FuNGI

A0A1G4AY39

Protein Details

Accession

A0A1G4AY39

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-58	GQPGQPGQPRPPPIKRRPKGDPLVARKRPGAPRPPASRPRPGS	Basic
207-231	LKDPSADKKPKPKEKEKDVQFHRQP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-59	PRPPPIKRRPKGDPLVARKRPGAPRPPASRPRPGSL
212-237	ADKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEKEK
428-447	KAEEERRKEGKRTTKALIKR
522-534	ALKKGKSLKRPGS
546-552	SRKKLKK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPPPGLPNGQNPNGQPGQPGQPRPPPIKRRPKGDPLVARKRPGAPRPPASRPRPGSLQTAPGARPPTGAPGHRGLQRPETEEDIRAKRAANGGWLDPAPQNVREFKIVTTKKALRDGVRHHVMKLYSAKAELEKNGIDPTNQDEFTRPVTLQRRDPRQPPPGREVKHEEPEPQPVDEKEAERLAQLKAEREAVRAVELAKSAPSLKDPSADKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEKEKKQQGLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAPLSETTVCFVATRDGKFAAIPLEKWYKFTAKPHFNTMRLEEAEALMSKKTDIGRWYMRDKQKKSEQEEWEATRHALYGPARIKTESSTFRAASREEKQDHDEIDMEGDEFQDDDENPGLDVDNDEDTKEATDRIRRDQMGANLFGEADERRVEKELNEMRKAEEERRKEGKRTTKALIKREKETIYQSDSSGYDPFESSSSEDDSDEEKKKEEDKDKDKDDENKEKDGDSKDKAASGVSPKGNTTPSGRQKHTDALKKGKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKLKKHAAASVHQSRSSTPSGGLKSNLGKGAMSDGEATGGEMSDGQLRKKKIKLVGSGARGTPVGSRAGSPVPAAAGSKPGSPVPEGSPAPRGPIQAHEIVDALPELPGGISIGNLMRRFQGRIGDGPGQMDRKEWIKLVKENCAYGSDKILRRRP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.46
3	0.44
4	0.38
5	0.34
6	0.39
7	0.42
8	0.46
9	0.45
10	0.51
11	0.58
12	0.64
13	0.71
14	0.71
15	0.75
16	0.81
17	0.81
18	0.82
19	0.84
20	0.86
21	0.85
22	0.84
23	0.84
24	0.83
25	0.87
26	0.84
27	0.79
28	0.73
29	0.73
30	0.72
31	0.7
32	0.7
33	0.68
34	0.72
35	0.76
36	0.81
37	0.83
38	0.8
39	0.81
40	0.77
41	0.74
42	0.71
43	0.67
44	0.64
45	0.58
46	0.57
47	0.5
48	0.5
49	0.44
50	0.41
51	0.41
52	0.34
53	0.32
54	0.26
55	0.3
56	0.31
57	0.32
58	0.31
59	0.33
60	0.39
61	0.43
62	0.47
63	0.44
64	0.46
65	0.48
66	0.48
67	0.45
68	0.46
69	0.43
70	0.42
71	0.46
72	0.42
73	0.4
74	0.38
75	0.35
76	0.32
77	0.35
78	0.31
79	0.3
80	0.28
81	0.27
82	0.29
83	0.28
84	0.27
85	0.23
86	0.26
87	0.23
88	0.23
89	0.25
90	0.25
91	0.28
92	0.29
93	0.29
94	0.27
95	0.35
96	0.35
97	0.36
98	0.41
99	0.44
100	0.46
101	0.52
102	0.55
103	0.5
104	0.55
105	0.58
106	0.59
107	0.62
108	0.58
109	0.51
110	0.51
111	0.46
112	0.43
113	0.42
114	0.35
115	0.28
116	0.28
117	0.28
118	0.27
119	0.29
120	0.25
121	0.23
122	0.21
123	0.2
124	0.23
125	0.22
126	0.18
127	0.17
128	0.21
129	0.23
130	0.23
131	0.22
132	0.21
133	0.23
134	0.26
135	0.27
136	0.22
137	0.24
138	0.33
139	0.37
140	0.44
141	0.51
142	0.57
143	0.61
144	0.68
145	0.69
146	0.71
147	0.74
148	0.71
149	0.71
150	0.71
151	0.66
152	0.67
153	0.66
154	0.63
155	0.63
156	0.59
157	0.55
158	0.49
159	0.54
160	0.49
161	0.41
162	0.37
163	0.29
164	0.32
165	0.3
166	0.29
167	0.24
168	0.23
169	0.22
170	0.2
171	0.22
172	0.18
173	0.19
174	0.19
175	0.18
176	0.18
177	0.24
178	0.24
179	0.23
180	0.24
181	0.21
182	0.2
183	0.18
184	0.18
185	0.13
186	0.12
187	0.11
188	0.1
189	0.11
190	0.11
191	0.1
192	0.12
193	0.14
194	0.14
195	0.19
196	0.22
197	0.28
198	0.38
199	0.45
200	0.48
201	0.55
202	0.65
203	0.7
204	0.76
205	0.8
206	0.79
207	0.81
208	0.86
209	0.84
210	0.84
211	0.8
212	0.82
213	0.79
214	0.78
215	0.75
216	0.71
217	0.67
218	0.65
219	0.69
220	0.68
221	0.68
222	0.69
223	0.73
224	0.72
225	0.77
226	0.74
227	0.71
228	0.69
229	0.63
230	0.56
231	0.48
232	0.44
233	0.36
234	0.32
235	0.25
236	0.18
237	0.16
238	0.12
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.13
243	0.13
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.12
248	0.11
249	0.09
250	0.06
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.1
258	0.09
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.12
265	0.14
266	0.15
267	0.15
268	0.15
269	0.15
270	0.15
271	0.15
272	0.15
273	0.13
274	0.13
275	0.16
276	0.23
277	0.22
278	0.24
279	0.26
280	0.25
281	0.27
282	0.33
283	0.39
284	0.4
285	0.42
286	0.5
287	0.53
288	0.51
289	0.51
290	0.46
291	0.42
292	0.34
293	0.32
294	0.23
295	0.18
296	0.17
297	0.15
298	0.13
299	0.07
300	0.07
301	0.06
302	0.08
303	0.09
304	0.1
305	0.11
306	0.16
307	0.21
308	0.25
309	0.3
310	0.36
311	0.43
312	0.5
313	0.52
314	0.55
315	0.59
316	0.63
317	0.66
318	0.67
319	0.62
320	0.6
321	0.61
322	0.55
323	0.48
324	0.41
325	0.34
326	0.24
327	0.21
328	0.14
329	0.13
330	0.11
331	0.16
332	0.18
333	0.19
334	0.2
335	0.2
336	0.21
337	0.18
338	0.23
339	0.2
340	0.21
341	0.22
342	0.22
343	0.23
344	0.25
345	0.24
346	0.24
347	0.25
348	0.29
349	0.27
350	0.29
351	0.31
352	0.31
353	0.31
354	0.26
355	0.22
356	0.16
357	0.14
358	0.12
359	0.09
360	0.07
361	0.06
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.08
385	0.14
386	0.16
387	0.21
388	0.27
389	0.27
390	0.29
391	0.32
392	0.35
393	0.33
394	0.32
395	0.27
396	0.21
397	0.21
398	0.18
399	0.15
400	0.1
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.1
408	0.19
409	0.25
410	0.3
411	0.32
412	0.32
413	0.31
414	0.36
415	0.38
416	0.38
417	0.39
418	0.37
419	0.42
420	0.5
421	0.53
422	0.52
423	0.58
424	0.59
425	0.59
426	0.6
427	0.58
428	0.57
429	0.61
430	0.65
431	0.67
432	0.61
433	0.57
434	0.58
435	0.55
436	0.5
437	0.48
438	0.43
439	0.39
440	0.36
441	0.32
442	0.28
443	0.27
444	0.25
445	0.21
446	0.17
447	0.12
448	0.11
449	0.12
450	0.1
451	0.1
452	0.1
453	0.11
454	0.12
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.14
459	0.19
460	0.22
461	0.21
462	0.2
463	0.21
464	0.26
465	0.33
466	0.39
467	0.43
468	0.48
469	0.56
470	0.59
471	0.62
472	0.63
473	0.64
474	0.63
475	0.64
476	0.59
477	0.56
478	0.52
479	0.48
480	0.48
481	0.45
482	0.42
483	0.34
484	0.35
485	0.31
486	0.31
487	0.31
488	0.26
489	0.24
490	0.23
491	0.27
492	0.24
493	0.25
494	0.24
495	0.26
496	0.27
497	0.26
498	0.27
499	0.3
500	0.37
501	0.45
502	0.46
503	0.47
504	0.49
505	0.55
506	0.58
507	0.57
508	0.54
509	0.56
510	0.59
511	0.62
512	0.69
513	0.67
514	0.67
515	0.68
516	0.7
517	0.68
518	0.71
519	0.71
520	0.71
521	0.68
522	0.62
523	0.55
524	0.49
525	0.41
526	0.34
527	0.36
528	0.3
529	0.28
530	0.3
531	0.28
532	0.31
533	0.4
534	0.45
535	0.41
536	0.47
537	0.56
538	0.62
539	0.67
540	0.7
541	0.69
542	0.68
543	0.74
544	0.74
545	0.67
546	0.58
547	0.52
548	0.44
549	0.41
550	0.38
551	0.3
552	0.23
553	0.25
554	0.27
555	0.29
556	0.3
557	0.29
558	0.29
559	0.32
560	0.32
561	0.26
562	0.22
563	0.2
564	0.23
565	0.19
566	0.16
567	0.13
568	0.11
569	0.11
570	0.11
571	0.11
572	0.07
573	0.07
574	0.06
575	0.05
576	0.06
577	0.11
578	0.13
579	0.16
580	0.22
581	0.26
582	0.33
583	0.37
584	0.44
585	0.46
586	0.53
587	0.57
588	0.61
589	0.65
590	0.65
591	0.64
592	0.57
593	0.51
594	0.42
595	0.35
596	0.28
597	0.21
598	0.18
599	0.15
600	0.15
601	0.16
602	0.18
603	0.19
604	0.17
605	0.15
606	0.13
607	0.14
608	0.14
609	0.12
610	0.15
611	0.15
612	0.16
613	0.17
614	0.18
615	0.19
616	0.19
617	0.22
618	0.2
619	0.27
620	0.27
621	0.28
622	0.33
623	0.31
624	0.35
625	0.35
626	0.33
627	0.27
628	0.31
629	0.34
630	0.32
631	0.33
632	0.28
633	0.26
634	0.24
635	0.23
636	0.18
637	0.13
638	0.08
639	0.07
640	0.06
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.04
646	0.06
647	0.09
648	0.14
649	0.15
650	0.16
651	0.2
652	0.23
653	0.26
654	0.27
655	0.31
656	0.3
657	0.33
658	0.39
659	0.4
660	0.38
661	0.39
662	0.41
663	0.37
664	0.33
665	0.3
666	0.27
667	0.25
668	0.27
669	0.28
670	0.31
671	0.35
672	0.42
673	0.46
674	0.53
675	0.53
676	0.52
677	0.5
678	0.47
679	0.43
680	0.37
681	0.4
682	0.39
683	0.42

A0A1G4AY39

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer