FuNGI

C0NYY1

Protein Details

Accession

C0NYY1

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-51	GPPMKIRRLKVDPLVRPKKKRIPLSPGPGPGH	Basic
531-550	GTDTARKKPKNKHTDVQVES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-57	RPPPGPSGPPMKIRRLKVDPLVRPKKKRIPLSPGPGPGHPGAGPV
474-487	ERGKKEKGKESDKN
499-523	SGRLKHTDPLGKKAASRAARKRPGS
536-541	RKKPKN
572-575	KKRG

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSTPPNRPPVTRPPPGPSGPPMKIRRLKVDPLVRPKKKRIPLSPGPGPGHPGAGPVANGRVGSPRPRPLQTAPRSQPSATQLKPAIPSADDLTVNGFSGPLLSKTYVDYPLVTTKRAWREGIKHHVAKFASKKNIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRASNIGPASEKDDQPSRRHGELNEAEREELEAKKAAREKERADNLAQIAPSAAATQKKTNALKQRTQQVFKSEMNPEEIVKARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSETYAMFVLQNDGKMRMVPLDKWYKFTTKTPFKTLSIEEAEKFMAKKIQDPRWFMEKEQDRAQKKALEAYAKQSRLFTGRKEGHTRVSEGFEGDDLDFEEDRFADDEEHVGIFDEDEDAKTAEKRIKEDQLKANIFDLKDERMYDEEENQEKKEKEALRNFGKHVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDESSDDSETEQLKEEKPEEERGKKEKGKESDKNSGISTKGTNTPSGRLKHTDPLGKKAASRAARKRPGSPNLSEASGTDTARKKPKNKHTDVQVESRPMSPGPSGQRKPNVAADQASKKRGRNGPPGSGSDGERGAGSGAEMSDSAAAGTKKLKLNPPGVLSKMGTPRGSRPGSPRANSPVPPTRTSSPGLTTPVSTNLAFPTALEIHSAIPATGIASAELLKIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDKLLRPGVLKEGTE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.66
3	0.65
4	0.63
5	0.59
6	0.59
7	0.56
8	0.6
9	0.59
10	0.62
11	0.66
12	0.67
13	0.69
14	0.67
15	0.69
16	0.69
17	0.74
18	0.73
19	0.76
20	0.82
21	0.82
22	0.83
23	0.86
24	0.87
25	0.86
26	0.87
27	0.85
28	0.84
29	0.85
30	0.86
31	0.84
32	0.82
33	0.76
34	0.67
35	0.62
36	0.52
37	0.45
38	0.35
39	0.28
40	0.21
41	0.19
42	0.18
43	0.15
44	0.17
45	0.15
46	0.15
47	0.14
48	0.18
49	0.21
50	0.28
51	0.33
52	0.39
53	0.44
54	0.47
55	0.53
56	0.55
57	0.63
58	0.62
59	0.67
60	0.64
61	0.66
62	0.67
63	0.61
64	0.59
65	0.55
66	0.57
67	0.46
68	0.48
69	0.42
70	0.42
71	0.44
72	0.4
73	0.36
74	0.27
75	0.28
76	0.24
77	0.25
78	0.21
79	0.19
80	0.2
81	0.18
82	0.17
83	0.15
84	0.12
85	0.08
86	0.1
87	0.1
88	0.09
89	0.11
90	0.12
91	0.13
92	0.15
93	0.19
94	0.2
95	0.2
96	0.2
97	0.2
98	0.28
99	0.29
100	0.28
101	0.27
102	0.33
103	0.4
104	0.43
105	0.43
106	0.41
107	0.48
108	0.56
109	0.64
110	0.65
111	0.62
112	0.6
113	0.63
114	0.56
115	0.56
116	0.56
117	0.54
118	0.54
119	0.51
120	0.55
121	0.59
122	0.68
123	0.64
124	0.61
125	0.57
126	0.58
127	0.59
128	0.55
129	0.5
130	0.48
131	0.46
132	0.46
133	0.45
134	0.45
135	0.52
136	0.57
137	0.62
138	0.65
139	0.74
140	0.76
141	0.75
142	0.73
143	0.71
144	0.64
145	0.6
146	0.52
147	0.45
148	0.38
149	0.36
150	0.35
151	0.31
152	0.3
153	0.27
154	0.33
155	0.34
156	0.36
157	0.44
158	0.43
159	0.42
160	0.45
161	0.42
162	0.44
163	0.47
164	0.49
165	0.46
166	0.41
167	0.38
168	0.35
169	0.36
170	0.28
171	0.21
172	0.17
173	0.15
174	0.15
175	0.2
176	0.25
177	0.28
178	0.33
179	0.39
180	0.42
181	0.48
182	0.54
183	0.52
184	0.48
185	0.47
186	0.42
187	0.39
188	0.34
189	0.24
190	0.18
191	0.15
192	0.13
193	0.1
194	0.1
195	0.11
196	0.13
197	0.16
198	0.2
199	0.27
200	0.3
201	0.37
202	0.44
203	0.48
204	0.53
205	0.56
206	0.63
207	0.63
208	0.65
209	0.61
210	0.56
211	0.55
212	0.5
213	0.49
214	0.43
215	0.37
216	0.36
217	0.34
218	0.29
219	0.26
220	0.25
221	0.23
222	0.21
223	0.2
224	0.18
225	0.18
226	0.19
227	0.17
228	0.19
229	0.21
230	0.22
231	0.24
232	0.24
233	0.23
234	0.23
235	0.22
236	0.19
237	0.14
238	0.16
239	0.14
240	0.14
241	0.13
242	0.13
243	0.13
244	0.13
245	0.14
246	0.11
247	0.1
248	0.09
249	0.1
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.08
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.07
262	0.07
263	0.09
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.11
269	0.12
270	0.13
271	0.13
272	0.19
273	0.28
274	0.28
275	0.31
276	0.33
277	0.34
278	0.35
279	0.39
280	0.43
281	0.42
282	0.46
283	0.48
284	0.5
285	0.47
286	0.48
287	0.44
288	0.39
289	0.33
290	0.31
291	0.26
292	0.23
293	0.22
294	0.19
295	0.18
296	0.14
297	0.13
298	0.11
299	0.17
300	0.24
301	0.33
302	0.38
303	0.42
304	0.45
305	0.49
306	0.49
307	0.43
308	0.44
309	0.41
310	0.39
311	0.43
312	0.47
313	0.42
314	0.43
315	0.46
316	0.4
317	0.34
318	0.36
319	0.3
320	0.26
321	0.25
322	0.3
323	0.35
324	0.32
325	0.33
326	0.28
327	0.26
328	0.27
329	0.28
330	0.22
331	0.25
332	0.29
333	0.32
334	0.38
335	0.39
336	0.4
337	0.4
338	0.41
339	0.33
340	0.3
341	0.26
342	0.2
343	0.19
344	0.12
345	0.12
346	0.09
347	0.08
348	0.06
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.09
375	0.11
376	0.13
377	0.16
378	0.19
379	0.28
380	0.32
381	0.38
382	0.43
383	0.49
384	0.48
385	0.46
386	0.44
387	0.38
388	0.33
389	0.28
390	0.23
391	0.16
392	0.16
393	0.15
394	0.14
395	0.13
396	0.15
397	0.14
398	0.15
399	0.18
400	0.21
401	0.23
402	0.22
403	0.27
404	0.25
405	0.25
406	0.29
407	0.3
408	0.34
409	0.4
410	0.46
411	0.48
412	0.52
413	0.53
414	0.54
415	0.55
416	0.49
417	0.47
418	0.47
419	0.47
420	0.53
421	0.61
422	0.63
423	0.66
424	0.7
425	0.73
426	0.69
427	0.66
428	0.59
429	0.51
430	0.46
431	0.4
432	0.36
433	0.3
434	0.27
435	0.23
436	0.21
437	0.19
438	0.14
439	0.13
440	0.12
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.14
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.14
449	0.15
450	0.14
451	0.15
452	0.14
453	0.15
454	0.17
455	0.18
456	0.18
457	0.2
458	0.28
459	0.33
460	0.37
461	0.42
462	0.45
463	0.53
464	0.54
465	0.59
466	0.58
467	0.6
468	0.64
469	0.66
470	0.68
471	0.69
472	0.67
473	0.62
474	0.54
475	0.48
476	0.39
477	0.33
478	0.27
479	0.2
480	0.24
481	0.23
482	0.27
483	0.25
484	0.3
485	0.35
486	0.36
487	0.37
488	0.35
489	0.37
490	0.39
491	0.43
492	0.46
493	0.41
494	0.45
495	0.46
496	0.43
497	0.41
498	0.39
499	0.41
500	0.4
501	0.47
502	0.5
503	0.55
504	0.63
505	0.65
506	0.69
507	0.71
508	0.72
509	0.69
510	0.62
511	0.57
512	0.5
513	0.48
514	0.4
515	0.31
516	0.28
517	0.24
518	0.22
519	0.23
520	0.25
521	0.29
522	0.38
523	0.45
524	0.48
525	0.56
526	0.66
527	0.71
528	0.76
529	0.77
530	0.78
531	0.82
532	0.78
533	0.75
534	0.69
535	0.62
536	0.55
537	0.48
538	0.4
539	0.3
540	0.27
541	0.2
542	0.21
543	0.26
544	0.35
545	0.37
546	0.42
547	0.5
548	0.5
549	0.53
550	0.56
551	0.51
552	0.43
553	0.44
554	0.43
555	0.46
556	0.48
557	0.52
558	0.49
559	0.47
560	0.54
561	0.58
562	0.6
563	0.6
564	0.63
565	0.64
566	0.65
567	0.65
568	0.61
569	0.55
570	0.49
571	0.4
572	0.34
573	0.25
574	0.2
575	0.17
576	0.12
577	0.1
578	0.08
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.08
588	0.08
589	0.09
590	0.12
591	0.17
592	0.22
593	0.27
594	0.34
595	0.38
596	0.44
597	0.48
598	0.51
599	0.51
600	0.48
601	0.47
602	0.41
603	0.4
604	0.41
605	0.4
606	0.38
607	0.35
608	0.38
609	0.44
610	0.46
611	0.43
612	0.43
613	0.49
614	0.55
615	0.55
616	0.56
617	0.55
618	0.58
619	0.56
620	0.58
621	0.57
622	0.54
623	0.54
624	0.54
625	0.49
626	0.47
627	0.47
628	0.43
629	0.37
630	0.36
631	0.37
632	0.33
633	0.31
634	0.29
635	0.3
636	0.3
637	0.26
638	0.23
639	0.2
640	0.21
641	0.18
642	0.16
643	0.17
644	0.15
645	0.15
646	0.16
647	0.15
648	0.14
649	0.16
650	0.16
651	0.1
652	0.09
653	0.09
654	0.08
655	0.09
656	0.08
657	0.07
658	0.07
659	0.08
660	0.08
661	0.09
662	0.09
663	0.1
664	0.14
665	0.16
666	0.17
667	0.21
668	0.25
669	0.33
670	0.4
671	0.45
672	0.46
673	0.56
674	0.64
675	0.64
676	0.63
677	0.55
678	0.49
679	0.44
680	0.48
681	0.46
682	0.4
683	0.39
684	0.38
685	0.39
686	0.38
687	0.37
688	0.3
689	0.24
690	0.22
691	0.21
692	0.21
693	0.24
694	0.27
695	0.32
696	0.34
697	0.33
698	0.34
699	0.35
700	0.4

C0NYY1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer