Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1F8A5J0

Protein Details
Accession A0A1F8A5J0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-401ATEPERARPSRGRKRHYDDNSFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
425-431KKKRKKV
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSDRASSASFRLGPPSPSSPAAGSLKANHPSYTSTEHTPQTPTSPPLMSVSAQNYASNFASSQTSPGQATSQPANLSSPPSSVPMSTQASQQPTVGTTNSFPTPASSVNGHFTGATPVDDSEQTEKSFGPEMGATSTTDMNAPMQQTEYRRTDHDRQSEGPSAQTGIRDFGNTGGQDMLNHGDAMDIDKGTADLSNYESSLESLQKEFTSAFHLCKSSHIATGPDPSYDLVSLYGLGPVAKSVARMDPVTGEKINRLRKSYEGKLKGLGLAGRNKPVKHEPGMAGGLRQMTMWPEEEWQNQKVFGKEIKVADMDSALYNLQMRAMKMEPGTVTNNDYWEDILGHEKQSKHAGSGDGSKKTATPSNGARVPSHANGTPTATEPERARPSRGRKRHYDDNSFVGYGEGYADDDDDGAFYSNSEGISKKKRKKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.35
4 0.35
5 0.36
6 0.31
7 0.35
8 0.35
9 0.31
10 0.29
11 0.3
12 0.36
13 0.4
14 0.41
15 0.35
16 0.33
17 0.34
18 0.36
19 0.37
20 0.33
21 0.32
22 0.36
23 0.38
24 0.39
25 0.4
26 0.37
27 0.35
28 0.36
29 0.34
30 0.32
31 0.31
32 0.3
33 0.29
34 0.3
35 0.26
36 0.25
37 0.25
38 0.26
39 0.26
40 0.25
41 0.22
42 0.24
43 0.24
44 0.2
45 0.17
46 0.14
47 0.16
48 0.16
49 0.18
50 0.17
51 0.19
52 0.18
53 0.19
54 0.2
55 0.18
56 0.21
57 0.21
58 0.22
59 0.2
60 0.21
61 0.22
62 0.21
63 0.24
64 0.21
65 0.19
66 0.17
67 0.19
68 0.19
69 0.17
70 0.18
71 0.2
72 0.24
73 0.23
74 0.26
75 0.28
76 0.31
77 0.32
78 0.31
79 0.25
80 0.22
81 0.23
82 0.2
83 0.16
84 0.14
85 0.16
86 0.17
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.17
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.16
99 0.15
100 0.16
101 0.15
102 0.13
103 0.11
104 0.1
105 0.12
106 0.12
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.17
115 0.15
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.12
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.13
133 0.15
134 0.21
135 0.23
136 0.23
137 0.26
138 0.32
139 0.4
140 0.45
141 0.49
142 0.47
143 0.47
144 0.51
145 0.53
146 0.46
147 0.38
148 0.3
149 0.25
150 0.21
151 0.2
152 0.15
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.04
180 0.04
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.16
201 0.15
202 0.17
203 0.21
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.16
208 0.16
209 0.21
210 0.2
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.12
235 0.13
236 0.15
237 0.15
238 0.14
239 0.17
240 0.24
241 0.32
242 0.32
243 0.33
244 0.32
245 0.37
246 0.44
247 0.48
248 0.51
249 0.48
250 0.47
251 0.46
252 0.45
253 0.4
254 0.34
255 0.28
256 0.22
257 0.24
258 0.25
259 0.29
260 0.32
261 0.31
262 0.34
263 0.38
264 0.39
265 0.35
266 0.38
267 0.32
268 0.33
269 0.36
270 0.32
271 0.26
272 0.23
273 0.2
274 0.15
275 0.13
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.09
281 0.11
282 0.14
283 0.19
284 0.23
285 0.24
286 0.24
287 0.24
288 0.26
289 0.25
290 0.25
291 0.24
292 0.23
293 0.25
294 0.25
295 0.26
296 0.24
297 0.23
298 0.19
299 0.17
300 0.15
301 0.1
302 0.1
303 0.08
304 0.07
305 0.08
306 0.07
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.14
311 0.15
312 0.18
313 0.17
314 0.19
315 0.17
316 0.18
317 0.21
318 0.19
319 0.22
320 0.2
321 0.21
322 0.19
323 0.19
324 0.16
325 0.13
326 0.13
327 0.1
328 0.13
329 0.14
330 0.15
331 0.2
332 0.2
333 0.22
334 0.29
335 0.29
336 0.26
337 0.28
338 0.27
339 0.26
340 0.35
341 0.39
342 0.35
343 0.35
344 0.33
345 0.31
346 0.33
347 0.36
348 0.29
349 0.28
350 0.31
351 0.39
352 0.42
353 0.44
354 0.41
355 0.39
356 0.42
357 0.39
358 0.37
359 0.31
360 0.29
361 0.28
362 0.31
363 0.28
364 0.25
365 0.26
366 0.23
367 0.25
368 0.25
369 0.33
370 0.39
371 0.4
372 0.44
373 0.49
374 0.6
375 0.67
376 0.75
377 0.74
378 0.75
379 0.81
380 0.86
381 0.86
382 0.85
383 0.79
384 0.75
385 0.71
386 0.6
387 0.52
388 0.41
389 0.31
390 0.21
391 0.17
392 0.11
393 0.08
394 0.07
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.1
406 0.1
407 0.12
408 0.13
409 0.19
410 0.3
411 0.4