Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1J5WMM0

Protein Details
Accession A0A1J5WMM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-119GVAPRAKMNQQRSRRFRSREEEHydrophilic
630-657ADLPGQSRRHWPRREDAGRERKRSRSDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
637-657RRHWPRREDAGRERKRSRSDA
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 7, cyto 7, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPSFFRWISKKYPKTVTPVVEETGEYGVFRSKENPNGMEFDNLYVDMNGIIHNCSHPENRTPPESEEGIFKEITRYFERVVAAVRPQNLVYIGIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSREEEGAGGGWFDPNCITPGTDFMLRLADYLHIYLEKAVHENLLFSGVKVILSDGSIPGEGEHKIMDFIRNQRARDDYSPGQRHVLHGLDADLIMLGLTTHEPRFHILREDVFLETKRKFHRCEKCEKTGHYKDECGKKREEKDLPLQLFHVGVLRECLEVELQELQIPGRVDFERVIDDWVFLCFLVGNDFLPHIPSLEIREGAIDRLVEIYKQTARSYITKDGVVRLNRLWDMLRGLEKVEAGIFQARREKEDQYKEFEKRKRAAGEMSSTEAIEEDNVQLHLPGFRERYYAEKFGTTSPEFRKKVVRDYLEGLCWVFGYYYRGCQSWSWFYPHHYSPLVSDIFEYGRNWKPRYAPDAPFKPLEQLMAVFPPASRSLVPAPLQKLFVEEEFGVTDFYPEKYPIDMNGKQVKWLAVVILPFIEEGRLLDAVEKVRPELSEEDLKRNLEGKTKFYTKDEKSMSQFSGDLSPTEKSSVFDYVPEPKEPVFSLLPDAVFDPVVLTDRDRDKIERQTKADLPGQSRRHWPRREDAGRERKRSRSDAPVDHRGGKEH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.67
3 0.71
4 0.75
5 0.7
6 0.66
7 0.61
8 0.55
9 0.47
10 0.42
11 0.35
12 0.28
13 0.23
14 0.16
15 0.13
16 0.16
17 0.15
18 0.17
19 0.21
20 0.24
21 0.32
22 0.38
23 0.4
24 0.38
25 0.41
26 0.42
27 0.4
28 0.35
29 0.29
30 0.25
31 0.23
32 0.2
33 0.16
34 0.15
35 0.11
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.12
43 0.15
44 0.2
45 0.22
46 0.29
47 0.36
48 0.41
49 0.45
50 0.47
51 0.46
52 0.47
53 0.46
54 0.39
55 0.37
56 0.34
57 0.32
58 0.28
59 0.25
60 0.25
61 0.25
62 0.29
63 0.28
64 0.28
65 0.27
66 0.31
67 0.31
68 0.27
69 0.27
70 0.26
71 0.28
72 0.28
73 0.29
74 0.27
75 0.26
76 0.26
77 0.24
78 0.22
79 0.16
80 0.14
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.13
90 0.19
91 0.27
92 0.37
93 0.45
94 0.54
95 0.64
96 0.73
97 0.79
98 0.83
99 0.82
100 0.81
101 0.79
102 0.77
103 0.74
104 0.69
105 0.6
106 0.51
107 0.46
108 0.36
109 0.29
110 0.21
111 0.15
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.11
121 0.14
122 0.16
123 0.15
124 0.14
125 0.16
126 0.16
127 0.15
128 0.14
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.11
142 0.12
143 0.11
144 0.14
145 0.13
146 0.11
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.09
166 0.09
167 0.12
168 0.15
169 0.2
170 0.3
171 0.34
172 0.34
173 0.36
174 0.39
175 0.41
176 0.4
177 0.41
178 0.37
179 0.43
180 0.47
181 0.46
182 0.46
183 0.41
184 0.4
185 0.36
186 0.31
187 0.22
188 0.18
189 0.17
190 0.13
191 0.13
192 0.11
193 0.07
194 0.06
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.11
205 0.13
206 0.14
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.2
211 0.21
212 0.2
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.2
217 0.24
218 0.29
219 0.32
220 0.36
221 0.45
222 0.53
223 0.55
224 0.65
225 0.67
226 0.7
227 0.71
228 0.7
229 0.71
230 0.68
231 0.7
232 0.62
233 0.59
234 0.57
235 0.6
236 0.63
237 0.56
238 0.54
239 0.55
240 0.57
241 0.61
242 0.59
243 0.54
244 0.56
245 0.61
246 0.56
247 0.48
248 0.44
249 0.35
250 0.3
251 0.25
252 0.18
253 0.1
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.07
285 0.06
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.07
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.08
314 0.09
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.14
319 0.17
320 0.2
321 0.23
322 0.23
323 0.23
324 0.23
325 0.24
326 0.27
327 0.26
328 0.24
329 0.19
330 0.2
331 0.19
332 0.19
333 0.16
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.09
343 0.08
344 0.07
345 0.06
346 0.1
347 0.09
348 0.1
349 0.16
350 0.16
351 0.19
352 0.21
353 0.25
354 0.29
355 0.38
356 0.38
357 0.4
358 0.46
359 0.5
360 0.56
361 0.57
362 0.57
363 0.51
364 0.55
365 0.51
366 0.46
367 0.44
368 0.39
369 0.39
370 0.33
371 0.32
372 0.26
373 0.23
374 0.2
375 0.16
376 0.13
377 0.08
378 0.07
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.11
388 0.12
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.19
393 0.22
394 0.24
395 0.22
396 0.22
397 0.22
398 0.23
399 0.28
400 0.23
401 0.25
402 0.28
403 0.37
404 0.37
405 0.37
406 0.44
407 0.41
408 0.48
409 0.51
410 0.47
411 0.41
412 0.44
413 0.45
414 0.37
415 0.35
416 0.27
417 0.18
418 0.15
419 0.12
420 0.08
421 0.06
422 0.1
423 0.1
424 0.14
425 0.15
426 0.16
427 0.17
428 0.18
429 0.22
430 0.25
431 0.27
432 0.28
433 0.28
434 0.31
435 0.35
436 0.36
437 0.35
438 0.29
439 0.27
440 0.23
441 0.27
442 0.24
443 0.18
444 0.17
445 0.14
446 0.14
447 0.15
448 0.15
449 0.15
450 0.21
451 0.27
452 0.29
453 0.31
454 0.35
455 0.39
456 0.46
457 0.48
458 0.47
459 0.51
460 0.56
461 0.55
462 0.53
463 0.48
464 0.43
465 0.36
466 0.3
467 0.21
468 0.16
469 0.14
470 0.13
471 0.13
472 0.1
473 0.09
474 0.11
475 0.11
476 0.12
477 0.1
478 0.12
479 0.15
480 0.2
481 0.23
482 0.26
483 0.28
484 0.28
485 0.3
486 0.26
487 0.26
488 0.22
489 0.2
490 0.18
491 0.15
492 0.14
493 0.13
494 0.13
495 0.12
496 0.1
497 0.11
498 0.09
499 0.1
500 0.11
501 0.11
502 0.12
503 0.13
504 0.14
505 0.17
506 0.24
507 0.26
508 0.32
509 0.4
510 0.39
511 0.39
512 0.41
513 0.37
514 0.3
515 0.27
516 0.21
517 0.14
518 0.14
519 0.12
520 0.1
521 0.1
522 0.08
523 0.08
524 0.07
525 0.05
526 0.05
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.09
531 0.11
532 0.13
533 0.15
534 0.15
535 0.14
536 0.15
537 0.15
538 0.18
539 0.17
540 0.21
541 0.28
542 0.3
543 0.35
544 0.38
545 0.38
546 0.36
547 0.37
548 0.35
549 0.34
550 0.34
551 0.33
552 0.37
553 0.42
554 0.43
555 0.44
556 0.52
557 0.48
558 0.54
559 0.56
560 0.54
561 0.54
562 0.57
563 0.53
564 0.45
565 0.41
566 0.33
567 0.33
568 0.27
569 0.22
570 0.19
571 0.2
572 0.18
573 0.21
574 0.2
575 0.15
576 0.17
577 0.21
578 0.18
579 0.19
580 0.22
581 0.28
582 0.31
583 0.31
584 0.31
585 0.27
586 0.29
587 0.28
588 0.3
589 0.22
590 0.2
591 0.22
592 0.23
593 0.22
594 0.2
595 0.2
596 0.16
597 0.15
598 0.13
599 0.1
600 0.08
601 0.1
602 0.1
603 0.11
604 0.16
605 0.2
606 0.24
607 0.27
608 0.3
609 0.35
610 0.45
611 0.53
612 0.55
613 0.54
614 0.59
615 0.6
616 0.62
617 0.62
618 0.57
619 0.55
620 0.56
621 0.58
622 0.55
623 0.61
624 0.65
625 0.69
626 0.71
627 0.71
628 0.71
629 0.77
630 0.81
631 0.8
632 0.8
633 0.82
634 0.84
635 0.87
636 0.84
637 0.82
638 0.81
639 0.78
640 0.74
641 0.74
642 0.73
643 0.74
644 0.76
645 0.77
646 0.74
647 0.74