Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0NJ66

Protein Details
Accession C0NJ66    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-116LIGRHKRARNQEEEEQRKKKKSKEGRREKKSRRRQESDDAFSGBasic
119-139EIEGKRARKRREDGEKRSRKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-108RHKRARNQEEEEQRKKKKSKEGRREKKSRRRQ
122-138GKRARKRREDGEKRSRK
198-207KKPTKRRARK
439-454RRMKARQAAAMKASKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEPAAAESPLVDKEDDSMQHKEDDIAKLDLSDDESVLSDVDDAQFEDFDAANVSIDERPAIAIDEENLKLIGRHKRARNQEEEEQRKKKKSKEGRREKKSRRRQESDDAFSGGEEIEGKRARKRREDGEKRSRKIVEEINEEDLDPAARMSSCPTPAIIVLSRLLTRGNISFFSSLIFTGRRRALDRMMDEQLKKPTKRRARKADGIDLADLADAEIEDVRRRMTDAAKLDSIARKENRPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLLAALGRLPINKETLIASGIGRVIVFYTKSKRPEIGIKRQAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYEEAYFDPSQLAARNQGVSAQATAAEARARELLPPRLANRARVEAGHTSYTIVPRSTTVQESRFARPLGASGEDRFRRMKARQAAAMKASKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.13
4 0.14
5 0.19
6 0.21
7 0.24
8 0.26
9 0.26
10 0.28
11 0.28
12 0.3
13 0.3
14 0.3
15 0.3
16 0.28
17 0.26
18 0.25
19 0.25
20 0.22
21 0.2
22 0.16
23 0.12
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.13
61 0.2
62 0.27
63 0.31
64 0.4
65 0.48
66 0.56
67 0.67
68 0.74
69 0.76
70 0.74
71 0.75
72 0.77
73 0.79
74 0.8
75 0.79
76 0.79
77 0.8
78 0.79
79 0.78
80 0.78
81 0.79
82 0.81
83 0.82
84 0.86
85 0.88
86 0.92
87 0.95
88 0.95
89 0.95
90 0.95
91 0.95
92 0.94
93 0.91
94 0.87
95 0.87
96 0.86
97 0.82
98 0.73
99 0.63
100 0.53
101 0.44
102 0.37
103 0.26
104 0.16
105 0.1
106 0.08
107 0.12
108 0.16
109 0.17
110 0.24
111 0.31
112 0.37
113 0.45
114 0.51
115 0.56
116 0.64
117 0.73
118 0.77
119 0.82
120 0.85
121 0.79
122 0.8
123 0.72
124 0.62
125 0.57
126 0.53
127 0.48
128 0.45
129 0.44
130 0.41
131 0.39
132 0.37
133 0.31
134 0.25
135 0.18
136 0.11
137 0.09
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.08
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.15
149 0.13
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.09
170 0.14
171 0.17
172 0.18
173 0.2
174 0.23
175 0.26
176 0.29
177 0.32
178 0.31
179 0.33
180 0.34
181 0.33
182 0.34
183 0.38
184 0.39
185 0.38
186 0.4
187 0.46
188 0.53
189 0.62
190 0.69
191 0.71
192 0.73
193 0.8
194 0.8
195 0.78
196 0.71
197 0.63
198 0.53
199 0.42
200 0.33
201 0.24
202 0.18
203 0.09
204 0.05
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.08
215 0.09
216 0.15
217 0.17
218 0.2
219 0.2
220 0.2
221 0.21
222 0.22
223 0.22
224 0.22
225 0.21
226 0.2
227 0.23
228 0.28
229 0.3
230 0.32
231 0.38
232 0.38
233 0.43
234 0.43
235 0.43
236 0.43
237 0.43
238 0.39
239 0.32
240 0.26
241 0.22
242 0.2
243 0.18
244 0.14
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.07
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.09
312 0.11
313 0.17
314 0.22
315 0.27
316 0.29
317 0.3
318 0.33
319 0.42
320 0.48
321 0.53
322 0.56
323 0.59
324 0.59
325 0.62
326 0.6
327 0.51
328 0.43
329 0.34
330 0.33
331 0.28
332 0.26
333 0.23
334 0.23
335 0.25
336 0.25
337 0.25
338 0.2
339 0.22
340 0.25
341 0.31
342 0.38
343 0.37
344 0.39
345 0.41
346 0.4
347 0.39
348 0.36
349 0.3
350 0.24
351 0.25
352 0.25
353 0.28
354 0.27
355 0.25
356 0.24
357 0.23
358 0.22
359 0.19
360 0.18
361 0.15
362 0.17
363 0.18
364 0.17
365 0.19
366 0.19
367 0.18
368 0.17
369 0.13
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.1
377 0.12
378 0.12
379 0.16
380 0.22
381 0.28
382 0.31
383 0.36
384 0.36
385 0.44
386 0.46
387 0.49
388 0.49
389 0.48
390 0.44
391 0.41
392 0.43
393 0.39
394 0.41
395 0.36
396 0.3
397 0.26
398 0.27
399 0.3
400 0.28
401 0.23
402 0.2
403 0.19
404 0.24
405 0.25
406 0.29
407 0.31
408 0.31
409 0.37
410 0.41
411 0.45
412 0.46
413 0.43
414 0.38
415 0.33
416 0.33
417 0.3
418 0.31
419 0.27
420 0.25
421 0.34
422 0.35
423 0.38
424 0.38
425 0.37
426 0.4
427 0.42
428 0.48
429 0.48
430 0.53
431 0.59
432 0.62
433 0.66
434 0.66