Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0NHJ5

Protein Details
Accession C0NHJ5    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-103ASTKDDRKRSNMSRNERRSRSRDRDDRRRDRSRSRDRRDKSRSRERRERDRDRDRDRDRABasic
252-276NNIYGVRKEKKTQYRQYMNRQGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-119KDDRKRSNMSRNERRSRSRDRDDRRRDRSRSRDRRDKSRSRERRERDRDRDRDRDRAGRKDRDRSGSRGRYTR
130-176RERGRDRSWSRSLSPARSPARNGSASTRSRRSRSPPPPRGSRPDRRG
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAEPPAKRARRTDSSTMWEMNDTKSHSDDYDNNELHGGMSKREASTKDDRKRSNMSRNERRSRSRDRDDRRRDRSRSRDRRDKSRSRERRERDRDRDRDRDRAGRKDRDRSGSRGRYTRWGDYGKTAQYRERGRDRSWSRSLSPARSPARNGSASTRSRRSRSPPPPRGSRPDRRGDLPPRDQVWESAKMGANGISSESRRHGSTKSKIQPVLESMGVDIDSADAEDLDQLIRKTMGFSSFRTTQNTKVPGNNIYGVRKEKKTQYRQYMNRQGGFNRPLSPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.66
3 0.61
4 0.54
5 0.48
6 0.42
7 0.37
8 0.34
9 0.3
10 0.27
11 0.27
12 0.28
13 0.25
14 0.28
15 0.3
16 0.32
17 0.39
18 0.37
19 0.35
20 0.34
21 0.33
22 0.28
23 0.3
24 0.23
25 0.15
26 0.18
27 0.2
28 0.2
29 0.24
30 0.26
31 0.26
32 0.36
33 0.45
34 0.52
35 0.58
36 0.61
37 0.64
38 0.71
39 0.74
40 0.74
41 0.73
42 0.74
43 0.76
44 0.83
45 0.87
46 0.85
47 0.84
48 0.82
49 0.83
50 0.82
51 0.82
52 0.81
53 0.82
54 0.85
55 0.88
56 0.91
57 0.89
58 0.9
59 0.86
60 0.87
61 0.87
62 0.88
63 0.88
64 0.87
65 0.88
66 0.84
67 0.88
68 0.87
69 0.87
70 0.85
71 0.85
72 0.86
73 0.85
74 0.89
75 0.86
76 0.88
77 0.88
78 0.89
79 0.88
80 0.88
81 0.88
82 0.86
83 0.88
84 0.81
85 0.8
86 0.74
87 0.73
88 0.68
89 0.68
90 0.69
91 0.68
92 0.69
93 0.69
94 0.7
95 0.69
96 0.67
97 0.64
98 0.65
99 0.64
100 0.62
101 0.58
102 0.54
103 0.54
104 0.55
105 0.51
106 0.46
107 0.4
108 0.36
109 0.36
110 0.38
111 0.33
112 0.32
113 0.3
114 0.28
115 0.32
116 0.34
117 0.36
118 0.41
119 0.41
120 0.39
121 0.47
122 0.49
123 0.5
124 0.52
125 0.49
126 0.41
127 0.46
128 0.47
129 0.41
130 0.4
131 0.4
132 0.38
133 0.37
134 0.38
135 0.32
136 0.34
137 0.32
138 0.3
139 0.26
140 0.31
141 0.34
142 0.37
143 0.41
144 0.41
145 0.42
146 0.45
147 0.47
148 0.5
149 0.57
150 0.63
151 0.65
152 0.68
153 0.75
154 0.76
155 0.79
156 0.77
157 0.76
158 0.72
159 0.71
160 0.67
161 0.62
162 0.65
163 0.64
164 0.64
165 0.59
166 0.58
167 0.51
168 0.51
169 0.47
170 0.42
171 0.38
172 0.34
173 0.29
174 0.27
175 0.27
176 0.24
177 0.24
178 0.21
179 0.17
180 0.12
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.13
185 0.14
186 0.16
187 0.16
188 0.18
189 0.21
190 0.28
191 0.36
192 0.45
193 0.5
194 0.56
195 0.57
196 0.56
197 0.55
198 0.49
199 0.44
200 0.34
201 0.26
202 0.19
203 0.17
204 0.16
205 0.12
206 0.09
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.19
224 0.19
225 0.21
226 0.26
227 0.32
228 0.35
229 0.4
230 0.41
231 0.4
232 0.47
233 0.51
234 0.47
235 0.47
236 0.48
237 0.45
238 0.46
239 0.46
240 0.41
241 0.39
242 0.42
243 0.45
244 0.48
245 0.49
246 0.52
247 0.56
248 0.63
249 0.69
250 0.74
251 0.77
252 0.81
253 0.86
254 0.9
255 0.91
256 0.88
257 0.83
258 0.77
259 0.69
260 0.67
261 0.63
262 0.55
263 0.49