Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J5WXQ9

Protein Details
Accession A0A1J5WXQ9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-34ADFMQQKIDRYRKKTKSPAITEEIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_mito 10.166, cyto_nucl 9.333, mito 8.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026699  Exosome_RNA_bind1/RRP40/RRP4  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF15985  KH_6  
CDD cd22526  KH-I_Rrp40  
Amino Acid Sequences MKLFLPGDSLADFMQQKIDRYRKKTKSPAITEEIKINAGIAQDRTGDLVSCVYGHCIFQSPNRFFVAPQRKYIGRAGDCVVGIVSSTTAEKYHVDIGCARNAVLPYLSFEAATKRKKTKIQIGALVYANVAEANPHLETELSCVDDDGKRSCYGELVGGMLLRCSAGFTRHLLSPESSILEKIGEKSHFETAVGLNGRVWVSADSTATTMEIMRTIKKEERKHSNAEGEREQAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.24
4 0.33
5 0.43
6 0.47
7 0.55
8 0.66
9 0.67
10 0.76
11 0.83
12 0.83
13 0.84
14 0.83
15 0.83
16 0.78
17 0.75
18 0.66
19 0.6
20 0.51
21 0.41
22 0.33
23 0.25
24 0.2
25 0.15
26 0.16
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.12
44 0.12
45 0.18
46 0.28
47 0.27
48 0.29
49 0.31
50 0.31
51 0.28
52 0.38
53 0.43
54 0.36
55 0.38
56 0.39
57 0.38
58 0.41
59 0.45
60 0.42
61 0.32
62 0.32
63 0.3
64 0.28
65 0.27
66 0.24
67 0.2
68 0.11
69 0.1
70 0.07
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.18
83 0.19
84 0.2
85 0.2
86 0.18
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.1
94 0.1
95 0.08
96 0.08
97 0.13
98 0.19
99 0.23
100 0.26
101 0.28
102 0.33
103 0.38
104 0.44
105 0.49
106 0.51
107 0.52
108 0.53
109 0.51
110 0.49
111 0.44
112 0.38
113 0.28
114 0.19
115 0.14
116 0.08
117 0.06
118 0.03
119 0.03
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.08
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.1
132 0.11
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.12
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.09
155 0.11
156 0.14
157 0.16
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.19
163 0.19
164 0.17
165 0.15
166 0.14
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.17
171 0.16
172 0.18
173 0.21
174 0.24
175 0.23
176 0.22
177 0.22
178 0.18
179 0.24
180 0.23
181 0.2
182 0.16
183 0.18
184 0.18
185 0.16
186 0.16
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.08
198 0.11
199 0.12
200 0.15
201 0.17
202 0.23
203 0.3
204 0.38
205 0.47
206 0.53
207 0.63
208 0.65
209 0.7
210 0.72
211 0.76
212 0.73
213 0.71
214 0.66