Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J5WGX7

Protein Details
Accession A0A1J5WGX7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-363LLDGFRNKIKKKKLTKKWLGPFVVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-355NKIKKKKLTKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR041373  RT_RNaseH  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF17917  RT_RNaseH  
PF00665  rve  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences REFKVVTDHKALKWLQETKSENTRLTRWKLQLQEFGDFEIVYREGENHGNVDCPSRLPVDLNAITRDMNEHILKIHQELGHAGSQVVWQHLKRKMESPPSENKIKQILDECENCMRFRVARTQPAKIRGIALYPWEKIAIDTLDMGSVTSEGNRYVIVAIDYFSKWVICQAIKEKTGKNIKEFLENKVFNEFGRPNVLVSDNGTEFVNKEVKNLLRKHEVRQSLCSPYHPQSNGLAERANRTILEKLAKTLWNTGKEWDQELQKTAFAHRCCIIRELKASPYEILFSIVPNLTGKEKSLRQDLDTQKLQDKIRKRNLEIEKNAEEGNTTAVLEPGTKVLLDGFRNKIKKKKLTKKWLGPFVVVSAGKSGQYIIKDGFDETLVANRRHLLEYKGKEPISSFQAEGDVMQAIANA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.46
3 0.5
4 0.54
5 0.53
6 0.62
7 0.6
8 0.56
9 0.53
10 0.57
11 0.57
12 0.6
13 0.62
14 0.58
15 0.61
16 0.66
17 0.67
18 0.68
19 0.63
20 0.61
21 0.52
22 0.49
23 0.42
24 0.33
25 0.26
26 0.21
27 0.18
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.13
32 0.16
33 0.17
34 0.15
35 0.15
36 0.17
37 0.17
38 0.2
39 0.18
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.18
45 0.2
46 0.24
47 0.27
48 0.28
49 0.28
50 0.27
51 0.26
52 0.24
53 0.25
54 0.18
55 0.19
56 0.18
57 0.16
58 0.17
59 0.19
60 0.2
61 0.2
62 0.23
63 0.18
64 0.18
65 0.19
66 0.21
67 0.21
68 0.2
69 0.18
70 0.13
71 0.15
72 0.15
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.23
77 0.29
78 0.33
79 0.34
80 0.38
81 0.44
82 0.51
83 0.56
84 0.55
85 0.6
86 0.6
87 0.66
88 0.61
89 0.56
90 0.53
91 0.47
92 0.44
93 0.4
94 0.39
95 0.36
96 0.38
97 0.37
98 0.37
99 0.38
100 0.35
101 0.3
102 0.27
103 0.23
104 0.24
105 0.3
106 0.29
107 0.38
108 0.42
109 0.48
110 0.52
111 0.57
112 0.56
113 0.47
114 0.44
115 0.35
116 0.32
117 0.26
118 0.25
119 0.23
120 0.21
121 0.2
122 0.18
123 0.17
124 0.15
125 0.17
126 0.12
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.08
154 0.1
155 0.09
156 0.12
157 0.17
158 0.23
159 0.26
160 0.29
161 0.29
162 0.34
163 0.42
164 0.42
165 0.39
166 0.41
167 0.39
168 0.45
169 0.45
170 0.42
171 0.43
172 0.41
173 0.38
174 0.34
175 0.33
176 0.23
177 0.28
178 0.23
179 0.15
180 0.18
181 0.17
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.1
194 0.14
195 0.12
196 0.13
197 0.16
198 0.19
199 0.26
200 0.28
201 0.3
202 0.35
203 0.37
204 0.4
205 0.44
206 0.48
207 0.43
208 0.46
209 0.46
210 0.42
211 0.41
212 0.39
213 0.36
214 0.32
215 0.36
216 0.31
217 0.29
218 0.26
219 0.3
220 0.29
221 0.26
222 0.25
223 0.2
224 0.22
225 0.21
226 0.19
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.19
232 0.16
233 0.16
234 0.19
235 0.21
236 0.21
237 0.27
238 0.3
239 0.3
240 0.3
241 0.31
242 0.32
243 0.31
244 0.32
245 0.28
246 0.26
247 0.24
248 0.26
249 0.25
250 0.22
251 0.21
252 0.23
253 0.26
254 0.23
255 0.24
256 0.24
257 0.25
258 0.25
259 0.29
260 0.28
261 0.25
262 0.29
263 0.29
264 0.3
265 0.3
266 0.3
267 0.26
268 0.23
269 0.21
270 0.18
271 0.17
272 0.13
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.1
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.17
283 0.21
284 0.24
285 0.31
286 0.32
287 0.32
288 0.41
289 0.45
290 0.47
291 0.47
292 0.46
293 0.43
294 0.47
295 0.48
296 0.45
297 0.49
298 0.52
299 0.58
300 0.63
301 0.62
302 0.66
303 0.73
304 0.76
305 0.73
306 0.7
307 0.62
308 0.56
309 0.53
310 0.43
311 0.33
312 0.23
313 0.19
314 0.12
315 0.1
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.09
326 0.13
327 0.16
328 0.21
329 0.26
330 0.34
331 0.41
332 0.46
333 0.52
334 0.58
335 0.65
336 0.71
337 0.76
338 0.8
339 0.84
340 0.9
341 0.92
342 0.92
343 0.92
344 0.84
345 0.75
346 0.65
347 0.55
348 0.51
349 0.41
350 0.31
351 0.24
352 0.22
353 0.19
354 0.18
355 0.18
356 0.14
357 0.15
358 0.17
359 0.16
360 0.17
361 0.18
362 0.19
363 0.18
364 0.15
365 0.15
366 0.13
367 0.19
368 0.22
369 0.22
370 0.23
371 0.25
372 0.27
373 0.29
374 0.31
375 0.3
376 0.35
377 0.41
378 0.45
379 0.5
380 0.48
381 0.46
382 0.46
383 0.45
384 0.41
385 0.38
386 0.32
387 0.25
388 0.27
389 0.26
390 0.23
391 0.19
392 0.14
393 0.1