FuNGI

A0A1D2VN78

Protein Details

Accession

A0A1D2VN78

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
363-385	SINLNFKKKKRQTSKIGKNDAKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
369-390	KKKKRQTSKIGKNDAKASSKRK

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 9, cyto 5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013197 RNA_pol_III_RPC82-rel_HTH IPR008806 RNA_pol_III_Rpc82_C IPR039748 RPC3 IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF08221 HTH_9 PF05645 RNA_pol_Rpc82

Amino Acid Sequences

MTTSASILPTLSPQASLFTTLVKNSLGSNASIIISILYSYGKSTINFLISKSKLNKKLVKSILVSLIQLSITTYWTDESSKQTYYFLNQEGLLVLLYSGDIITHIKNYYQDDLPAEIIQNILNYGNLTLDNYLQTNMKNREKSSLIEFYFNKLIFDGFLMPINSNYFKNKFELYDQIYKKKLVTVFTNKSTLSIAKQKIQILKETDFEFESYFLIDNSSIFLENDRFMMRNNDYNKKIHKRINGNTSFKFNLKRYLKTVRSTHLIKLVNQYLGELPSKIYEKILFKVEKNSPNCFNYEFNNYLNDIEFLSNNSKIDVTNDGSKLMENYLNYVRQEYEDNSKNYFNFNDILNLVKSDNLDLSDSINLNFKKKKRQTSKIGKNDAKASSKRKINTKNDGEDDGYNDYEEDDDDDDFDDDFDDIEVDGKQSQSGLLNQHLKILANHSIPFLVEKTSGKYYIPFSKLIPILKEKIYLYVIKSSVDLNCFKILNCIICERLVEDKRLMNLTLIDEKTLRICINKLFKLQAICIQEIPKTAHREASREVFAYRFNNKNCYEILGNNFIYESYLIFQNLEKMREKNSILLSKVNRDDVKGQEEELLLANELNQLKWLKERELNCVGRINRARSLWDVFSII

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.17
3	0.2
4	0.18
5	0.19
6	0.21
7	0.2
8	0.22
9	0.19
10	0.19
11	0.16
12	0.21
13	0.18
14	0.16
15	0.17
16	0.17
17	0.16
18	0.16
19	0.15
20	0.1
21	0.09
22	0.08
23	0.08
24	0.07
25	0.07
26	0.07
27	0.1
28	0.12
29	0.12
30	0.16
31	0.19
32	0.23
33	0.23
34	0.24
35	0.31
36	0.31
37	0.39
38	0.43
39	0.5
40	0.53
41	0.62
42	0.69
43	0.66
44	0.74
45	0.72
46	0.71
47	0.65
48	0.61
49	0.58
50	0.51
51	0.45
52	0.35
53	0.3
54	0.23
55	0.2
56	0.16
57	0.1
58	0.09
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.11
63	0.13
64	0.15
65	0.2
66	0.23
67	0.25
68	0.25
69	0.26
70	0.26
71	0.28
72	0.31
73	0.27
74	0.26
75	0.23
76	0.23
77	0.21
78	0.2
79	0.15
80	0.1
81	0.07
82	0.05
83	0.05
84	0.04
85	0.04
86	0.03
87	0.04
88	0.06
89	0.07
90	0.09
91	0.1
92	0.12
93	0.15
94	0.19
95	0.22
96	0.22
97	0.24
98	0.23
99	0.25
100	0.25
101	0.22
102	0.19
103	0.15
104	0.14
105	0.13
106	0.11
107	0.09
108	0.08
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.08
115	0.08
116	0.09
117	0.1
118	0.1
119	0.11
120	0.12
121	0.13
122	0.21
123	0.28
124	0.35
125	0.38
126	0.39
127	0.44
128	0.44
129	0.45
130	0.43
131	0.44
132	0.37
133	0.39
134	0.39
135	0.37
136	0.4
137	0.37
138	0.31
139	0.23
140	0.22
141	0.15
142	0.16
143	0.14
144	0.09
145	0.12
146	0.12
147	0.12
148	0.13
149	0.16
150	0.16
151	0.16
152	0.2
153	0.2
154	0.21
155	0.24
156	0.24
157	0.24
158	0.25
159	0.3
160	0.32
161	0.39
162	0.41
163	0.45
164	0.45
165	0.44
166	0.41
167	0.39
168	0.36
169	0.3
170	0.34
171	0.38
172	0.42
173	0.45
174	0.47
175	0.42
176	0.4
177	0.38
178	0.31
179	0.26
180	0.28
181	0.28
182	0.3
183	0.34
184	0.37
185	0.41
186	0.41
187	0.42
188	0.38
189	0.37
190	0.35
191	0.32
192	0.3
193	0.24
194	0.24
195	0.19
196	0.14
197	0.12
198	0.1
199	0.09
200	0.07
201	0.07
202	0.07
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.16
216	0.17
217	0.22
218	0.27
219	0.33
220	0.36
221	0.4
222	0.48
223	0.51
224	0.56
225	0.56
226	0.59
227	0.61
228	0.65
229	0.71
230	0.71
231	0.69
232	0.63
233	0.62
234	0.56
235	0.49
236	0.47
237	0.37
238	0.38
239	0.37
240	0.38
241	0.39
242	0.46
243	0.49
244	0.5
245	0.52
246	0.45
247	0.47
248	0.46
249	0.43
250	0.41
251	0.38
252	0.33
253	0.35
254	0.34
255	0.29
256	0.26
257	0.25
258	0.18
259	0.18
260	0.17
261	0.11
262	0.09
263	0.1
264	0.11
265	0.11
266	0.11
267	0.13
268	0.15
269	0.17
270	0.23
271	0.23
272	0.22
273	0.29
274	0.35
275	0.39
276	0.4
277	0.42
278	0.4
279	0.39
280	0.4
281	0.35
282	0.3
283	0.25
284	0.27
285	0.25
286	0.21
287	0.21
288	0.2
289	0.18
290	0.17
291	0.15
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.1
299	0.1
300	0.1
301	0.09
302	0.1
303	0.12
304	0.11
305	0.15
306	0.15
307	0.15
308	0.15
309	0.15
310	0.14
311	0.12
312	0.12
313	0.08
314	0.1
315	0.12
316	0.14
317	0.14
318	0.15
319	0.14
320	0.13
321	0.15
322	0.14
323	0.19
324	0.22
325	0.24
326	0.25
327	0.26
328	0.26
329	0.25
330	0.24
331	0.19
332	0.14
333	0.13
334	0.13
335	0.11
336	0.13
337	0.11
338	0.12
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.08
346	0.07
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.14
352	0.14
353	0.18
354	0.23
355	0.25
356	0.35
357	0.42
358	0.52
359	0.57
360	0.66
361	0.73
362	0.79
363	0.86
364	0.86
365	0.89
366	0.81
367	0.74
368	0.71
369	0.65
370	0.6
371	0.55
372	0.51
373	0.48
374	0.5
375	0.51
376	0.54
377	0.6
378	0.62
379	0.66
380	0.67
381	0.66
382	0.63
383	0.62
384	0.54
385	0.45
386	0.38
387	0.3
388	0.23
389	0.17
390	0.14
391	0.11
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.04
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.08
417	0.1
418	0.13
419	0.18
420	0.23
421	0.23
422	0.26
423	0.26
424	0.25
425	0.23
426	0.24
427	0.24
428	0.2
429	0.21
430	0.19
431	0.18
432	0.17
433	0.18
434	0.15
435	0.11
436	0.11
437	0.12
438	0.15
439	0.18
440	0.19
441	0.18
442	0.2
443	0.23
444	0.29
445	0.3
446	0.28
447	0.26
448	0.31
449	0.34
450	0.34
451	0.33
452	0.3
453	0.31
454	0.31
455	0.33
456	0.27
457	0.27
458	0.27
459	0.26
460	0.23
461	0.26
462	0.25
463	0.22
464	0.22
465	0.21
466	0.21
467	0.22
468	0.21
469	0.18
470	0.21
471	0.21
472	0.2
473	0.23
474	0.23
475	0.22
476	0.22
477	0.22
478	0.2
479	0.2
480	0.2
481	0.18
482	0.25
483	0.25
484	0.26
485	0.26
486	0.28
487	0.3
488	0.31
489	0.3
490	0.22
491	0.21
492	0.21
493	0.26
494	0.23
495	0.22
496	0.2
497	0.2
498	0.21
499	0.22
500	0.19
501	0.14
502	0.16
503	0.22
504	0.3
505	0.34
506	0.36
507	0.36
508	0.38
509	0.39
510	0.39
511	0.38
512	0.33
513	0.31
514	0.3
515	0.29
516	0.28
517	0.28
518	0.31
519	0.31
520	0.33
521	0.32
522	0.37
523	0.37
524	0.4
525	0.42
526	0.43
527	0.4
528	0.35
529	0.35
530	0.29
531	0.32
532	0.33
533	0.36
534	0.37
535	0.37
536	0.43
537	0.44
538	0.45
539	0.41
540	0.4
541	0.36
542	0.33
543	0.36
544	0.35
545	0.34
546	0.31
547	0.3
548	0.25
549	0.23
550	0.19
551	0.14
552	0.09
553	0.11
554	0.11
555	0.12
556	0.13
557	0.2
558	0.23
559	0.26
560	0.29
561	0.29
562	0.33
563	0.39
564	0.41
565	0.39
566	0.44
567	0.46
568	0.43
569	0.5
570	0.49
571	0.5
572	0.53
573	0.54
574	0.47
575	0.44
576	0.48
577	0.45
578	0.47
579	0.4
580	0.37
581	0.33
582	0.32
583	0.29
584	0.25
585	0.21
586	0.15
587	0.14
588	0.13
589	0.15
590	0.16
591	0.14
592	0.17
593	0.17
594	0.18
595	0.25
596	0.29
597	0.3
598	0.36
599	0.39
600	0.43
601	0.52
602	0.54
603	0.5
604	0.54
605	0.49
606	0.52
607	0.57
608	0.54
609	0.5
610	0.49
611	0.5
612	0.46
613	0.51
614	0.43

A0A1D2VN78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer