FuNGI

C0NRP8

Protein Details

Accession

C0NRP8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
143-162	EQIVPPKKKNPRPHGVGRGT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
477-504	SGNKGGGRGRGGRGGQNGRAGGGRERRR

Subcellular Location(s)

cyto 8.5, cyto_nucl 8, nucl 6.5, mito 4, pero 4, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024337 tRNA_splic_suSen54 IPR024336 tRNA_splic_suSen54_N
Gene Ontology	GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF12928 tRNA_int_end_N2

Amino Acid Sequences

MADADEDALIQPPSSHDQSAHIDQDLSDETQDFRFLNSLSFLPDPNQPASLPRRGEKDFEPNPTLRQTDVLVASRDAMHNALAYPRLHNPKTRVVGIYCPTGLLRPAHAEGSDSADTESGGQVAVNEERKQEEICKVEDRYEEQIVPPKKKNPRPHGVGRGTCVCVPSPRGQHFRTVGRSDQWNRMWLLPEEALYLLERGSLDVRWPARAGGHGAKGAVTEHGENVEDADGGVPMSLQVAYACFLGRGGLTLQRYIVYANLRRGGYAVIRAPSWDDCDGNDDNRAVNQVATDAAVATTGAGIRAHMEQSRGGLINLLTRFFNSLFETGPARRLAHGPVIGLDDIYRALSIITAHNPEQPEPTSPKHTTPPYRLAYYVYKPSTPFRKSTPGNPDFRLAVIDSRRNPTLPTLHELSALLESTPLDPPHGEKMERLTYMRLRHGWRNVILAVVDQGVVSFLRVADAGFVGVRVYEKGAPSGNKGGGRGRGGRGGQNGRAGGGRERRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.21
3	0.2
4	0.25
5	0.32
6	0.37
7	0.37
8	0.31
9	0.29
10	0.27
11	0.3
12	0.28
13	0.22
14	0.17
15	0.15
16	0.16
17	0.16
18	0.18
19	0.15
20	0.13
21	0.15
22	0.15
23	0.15
24	0.16
25	0.16
26	0.18
27	0.19
28	0.19
29	0.19
30	0.23
31	0.25
32	0.25
33	0.26
34	0.22
35	0.28
36	0.33
37	0.39
38	0.38
39	0.38
40	0.44
41	0.44
42	0.48
43	0.47
44	0.51
45	0.49
46	0.52
47	0.53
48	0.48
49	0.49
50	0.5
51	0.46
52	0.36
53	0.32
54	0.26
55	0.25
56	0.28
57	0.27
58	0.24
59	0.23
60	0.24
61	0.23
62	0.23
63	0.19
64	0.15
65	0.12
66	0.11
67	0.11
68	0.12
69	0.15
70	0.15
71	0.17
72	0.24
73	0.32
74	0.34
75	0.39
76	0.43
77	0.48
78	0.52
79	0.53
80	0.49
81	0.42
82	0.47
83	0.44
84	0.43
85	0.33
86	0.29
87	0.25
88	0.23
89	0.23
90	0.17
91	0.16
92	0.16
93	0.18
94	0.18
95	0.18
96	0.18
97	0.16
98	0.22
99	0.2
100	0.17
101	0.15
102	0.14
103	0.14
104	0.13
105	0.13
106	0.06
107	0.06
108	0.05
109	0.05
110	0.07
111	0.11
112	0.14
113	0.15
114	0.16
115	0.17
116	0.19
117	0.2
118	0.21
119	0.24
120	0.23
121	0.25
122	0.29
123	0.29
124	0.31
125	0.32
126	0.32
127	0.31
128	0.31
129	0.28
130	0.25
131	0.33
132	0.35
133	0.39
134	0.4
135	0.44
136	0.51
137	0.59
138	0.68
139	0.7
140	0.73
141	0.75
142	0.79
143	0.81
144	0.8
145	0.74
146	0.67
147	0.61
148	0.54
149	0.47
150	0.38
151	0.29
152	0.22
153	0.23
154	0.26
155	0.29
156	0.33
157	0.39
158	0.39
159	0.44
160	0.47
161	0.49
162	0.49
163	0.45
164	0.41
165	0.38
166	0.45
167	0.43
168	0.46
169	0.42
170	0.39
171	0.37
172	0.36
173	0.36
174	0.28
175	0.27
176	0.2
177	0.18
178	0.16
179	0.14
180	0.13
181	0.1
182	0.1
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.07
190	0.11
191	0.12
192	0.12
193	0.13
194	0.12
195	0.12
196	0.13
197	0.16
198	0.15
199	0.16
200	0.16
201	0.15
202	0.15
203	0.15
204	0.14
205	0.11
206	0.08
207	0.07
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.05
235	0.05
236	0.08
237	0.08
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.09
243	0.1
244	0.11
245	0.14
246	0.16
247	0.21
248	0.2
249	0.2
250	0.2
251	0.19
252	0.16
253	0.15
254	0.15
255	0.11
256	0.12
257	0.12
258	0.13
259	0.12
260	0.15
261	0.13
262	0.11
263	0.1
264	0.15
265	0.16
266	0.15
267	0.16
268	0.13
269	0.12
270	0.12
271	0.14
272	0.09
273	0.08
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.04
287	0.03
288	0.03
289	0.05
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.12
297	0.12
298	0.11
299	0.11
300	0.1
301	0.14
302	0.14
303	0.14
304	0.12
305	0.12
306	0.14
307	0.13
308	0.14
309	0.11
310	0.12
311	0.11
312	0.13
313	0.16
314	0.14
315	0.17
316	0.18
317	0.16
318	0.17
319	0.18
320	0.18
321	0.2
322	0.2
323	0.17
324	0.16
325	0.17
326	0.16
327	0.14
328	0.12
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.04
334	0.04
335	0.05
336	0.06
337	0.07
338	0.1
339	0.13
340	0.14
341	0.17
342	0.18
343	0.18
344	0.21
345	0.2
346	0.22
347	0.24
348	0.27
349	0.32
350	0.33
351	0.36
352	0.39
353	0.46
354	0.49
355	0.51
356	0.56
357	0.53
358	0.53
359	0.5
360	0.47
361	0.46
362	0.43
363	0.45
364	0.38
365	0.35
366	0.35
367	0.41
368	0.46
369	0.43
370	0.42
371	0.38
372	0.46
373	0.47
374	0.54
375	0.59
376	0.57
377	0.59
378	0.58
379	0.56
380	0.47
381	0.44
382	0.37
383	0.27
384	0.25
385	0.25
386	0.3
387	0.31
388	0.35
389	0.36
390	0.34
391	0.34
392	0.34
393	0.35
394	0.31
395	0.33
396	0.33
397	0.32
398	0.33
399	0.32
400	0.28
401	0.23
402	0.19
403	0.14
404	0.1
405	0.1
406	0.11
407	0.14
408	0.12
409	0.12
410	0.13
411	0.15
412	0.23
413	0.26
414	0.25
415	0.24
416	0.3
417	0.35
418	0.37
419	0.36
420	0.34
421	0.36
422	0.41
423	0.46
424	0.45
425	0.45
426	0.51
427	0.57
428	0.58
429	0.54
430	0.53
431	0.46
432	0.41
433	0.36
434	0.28
435	0.22
436	0.16
437	0.13
438	0.09
439	0.08
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.06
444	0.05
445	0.06
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.07
452	0.07
453	0.06
454	0.07
455	0.08
456	0.07
457	0.1
458	0.13
459	0.14
460	0.17
461	0.22
462	0.24
463	0.28
464	0.34
465	0.36
466	0.36
467	0.37
468	0.4
469	0.4
470	0.44
471	0.44
472	0.41
473	0.43
474	0.43
475	0.46
476	0.5
477	0.51
478	0.49
479	0.5
480	0.47
481	0.41
482	0.41
483	0.38
484	0.37

C0NRP8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer