Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1G4BFI1

Protein Details
Accession A0A1G4BFI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-372DGETTKPQQPRRRHPPRRDDFEAMBasic
445-474LHSWKANRRGNYHRKRRRWARTRYIVDSTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
452-464RRGNYHRKRRRWA
612-621ARGKFKRRKV
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_mito 10.5, mito 7.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHHLVQSHQWVSLKLLSEDTKVLQVVPNTTISLGKLGSFPSNLVLERPYHITYEIQDRRDGENFNRLRVVPTSEIHADALADLNAQNAEEEGTTLENVIAAPDGAEFELVDQESGNVVAHSRREIIDDAARQTLTTEEIEQLKQGNTDAGKDIIAKLLLSHTAIDQKTAFSLAKYKLLKTKKYIRRFMIQPLDPLTLGKWLLEEKDAGKVLEMREEMMGLLNSWANVHFGGVSPTDKPETVTIDGSGMLDKSEIGGRWLVVEDTGGLVTAAMAERMGILYPKDPEDAEEAEAMDFVKEEANGAKSAESNATTLDDAATIQTQETSTGAAAQDSTLNLEETTTDATMTNDGETTKPQQPRRRHPPRRDDFEAMFAPTNTLTLIHPNSQPNLALLKYYNFDSTNPNQPYPLHPLATNLLPISWLQLLEPEEDVTYSTPPPEVSDEELHSWKANRRGNYHRKRRRWARTRYIVDSTRAGGFSGLVIASTMDTVSILRHTLPLLAGGAPIAVYSQSIEPLTELADCFSIARRAGWSSNPPPEAAGKSVQDLERWEGSDDFPINPTLLLGANVQTSRAKRWQVLPGRTHPMMMGRGGADGYVFTGWKAVPAEGKVEARGKFKRRKVEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.28
4 0.28
5 0.3
6 0.27
7 0.26
8 0.23
9 0.23
10 0.21
11 0.22
12 0.22
13 0.23
14 0.23
15 0.2
16 0.21
17 0.21
18 0.18
19 0.18
20 0.15
21 0.14
22 0.13
23 0.15
24 0.17
25 0.17
26 0.16
27 0.17
28 0.19
29 0.19
30 0.19
31 0.19
32 0.18
33 0.2
34 0.24
35 0.23
36 0.21
37 0.22
38 0.22
39 0.23
40 0.32
41 0.36
42 0.33
43 0.36
44 0.37
45 0.41
46 0.43
47 0.44
48 0.37
49 0.41
50 0.4
51 0.4
52 0.41
53 0.37
54 0.36
55 0.34
56 0.36
57 0.3
58 0.29
59 0.32
60 0.29
61 0.3
62 0.27
63 0.25
64 0.18
65 0.15
66 0.15
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.05
104 0.06
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.13
109 0.13
110 0.16
111 0.17
112 0.2
113 0.24
114 0.26
115 0.26
116 0.27
117 0.26
118 0.23
119 0.22
120 0.19
121 0.15
122 0.13
123 0.12
124 0.13
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.18
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.15
133 0.13
134 0.15
135 0.16
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.16
150 0.16
151 0.17
152 0.16
153 0.15
154 0.15
155 0.17
156 0.16
157 0.1
158 0.16
159 0.17
160 0.24
161 0.25
162 0.27
163 0.34
164 0.4
165 0.45
166 0.47
167 0.56
168 0.58
169 0.66
170 0.72
171 0.69
172 0.7
173 0.68
174 0.7
175 0.68
176 0.6
177 0.53
178 0.48
179 0.45
180 0.37
181 0.34
182 0.25
183 0.18
184 0.16
185 0.13
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.14
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.16
197 0.15
198 0.18
199 0.18
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.06
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.06
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.12
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.06
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.08
339 0.13
340 0.18
341 0.25
342 0.32
343 0.4
344 0.49
345 0.59
346 0.69
347 0.76
348 0.8
349 0.84
350 0.88
351 0.88
352 0.88
353 0.84
354 0.78
355 0.67
356 0.62
357 0.53
358 0.43
359 0.34
360 0.25
361 0.2
362 0.14
363 0.13
364 0.08
365 0.08
366 0.06
367 0.1
368 0.12
369 0.14
370 0.17
371 0.19
372 0.2
373 0.2
374 0.2
375 0.17
376 0.17
377 0.14
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.12
382 0.13
383 0.14
384 0.12
385 0.14
386 0.19
387 0.22
388 0.3
389 0.32
390 0.31
391 0.3
392 0.3
393 0.33
394 0.35
395 0.35
396 0.26
397 0.23
398 0.25
399 0.26
400 0.26
401 0.23
402 0.14
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.09
408 0.08
409 0.07
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.09
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.1
425 0.12
426 0.13
427 0.16
428 0.18
429 0.2
430 0.23
431 0.24
432 0.23
433 0.22
434 0.23
435 0.24
436 0.3
437 0.33
438 0.35
439 0.4
440 0.51
441 0.61
442 0.69
443 0.75
444 0.77
445 0.82
446 0.88
447 0.92
448 0.92
449 0.91
450 0.91
451 0.91
452 0.91
453 0.88
454 0.84
455 0.81
456 0.73
457 0.65
458 0.57
459 0.47
460 0.39
461 0.32
462 0.25
463 0.18
464 0.14
465 0.11
466 0.1
467 0.08
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.04
495 0.04
496 0.05
497 0.06
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.1
511 0.13
512 0.12
513 0.13
514 0.14
515 0.17
516 0.2
517 0.24
518 0.31
519 0.35
520 0.42
521 0.42
522 0.41
523 0.39
524 0.4
525 0.38
526 0.32
527 0.3
528 0.23
529 0.24
530 0.29
531 0.28
532 0.26
533 0.26
534 0.28
535 0.26
536 0.26
537 0.26
538 0.23
539 0.23
540 0.27
541 0.25
542 0.22
543 0.2
544 0.2
545 0.18
546 0.17
547 0.15
548 0.11
549 0.1
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.13
554 0.13
555 0.15
556 0.18
557 0.2
558 0.25
559 0.32
560 0.35
561 0.36
562 0.43
563 0.52
564 0.57
565 0.64
566 0.65
567 0.66
568 0.69
569 0.65
570 0.59
571 0.5
572 0.46
573 0.39
574 0.32
575 0.27
576 0.19
577 0.19
578 0.19
579 0.17
580 0.12
581 0.09
582 0.1
583 0.08
584 0.08
585 0.07
586 0.09
587 0.09
588 0.13
589 0.14
590 0.15
591 0.18
592 0.19
593 0.22
594 0.25
595 0.27
596 0.28
597 0.32
598 0.35
599 0.38
600 0.46
601 0.53
602 0.58
603 0.64