Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1J5X7B4

Protein Details
Accession A0A1J5X7B4    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-215GHLAHECRKKMKERKDSKVNALLCHydrophilic
323-352SGEIKKKNSLAPRNRRKRKKSFKGGADIGAHydrophilic
1102-1128LLDSQRINPTKKKKKLLKRWIGPYIVDHydrophilic
1135-1163QYVIRDRSGRTIRVNRRHLRPYKGQSPVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-345KKKNSLAPRNRRKRKKSFK
1112-1120KKKKKLLKR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 9.5, cyto_mito 5.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR000477  RT_dom  
IPR041373  RT_RNaseH  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF13975  gag-asp_proteas  
PF17917  RT_RNaseH  
PF00665  rve  
PF00078  RVT_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
PS50878  RT_POL  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
cd09274  RNase_HI_RT_Ty3  
cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences NAVTIGSPHSVEVPSFHGKRWEDIGSWLSTIKAERTAGDALQCALQLLKGEAKISLLIVQKRRGKFENWKAFVEWAREEFGKDNNAKKTNFFGFLSSEKKEKIPLAEFIATALDFGIEADIDENSIVRAIVASMPATIRRMPETEKASTFEDLNQIIKDLSAQTKLAWQKHEHARPLNLEKKKKCNYCSKTGHLAHECRKKMKERKDSKVNALLCRARESHPLRVEGEINGLPASMLVDTGAKGLYVSGRTAKRADIDGSTPHAVTVADGRTTEALESDKKVLLSFKDTKQKTTAIIMPDLTESVILGREPLAKAKLVIDTESGEIKKKNSLAPRNRRKRKKSFKGGADIGALDTQEVTPETALPSTLGDARKELKAVLSKNEFDVGRTNVMECHIDTGTNQPVSRVPYSMTRDKEDRLKGIIEELSQRKLIERVRFSRWSSPAILVHQNEKYRLCVDYRSLNAITVTESHPMPTLQQIFTSLEGARYFSTLDLTKGFWQLPVSSEDAEKTTFTTKFGTFRWNVMPFGLKNAPALFQRMIDGVIDSVRGTCALAYIDDIIVYSKTREEHVEHLKTVARLLKDANLKISPTKCRFFCKEVTYLGHNISAGKITPSGGNIEKIIRVEVPRSTKATRSFLGMVNYYRDYIPNIARIAGPLYELTEKGKKFKWEPAHDQAFRELKEALEANCTLRIPDFQKPFVVYTDASKEGLGGILAQTDDTGQEKIVKTVSRTLSPAEKNYGITELECLSVVWTLEKFRYYLVGRQFKVVTDHRALEWLDSHKDSNSKLMRWALQLQDFGDFTIQFRAGKDHGNADGISRLPEKILALDSNETQTVLDVHSKLGHAAAEVTHKYLTRDPTWKGKLCDTERLIQDCLLCQNFGNRYDNFTKRRSTAFKPMEKIAIDIMDVGSVTDEGNKYVVAAIDYFSRWLFAKAIPDKTSETVAQFIENEIIRRFGIPDVLVSDNGKEFANVKIKALTSKHGIRHSMTSAYYPQANGLVERTNRTILKKLGCAIRDLEMDWDKALPQTTLAYNSCPIRSMGYSPFELLHGWTPRITKSVKRMEKLNTHELRKEVTEKHLLEEEKQANKGKATDDLEPNTKILLDSQRINPTKKKKKLLKRWIGPYIVDSNNANGQYVIRDRSGRTIRVNRRHLRPYKGQSPVASFEEGGDVDSTP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.29
4 0.35
5 0.35
6 0.39
7 0.42
8 0.4
9 0.32
10 0.36
11 0.38
12 0.31
13 0.31
14 0.27
15 0.23
16 0.21
17 0.22
18 0.19
19 0.2
20 0.19
21 0.19
22 0.22
23 0.24
24 0.24
25 0.24
26 0.23
27 0.19
28 0.19
29 0.18
30 0.15
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.19
43 0.21
44 0.28
45 0.33
46 0.41
47 0.48
48 0.51
49 0.57
50 0.56
51 0.57
52 0.61
53 0.67
54 0.69
55 0.66
56 0.65
57 0.61
58 0.62
59 0.58
60 0.53
61 0.45
62 0.36
63 0.36
64 0.33
65 0.33
66 0.3
67 0.3
68 0.33
69 0.34
70 0.39
71 0.44
72 0.5
73 0.49
74 0.49
75 0.53
76 0.49
77 0.49
78 0.42
79 0.36
80 0.33
81 0.38
82 0.41
83 0.36
84 0.35
85 0.32
86 0.33
87 0.35
88 0.35
89 0.36
90 0.35
91 0.36
92 0.38
93 0.39
94 0.37
95 0.33
96 0.31
97 0.24
98 0.19
99 0.15
100 0.08
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.05
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.12
123 0.14
124 0.15
125 0.16
126 0.18
127 0.21
128 0.24
129 0.31
130 0.35
131 0.38
132 0.38
133 0.39
134 0.39
135 0.37
136 0.34
137 0.28
138 0.28
139 0.24
140 0.24
141 0.21
142 0.19
143 0.17
144 0.16
145 0.15
146 0.14
147 0.15
148 0.16
149 0.16
150 0.16
151 0.23
152 0.3
153 0.33
154 0.35
155 0.35
156 0.42
157 0.52
158 0.59
159 0.6
160 0.59
161 0.6
162 0.63
163 0.69
164 0.69
165 0.67
166 0.69
167 0.69
168 0.74
169 0.78
170 0.79
171 0.76
172 0.78
173 0.76
174 0.77
175 0.78
176 0.75
177 0.76
178 0.72
179 0.74
180 0.7
181 0.71
182 0.7
183 0.71
184 0.69
185 0.65
186 0.67
187 0.69
188 0.71
189 0.73
190 0.75
191 0.76
192 0.81
193 0.86
194 0.86
195 0.84
196 0.83
197 0.77
198 0.71
199 0.68
200 0.62
201 0.53
202 0.5
203 0.45
204 0.39
205 0.43
206 0.44
207 0.45
208 0.46
209 0.47
210 0.44
211 0.44
212 0.43
213 0.33
214 0.33
215 0.24
216 0.19
217 0.16
218 0.14
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.08
233 0.08
234 0.1
235 0.16
236 0.18
237 0.21
238 0.22
239 0.23
240 0.24
241 0.25
242 0.26
243 0.21
244 0.22
245 0.22
246 0.26
247 0.26
248 0.23
249 0.2
250 0.18
251 0.16
252 0.14
253 0.15
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.14
265 0.15
266 0.16
267 0.16
268 0.17
269 0.19
270 0.18
271 0.24
272 0.28
273 0.32
274 0.41
275 0.41
276 0.44
277 0.45
278 0.45
279 0.4
280 0.38
281 0.36
282 0.29
283 0.3
284 0.27
285 0.25
286 0.23
287 0.21
288 0.15
289 0.11
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.09
297 0.1
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.16
303 0.19
304 0.16
305 0.17
306 0.15
307 0.15
308 0.16
309 0.19
310 0.18
311 0.17
312 0.17
313 0.18
314 0.21
315 0.22
316 0.26
317 0.32
318 0.42
319 0.5
320 0.6
321 0.7
322 0.77
323 0.86
324 0.91
325 0.92
326 0.93
327 0.93
328 0.93
329 0.93
330 0.92
331 0.89
332 0.88
333 0.8
334 0.71
335 0.61
336 0.5
337 0.39
338 0.3
339 0.21
340 0.12
341 0.09
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.06
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.11
355 0.13
356 0.12
357 0.14
358 0.17
359 0.17
360 0.17
361 0.16
362 0.16
363 0.2
364 0.22
365 0.27
366 0.29
367 0.29
368 0.29
369 0.33
370 0.29
371 0.24
372 0.26
373 0.22
374 0.2
375 0.19
376 0.19
377 0.15
378 0.17
379 0.17
380 0.12
381 0.13
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.14
386 0.17
387 0.18
388 0.18
389 0.16
390 0.18
391 0.22
392 0.23
393 0.2
394 0.16
395 0.22
396 0.28
397 0.34
398 0.34
399 0.34
400 0.36
401 0.38
402 0.44
403 0.4
404 0.36
405 0.32
406 0.3
407 0.26
408 0.26
409 0.25
410 0.18
411 0.22
412 0.21
413 0.21
414 0.21
415 0.21
416 0.19
417 0.22
418 0.26
419 0.27
420 0.32
421 0.35
422 0.41
423 0.46
424 0.48
425 0.51
426 0.48
427 0.44
428 0.39
429 0.38
430 0.33
431 0.32
432 0.34
433 0.27
434 0.29
435 0.3
436 0.3
437 0.29
438 0.28
439 0.26
440 0.22
441 0.22
442 0.19
443 0.17
444 0.18
445 0.22
446 0.22
447 0.25
448 0.24
449 0.23
450 0.22
451 0.19
452 0.17
453 0.14
454 0.13
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.13
462 0.15
463 0.13
464 0.13
465 0.15
466 0.15
467 0.16
468 0.17
469 0.13
470 0.11
471 0.11
472 0.12
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.07
477 0.1
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.11
482 0.12
483 0.13
484 0.13
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.12
489 0.13
490 0.13
491 0.12
492 0.12
493 0.12
494 0.12
495 0.12
496 0.1
497 0.1
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.15
502 0.15
503 0.17
504 0.18
505 0.23
506 0.21
507 0.23
508 0.28
509 0.27
510 0.26
511 0.24
512 0.26
513 0.19
514 0.24
515 0.22
516 0.17
517 0.16
518 0.16
519 0.17
520 0.14
521 0.17
522 0.12
523 0.11
524 0.12
525 0.11
526 0.11
527 0.09
528 0.09
529 0.06
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.03
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.04
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.06
551 0.06
552 0.08
553 0.1
554 0.12
555 0.18
556 0.26
557 0.28
558 0.27
559 0.28
560 0.29
561 0.26
562 0.26
563 0.23
564 0.15
565 0.13
566 0.14
567 0.17
568 0.19
569 0.2
570 0.21
571 0.18
572 0.19
573 0.21
574 0.24
575 0.27
576 0.27
577 0.31
578 0.3
579 0.35
580 0.39
581 0.39
582 0.41
583 0.38
584 0.37
585 0.35
586 0.36
587 0.33
588 0.31
589 0.27
590 0.22
591 0.18
592 0.15
593 0.12
594 0.1
595 0.08
596 0.07
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.07
601 0.09
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.11
607 0.11
608 0.11
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.14
613 0.18
614 0.19
615 0.22
616 0.23
617 0.27
618 0.31
619 0.33
620 0.29
621 0.28
622 0.28
623 0.27
624 0.28
625 0.25
626 0.21
627 0.2
628 0.2
629 0.17
630 0.15
631 0.13
632 0.12
633 0.14
634 0.14
635 0.15
636 0.15
637 0.14
638 0.14
639 0.14
640 0.14
641 0.11
642 0.1
643 0.07
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.11
648 0.15
649 0.15
650 0.18
651 0.21
652 0.24
653 0.26
654 0.34
655 0.41
656 0.43
657 0.51
658 0.56
659 0.62
660 0.59
661 0.57
662 0.55
663 0.49
664 0.42
665 0.35
666 0.27
667 0.18
668 0.18
669 0.19
670 0.13
671 0.12
672 0.12
673 0.12
674 0.13
675 0.13
676 0.11
677 0.1
678 0.13
679 0.14
680 0.21
681 0.23
682 0.22
683 0.24
684 0.25
685 0.26
686 0.24
687 0.22
688 0.16
689 0.15
690 0.18
691 0.17
692 0.16
693 0.15
694 0.14
695 0.12
696 0.11
697 0.09
698 0.05
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.04
704 0.04
705 0.04
706 0.05
707 0.06
708 0.05
709 0.1
710 0.11
711 0.12
712 0.14
713 0.15
714 0.15
715 0.22
716 0.24
717 0.22
718 0.23
719 0.24
720 0.29
721 0.3
722 0.31
723 0.27
724 0.26
725 0.25
726 0.25
727 0.25
728 0.17
729 0.15
730 0.14
731 0.11
732 0.1
733 0.09
734 0.08
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.08
741 0.09
742 0.1
743 0.09
744 0.09
745 0.14
746 0.15
747 0.2
748 0.28
749 0.35
750 0.35
751 0.38
752 0.38
753 0.34
754 0.38
755 0.36
756 0.32
757 0.27
758 0.27
759 0.24
760 0.27
761 0.26
762 0.21
763 0.21
764 0.19
765 0.18
766 0.19
767 0.19
768 0.18
769 0.2
770 0.2
771 0.26
772 0.26
773 0.25
774 0.27
775 0.3
776 0.31
777 0.31
778 0.35
779 0.3
780 0.29
781 0.29
782 0.26
783 0.24
784 0.22
785 0.19
786 0.16
787 0.12
788 0.1
789 0.11
790 0.12
791 0.1
792 0.11
793 0.14
794 0.14
795 0.18
796 0.19
797 0.19
798 0.19
799 0.2
800 0.2
801 0.17
802 0.18
803 0.15
804 0.16
805 0.13
806 0.12
807 0.11
808 0.12
809 0.11
810 0.1
811 0.12
812 0.1
813 0.11
814 0.13
815 0.14
816 0.14
817 0.14
818 0.13
819 0.11
820 0.1
821 0.09
822 0.09
823 0.11
824 0.1
825 0.11
826 0.12
827 0.12
828 0.12
829 0.12
830 0.11
831 0.08
832 0.08
833 0.08
834 0.12
835 0.12
836 0.13
837 0.14
838 0.15
839 0.17
840 0.2
841 0.24
842 0.25
843 0.3
844 0.32
845 0.41
846 0.48
847 0.51
848 0.5
849 0.51
850 0.54
851 0.53
852 0.58
853 0.52
854 0.51
855 0.5
856 0.51
857 0.46
858 0.38
859 0.35
860 0.27
861 0.28
862 0.22
863 0.18
864 0.15
865 0.19
866 0.22
867 0.25
868 0.28
869 0.23
870 0.29
871 0.36
872 0.44
873 0.43
874 0.43
875 0.44
876 0.43
877 0.5
878 0.5
879 0.49
880 0.52
881 0.57
882 0.6
883 0.59
884 0.59
885 0.56
886 0.5
887 0.45
888 0.35
889 0.26
890 0.19
891 0.16
892 0.13
893 0.08
894 0.08
895 0.06
896 0.05
897 0.05
898 0.05
899 0.07
900 0.07
901 0.08
902 0.08
903 0.08
904 0.08
905 0.09
906 0.09
907 0.07
908 0.07
909 0.08
910 0.09
911 0.1
912 0.11
913 0.1
914 0.1
915 0.1
916 0.12
917 0.13
918 0.13
919 0.22
920 0.27
921 0.33
922 0.33
923 0.35
924 0.36
925 0.36
926 0.37
927 0.3
928 0.25
929 0.22
930 0.21
931 0.19
932 0.17
933 0.16
934 0.17
935 0.16
936 0.16
937 0.14
938 0.15
939 0.14
940 0.15
941 0.15
942 0.12
943 0.14
944 0.12
945 0.13
946 0.15
947 0.16
948 0.17
949 0.16
950 0.17
951 0.15
952 0.15
953 0.14
954 0.11
955 0.11
956 0.16
957 0.24
958 0.23
959 0.24
960 0.27
961 0.28
962 0.33
963 0.34
964 0.32
965 0.31
966 0.37
967 0.42
968 0.44
969 0.46
970 0.43
971 0.46
972 0.45
973 0.41
974 0.35
975 0.32
976 0.29
977 0.28
978 0.27
979 0.22
980 0.2
981 0.19
982 0.19
983 0.16
984 0.16
985 0.2
986 0.2
987 0.24
988 0.25
989 0.28
990 0.3
991 0.33
992 0.37
993 0.37
994 0.41
995 0.4
996 0.44
997 0.45
998 0.43
999 0.42
1000 0.37
1001 0.35
1002 0.31
1003 0.28
1004 0.29
1005 0.25
1006 0.25
1007 0.23
1008 0.21
1009 0.17
1010 0.18
1011 0.19
1012 0.13
1013 0.11
1014 0.14
1015 0.15
1016 0.2
1017 0.2
1018 0.21
1019 0.24
1020 0.26
1021 0.26
1022 0.24
1023 0.23
1024 0.21
1025 0.22
1026 0.24
1027 0.26
1028 0.27
1029 0.28
1030 0.28
1031 0.28
1032 0.25
1033 0.23
1034 0.21
1035 0.22
1036 0.22
1037 0.22
1038 0.23
1039 0.25
1040 0.25
1041 0.3
1042 0.31
1043 0.31
1044 0.37
1045 0.47
1046 0.53
1047 0.54
1048 0.6
1049 0.63
1050 0.7
1051 0.7
1052 0.71
1053 0.68
1054 0.65
1055 0.66
1056 0.61
1057 0.56
1058 0.51
1059 0.5
1060 0.44
1061 0.42
1062 0.46
1063 0.42
1064 0.44
1065 0.47
1066 0.43
1067 0.4
1068 0.45
1069 0.46
1070 0.42
1071 0.46
1072 0.48
1073 0.44
1074 0.45
1075 0.45
1076 0.38
1077 0.39
1078 0.37
1079 0.39
1080 0.41
1081 0.44
1082 0.46
1083 0.44
1084 0.43
1085 0.35
1086 0.32
1087 0.25
1088 0.23
1089 0.25
1090 0.25
1091 0.29
1092 0.35
1093 0.45
1094 0.5
1095 0.55
1096 0.59
1097 0.62
1098 0.69
1099 0.73
1100 0.78
1101 0.78
1102 0.85
1103 0.91
1104 0.93
1105 0.93
1106 0.92
1107 0.92
1108 0.9
1109 0.84
1110 0.74
1111 0.67
1112 0.63
1113 0.54
1114 0.46
1115 0.37
1116 0.32
1117 0.33
1118 0.32
1119 0.27
1120 0.2
1121 0.19
1122 0.21
1123 0.25
1124 0.25
1125 0.23
1126 0.26
1127 0.28
1128 0.37
1129 0.43
1130 0.44
1131 0.49
1132 0.56
1133 0.64
1134 0.71
1135 0.8
1136 0.79
1137 0.82
1138 0.87
1139 0.85
1140 0.83
1141 0.83
1142 0.83
1143 0.82
1144 0.81
1145 0.77
1146 0.71
1147 0.69
1148 0.65
1149 0.58
1150 0.5
1151 0.41
1152 0.33
1153 0.31
1154 0.26
1155 0.21