Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J5XC02

Protein Details
Accession A0A1J5XC02    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-167ETDQFKCGKCKQRKTTYYQLQTRSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF01096  TFIIS_C  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS00466  ZF_TFIIS_1  
PS51133  ZF_TFIIS_2  
CDD cd13749  Zn-ribbon_TFIIS  
Amino Acid Sequences MSKRTKGSTKQKIKILEEGDEKNNSAELEEIETPGNDEADRACGEELLKRLFEKGGIAKDIENQVHENTKTCNEQYRNHLRRLFLDLSLNKELAEKIKHGEVKPEEVARMSSADMAHEERRAEDELIRLQCLKKTVITRDEMAETDQFKCGKCKQRKTTYYQLQTRSADEPMTTFVSCIVCGNRWKFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.66
3 0.62
4 0.57
5 0.54
6 0.52
7 0.45
8 0.42
9 0.34
10 0.32
11 0.25
12 0.19
13 0.15
14 0.11
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.13
19 0.13
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.14
33 0.16
34 0.16
35 0.16
36 0.15
37 0.17
38 0.16
39 0.16
40 0.16
41 0.17
42 0.18
43 0.19
44 0.19
45 0.18
46 0.21
47 0.25
48 0.22
49 0.19
50 0.17
51 0.17
52 0.21
53 0.21
54 0.19
55 0.17
56 0.2
57 0.21
58 0.2
59 0.27
60 0.26
61 0.3
62 0.38
63 0.47
64 0.48
65 0.52
66 0.54
67 0.47
68 0.45
69 0.47
70 0.4
71 0.3
72 0.32
73 0.27
74 0.29
75 0.29
76 0.27
77 0.2
78 0.19
79 0.18
80 0.15
81 0.15
82 0.1
83 0.1
84 0.14
85 0.18
86 0.17
87 0.24
88 0.23
89 0.25
90 0.27
91 0.26
92 0.23
93 0.2
94 0.2
95 0.14
96 0.13
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.14
108 0.16
109 0.15
110 0.14
111 0.15
112 0.19
113 0.2
114 0.21
115 0.2
116 0.19
117 0.2
118 0.21
119 0.2
120 0.18
121 0.23
122 0.28
123 0.32
124 0.34
125 0.34
126 0.34
127 0.34
128 0.3
129 0.27
130 0.24
131 0.21
132 0.19
133 0.21
134 0.2
135 0.19
136 0.24
137 0.3
138 0.38
139 0.46
140 0.56
141 0.63
142 0.73
143 0.79
144 0.82
145 0.85
146 0.85
147 0.85
148 0.82
149 0.77
150 0.74
151 0.68
152 0.63
153 0.55
154 0.45
155 0.36
156 0.29
157 0.24
158 0.21
159 0.22
160 0.18
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.18
166 0.17
167 0.19
168 0.26