Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TQ45

Protein Details
Accession A7TQ45    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-109DGVAPRAKMNQQRSRRFRTAMHydrophilic
183-207HKIMDYIRKKRSQKGYNPNLRHCIYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8, pero 5, E.R. 4, mito 3.5, cyto_mito 3.5, plas 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR016494  5_3_exoribonuclease_1  
IPR041385  SH3_12  
IPR040992  XRN1_D1  
IPR047007  XRN1_D1_sf  
IPR041106  XRN1_D2_D3  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR047008  XRN1_SH3_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG vpo:Kpol_1006p9  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18129  SH3_12  
PF18332  XRN1_D1  
PF18334  XRN1_D2_D3  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPKFFRYICERWPLILQLIENDNVPEFDNLYLDMNSILHSCSHGDRGDTEGIIKPLTEEEIFTRIFIYIDHLFQLIKPKKVFYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRTAMENEKAMNKIIENGGVISEEIKPFDPNAITPGTTFMEKLTKYLKYFIHDKISNDINWANIEIILSGHEVPGEGEHKIMDYIRKKRSQKGYNPNLRHCIYGLDADLIILGLSTHAPHFAILREEVTFTKTLKNKKTGLELQRFYFLQLSLLREYLELEFKDIANKLKYKYDFERILDDFILILFVIGNDFLPNLPDLHLNKGAFPVILETFKLSLLSSEGYINENGTIDLKRLSTWIDYLSKFELMNFKQKEFNEEWFNKQLIALAKEKQADSKGNKLLINNRRKILSKIENWINEEVFANQLINENVELRLKRNVIIGNSDFFKALCKDLSLEIVKDKKKNEYLIHPIFKENQGEVETTELGLQYEEMKNVLKKHKDSYKEFHSTPDKLPKLDKLDEFNNESFTKMKSSYYLRKLSIDITDEEKVTDLAKNYVEGLQWVMYYYYRGCASWGWFYRYHYAPRISDIYLGLNQKIQFEKDDPFTPFQQLMAVLPERSKELIPTIFRPLMYNQDSPILDFYPSEVKLDRNGKSADWEAVVLISFVDQERLVAAMEPLLKDLEPKDARRNKFGTDILFLYENVEKENYRSPNINIFPDIFSDKCHEEIFSLEIPEKLQYGLLPGTFLRQKLLFGFPTLYTLQFMGKQGMLGCKIFENPSKQETMSLIIHNRKKEDSASIEDFSTRYLGKTIYIHWPYLKESKLHSIYNDGRFYELQFIPDKLGHKHKKFVTRSATSEEKAIMNKMKDKWSRNLKNQGGIITEPIHSLVVVNRFKGFGKSRKDALIRSYEEEVEYYPLQLVIEKVMHNMEIALLNSQDQLRTEYKIGSTFVYLGDNLYGAKAKIIELDENNKFVVEIEPFNSNNENMLKRFRIKDKENIKYYPSFVLAKMLKISSLALSRITSKYRITDMSGQQINVGLPLKNPGRDIKVEGYSRKLLNFWEFSHATLDLIISFKSTFPELFNDLTKEGPKITSAENILMNMTSENRSLLLQKARTWIKENTKDLELVPVTSKQLSGSVVREIELIVQKQKSDNSEKKPLRFSNIISQYLLNPYESSILLETQNFLLGDKVRYILKSGLVPEGSIGTVISLRTVAKLLYIDVLFDDEFLGGRTYGDVITTGRVMAVKCTSLLNLTSTSLLARGTNPKKLERSVAKIVTGSKKEVNKNSGMKQKGDKSIPVTSKKKFIFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.45
3 0.41
4 0.39
5 0.32
6 0.27
7 0.29
8 0.28
9 0.24
10 0.22
11 0.19
12 0.17
13 0.18
14 0.14
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.14
20 0.13
21 0.12
22 0.12
23 0.11
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.14
31 0.19
32 0.19
33 0.2
34 0.21
35 0.25
36 0.27
37 0.25
38 0.24
39 0.24
40 0.24
41 0.22
42 0.21
43 0.17
44 0.15
45 0.18
46 0.16
47 0.13
48 0.15
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.18
53 0.15
54 0.15
55 0.13
56 0.16
57 0.15
58 0.16
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.18
63 0.28
64 0.29
65 0.33
66 0.34
67 0.35
68 0.38
69 0.42
70 0.43
71 0.36
72 0.39
73 0.34
74 0.34
75 0.32
76 0.3
77 0.27
78 0.27
79 0.24
80 0.14
81 0.17
82 0.22
83 0.29
84 0.4
85 0.48
86 0.56
87 0.67
88 0.75
89 0.81
90 0.82
91 0.77
92 0.72
93 0.73
94 0.73
95 0.73
96 0.69
97 0.63
98 0.58
99 0.58
100 0.54
101 0.44
102 0.35
103 0.25
104 0.24
105 0.21
106 0.21
107 0.17
108 0.17
109 0.15
110 0.14
111 0.14
112 0.11
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.18
120 0.18
121 0.15
122 0.18
123 0.19
124 0.18
125 0.17
126 0.2
127 0.18
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.2
132 0.2
133 0.23
134 0.25
135 0.28
136 0.29
137 0.36
138 0.37
139 0.35
140 0.41
141 0.44
142 0.48
143 0.47
144 0.47
145 0.46
146 0.48
147 0.43
148 0.4
149 0.35
150 0.27
151 0.24
152 0.23
153 0.18
154 0.13
155 0.13
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.13
173 0.18
174 0.26
175 0.34
176 0.43
177 0.52
178 0.57
179 0.65
180 0.74
181 0.76
182 0.78
183 0.8
184 0.83
185 0.84
186 0.88
187 0.86
188 0.83
189 0.73
190 0.64
191 0.53
192 0.45
193 0.36
194 0.3
195 0.24
196 0.17
197 0.16
198 0.14
199 0.14
200 0.11
201 0.08
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.15
218 0.15
219 0.17
220 0.17
221 0.15
222 0.22
223 0.26
224 0.34
225 0.41
226 0.47
227 0.49
228 0.52
229 0.6
230 0.61
231 0.66
232 0.67
233 0.62
234 0.57
235 0.58
236 0.54
237 0.46
238 0.39
239 0.29
240 0.23
241 0.22
242 0.24
243 0.21
244 0.21
245 0.2
246 0.17
247 0.19
248 0.17
249 0.19
250 0.15
251 0.16
252 0.17
253 0.16
254 0.2
255 0.2
256 0.23
257 0.24
258 0.27
259 0.27
260 0.34
261 0.37
262 0.4
263 0.44
264 0.48
265 0.48
266 0.46
267 0.51
268 0.44
269 0.44
270 0.38
271 0.32
272 0.23
273 0.17
274 0.15
275 0.08
276 0.07
277 0.04
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.13
290 0.14
291 0.19
292 0.25
293 0.24
294 0.24
295 0.25
296 0.24
297 0.19
298 0.17
299 0.15
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.09
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.15
331 0.19
332 0.19
333 0.21
334 0.22
335 0.22
336 0.21
337 0.21
338 0.25
339 0.22
340 0.31
341 0.31
342 0.31
343 0.35
344 0.35
345 0.4
346 0.36
347 0.39
348 0.39
349 0.4
350 0.43
351 0.42
352 0.42
353 0.35
354 0.32
355 0.3
356 0.25
357 0.26
358 0.23
359 0.22
360 0.25
361 0.27
362 0.28
363 0.26
364 0.26
365 0.3
366 0.31
367 0.37
368 0.37
369 0.39
370 0.4
371 0.4
372 0.46
373 0.49
374 0.55
375 0.52
376 0.49
377 0.48
378 0.49
379 0.49
380 0.49
381 0.48
382 0.43
383 0.46
384 0.51
385 0.51
386 0.51
387 0.5
388 0.41
389 0.33
390 0.29
391 0.21
392 0.15
393 0.12
394 0.09
395 0.07
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.12
403 0.13
404 0.13
405 0.18
406 0.18
407 0.18
408 0.21
409 0.23
410 0.21
411 0.26
412 0.26
413 0.23
414 0.24
415 0.23
416 0.2
417 0.17
418 0.18
419 0.14
420 0.14
421 0.12
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.17
426 0.16
427 0.15
428 0.19
429 0.25
430 0.28
431 0.31
432 0.32
433 0.35
434 0.38
435 0.43
436 0.42
437 0.43
438 0.49
439 0.53
440 0.56
441 0.5
442 0.47
443 0.44
444 0.43
445 0.37
446 0.27
447 0.21
448 0.18
449 0.18
450 0.16
451 0.15
452 0.12
453 0.1
454 0.11
455 0.08
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.1
464 0.12
465 0.18
466 0.25
467 0.28
468 0.3
469 0.37
470 0.43
471 0.49
472 0.53
473 0.55
474 0.56
475 0.57
476 0.55
477 0.54
478 0.53
479 0.49
480 0.48
481 0.51
482 0.44
483 0.39
484 0.41
485 0.39
486 0.4
487 0.41
488 0.38
489 0.33
490 0.35
491 0.37
492 0.39
493 0.34
494 0.31
495 0.27
496 0.25
497 0.22
498 0.19
499 0.18
500 0.14
501 0.14
502 0.15
503 0.21
504 0.29
505 0.35
506 0.4
507 0.38
508 0.39
509 0.39
510 0.38
511 0.34
512 0.27
513 0.21
514 0.2
515 0.2
516 0.18
517 0.17
518 0.15
519 0.13
520 0.12
521 0.12
522 0.09
523 0.09
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.11
528 0.1
529 0.09
530 0.09
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.12
544 0.18
545 0.2
546 0.22
547 0.23
548 0.26
549 0.3
550 0.31
551 0.32
552 0.3
553 0.31
554 0.28
555 0.29
556 0.3
557 0.25
558 0.24
559 0.21
560 0.18
561 0.18
562 0.18
563 0.15
564 0.15
565 0.15
566 0.16
567 0.16
568 0.15
569 0.13
570 0.14
571 0.16
572 0.17
573 0.2
574 0.2
575 0.22
576 0.22
577 0.22
578 0.2
579 0.18
580 0.16
581 0.13
582 0.1
583 0.11
584 0.1
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.1
590 0.1
591 0.08
592 0.1
593 0.13
594 0.15
595 0.17
596 0.2
597 0.2
598 0.2
599 0.21
600 0.2
601 0.23
602 0.25
603 0.23
604 0.19
605 0.22
606 0.22
607 0.21
608 0.21
609 0.15
610 0.11
611 0.1
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.12
616 0.11
617 0.11
618 0.17
619 0.23
620 0.23
621 0.22
622 0.23
623 0.22
624 0.24
625 0.25
626 0.2
627 0.14
628 0.13
629 0.09
630 0.09
631 0.08
632 0.05
633 0.04
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.05
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.07
652 0.07
653 0.14
654 0.16
655 0.19
656 0.28
657 0.36
658 0.38
659 0.43
660 0.44
661 0.38
662 0.4
663 0.4
664 0.32
665 0.27
666 0.25
667 0.21
668 0.19
669 0.17
670 0.14
671 0.14
672 0.12
673 0.1
674 0.1
675 0.09
676 0.1
677 0.17
678 0.17
679 0.17
680 0.19
681 0.2
682 0.26
683 0.28
684 0.28
685 0.22
686 0.22
687 0.2
688 0.2
689 0.21
690 0.13
691 0.12
692 0.14
693 0.14
694 0.14
695 0.13
696 0.12
697 0.11
698 0.11
699 0.13
700 0.11
701 0.11
702 0.1
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.1
707 0.07
708 0.06
709 0.06
710 0.07
711 0.08
712 0.07
713 0.07
714 0.07
715 0.1
716 0.12
717 0.12
718 0.11
719 0.11
720 0.12
721 0.13
722 0.16
723 0.14
724 0.13
725 0.15
726 0.13
727 0.16
728 0.16
729 0.14
730 0.11
731 0.11
732 0.11
733 0.11
734 0.12
735 0.1
736 0.1
737 0.1
738 0.11
739 0.12
740 0.13
741 0.11
742 0.11
743 0.1
744 0.11
745 0.13
746 0.15
747 0.18
748 0.19
749 0.21
750 0.23
751 0.22
752 0.22
753 0.21
754 0.22
755 0.18
756 0.18
757 0.21
758 0.26
759 0.3
760 0.31
761 0.32
762 0.29
763 0.28
764 0.27
765 0.27
766 0.24
767 0.27
768 0.29
769 0.28
770 0.27
771 0.26
772 0.24
773 0.2
774 0.17
775 0.11
776 0.08
777 0.08
778 0.08
779 0.09
780 0.11
781 0.13
782 0.2
783 0.22
784 0.23
785 0.23
786 0.24
787 0.26
788 0.3
789 0.29
790 0.21
791 0.22
792 0.3
793 0.32
794 0.32
795 0.29
796 0.32
797 0.36
798 0.41
799 0.4
800 0.32
801 0.3
802 0.29
803 0.29
804 0.28
805 0.23
806 0.18
807 0.18
808 0.18
809 0.18
810 0.2
811 0.22
812 0.19
813 0.29
814 0.36
815 0.37
816 0.44
817 0.48
818 0.56
819 0.58
820 0.62
821 0.6
822 0.56
823 0.56
824 0.55
825 0.53
826 0.44
827 0.41
828 0.34
829 0.27
830 0.23
831 0.23
832 0.22
833 0.2
834 0.25
835 0.27
836 0.35
837 0.4
838 0.44
839 0.5
840 0.57
841 0.63
842 0.67
843 0.74
844 0.68
845 0.66
846 0.63
847 0.56
848 0.47
849 0.38
850 0.31
851 0.22
852 0.19
853 0.14
854 0.13
855 0.11
856 0.09
857 0.09
858 0.1
859 0.16
860 0.17
861 0.18
862 0.18
863 0.19
864 0.2
865 0.25
866 0.29
867 0.29
868 0.35
869 0.39
870 0.41
871 0.47
872 0.49
873 0.46
874 0.44
875 0.44
876 0.39
877 0.38
878 0.37
879 0.31
880 0.28
881 0.27
882 0.22
883 0.17
884 0.15
885 0.12
886 0.1
887 0.1
888 0.09
889 0.09
890 0.09
891 0.08
892 0.1
893 0.09
894 0.1
895 0.11
896 0.11
897 0.1
898 0.09
899 0.08
900 0.08
901 0.08
902 0.08
903 0.07
904 0.07
905 0.09
906 0.09
907 0.09
908 0.08
909 0.13
910 0.13
911 0.16
912 0.17
913 0.17
914 0.18
915 0.2
916 0.2
917 0.16
918 0.16
919 0.14
920 0.13
921 0.13
922 0.11
923 0.1
924 0.09
925 0.08
926 0.07
927 0.07
928 0.08
929 0.06
930 0.07
931 0.07
932 0.07
933 0.1
934 0.12
935 0.15
936 0.16
937 0.24
938 0.25
939 0.25
940 0.25
941 0.22
942 0.2
943 0.17
944 0.17
945 0.12
946 0.12
947 0.12
948 0.16
949 0.17
950 0.19
951 0.19
952 0.17
953 0.18
954 0.21
955 0.22
956 0.2
957 0.25
958 0.27
959 0.31
960 0.37
961 0.42
962 0.47
963 0.49
964 0.57
965 0.62
966 0.68
967 0.69
968 0.66
969 0.62
970 0.56
971 0.53
972 0.46
973 0.39
974 0.31
975 0.25
976 0.3
977 0.27
978 0.25
979 0.26
980 0.23
981 0.19
982 0.18
983 0.19
984 0.14
985 0.15
986 0.14
987 0.13
988 0.14
989 0.18
990 0.2
991 0.22
992 0.22
993 0.22
994 0.24
995 0.26
996 0.27
997 0.28
998 0.33
999 0.34
1000 0.4
1001 0.4
1002 0.37
1003 0.34
1004 0.33
1005 0.29
1006 0.23
1007 0.21
1008 0.13
1009 0.11
1010 0.18
1011 0.2
1012 0.2
1013 0.22
1014 0.24
1015 0.27
1016 0.29
1017 0.33
1018 0.32
1019 0.37
1020 0.4
1021 0.4
1022 0.41
1023 0.42
1024 0.41
1025 0.37
1026 0.33
1027 0.29
1028 0.3
1029 0.31
1030 0.27
1031 0.3
1032 0.29
1033 0.29
1034 0.3
1035 0.27
1036 0.21
1037 0.18
1038 0.16
1039 0.1
1040 0.1
1041 0.09
1042 0.08
1043 0.08
1044 0.08
1045 0.1
1046 0.11
1047 0.11
1048 0.12
1049 0.16
1050 0.18
1051 0.2
1052 0.22
1053 0.23
1054 0.22
1055 0.24
1056 0.23
1057 0.2
1058 0.19
1059 0.17
1060 0.16
1061 0.16
1062 0.17
1063 0.2
1064 0.2
1065 0.22
1066 0.22
1067 0.21
1068 0.2
1069 0.18
1070 0.17
1071 0.13
1072 0.13
1073 0.11
1074 0.11
1075 0.11
1076 0.11
1077 0.12
1078 0.14
1079 0.19
1080 0.25
1081 0.26
1082 0.29
1083 0.36
1084 0.4
1085 0.43
1086 0.46
1087 0.49
1088 0.52
1089 0.59
1090 0.6
1091 0.56
1092 0.54
1093 0.52
1094 0.46
1095 0.45
1096 0.35
1097 0.28
1098 0.26
1099 0.23
1100 0.23
1101 0.22
1102 0.22
1103 0.15
1104 0.17
1105 0.17
1106 0.18
1107 0.17
1108 0.2
1109 0.2
1110 0.2
1111 0.2
1112 0.18
1113 0.21
1114 0.22
1115 0.23
1116 0.24
1117 0.25
1118 0.25
1119 0.28
1120 0.32
1121 0.34
1122 0.39
1123 0.46
1124 0.48
1125 0.58
1126 0.63
1127 0.66
1128 0.72
1129 0.7
1130 0.67
1131 0.63
1132 0.59
1133 0.59
1134 0.6
1135 0.56
1136 0.48
1137 0.45
1138 0.4
1139 0.4
1140 0.36
1141 0.26
1142 0.19
1143 0.17
1144 0.18
1145 0.17
1146 0.17
1147 0.13
1148 0.14
1149 0.14
1150 0.15
1151 0.15
1152 0.13
1153 0.16
1154 0.14
1155 0.13
1156 0.14
1157 0.16
1158 0.17
1159 0.17
1160 0.18
1161 0.18
1162 0.18
1163 0.21
1164 0.21
1165 0.21
1166 0.23
1167 0.24
1168 0.28
1169 0.26
1170 0.25
1171 0.23
1172 0.21
1173 0.18
1174 0.14
1175 0.12
1176 0.07
1177 0.08
1178 0.08
1179 0.08
1180 0.08
1181 0.08
1182 0.09
1183 0.1
1184 0.1
1185 0.1
1186 0.11
1187 0.12
1188 0.15
1189 0.14
1190 0.14
1191 0.13
1192 0.16
1193 0.13
1194 0.13
1195 0.12
1196 0.08
1197 0.08
1198 0.09
1199 0.1
1200 0.08
1201 0.08
1202 0.09
1203 0.09
1204 0.09
1205 0.09
1206 0.09
1207 0.09
1208 0.11
1209 0.11
1210 0.11
1211 0.1
1212 0.13
1213 0.12
1214 0.15
1215 0.17
1216 0.16
1217 0.17
1218 0.18
1219 0.18
1220 0.18
1221 0.19
1222 0.18
1223 0.17
1224 0.17
1225 0.17
1226 0.16
1227 0.16
1228 0.14
1229 0.13
1230 0.12
1231 0.15
1232 0.24
1233 0.29
1234 0.36
1235 0.4
1236 0.46
1237 0.51
1238 0.54
1239 0.6
1240 0.57
1241 0.6
1242 0.62
1243 0.62
1244 0.57
1245 0.54
1246 0.57
1247 0.57
1248 0.52
1249 0.49
1250 0.46
1251 0.5
1252 0.57
1253 0.63
1254 0.61
1255 0.61
1256 0.65
1257 0.69
1258 0.71
1259 0.68
1260 0.65
1261 0.65
1262 0.68
1263 0.68
1264 0.65
1265 0.62
1266 0.59
1267 0.64
1268 0.66
1269 0.67
1270 0.66
1271 0.62
1272 0.67