Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0P180

Protein Details
Accession C0P180    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
491-517QWEVHVRGRRHKRAVKSAEKRRARDEYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
497-514RGRRHKRAVKSAEKRRAR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0016765  F:transferase activity, transferring alkyl or aryl (other than methyl) groups  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MDQDSIHSIHSAILAVDLATRFNGEIINGDAMQLYKGLPIITNQIPTEERKGIPHHLLGCIGFDQEPWHVSHFKRECLRTIKEIRGRGKLPVLVGGTHYYTQAVLFKEAILDRDGENDEESGNADRERMVTDGNSEISKIATPQSEKFPILNASPEVILQKLREVDPAMASRWHPNDTRRIYRSLEIYLQTGRPASEIYQEQQRLKDAASILDNHSLHDLSYVENHATTRPSPASVGPSHLRFPTLLFWVHTEDGELTRRLSQRVDNMAEQGLVAEAESLFNYLNEKHAQGVEIDRTRGVWVSIGFKELEPYFQALLSSASTSAAATNGAGSVDIVSDAASNITSTSILNPEQLSNLKQSCLSSIKSATRHYYRQQIRWIRGRLWNALTDAHATQQLYVIDSTGACSNPSAWQSAVREPAERVVESFLSRGVAECPDPRELSEAAKRVFETQLQSSVAAGAVDGEERARQRTVFKCSTCDVCGIAVQSDEQWEVHVRGRRHKRAVKSAEKRRARDEYLESRRERGVMEKGVVNPDCNLDERLVDELAQGQGKGEDEGERVNN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.1
4 0.1
5 0.09
6 0.09
7 0.1
8 0.09
9 0.1
10 0.1
11 0.08
12 0.1
13 0.12
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.12
21 0.1
22 0.08
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.1
27 0.17
28 0.19
29 0.23
30 0.22
31 0.24
32 0.26
33 0.29
34 0.34
35 0.33
36 0.31
37 0.32
38 0.37
39 0.39
40 0.42
41 0.43
42 0.39
43 0.36
44 0.37
45 0.33
46 0.3
47 0.24
48 0.21
49 0.16
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.15
54 0.14
55 0.17
56 0.21
57 0.21
58 0.32
59 0.34
60 0.4
61 0.46
62 0.48
63 0.52
64 0.55
65 0.6
66 0.58
67 0.61
68 0.63
69 0.63
70 0.68
71 0.66
72 0.66
73 0.63
74 0.58
75 0.56
76 0.48
77 0.42
78 0.39
79 0.34
80 0.27
81 0.27
82 0.25
83 0.22
84 0.2
85 0.19
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.14
98 0.14
99 0.12
100 0.16
101 0.17
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.13
106 0.11
107 0.13
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.11
128 0.13
129 0.16
130 0.18
131 0.25
132 0.28
133 0.29
134 0.28
135 0.28
136 0.27
137 0.25
138 0.25
139 0.19
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.14
144 0.12
145 0.13
146 0.1
147 0.12
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.18
156 0.18
157 0.19
158 0.22
159 0.23
160 0.25
161 0.25
162 0.28
163 0.36
164 0.41
165 0.49
166 0.46
167 0.48
168 0.47
169 0.47
170 0.46
171 0.39
172 0.36
173 0.28
174 0.27
175 0.25
176 0.23
177 0.2
178 0.18
179 0.15
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.22
187 0.25
188 0.27
189 0.27
190 0.28
191 0.24
192 0.23
193 0.25
194 0.18
195 0.16
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.22
200 0.21
201 0.18
202 0.19
203 0.17
204 0.15
205 0.14
206 0.13
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.14
221 0.18
222 0.17
223 0.21
224 0.2
225 0.21
226 0.22
227 0.21
228 0.21
229 0.16
230 0.17
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.12
235 0.14
236 0.16
237 0.16
238 0.14
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.12
244 0.1
245 0.14
246 0.16
247 0.16
248 0.17
249 0.18
250 0.21
251 0.26
252 0.28
253 0.24
254 0.24
255 0.23
256 0.22
257 0.19
258 0.13
259 0.08
260 0.05
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.03
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.11
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.11
287 0.08
288 0.07
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.14
295 0.13
296 0.13
297 0.09
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.04
327 0.03
328 0.03
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.12
340 0.13
341 0.14
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.18
348 0.19
349 0.19
350 0.17
351 0.21
352 0.26
353 0.28
354 0.31
355 0.34
356 0.36
357 0.4
358 0.41
359 0.46
360 0.48
361 0.5
362 0.57
363 0.59
364 0.61
365 0.64
366 0.64
367 0.59
368 0.6
369 0.58
370 0.53
371 0.47
372 0.42
373 0.35
374 0.32
375 0.27
376 0.23
377 0.2
378 0.16
379 0.16
380 0.13
381 0.12
382 0.14
383 0.13
384 0.12
385 0.12
386 0.11
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.12
396 0.13
397 0.14
398 0.12
399 0.17
400 0.2
401 0.24
402 0.29
403 0.27
404 0.28
405 0.26
406 0.31
407 0.29
408 0.26
409 0.23
410 0.19
411 0.19
412 0.18
413 0.18
414 0.14
415 0.12
416 0.11
417 0.11
418 0.1
419 0.11
420 0.12
421 0.15
422 0.18
423 0.2
424 0.21
425 0.2
426 0.22
427 0.21
428 0.25
429 0.28
430 0.31
431 0.29
432 0.3
433 0.3
434 0.3
435 0.31
436 0.28
437 0.26
438 0.23
439 0.26
440 0.26
441 0.25
442 0.23
443 0.21
444 0.18
445 0.13
446 0.1
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.08
453 0.09
454 0.12
455 0.13
456 0.14
457 0.22
458 0.28
459 0.37
460 0.42
461 0.43
462 0.45
463 0.47
464 0.5
465 0.45
466 0.4
467 0.32
468 0.24
469 0.24
470 0.21
471 0.18
472 0.14
473 0.13
474 0.12
475 0.12
476 0.12
477 0.1
478 0.11
479 0.13
480 0.15
481 0.21
482 0.26
483 0.28
484 0.38
485 0.49
486 0.57
487 0.65
488 0.7
489 0.74
490 0.78
491 0.85
492 0.86
493 0.86
494 0.87
495 0.88
496 0.89
497 0.84
498 0.81
499 0.79
500 0.73
501 0.7
502 0.68
503 0.68
504 0.69
505 0.73
506 0.67
507 0.62
508 0.58
509 0.52
510 0.44
511 0.4
512 0.38
513 0.35
514 0.36
515 0.37
516 0.38
517 0.45
518 0.44
519 0.39
520 0.32
521 0.3
522 0.29
523 0.27
524 0.26
525 0.18
526 0.18
527 0.18
528 0.2
529 0.17
530 0.15
531 0.14
532 0.14
533 0.17
534 0.17
535 0.15
536 0.13
537 0.14
538 0.15
539 0.15
540 0.14
541 0.13
542 0.14