Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C0NHA4

Protein Details
Accession C0NHA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
456-476GAKAVARQVKKRRTIENAIKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-249KKVATAPFPQGKAGSKKAPKNPLLEKRPR
464-467VKKR
Subcellular Location(s) mito 12.5, mito_nucl 8.5, cyto 7, nucl 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016635  AP_complex_ssu  
IPR022775  AP_mu_sigma_su  
IPR029064  L30e-like  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR001921  Ribosomal_L7A/L8  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
IPR004037  Ribosomal_L7Ae_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01217  Clat_adaptor_s  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01082  RIBOSOMAL_L7AE  
Amino Acid Sequences MINAVLVFNNSGQPRLTKFYTQLDTQTQQSLIAQIYNLVSQRPSSACNFLPLPPLLAEGASSSTPATSFSDAPSQITYRTYATLSFILISTSTESPLALIDLIQVFVEALDRLFENVCELDLIFGFETMHAVLGEMIVGGVVLETNLERIVQGVKSQEGSKAKRRTAEAGSGAIGRAGIPGLGVPWSLNTKVGFLFVIPLLVPVNQRSYDNTDKMPPKTGKKVATAPFPQGKAGSKKAPKNPLLEKRPRNFGIGQDIQPKRNLSRMVKWPEYVRLQRQKKILNLRLKVPPAIAQFQNTLDRNTAAQTLKLLNKYRPESKAEKKERLLKEATAVQAGQKKEDVSKKPYTVKYGLNHVVGLIENKKASLVLIPNDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYAIIKGKARLGTVVHKKTAAVLALTEVRSEDKTELSKLISAIKEGYSDKYEESKRRWGGGIMGAKAVARQVKKRRTIENAIKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.29
3 0.33
4 0.31
5 0.36
6 0.42
7 0.46
8 0.45
9 0.46
10 0.47
11 0.46
12 0.44
13 0.43
14 0.35
15 0.31
16 0.29
17 0.26
18 0.19
19 0.18
20 0.15
21 0.13
22 0.14
23 0.16
24 0.16
25 0.15
26 0.14
27 0.14
28 0.18
29 0.18
30 0.2
31 0.21
32 0.26
33 0.25
34 0.29
35 0.31
36 0.28
37 0.32
38 0.29
39 0.28
40 0.23
41 0.24
42 0.19
43 0.17
44 0.15
45 0.11
46 0.12
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.15
57 0.22
58 0.22
59 0.23
60 0.24
61 0.23
62 0.21
63 0.22
64 0.21
65 0.17
66 0.18
67 0.17
68 0.15
69 0.17
70 0.17
71 0.16
72 0.14
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.02
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.13
143 0.14
144 0.19
145 0.24
146 0.29
147 0.37
148 0.43
149 0.45
150 0.48
151 0.5
152 0.49
153 0.46
154 0.47
155 0.4
156 0.33
157 0.31
158 0.27
159 0.24
160 0.19
161 0.14
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.05
173 0.07
174 0.07
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.13
195 0.19
196 0.23
197 0.25
198 0.25
199 0.29
200 0.33
201 0.34
202 0.4
203 0.37
204 0.37
205 0.42
206 0.47
207 0.44
208 0.44
209 0.5
210 0.46
211 0.49
212 0.46
213 0.44
214 0.42
215 0.38
216 0.35
217 0.28
218 0.29
219 0.26
220 0.28
221 0.3
222 0.32
223 0.38
224 0.45
225 0.52
226 0.52
227 0.53
228 0.59
229 0.61
230 0.64
231 0.67
232 0.69
233 0.64
234 0.67
235 0.63
236 0.57
237 0.49
238 0.42
239 0.4
240 0.35
241 0.34
242 0.36
243 0.37
244 0.34
245 0.36
246 0.35
247 0.27
248 0.29
249 0.32
250 0.27
251 0.33
252 0.41
253 0.45
254 0.46
255 0.47
256 0.44
257 0.43
258 0.46
259 0.43
260 0.43
261 0.46
262 0.5
263 0.53
264 0.57
265 0.57
266 0.57
267 0.63
268 0.62
269 0.61
270 0.58
271 0.58
272 0.58
273 0.54
274 0.48
275 0.38
276 0.35
277 0.29
278 0.3
279 0.26
280 0.22
281 0.21
282 0.22
283 0.28
284 0.24
285 0.22
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.18
290 0.2
291 0.15
292 0.14
293 0.15
294 0.18
295 0.21
296 0.26
297 0.28
298 0.27
299 0.34
300 0.38
301 0.43
302 0.42
303 0.45
304 0.48
305 0.54
306 0.62
307 0.63
308 0.66
309 0.66
310 0.72
311 0.69
312 0.67
313 0.6
314 0.5
315 0.45
316 0.42
317 0.37
318 0.29
319 0.25
320 0.23
321 0.25
322 0.24
323 0.21
324 0.19
325 0.19
326 0.24
327 0.32
328 0.34
329 0.36
330 0.43
331 0.47
332 0.54
333 0.56
334 0.57
335 0.53
336 0.54
337 0.5
338 0.51
339 0.5
340 0.43
341 0.39
342 0.33
343 0.29
344 0.23
345 0.23
346 0.16
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.14
355 0.15
356 0.19
357 0.19
358 0.19
359 0.2
360 0.2
361 0.15
362 0.12
363 0.11
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.08
371 0.08
372 0.1
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.15
377 0.19
378 0.18
379 0.19
380 0.21
381 0.28
382 0.3
383 0.32
384 0.28
385 0.28
386 0.31
387 0.31
388 0.27
389 0.24
390 0.24
391 0.32
392 0.41
393 0.44
394 0.42
395 0.4
396 0.4
397 0.4
398 0.4
399 0.31
400 0.21
401 0.16
402 0.17
403 0.21
404 0.21
405 0.19
406 0.16
407 0.16
408 0.17
409 0.19
410 0.17
411 0.16
412 0.19
413 0.21
414 0.23
415 0.22
416 0.24
417 0.23
418 0.28
419 0.25
420 0.23
421 0.23
422 0.22
423 0.24
424 0.23
425 0.26
426 0.22
427 0.23
428 0.24
429 0.3
430 0.37
431 0.41
432 0.46
433 0.52
434 0.53
435 0.55
436 0.55
437 0.48
438 0.46
439 0.46
440 0.48
441 0.39
442 0.36
443 0.32
444 0.3
445 0.29
446 0.28
447 0.26
448 0.24
449 0.32
450 0.42
451 0.52
452 0.62
453 0.68
454 0.73
455 0.76
456 0.81