FuNGI

A0A1J5X239

Protein Details

Accession

A0A1J5X239

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-106	LDPKTQAYRPRKNKLNTIMF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 18, nucl 4, pero 3, mito_nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003593 AAA+_ATPase IPR027417 P-loop_NTPase IPR036891 Signal_recog_part_SRP54_M_sf IPR013822 Signal_recog_particl_SRP54_hlx IPR004125 Signal_recog_particle_SRP54_M IPR036225 SRP/SRP_N IPR022941 SRP54 IPR000897 SRP54_GTPase_dom IPR042101 SRP54_N_sf
Gene Ontology	GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF00448 SRP54 PF02881 SRP54_N PF02978 SRP_SPB
PROSITE	View protein in PROSITE PS00300 SRP54
CDD	cd17875 SRP54_G

Amino Acid Sequences

MVLGQIGEKIARSLEGLTFQTKVNEKELDEALRVISRSLLQADINIRTVARIREKVRKRVTASDLPESANRKKIATKAVFEELVDMLDPKTQAYRPRKNKLNTIMFVGLQGAGKTTSCSKLANYYRRRGWKTGLVCADTFRPGAHAQLKQNAEKTKTPFFGQENADDECEIARKGVEHFRESKYEIVIVDTSGRNRQEENLFANISRLEKETRPDHVILLMDATTGQAASDQAAAFAGAVEVGSIFLTKTDTNAKCGGALSGIAATGCPISFLGTGEHMNDIEHFSPRQFVSAMLGGFSVEQLAEKVAAIEQEDKEQMEEMLKRNRMIFRDLQVQLKVIDEIGAMKNILSMLPQNMRSSAVKELETMEKYSRLFCVLFSSMTKKEMGMDAKEFTKEGGRVARVSVGTGIPPAEIAEMMAFCRKFSAMLKKIASSGMLKHGAGGVSPDALMKQLGGRL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.17
3	0.19
4	0.2
5	0.21
6	0.21
7	0.26
8	0.29
9	0.3
10	0.3
11	0.31
12	0.3
13	0.34
14	0.37
15	0.34
16	0.3
17	0.28
18	0.25
19	0.24
20	0.23
21	0.18
22	0.16
23	0.15
24	0.16
25	0.17
26	0.17
27	0.14
28	0.18
29	0.22
30	0.23
31	0.23
32	0.22
33	0.2
34	0.2
35	0.23
36	0.26
37	0.3
38	0.35
39	0.39
40	0.49
41	0.58
42	0.67
43	0.72
44	0.74
45	0.72
46	0.74
47	0.76
48	0.74
49	0.71
50	0.68
51	0.61
52	0.54
53	0.53
54	0.5
55	0.46
56	0.44
57	0.4
58	0.35
59	0.37
60	0.41
61	0.46
62	0.46
63	0.46
64	0.44
65	0.47
66	0.46
67	0.41
68	0.38
69	0.27
70	0.22
71	0.18
72	0.13
73	0.09
74	0.1
75	0.1
76	0.09
77	0.12
78	0.15
79	0.24
80	0.34
81	0.44
82	0.52
83	0.62
84	0.71
85	0.73
86	0.8
87	0.8
88	0.8
89	0.7
90	0.67
91	0.59
92	0.49
93	0.44
94	0.35
95	0.26
96	0.17
97	0.15
98	0.1
99	0.08
100	0.08
101	0.09
102	0.11
103	0.13
104	0.14
105	0.15
106	0.15
107	0.24
108	0.33
109	0.42
110	0.47
111	0.52
112	0.58
113	0.67
114	0.71
115	0.65
116	0.61
117	0.6
118	0.56
119	0.56
120	0.53
121	0.46
122	0.41
123	0.39
124	0.36
125	0.29
126	0.25
127	0.17
128	0.15
129	0.13
130	0.17
131	0.22
132	0.25
133	0.26
134	0.33
135	0.37
136	0.36
137	0.42
138	0.41
139	0.4
140	0.4
141	0.42
142	0.41
143	0.4
144	0.38
145	0.38
146	0.36
147	0.38
148	0.35
149	0.33
150	0.3
151	0.29
152	0.28
153	0.23
154	0.2
155	0.14
156	0.13
157	0.1
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.09
162	0.15
163	0.17
164	0.2
165	0.24
166	0.26
167	0.29
168	0.3
169	0.29
170	0.24
171	0.23
172	0.19
173	0.17
174	0.14
175	0.12
176	0.13
177	0.12
178	0.13
179	0.15
180	0.16
181	0.15
182	0.15
183	0.19
184	0.18
185	0.2
186	0.22
187	0.2
188	0.2
189	0.19
190	0.2
191	0.17
192	0.15
193	0.13
194	0.12
195	0.12
196	0.13
197	0.17
198	0.19
199	0.22
200	0.25
201	0.24
202	0.23
203	0.22
204	0.21
205	0.16
206	0.14
207	0.1
208	0.07
209	0.06
210	0.05
211	0.04
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.03
225	0.02
226	0.02
227	0.02
228	0.02
229	0.02
230	0.02
231	0.02
232	0.02
233	0.03
234	0.04
235	0.04
236	0.06
237	0.15
238	0.15
239	0.18
240	0.2
241	0.2
242	0.19
243	0.2
244	0.18
245	0.1
246	0.09
247	0.07
248	0.05
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.05
258	0.05
259	0.06
260	0.07
261	0.08
262	0.09
263	0.09
264	0.1
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.1
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.13
274	0.13
275	0.13
276	0.11
277	0.11
278	0.12
279	0.14
280	0.14
281	0.11
282	0.11
283	0.1
284	0.09
285	0.09
286	0.06
287	0.03
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.07
297	0.1
298	0.1
299	0.12
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.13
304	0.12
305	0.12
306	0.15
307	0.18
308	0.25
309	0.27
310	0.28
311	0.32
312	0.36
313	0.34
314	0.36
315	0.36
316	0.32
317	0.4
318	0.41
319	0.4
320	0.37
321	0.36
322	0.31
323	0.27
324	0.23
325	0.14
326	0.12
327	0.08
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.07
337	0.08
338	0.11
339	0.16
340	0.18
341	0.18
342	0.19
343	0.22
344	0.23
345	0.24
346	0.25
347	0.24
348	0.22
349	0.22
350	0.24
351	0.27
352	0.28
353	0.28
354	0.24
355	0.24
356	0.25
357	0.25
358	0.23
359	0.2
360	0.19
361	0.16
362	0.21
363	0.19
364	0.2
365	0.21
366	0.26
367	0.25
368	0.27
369	0.27
370	0.21
371	0.21
372	0.25
373	0.26
374	0.25
375	0.26
376	0.27
377	0.29
378	0.29
379	0.27
380	0.23
381	0.24
382	0.21
383	0.22
384	0.26
385	0.26
386	0.26
387	0.28
388	0.31
389	0.26
390	0.26
391	0.24
392	0.18
393	0.16
394	0.16
395	0.15
396	0.11
397	0.11
398	0.1
399	0.08
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.09
405	0.14
406	0.14
407	0.13
408	0.15
409	0.15
410	0.16
411	0.23
412	0.33
413	0.33
414	0.42
415	0.45
416	0.45
417	0.47
418	0.45
419	0.41
420	0.32
421	0.3
422	0.29
423	0.3
424	0.28
425	0.27
426	0.28
427	0.26
428	0.23
429	0.22
430	0.15
431	0.12
432	0.12
433	0.12
434	0.1
435	0.11
436	0.11
437	0.09

A0A1J5X239

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer