Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1F8A550

Protein Details
Accession A0A1F8A550    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-49AREVASKGEKSKRKKKEPTPSSSSESHydrophilic
66-89SEEEKPAKKEVKKADKKKAAESSSHydrophilic
111-139ESEEEKPKKESKKESKKESKKAKDSSDSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-40KKGAEKPVDKALSKIAREVASKGEKSKRKKKE
70-83KPAKKEVKKADKKK
116-133KPKKESKKESKKESKKAK
455-498GGGGGRGRGGFGGRGGGGPRGGGRGGRGGFGGRGGGPPNKARGG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKTKSVSKKGAEKPVDKALSKIAREVASKGEKSKRKKKEPTPSSSSESDSDEEMESSSSSSESESEEEKPAKKEVKKADKKKAAESSSESSESESDSDSDEEMEDASSSESEEEKPKKESKKESKKESKKAKDSSDSDSSESESEDEKPAKKEVKKVEKAAESSDSSESDSSDEEEAPKKAAKEASDSDSSESESESDSDEAPKKAEKSSDSSDSDSDSSDSESEDSEESAKDSKKRKAEDDVSATPKKTKTEEPAAGASANLFVGNLSWNVDEAWLQSEFEEFGELSGVRIMTERDTGRSRGFGYVEYTNAVDAAKAFEAKRDTEIDGRKINLDYATGRPANRDQGGFQDRAQARARSFGDQASPESDTLFVGNIPFSANEDSLHEVFGQKGGIMGIRLPTDPESGRPKGFGYVQFSSVEEAREAFNELNGAEIDGRPIRLDFSTPRANNGGGGGGGRGRGGFGGRGGGGPRGGGRGGRGGFGGRGGGPPNKARGGIPEYKGTKVTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.73
3 0.71
4 0.61
5 0.54
6 0.53
7 0.52
8 0.49
9 0.47
10 0.42
11 0.4
12 0.41
13 0.41
14 0.4
15 0.41
16 0.42
17 0.46
18 0.5
19 0.55
20 0.63
21 0.72
22 0.74
23 0.77
24 0.85
25 0.88
26 0.9
27 0.92
28 0.91
29 0.89
30 0.84
31 0.79
32 0.71
33 0.64
34 0.55
35 0.48
36 0.4
37 0.32
38 0.28
39 0.22
40 0.2
41 0.16
42 0.15
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.08
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.12
52 0.13
53 0.16
54 0.21
55 0.25
56 0.28
57 0.3
58 0.34
59 0.41
60 0.43
61 0.49
62 0.54
63 0.61
64 0.69
65 0.76
66 0.81
67 0.82
68 0.82
69 0.83
70 0.81
71 0.73
72 0.68
73 0.64
74 0.58
75 0.53
76 0.51
77 0.42
78 0.33
79 0.3
80 0.26
81 0.2
82 0.16
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.1
100 0.18
101 0.21
102 0.24
103 0.29
104 0.36
105 0.44
106 0.51
107 0.61
108 0.64
109 0.72
110 0.78
111 0.84
112 0.88
113 0.9
114 0.92
115 0.92
116 0.91
117 0.89
118 0.88
119 0.84
120 0.82
121 0.75
122 0.72
123 0.69
124 0.6
125 0.52
126 0.45
127 0.38
128 0.29
129 0.26
130 0.2
131 0.14
132 0.13
133 0.16
134 0.18
135 0.2
136 0.22
137 0.26
138 0.33
139 0.35
140 0.41
141 0.47
142 0.55
143 0.59
144 0.63
145 0.65
146 0.63
147 0.61
148 0.56
149 0.5
150 0.4
151 0.35
152 0.31
153 0.24
154 0.2
155 0.19
156 0.16
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.16
167 0.14
168 0.17
169 0.19
170 0.18
171 0.21
172 0.24
173 0.27
174 0.28
175 0.28
176 0.26
177 0.24
178 0.24
179 0.18
180 0.15
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.11
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.16
192 0.16
193 0.17
194 0.2
195 0.19
196 0.22
197 0.26
198 0.32
199 0.32
200 0.32
201 0.31
202 0.29
203 0.27
204 0.22
205 0.18
206 0.12
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.11
219 0.12
220 0.17
221 0.23
222 0.29
223 0.35
224 0.38
225 0.41
226 0.46
227 0.49
228 0.49
229 0.5
230 0.49
231 0.49
232 0.48
233 0.45
234 0.39
235 0.35
236 0.31
237 0.27
238 0.26
239 0.25
240 0.32
241 0.34
242 0.34
243 0.33
244 0.32
245 0.29
246 0.25
247 0.19
248 0.11
249 0.08
250 0.05
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.05
272 0.04
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.1
283 0.11
284 0.13
285 0.16
286 0.18
287 0.18
288 0.2
289 0.2
290 0.19
291 0.19
292 0.16
293 0.17
294 0.17
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.06
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.08
307 0.11
308 0.13
309 0.14
310 0.16
311 0.17
312 0.18
313 0.23
314 0.27
315 0.29
316 0.29
317 0.29
318 0.28
319 0.26
320 0.26
321 0.2
322 0.17
323 0.15
324 0.15
325 0.19
326 0.2
327 0.19
328 0.21
329 0.23
330 0.27
331 0.27
332 0.26
333 0.21
334 0.28
335 0.32
336 0.3
337 0.28
338 0.32
339 0.3
340 0.34
341 0.37
342 0.32
343 0.28
344 0.34
345 0.36
346 0.29
347 0.3
348 0.27
349 0.26
350 0.24
351 0.25
352 0.21
353 0.2
354 0.17
355 0.17
356 0.15
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.12
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.14
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.11
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.13
390 0.16
391 0.16
392 0.2
393 0.26
394 0.28
395 0.29
396 0.28
397 0.28
398 0.28
399 0.32
400 0.32
401 0.32
402 0.31
403 0.32
404 0.32
405 0.31
406 0.3
407 0.26
408 0.22
409 0.15
410 0.14
411 0.12
412 0.12
413 0.14
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.11
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.12
424 0.13
425 0.13
426 0.12
427 0.13
428 0.14
429 0.14
430 0.18
431 0.17
432 0.23
433 0.33
434 0.32
435 0.36
436 0.37
437 0.36
438 0.33
439 0.31
440 0.25
441 0.15
442 0.15
443 0.12
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.08
448 0.07
449 0.08
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.12
454 0.12
455 0.14
456 0.15
457 0.16
458 0.15
459 0.14
460 0.15
461 0.14
462 0.15
463 0.14
464 0.15
465 0.2
466 0.21
467 0.21
468 0.21
469 0.2
470 0.2
471 0.2
472 0.2
473 0.13
474 0.15
475 0.18
476 0.21
477 0.24
478 0.28
479 0.33
480 0.34
481 0.34
482 0.32
483 0.36
484 0.4
485 0.44
486 0.43
487 0.47
488 0.47
489 0.48