Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0NDR7

Protein Details
Accession C0NDR7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-51ISNIRGKRKGPRGLRHSHTABasic
276-304TAALRHSKKTHHRSHKNRKHRQHFTSHPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-44GKRKGPRG
282-296SKKTHHRSHKNRKHR
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 9.833, cyto 7.5, cyto_mito 6.166, cysk 5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023797  RNA3'_phos_cyclase_dom  
IPR037136  RNA3'_phos_cyclase_dom_sf  
IPR000228  RNA3'_term_phos_cyc  
IPR013792  RNA3'P_cycl/enolpyr_Trfase_a/b  
Gene Ontology GO:0003963  F:RNA-3'-phosphate cyclase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01137  RTC  
Amino Acid Sequences MLHLDGSNLEGGGQLVRNALTLSALTGRPVTISNIRGKRKGPRGLRHSHTAAIQFLAEICGARIVGATVGSSEITFYPRDTENALLNGGTGGDESPSVLQVRARLHPIPLTSPIQSEYNIRLTTPGSIFLIFQALYPYLMYAGARLHTKGEVVSVTPASRVIKLNITGGTNISFSPTYDYVSQVLIPTFAKLGLPSLSVKLNRRGWSTGTVQIGSVSFEIEPLAISSVRRVPPGQTESSCFLPVRYPRISLENLDPGYITRVDITVLAPDTTLRQTAALRHSKKTHHRSHKNRKHRQHFTSHPENEPPKRTTFVESEFDVGESEGLEPSSSEGRGLYDSPSLQSIRSFLEDAIMKSVTRSLRVFSDNNAVATKQPSADETPVVRIHTTEPTYDPSHIYILLVAHTSTGFRLGRSQLYSEYQPKERNKESCFPNAEAHLETLLYGMVNECVAGLMEEFTTVTDEEPNDVPKRGTKGCLDTFMRDQVVVFQALGELDEEGKGCKSGNQTEEPGLSLHSLTAMWVCERILGVKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.11
6 0.1
7 0.09
8 0.08
9 0.1
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.15
17 0.18
18 0.2
19 0.25
20 0.34
21 0.42
22 0.48
23 0.52
24 0.56
25 0.61
26 0.65
27 0.7
28 0.71
29 0.72
30 0.75
31 0.8
32 0.81
33 0.79
34 0.73
35 0.66
36 0.6
37 0.52
38 0.45
39 0.36
40 0.3
41 0.21
42 0.18
43 0.16
44 0.12
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.17
68 0.19
69 0.2
70 0.21
71 0.21
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.12
76 0.09
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.14
88 0.18
89 0.21
90 0.25
91 0.25
92 0.26
93 0.28
94 0.29
95 0.28
96 0.29
97 0.29
98 0.25
99 0.25
100 0.25
101 0.23
102 0.23
103 0.22
104 0.21
105 0.24
106 0.23
107 0.22
108 0.21
109 0.2
110 0.23
111 0.21
112 0.19
113 0.14
114 0.14
115 0.15
116 0.13
117 0.15
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.16
148 0.15
149 0.18
150 0.19
151 0.21
152 0.21
153 0.21
154 0.18
155 0.17
156 0.17
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.09
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.13
185 0.17
186 0.2
187 0.27
188 0.32
189 0.33
190 0.36
191 0.36
192 0.35
193 0.36
194 0.36
195 0.33
196 0.29
197 0.26
198 0.23
199 0.22
200 0.2
201 0.16
202 0.12
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.12
215 0.13
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.21
220 0.26
221 0.27
222 0.23
223 0.25
224 0.26
225 0.28
226 0.28
227 0.21
228 0.17
229 0.19
230 0.2
231 0.23
232 0.22
233 0.21
234 0.21
235 0.25
236 0.26
237 0.23
238 0.24
239 0.23
240 0.22
241 0.2
242 0.19
243 0.15
244 0.16
245 0.14
246 0.11
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.11
264 0.19
265 0.26
266 0.28
267 0.31
268 0.36
269 0.42
270 0.51
271 0.57
272 0.61
273 0.63
274 0.71
275 0.79
276 0.87
277 0.9
278 0.91
279 0.92
280 0.92
281 0.92
282 0.91
283 0.86
284 0.83
285 0.81
286 0.79
287 0.79
288 0.71
289 0.63
290 0.6
291 0.6
292 0.56
293 0.52
294 0.46
295 0.38
296 0.37
297 0.36
298 0.33
299 0.31
300 0.3
301 0.28
302 0.26
303 0.25
304 0.22
305 0.21
306 0.17
307 0.14
308 0.09
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.13
334 0.13
335 0.11
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.17
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.18
344 0.15
345 0.16
346 0.16
347 0.15
348 0.18
349 0.23
350 0.24
351 0.22
352 0.29
353 0.27
354 0.27
355 0.26
356 0.23
357 0.2
358 0.21
359 0.2
360 0.13
361 0.12
362 0.13
363 0.16
364 0.17
365 0.18
366 0.18
367 0.21
368 0.22
369 0.23
370 0.2
371 0.18
372 0.19
373 0.22
374 0.23
375 0.2
376 0.2
377 0.23
378 0.26
379 0.26
380 0.25
381 0.2
382 0.2
383 0.18
384 0.16
385 0.13
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.07
394 0.12
395 0.11
396 0.11
397 0.15
398 0.18
399 0.22
400 0.24
401 0.26
402 0.23
403 0.27
404 0.32
405 0.35
406 0.37
407 0.39
408 0.45
409 0.49
410 0.55
411 0.58
412 0.6
413 0.59
414 0.63
415 0.62
416 0.64
417 0.62
418 0.57
419 0.53
420 0.48
421 0.45
422 0.37
423 0.33
424 0.24
425 0.19
426 0.16
427 0.12
428 0.1
429 0.07
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.1
449 0.1
450 0.13
451 0.15
452 0.2
453 0.21
454 0.22
455 0.23
456 0.25
457 0.32
458 0.32
459 0.35
460 0.36
461 0.41
462 0.44
463 0.51
464 0.49
465 0.48
466 0.48
467 0.48
468 0.44
469 0.35
470 0.32
471 0.28
472 0.27
473 0.23
474 0.19
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.13
479 0.09
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.1
487 0.09
488 0.13
489 0.19
490 0.26
491 0.31
492 0.36
493 0.39
494 0.42
495 0.43
496 0.4
497 0.34
498 0.28
499 0.23
500 0.18
501 0.14
502 0.11
503 0.1
504 0.09
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.12
511 0.13