Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J5WTD8

Protein Details
Accession A0A1J5WTD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-317SAEPTVPKANRSRGKKRKVRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-317KANRSRGKKRKVRK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 13, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035312  F:5'-3' DNA exonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
CDD cd09901  H3TH_FEN1-like  
Amino Acid Sequences MGVDRLKQVLCKIFKKNTLVSDYNGKTLGVDASNWIHTIFTDEKIIDPFTFFLNKAKKLVLQGVDLVFVFDGNVFPLKKQHERIKKTTEQESQGRLIPSTTVRDLVVLLREAKMQCIVAPYEADAQLAHLERTEVIDAVITEDSDLILYGCKKILFNLNKKGEGKADEFCSQRLYCCAKSDLRGMSPDEFVRMGILIGCDYVKRLPKLRPETVYKLFKQHGTFEAVKAKIVSNPSSEIPENYWRDVRRAELVFKHYIVYDMRKKRRVHLMPIDDSVVQEMGDVSFLGSLEETEESFSAEPTVPKANRSRGKKRKVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.65
3 0.66
4 0.64
5 0.65
6 0.6
7 0.55
8 0.57
9 0.51
10 0.47
11 0.42
12 0.34
13 0.26
14 0.25
15 0.24
16 0.15
17 0.13
18 0.14
19 0.16
20 0.17
21 0.17
22 0.16
23 0.13
24 0.12
25 0.17
26 0.16
27 0.15
28 0.17
29 0.17
30 0.19
31 0.21
32 0.23
33 0.17
34 0.16
35 0.15
36 0.15
37 0.17
38 0.16
39 0.22
40 0.27
41 0.3
42 0.31
43 0.32
44 0.32
45 0.33
46 0.39
47 0.34
48 0.29
49 0.29
50 0.28
51 0.27
52 0.24
53 0.2
54 0.13
55 0.1
56 0.09
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.15
64 0.21
65 0.27
66 0.35
67 0.44
68 0.51
69 0.59
70 0.66
71 0.7
72 0.71
73 0.7
74 0.72
75 0.68
76 0.64
77 0.61
78 0.58
79 0.51
80 0.47
81 0.42
82 0.33
83 0.27
84 0.23
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.12
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.17
142 0.23
143 0.29
144 0.38
145 0.41
146 0.45
147 0.46
148 0.45
149 0.39
150 0.35
151 0.31
152 0.24
153 0.24
154 0.23
155 0.23
156 0.23
157 0.24
158 0.21
159 0.19
160 0.22
161 0.23
162 0.2
163 0.22
164 0.25
165 0.23
166 0.25
167 0.29
168 0.26
169 0.23
170 0.24
171 0.23
172 0.22
173 0.22
174 0.2
175 0.16
176 0.14
177 0.13
178 0.11
179 0.09
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.09
189 0.13
190 0.16
191 0.2
192 0.25
193 0.35
194 0.43
195 0.48
196 0.5
197 0.52
198 0.58
199 0.62
200 0.63
201 0.55
202 0.53
203 0.5
204 0.49
205 0.44
206 0.4
207 0.34
208 0.34
209 0.33
210 0.3
211 0.35
212 0.3
213 0.29
214 0.27
215 0.25
216 0.21
217 0.24
218 0.23
219 0.18
220 0.2
221 0.21
222 0.24
223 0.24
224 0.22
225 0.22
226 0.29
227 0.3
228 0.3
229 0.34
230 0.31
231 0.34
232 0.34
233 0.33
234 0.31
235 0.31
236 0.33
237 0.34
238 0.38
239 0.38
240 0.36
241 0.34
242 0.27
243 0.27
244 0.25
245 0.28
246 0.33
247 0.4
248 0.49
249 0.56
250 0.58
251 0.62
252 0.71
253 0.7
254 0.7
255 0.7
256 0.7
257 0.67
258 0.67
259 0.62
260 0.51
261 0.44
262 0.35
263 0.25
264 0.15
265 0.11
266 0.09
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.13
287 0.15
288 0.24
289 0.23
290 0.29
291 0.36
292 0.45
293 0.52
294 0.61
295 0.69
296 0.71
297 0.81