIVATQTMNRLAEKISDPPHVFRKPEKRIAVLTLDEKGPYCVVMDSLGNVARKYRTEGTAQSMLEGDVAPHRPEFVAVSGRSPQIVDLLAAARRVFGAAVEAEYVDDSVARIVAGREEGPEHTEAYAQSVGRYLLNPLHETAKCGSDILRLQIHPRQAEISPDLLRKYTGRAFINAVNAAGLDPNRAVLPGGASSCLQYVCGLGPSSASHLEKSLRKEQLLSRKELGGRLGTHAALQAAGTLVLDTETVRDPEKKGAVHILDTLRIHPEDYPLVEEIAQRTVQTNTAVLCCVSEMLQAQKEKLAVFPFEEFADEIEQRNGQKKRATLQKIKTVLLPPAVPPSCRHRLGPEELFNMVSPIPLERLRAGELVNATVAAVLQTRIICSLAENITAVVPCHLTDVPPGTPLSAVFSKGGALRGVPIHVDVEAFTVTLSTRQQDTRLKTAPSRPPASRTCHHPLFKNISRVHAEALLETRQPGECIIRPSSLPDQLAITLKIADGLCWHIPVAEFERPTEYALGKHFYVQKRRCSSVDELARHAALLYQKIAGVKESRKYTQPDTAIPERQLCETKLRRLKSSADHIPYLLTLSAEHPGRILLAVLTKRCFFEYIHPAVDGYLFRGRLFATVQELTNWFKRNTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.47
3 0.47
4 0.5
5 0.53
6 0.55
7 0.57
8 0.59
9 0.56
10 0.56
11 0.56
12 0.55
13 0.62
14 0.59
15 0.58
16 0.57
17 0.51
18 0.42
19 0.43
20 0.45
21 0.36
22 0.32
23 0.34
24 0.35
25 0.36
26 0.36
27 0.32
28 0.3
29 0.31
30 0.34
31 0.29
32 0.26
33 0.27
34 0.28
35 0.28
36 0.27
37 0.27
38 0.26
39 0.26
40 0.22
41 0.21
42 0.21
43 0.21
44 0.2
45 0.21
46 0.19
47 0.2
48 0.23
49 0.24
50 0.23
51 0.23
52 0.22
53 0.21
54 0.24
55 0.26
56 0.32
57 0.36
58 0.36
59 0.43
60 0.51
61 0.57
62 0.63
63 0.66
64 0.67
65 0.72
66 0.75
67 0.79
68 0.79
69 0.81
70 0.76
71 0.73
72 0.67
73 0.63
74 0.63
75 0.53
76 0.47
77 0.41
78 0.36
79 0.32
80 0.3
81 0.25
82 0.2
83 0.19
84 0.17
85 0.15
86 0.15
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.19
123 0.21
124 0.22
125 0.29
126 0.34
127 0.38
128 0.44
129 0.47
130 0.48
131 0.5
132 0.55
133 0.49
134 0.46
135 0.43
136 0.36
137 0.33
138 0.25
139 0.21
140 0.15
141 0.14
142 0.12
143 0.1
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.16
149 0.16
150 0.16
151 0.15
152 0.13
153 0.12
154 0.1
155 0.08
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.1
171 0.09
172 0.12
173 0.13
174 0.19
175 0.18
176 0.2
177 0.27
178 0.3
179 0.3
180 0.34
181 0.35
182 0.32
183 0.33
184 0.37
185 0.31
186 0.28
187 0.27
188 0.22
189 0.2
190 0.17
191 0.15
192 0.09
193 0.08
194 0.17
195 0.17
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.18
200 0.22
201 0.25
202 0.22
203 0.31
204 0.36
205 0.38
206 0.43
207 0.51
208 0.51
209 0.54
210 0.59
211 0.57
212 0.57
213 0.62
214 0.65
215 0.59
216 0.57
217 0.49
218 0.42
219 0.37
220 0.3
221 0.23
222 0.16
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.07
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.12
232 0.14
233 0.17
234 0.2
235 0.21
236 0.22
237 0.28
238 0.28
239 0.25
240 0.26
241 0.25
242 0.25
243 0.28
244 0.28
245 0.24
246 0.21
247 0.2
248 0.18
249 0.18
250 0.16
251 0.15
252 0.21
253 0.22
254 0.22
255 0.24
256 0.24
257 0.29
258 0.35
259 0.4
260 0.37
261 0.38
262 0.42
263 0.49
264 0.54
265 0.5
266 0.46
267 0.4
268 0.39
269 0.38
270 0.36
271 0.29
272 0.27
273 0.25
274 0.25
275 0.25
276 0.24
277 0.21
278 0.18
279 0.19
280 0.16
281 0.18
282 0.16
283 0.15
284 0.2
285 0.27
286 0.28
287 0.28
288 0.33
289 0.41
290 0.46
291 0.48
292 0.47
293 0.5
294 0.54
295 0.58
296 0.56
297 0.5
298 0.46
299 0.42
300 0.4
301 0.33
302 0.32
303 0.32
304 0.3
305 0.3
306 0.28
307 0.29
308 0.28
309 0.26
310 0.22
311 0.18
312 0.18
313 0.15
314 0.15
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.12
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.11
327 0.14
328 0.19
329 0.22
330 0.28
331 0.33
332 0.35
333 0.4
334 0.45
335 0.47
336 0.48
337 0.47
338 0.46
339 0.4
340 0.37
341 0.31
342 0.24
343 0.18
344 0.13
345 0.1
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.07
352 0.06
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.09
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.14
377 0.17
378 0.25
379 0.28
380 0.24
381 0.25
382 0.26
383 0.25
384 0.24
385 0.22
386 0.16
387 0.15
388 0.16
389 0.18
390 0.21
391 0.21
392 0.21
393 0.22
394 0.19
395 0.2
396 0.19
397 0.2
398 0.17
399 0.21
400 0.23
401 0.25
402 0.32
403 0.33
404 0.33
405 0.37
406 0.44
407 0.47
408 0.54
409 0.54
410 0.49
411 0.48
412 0.49
413 0.44
414 0.36
415 0.29
416 0.22
417 0.2
418 0.17
419 0.16
420 0.13
421 0.1
422 0.08
423 0.07
424 0.06
425 0.05
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.07
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.12
436 0.16
437 0.18
438 0.17
439 0.19
440 0.22
441 0.25
442 0.29
443 0.28
444 0.24
445 0.22
446 0.19
447 0.17
448 0.14
449 0.09
450 0.07
451 0.09
452 0.09
453 0.08
454 0.09
455 0.08
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.12
460 0.12
461 0.14
462 0.16
463 0.16
464 0.15
465 0.15
466 0.13
467 0.09
468 0.09
469 0.07
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.05
479 0.04
480 0.05
481 0.04
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.07
502 0.08
503 0.08
504 0.09
505 0.08
506 0.09
507 0.08
508 0.1
509 0.11
510 0.1
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.09
515 0.09
516 0.08
517 0.09
518 0.1
519 0.11
520 0.11
521 0.15
522 0.15
523 0.17
524 0.17
525 0.16
526 0.14
527 0.14
528 0.13
529 0.12
530 0.13
531 0.14
532 0.15
533 0.14
534 0.17
535 0.19
536 0.23
537 0.19
538 0.19
539 0.18
540 0.16
541 0.18
542 0.17
543 0.17
544 0.16
545 0.18
546 0.18
547 0.16
548 0.16
549 0.14
550 0.17
551 0.17
552 0.21
553 0.2
554 0.21
555 0.23
556 0.25
557 0.27
558 0.23
559 0.19
560 0.13
561 0.12
562 0.11
563 0.09
564 0.07
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.04
572 0.05
573 0.06
574 0.06
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.06
587 0.07
588 0.07
589 0.09
590 0.11
591 0.12
592 0.1
593 0.12
594 0.16
595 0.2
596 0.25
597 0.31
598 0.3
599 0.3
600 0.33
601 0.38
602 0.44
603 0.44
604 0.43
605 0.37
606 0.37
607 0.38
608 0.36
609 0.32
610 0.25
611 0.22
612 0.2
613 0.2
614 0.16
615 0.15
616 0.14
617 0.12
618 0.09
619 0.08
620 0.06
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.03
625 0.03
626 0.03
627 0.03
628 0.03
629 0.05
630 0.06
631 0.07
632 0.08
633 0.11
634 0.12
635 0.16
636 0.2
637 0.18
638 0.19
639 0.23
640 0.23
641 0.22
642 0.24
643 0.21
644 0.21
645 0.21
646 0.2
647 0.17
648 0.17
649 0.16
650 0.13
651 0.14
652 0.12
653 0.12
654 0.13
655 0.11
656 0.12
657 0.12
658 0.12
659 0.11
660 0.12
661 0.12
662 0.1
663 0.11
664 0.11
665 0.12
666 0.12
667 0.12
668 0.1
669 0.11
670 0.11
671 0.1
672 0.09
673 0.07
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.07
678 0.09
679 0.14
680 0.15
681 0.15
682 0.16
683 0.17
684 0.16
685 0.18
686 0.17
687 0.13
688 0.14
689 0.15
690 0.14
691 0.13
692 0.14
693 0.11
694 0.1
695 0.12
696 0.11
697 0.11
698 0.12
699 0.14
700 0.14
701 0.23
702 0.24
703 0.25
704 0.29
705 0.3
706 0.37
707 0.45
708 0.52
709 0.53
710 0.58
711 0.63
712 0.64
713 0.62
714 0.58
715 0.51
716 0.45
717 0.38
718 0.31
719 0.23
720 0.28
721 0.28
722 0.25
723 0.25
724 0.3
725 0.35
726 0.36
727 0.36
728 0.32
729 0.37
730 0.44
731 0.49
732 0.45
733 0.4
734 0.39
735 0.39
736 0.33
737 0.28
738 0.21
739 0.14
740 0.09
741 0.08
742 0.1
743 0.1
744 0.12
745 0.12
746 0.14
747 0.15
748 0.16
749 0.16
750 0.16
751 0.15
752 0.14
753 0.13
754 0.11
755 0.09
756 0.08
757 0.07
758 0.05
759 0.05
760 0.04
761 0.06
762 0.06
763 0.07
764 0.08
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.13
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.12
775 0.12
776 0.08
777 0.08
778 0.07
779 0.1
780 0.1
781 0.09
782 0.11
783 0.15
784 0.15
785 0.16
786 0.16
787 0.14
788 0.14
789 0.14
790 0.16
791 0.14
792 0.15
793 0.13
794 0.13
795 0.15
796 0.16
797 0.17
798 0.12
799 0.11
800 0.12
801 0.12
802 0.13
803 0.12
804 0.11
805 0.1
806 0.1
807 0.1
808 0.08
809 0.08
810 0.08
811 0.07
812 0.06
813 0.06
814 0.06
815 0.08
816 0.1
817 0.1
818 0.13
819 0.15
820 0.21
821 0.28
822 0.33
823 0.39
824 0.43
825 0.45
826 0.48
827 0.56
828 0.59
829 0.6
830 0.61
831 0.56
832 0.58
833 0.6
834 0.62
835 0.57
836 0.56
837 0.56
838 0.59
839 0.6
840 0.59
841 0.61
842 0.63
843 0.65
844 0.66
845 0.59
846 0.56
847 0.57
848 0.53
849 0.46
850 0.4
851 0.33
852 0.25
853 0.27
854 0.23
855 0.19
856 0.18
857 0.18
858 0.15
859 0.15
860 0.15
861 0.17
862 0.18
863 0.23
864 0.25
865 0.25
866 0.25
867 0.3
868 0.34
869 0.34
870 0.31
871 0.26
872 0.25
873 0.26
874 0.29
875 0.24
876 0.19
877 0.15
878 0.14
879 0.17
880 0.15
881 0.13
882 0.12
883 0.16
884 0.16
885 0.16
886 0.16
887 0.13
888 0.13
889 0.17
890 0.21
891 0.22
892 0.22
893 0.22
894 0.27
895 0.26
896 0.27
897 0.27
898 0.22
899 0.19
900 0.22
901 0.25
902 0.21
903 0.26
904 0.32
905 0.37
906 0.47
907 0.51
908 0.58
909 0.61
910 0.66
911 0.62
912 0.61
913 0.59
914 0.59
915 0.61
916 0.54
917 0.51
918 0.49
919 0.47
920 0.41
921 0.35
922 0.27
923 0.21
924 0.2
925 0.18
926 0.16
927 0.17
928 0.19
929 0.19
930 0.2
931 0.23
932 0.26
933 0.32
934 0.38
935 0.4
936 0.44
937 0.5
938 0.52
939 0.54
940 0.53
941 0.51
942 0.53
943 0.57
944 0.56
945 0.53
946 0.53
947 0.46
948 0.46
949 0.45
950 0.39
951 0.42
952 0.43
953 0.5
954 0.54
955 0.57
956 0.58
957 0.58
958 0.63
959 0.61
960 0.64
961 0.63
962 0.6
963 0.58
964 0.53
965 0.49
966 0.42
967 0.36
968 0.27
969 0.17
970 0.12
971 0.12
972 0.18
973 0.17
974 0.17
975 0.15
976 0.15
977 0.15
978 0.14
979 0.13
980 0.09
981 0.15
982 0.2
983 0.23
984 0.26
985 0.28
986 0.29
987 0.3
988 0.3
989 0.25
990 0.3
991 0.35
992 0.38
993 0.39
994 0.37
995 0.36
996 0.35
997 0.35
998 0.26
999 0.21
1000 0.21
1001 0.19
1002 0.19
1003 0.2
1004 0.2
1005 0.2
1006 0.21
1007 0.19
1008 0.2
1009 0.22
1010 0.23
1011 0.25
1012 0.27
1013 0.3
1014 0.34
1015 0.36