Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GH39

Protein Details
Accession C1GH39    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
440-459MEERKATKKDTKKADNKVTEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 9.5, cyto_nucl 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG pbn:PADG_06575  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQTQSQQFASQTFSPPVSTPSPGAPSPVSGIAPPPKRQRFSPLPQSQSPYESPSFGTLQLPHTGSPVNVSFANGTSTPAMNAPPLPGSMGPPSRPVEKATDTAELTDVLASSGIDVREEEEYLTHAYGQAPAAPQQPPRLQTNFNNSFVTHQSAGTVSAGTSFVESPLHKSTPTQGTFVTPISISAKSATIQNPEAAAEDEILRQDTAASRRMQYPLQAPFLSTSLLEERIQKRTYDLGVRVPAHGVYRPYPGRAAGPVEVTGPDGSSVVRTGKALLTQDAPLGDILSLVTLACEERLRSVIDHSYALAINRRVNSHGVVPLEWSDMAVALTPPSAKADGTSTKEATPTAATPKRPLPNDVAKDDESPNKKQMTIVNIIAKRSRSLVEKDISFEEERASKRTRRNADAILGGDTSRAGSVGLGTSGTATPTGQLSERIMEERKATKKDTKKADNKVTEAVQHQQSVETARMATNNLTSGVRFGGKKKTYSWLTNSSPATARSVSTPSRASVGAAATAGTPTPRPTGVAVTGPSRLTGKQMGDWRESDKERGAGVQIRDILFVLEVDGKGLKHLQKAYSKESKEDNDKSVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.27
4 0.31
5 0.28
6 0.28
7 0.25
8 0.27
9 0.31
10 0.29
11 0.32
12 0.28
13 0.26
14 0.26
15 0.27
16 0.23
17 0.18
18 0.24
19 0.29
20 0.35
21 0.41
22 0.49
23 0.55
24 0.58
25 0.61
26 0.65
27 0.66
28 0.69
29 0.73
30 0.72
31 0.7
32 0.71
33 0.74
34 0.67
35 0.62
36 0.55
37 0.5
38 0.42
39 0.36
40 0.32
41 0.3
42 0.29
43 0.25
44 0.26
45 0.22
46 0.23
47 0.27
48 0.27
49 0.23
50 0.23
51 0.23
52 0.2
53 0.22
54 0.2
55 0.17
56 0.16
57 0.17
58 0.17
59 0.16
60 0.2
61 0.15
62 0.16
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.13
69 0.14
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.13
75 0.15
76 0.2
77 0.24
78 0.23
79 0.27
80 0.3
81 0.32
82 0.32
83 0.32
84 0.32
85 0.31
86 0.34
87 0.32
88 0.34
89 0.3
90 0.3
91 0.28
92 0.22
93 0.18
94 0.15
95 0.12
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.1
108 0.08
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.14
120 0.18
121 0.19
122 0.21
123 0.26
124 0.3
125 0.31
126 0.35
127 0.37
128 0.38
129 0.42
130 0.5
131 0.5
132 0.48
133 0.47
134 0.41
135 0.4
136 0.37
137 0.36
138 0.26
139 0.2
140 0.18
141 0.17
142 0.18
143 0.15
144 0.13
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.1
154 0.13
155 0.17
156 0.18
157 0.17
158 0.18
159 0.25
160 0.31
161 0.32
162 0.29
163 0.25
164 0.27
165 0.29
166 0.28
167 0.23
168 0.14
169 0.13
170 0.15
171 0.15
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.15
177 0.16
178 0.17
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.17
183 0.17
184 0.14
185 0.12
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.1
195 0.12
196 0.16
197 0.17
198 0.19
199 0.21
200 0.24
201 0.24
202 0.23
203 0.27
204 0.27
205 0.29
206 0.27
207 0.25
208 0.24
209 0.24
210 0.21
211 0.15
212 0.12
213 0.1
214 0.12
215 0.12
216 0.18
217 0.2
218 0.25
219 0.26
220 0.25
221 0.25
222 0.25
223 0.27
224 0.26
225 0.25
226 0.23
227 0.28
228 0.28
229 0.27
230 0.25
231 0.23
232 0.19
233 0.19
234 0.16
235 0.13
236 0.18
237 0.19
238 0.19
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.18
243 0.18
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.08
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.04
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.02
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.12
298 0.14
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.17
303 0.17
304 0.16
305 0.17
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.11
312 0.09
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.03
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.06
324 0.05
325 0.06
326 0.1
327 0.14
328 0.18
329 0.21
330 0.21
331 0.21
332 0.22
333 0.21
334 0.19
335 0.15
336 0.13
337 0.18
338 0.21
339 0.22
340 0.24
341 0.31
342 0.36
343 0.36
344 0.37
345 0.36
346 0.41
347 0.44
348 0.43
349 0.41
350 0.36
351 0.38
352 0.37
353 0.38
354 0.33
355 0.32
356 0.34
357 0.31
358 0.3
359 0.3
360 0.31
361 0.3
362 0.3
363 0.31
364 0.34
365 0.34
366 0.35
367 0.35
368 0.32
369 0.27
370 0.25
371 0.23
372 0.19
373 0.22
374 0.27
375 0.28
376 0.28
377 0.3
378 0.29
379 0.3
380 0.27
381 0.23
382 0.19
383 0.19
384 0.2
385 0.22
386 0.25
387 0.28
388 0.35
389 0.44
390 0.49
391 0.5
392 0.54
393 0.54
394 0.53
395 0.5
396 0.44
397 0.36
398 0.29
399 0.23
400 0.18
401 0.14
402 0.11
403 0.07
404 0.06
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.06
418 0.07
419 0.08
420 0.07
421 0.09
422 0.1
423 0.12
424 0.13
425 0.15
426 0.17
427 0.17
428 0.21
429 0.27
430 0.32
431 0.34
432 0.38
433 0.45
434 0.52
435 0.59
436 0.65
437 0.68
438 0.71
439 0.77
440 0.83
441 0.8
442 0.74
443 0.7
444 0.61
445 0.54
446 0.48
447 0.44
448 0.37
449 0.31
450 0.29
451 0.25
452 0.24
453 0.23
454 0.21
455 0.16
456 0.13
457 0.13
458 0.14
459 0.14
460 0.15
461 0.13
462 0.13
463 0.14
464 0.14
465 0.13
466 0.13
467 0.13
468 0.16
469 0.16
470 0.19
471 0.27
472 0.31
473 0.33
474 0.35
475 0.42
476 0.45
477 0.5
478 0.53
479 0.52
480 0.52
481 0.57
482 0.55
483 0.49
484 0.45
485 0.4
486 0.38
487 0.3
488 0.26
489 0.21
490 0.26
491 0.25
492 0.27
493 0.28
494 0.24
495 0.26
496 0.25
497 0.23
498 0.2
499 0.19
500 0.15
501 0.13
502 0.13
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.08
507 0.09
508 0.1
509 0.12
510 0.13
511 0.14
512 0.16
513 0.2
514 0.21
515 0.24
516 0.24
517 0.24
518 0.27
519 0.25
520 0.25
521 0.22
522 0.2
523 0.2
524 0.24
525 0.23
526 0.27
527 0.34
528 0.38
529 0.4
530 0.42
531 0.42
532 0.45
533 0.45
534 0.43
535 0.4
536 0.37
537 0.34
538 0.34
539 0.34
540 0.33
541 0.32
542 0.33
543 0.33
544 0.31
545 0.31
546 0.29
547 0.24
548 0.18
549 0.16
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.12
554 0.13
555 0.13
556 0.15
557 0.21
558 0.22
559 0.26
560 0.31
561 0.37
562 0.43
563 0.49
564 0.56
565 0.6
566 0.59
567 0.58
568 0.61
569 0.62
570 0.64
571 0.64