Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0NAG6

Protein Details
Accession C0NAG6    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-38TEEFRRVKKKSTKSTQAPGSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, extr 5, cyto_nucl 4, nucl 3.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
Amino Acid Sequences MAANKQGKMHMNLVLADTEEFRRVKKKSTKSTQAPGSSTPTLVEAEEKRTLGLTILRGTQVVSCSVDGPPPADPAARLGTTVPGASGASAATLAAGPGISRPAGRGLPVGLGGPAAGVGGPPPPGGFGAFPPPGFPGAMPPGFPGRGGPPGGPAGFAPPPPGFAPGATGGPGGPPGFPQPPGFQPPPGQGRGFPPPGFGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.23
3 0.19
4 0.18
5 0.15
6 0.17
7 0.17
8 0.18
9 0.25
10 0.26
11 0.36
12 0.44
13 0.53
14 0.59
15 0.69
16 0.77
17 0.78
18 0.85
19 0.84
20 0.8
21 0.72
22 0.64
23 0.6
24 0.5
25 0.42
26 0.33
27 0.26
28 0.21
29 0.18
30 0.2
31 0.15
32 0.19
33 0.21
34 0.2
35 0.19
36 0.19
37 0.19
38 0.15
39 0.16
40 0.14
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.11
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.08
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.02
82 0.02
83 0.02
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.04
88 0.04
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.02
104 0.02
105 0.02
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.11
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.15
132 0.13
133 0.16
134 0.17
135 0.16
136 0.16
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.15
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.17
145 0.14
146 0.17
147 0.17
148 0.2
149 0.16
150 0.14
151 0.17
152 0.15
153 0.16
154 0.14
155 0.13
156 0.11
157 0.11
158 0.13
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.13
163 0.15
164 0.17
165 0.2
166 0.22
167 0.27
168 0.35
169 0.36
170 0.35
171 0.37
172 0.43
173 0.46
174 0.46
175 0.42
176 0.37
177 0.41
178 0.46
179 0.48
180 0.4
181 0.36