Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GM67

Protein Details
Accession C1GM67    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-79APANVNTLRRRNHRTARRRTAYMTHydrophilic
673-703YHFRNRTPEKYDRRRDRHRSRSPYGRPGRYRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
604-642KRSRSPDHPRGVPSLRGKRPSSPHRYDRASESRKPPPFR
676-705RNRTPEKYDRRRDRHRSRSPYGRPGRYRSP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036621  Anticodon-bd_dom_sf  
IPR034167  Nab3_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pbn:PADG_08153  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12342  RRM_Nab3p  
Amino Acid Sequences MSGSVYYAISGPYLSSKCSYIPVIDPFNNHPQCAPDQEIAVLGSSHSRAEPGQTAAPANVNTLRRRNHRTARRRTAYMTSNIPDEALHIRGKTLTPESPRPLYISEPSHIPLLQNQMDPAFGESGAYQELFSEKTPSSSDTEHGGIMSDQVHLASHTYTMLHRAVGGSGPNAVGDQGAVSFPESIQTGYHKTETGNESTFSAAHRPVSSSQSATHVGETSTVELNHERAVHTATATSTSTIPKTSPQLDRLILSENYPSKPYPPSTLPGADYVSNLKERGFNNNTVEHTPTLSGRHGRNIKSEANTVPDGDASHPSSLNTISDSKNSHLSSPTAIANTVASTDDYMTKPLNSDSSTFHSAGLPPRPPPQDKPSINLNYTATDNIQPFHPLPTQPENGATTQYGQSNYLQSSGLPALVAPPAAPGTSSALNGLPPTSIPTFQHQFPPSSSAQAKPDIQKFQRGERLDDEGLKFLRGDSDREEPWGPDVQKKYDEFLHYERVYVTEGMWDRFPPGSRLFVGNLPTERVTKRDLFHLFHKYGDLAQISIKQAYGFVQFVEPSACRKALEAEQGGLIRGRKIHLEISKPQKSTRHAPATDSSRTQATKRSRSPDHPRGVPSLRGKRPSSPHRYDRASESRKPPPFREFRGHDDQYRRRDDYRPNRTPSPHGHRRDEYHFRNRTPEKYDRRRDRHRSRSPYGRPGRYRSPSPRQRSYENDSDLPIPRRSLRQVPDVQIIVLENVDREFIYHIESSFQDRGLRTDVLILSPRISLAAVVRRQIIEGVLAIIKLSRTNQYSGKIPLQVFDRSGGSDNVKFNEYSEVEPNIAAEVVLQAQTIFVANTSKHPSTQVPPVISQLLPNPTRYQPLQPPLATSSNITNLISNLDGPALQSLLVALQQNPAALQVAQQQYAPQRSPTGLASILSNLSHQQNPSAPPKNTPGQASQPTCGFPQQSQLRPGAGGDTTLASLLAQTIGGQEASQLPQPPPPPKSQAPAMAPFRPQMAPHVQNIMDQLMKWKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.19
4 0.2
5 0.24
6 0.25
7 0.22
8 0.27
9 0.31
10 0.36
11 0.37
12 0.4
13 0.42
14 0.51
15 0.5
16 0.45
17 0.39
18 0.36
19 0.37
20 0.39
21 0.38
22 0.29
23 0.28
24 0.28
25 0.28
26 0.24
27 0.21
28 0.15
29 0.1
30 0.11
31 0.11
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.11
36 0.16
37 0.19
38 0.21
39 0.24
40 0.24
41 0.26
42 0.25
43 0.28
44 0.24
45 0.24
46 0.26
47 0.28
48 0.32
49 0.39
50 0.46
51 0.51
52 0.6
53 0.67
54 0.71
55 0.77
56 0.82
57 0.85
58 0.88
59 0.88
60 0.84
61 0.79
62 0.76
63 0.72
64 0.68
65 0.63
66 0.54
67 0.48
68 0.43
69 0.38
70 0.29
71 0.25
72 0.22
73 0.18
74 0.18
75 0.16
76 0.17
77 0.19
78 0.2
79 0.23
80 0.24
81 0.28
82 0.32
83 0.4
84 0.46
85 0.47
86 0.47
87 0.45
88 0.42
89 0.4
90 0.39
91 0.36
92 0.31
93 0.31
94 0.31
95 0.3
96 0.29
97 0.25
98 0.23
99 0.26
100 0.28
101 0.26
102 0.26
103 0.24
104 0.24
105 0.23
106 0.21
107 0.14
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.14
120 0.13
121 0.15
122 0.17
123 0.19
124 0.21
125 0.22
126 0.22
127 0.22
128 0.23
129 0.21
130 0.2
131 0.18
132 0.14
133 0.14
134 0.13
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.13
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.12
174 0.15
175 0.18
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.25
180 0.28
181 0.29
182 0.27
183 0.25
184 0.24
185 0.24
186 0.24
187 0.19
188 0.19
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.18
193 0.2
194 0.25
195 0.26
196 0.24
197 0.24
198 0.25
199 0.28
200 0.25
201 0.24
202 0.2
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.15
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.13
216 0.15
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.13
225 0.14
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.16
230 0.21
231 0.26
232 0.29
233 0.31
234 0.34
235 0.35
236 0.35
237 0.33
238 0.33
239 0.27
240 0.23
241 0.25
242 0.23
243 0.24
244 0.25
245 0.24
246 0.21
247 0.26
248 0.27
249 0.27
250 0.27
251 0.28
252 0.31
253 0.33
254 0.32
255 0.29
256 0.29
257 0.24
258 0.21
259 0.21
260 0.18
261 0.17
262 0.16
263 0.15
264 0.18
265 0.19
266 0.27
267 0.29
268 0.32
269 0.34
270 0.37
271 0.39
272 0.36
273 0.37
274 0.28
275 0.25
276 0.22
277 0.19
278 0.18
279 0.19
280 0.22
281 0.21
282 0.29
283 0.34
284 0.35
285 0.4
286 0.42
287 0.43
288 0.41
289 0.43
290 0.35
291 0.34
292 0.33
293 0.28
294 0.23
295 0.19
296 0.17
297 0.15
298 0.17
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.13
306 0.12
307 0.13
308 0.13
309 0.16
310 0.18
311 0.19
312 0.25
313 0.25
314 0.24
315 0.23
316 0.23
317 0.21
318 0.21
319 0.21
320 0.15
321 0.15
322 0.13
323 0.12
324 0.11
325 0.1
326 0.08
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.12
339 0.14
340 0.15
341 0.2
342 0.24
343 0.23
344 0.23
345 0.21
346 0.22
347 0.26
348 0.28
349 0.24
350 0.22
351 0.29
352 0.33
353 0.36
354 0.39
355 0.41
356 0.46
357 0.45
358 0.47
359 0.5
360 0.5
361 0.47
362 0.45
363 0.39
364 0.3
365 0.3
366 0.27
367 0.18
368 0.16
369 0.16
370 0.14
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.16
375 0.17
376 0.14
377 0.19
378 0.24
379 0.25
380 0.24
381 0.26
382 0.24
383 0.22
384 0.23
385 0.18
386 0.14
387 0.14
388 0.16
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.12
396 0.1
397 0.12
398 0.11
399 0.1
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.07
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.06
420 0.05
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.11
425 0.16
426 0.18
427 0.19
428 0.26
429 0.24
430 0.25
431 0.25
432 0.28
433 0.24
434 0.26
435 0.26
436 0.22
437 0.22
438 0.24
439 0.26
440 0.26
441 0.31
442 0.33
443 0.33
444 0.39
445 0.38
446 0.4
447 0.45
448 0.41
449 0.39
450 0.34
451 0.39
452 0.32
453 0.32
454 0.27
455 0.22
456 0.21
457 0.18
458 0.16
459 0.1
460 0.14
461 0.13
462 0.14
463 0.14
464 0.18
465 0.18
466 0.21
467 0.21
468 0.17
469 0.18
470 0.22
471 0.19
472 0.2
473 0.23
474 0.22
475 0.26
476 0.26
477 0.26
478 0.24
479 0.25
480 0.23
481 0.24
482 0.29
483 0.25
484 0.25
485 0.23
486 0.2
487 0.2
488 0.16
489 0.14
490 0.11
491 0.11
492 0.12
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.13
498 0.11
499 0.12
500 0.13
501 0.14
502 0.15
503 0.15
504 0.16
505 0.18
506 0.17
507 0.16
508 0.16
509 0.16
510 0.16
511 0.15
512 0.15
513 0.16
514 0.18
515 0.18
516 0.24
517 0.26
518 0.27
519 0.32
520 0.37
521 0.34
522 0.31
523 0.31
524 0.24
525 0.21
526 0.2
527 0.15
528 0.09
529 0.09
530 0.11
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.1
538 0.08
539 0.07
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.14
551 0.15
552 0.2
553 0.18
554 0.17
555 0.18
556 0.18
557 0.18
558 0.16
559 0.14
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.16
566 0.18
567 0.23
568 0.29
569 0.38
570 0.44
571 0.44
572 0.45
573 0.45
574 0.46
575 0.48
576 0.51
577 0.5
578 0.45
579 0.47
580 0.5
581 0.5
582 0.48
583 0.42
584 0.34
585 0.28
586 0.28
587 0.26
588 0.29
589 0.31
590 0.37
591 0.42
592 0.48
593 0.5
594 0.58
595 0.68
596 0.69
597 0.67
598 0.63
599 0.59
600 0.58
601 0.55
602 0.53
603 0.52
604 0.52
605 0.5
606 0.53
607 0.52
608 0.53
609 0.59
610 0.62
611 0.63
612 0.61
613 0.64
614 0.65
615 0.67
616 0.62
617 0.62
618 0.63
619 0.59
620 0.58
621 0.57
622 0.59
623 0.62
624 0.64
625 0.6
626 0.59
627 0.6
628 0.59
629 0.61
630 0.56
631 0.57
632 0.62
633 0.6
634 0.57
635 0.6
636 0.61
637 0.6
638 0.62
639 0.57
640 0.51
641 0.54
642 0.59
643 0.6
644 0.64
645 0.65
646 0.64
647 0.67
648 0.67
649 0.67
650 0.66
651 0.65
652 0.63
653 0.62
654 0.63
655 0.61
656 0.63
657 0.66
658 0.66
659 0.64
660 0.64
661 0.63
662 0.58
663 0.63
664 0.62
665 0.59
666 0.57
667 0.59
668 0.59
669 0.64
670 0.73
671 0.74
672 0.8
673 0.85
674 0.89
675 0.9
676 0.9
677 0.9
678 0.89
679 0.86
680 0.88
681 0.84
682 0.84
683 0.82
684 0.81
685 0.76
686 0.73
687 0.75
688 0.69
689 0.7
690 0.69
691 0.7
692 0.71
693 0.74
694 0.76
695 0.71
696 0.72
697 0.7
698 0.69
699 0.66
700 0.61
701 0.54
702 0.46
703 0.44
704 0.44
705 0.41
706 0.35
707 0.28
708 0.26
709 0.29
710 0.32
711 0.37
712 0.36
713 0.4
714 0.45
715 0.46
716 0.49
717 0.45
718 0.4
719 0.32
720 0.29
721 0.2
722 0.14
723 0.1
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.05
728 0.06
729 0.07
730 0.07
731 0.1
732 0.1
733 0.11
734 0.12
735 0.13
736 0.18
737 0.18
738 0.19
739 0.19
740 0.19
741 0.21
742 0.23
743 0.22
744 0.17
745 0.2
746 0.19
747 0.18
748 0.21
749 0.19
750 0.16
751 0.15
752 0.15
753 0.11
754 0.11
755 0.09
756 0.1
757 0.18
758 0.19
759 0.2
760 0.22
761 0.22
762 0.22
763 0.22
764 0.18
765 0.11
766 0.09
767 0.09
768 0.08
769 0.08
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.08
774 0.1
775 0.13
776 0.15
777 0.19
778 0.23
779 0.25
780 0.3
781 0.33
782 0.36
783 0.36
784 0.34
785 0.33
786 0.33
787 0.32
788 0.29
789 0.26
790 0.23
791 0.19
792 0.21
793 0.21
794 0.21
795 0.23
796 0.25
797 0.24
798 0.25
799 0.23
800 0.22
801 0.26
802 0.24
803 0.22
804 0.24
805 0.24
806 0.23
807 0.23
808 0.22
809 0.15
810 0.14
811 0.1
812 0.07
813 0.06
814 0.06
815 0.06
816 0.06
817 0.05
818 0.05
819 0.06
820 0.06
821 0.05
822 0.05
823 0.07
824 0.08
825 0.13
826 0.2
827 0.21
828 0.22
829 0.25
830 0.28
831 0.3
832 0.39
833 0.4
834 0.36
835 0.36
836 0.38
837 0.38
838 0.34
839 0.31
840 0.27
841 0.29
842 0.27
843 0.29
844 0.3
845 0.29
846 0.35
847 0.35
848 0.38
849 0.38
850 0.44
851 0.48
852 0.44
853 0.46
854 0.46
855 0.46
856 0.4
857 0.33
858 0.3
859 0.27
860 0.28
861 0.25
862 0.21
863 0.18
864 0.19
865 0.18
866 0.15
867 0.11
868 0.09
869 0.09
870 0.09
871 0.09
872 0.07
873 0.07
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.08
878 0.09
879 0.09
880 0.11
881 0.11
882 0.12
883 0.12
884 0.12
885 0.11
886 0.1
887 0.11
888 0.17
889 0.19
890 0.2
891 0.2
892 0.23
893 0.28
894 0.34
895 0.34
896 0.28
897 0.28
898 0.28
899 0.31
900 0.29
901 0.26
902 0.21
903 0.2
904 0.19
905 0.18
906 0.18
907 0.16
908 0.16
909 0.15
910 0.18
911 0.2
912 0.19
913 0.22
914 0.25
915 0.3
916 0.39
917 0.45
918 0.43
919 0.44
920 0.5
921 0.53
922 0.53
923 0.51
924 0.48
925 0.48
926 0.56
927 0.55
928 0.51
929 0.46
930 0.45
931 0.42
932 0.41
933 0.34
934 0.25
935 0.32
936 0.37
937 0.41
938 0.44
939 0.44
940 0.41
941 0.39
942 0.39
943 0.32
944 0.24
945 0.18
946 0.15
947 0.13
948 0.12
949 0.12
950 0.11
951 0.08
952 0.07
953 0.07
954 0.06
955 0.05
956 0.05
957 0.06
958 0.07
959 0.07
960 0.07
961 0.08
962 0.11
963 0.13
964 0.16
965 0.19
966 0.19
967 0.25
968 0.32
969 0.39
970 0.4
971 0.45
972 0.49
973 0.51
974 0.56
975 0.57
976 0.59
977 0.57
978 0.62
979 0.62
980 0.59
981 0.56
982 0.51
983 0.48
984 0.41
985 0.36
986 0.33
987 0.37
988 0.36
989 0.37
990 0.42
991 0.38
992 0.38
993 0.4
994 0.36
995 0.28
996 0.24