Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VNN2

Protein Details
Accession A0A1D2VNN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-256SNNNDSNKPKSKHRKYAHVIDINHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MGNELDNQEDFLKEFLIPSAQLPWQLLDLTQTDLKDSNKNSQLFNSLLTLPKSISKTTLTFKRKGFECTISDSAEVLDLSTLNNNDATTSASLSRNYTSKNDSVLGQSSFLPFKPGGINTESIKNNTSSMHRDEFNLFDIPQGLSRGLFIKNTSTSKDYLNFQKFEDSNDTFEDSDNKLDQINQINQIDENINQPDSQSNNDSKNNVSKNSIFKNDTLNEIDELLPFKVSFNSNNNDSNKPKSKHRKYAHVIDINHKIDNFEELVPDMARTWPFTLDVFQKEAIYHLEQNDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIAMAHRNMTKTIYTSPIKALSNQKFRDFKETFPDIEIGLITGDVQINPHADCLIMTTEVLRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDIDRGVVWEEVIIMLPDHVKFILLSATVPNTLEFAEWIGRTKQKDIYVISTTKRPIPLEISIWAKNKLFTIIDAERNFLDLNFKKHKEEFEKPSRQFLTNNRGRKNTNANQRGSLAGNRGSLDRNRGSSGGNRGRMVKQTQSFKSSYDGPNKSTWPKLVQYLKSNGLLPGVIFVFSKKRCEEYADFLTGVDFCTAKEKSQIRIFIDRAVSRLKKDDKDLPQILKVREMLSRGIGVHHGGLLPIVKEIIEILFSKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFDKLRKHDGKNFRNLLPGEFTQMSGRAGRRGLDPIGTVIVMAYNNPLESLSFKEVTLGLATKLTSQFRLTYIMILNLLRIEALKVEEMIKHSFSENLNRSLLPEHEKLTENLQNKLKDLEFELSKENFEFSSFTEKDIEELCLLFKRYNQIQVEIISEAFKGNLTKHFKTGKLLVFIDNNGYTRPGLILKIDLHLQKFIILSPTINIKEAEKLKDVPFSNIPYITSISGFTKLLFPTWHFEKGLEQTEISFGQINIIFDDSLDISFQKLLNNDSSETEKFRSQFNKLLRFSHSWKDLVWNKTTLELNDLMKQQFDVSKQIANNQNFSNAIQSEYFLRKYKIINKKIETNEEIQRLQYLVSDQNLKLLPDYQQRLLVLKKLEFVDKNLNVLLKGRIACEISSGWELFITELIVDNFLGEFEPEEIVALLTCFVYEGRTKDEEEPLITARLEKGKQKIKKISEVILATYQQFQVPLTRDEEEFMDSKRFALCNVVYEWARGMSFKKIMEISPEAEGTIVRVITRLDEVCREVKNAALIVGDSRLHSSMTDAQDKIKRDIVFCASLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.17
7 0.17
8 0.19
9 0.2
10 0.19
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.18
17 0.19
18 0.18
19 0.19
20 0.22
21 0.25
22 0.29
23 0.31
24 0.37
25 0.42
26 0.45
27 0.45
28 0.45
29 0.47
30 0.4
31 0.39
32 0.33
33 0.28
34 0.3
35 0.29
36 0.27
37 0.23
38 0.28
39 0.29
40 0.27
41 0.28
42 0.28
43 0.3
44 0.38
45 0.47
46 0.48
47 0.52
48 0.54
49 0.59
50 0.58
51 0.6
52 0.58
53 0.55
54 0.52
55 0.53
56 0.52
57 0.46
58 0.43
59 0.36
60 0.3
61 0.25
62 0.21
63 0.13
64 0.1
65 0.08
66 0.08
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.15
75 0.12
76 0.14
77 0.17
78 0.18
79 0.2
80 0.22
81 0.25
82 0.26
83 0.28
84 0.3
85 0.32
86 0.33
87 0.35
88 0.34
89 0.32
90 0.33
91 0.34
92 0.3
93 0.26
94 0.24
95 0.24
96 0.24
97 0.22
98 0.22
99 0.17
100 0.18
101 0.22
102 0.22
103 0.23
104 0.25
105 0.28
106 0.26
107 0.34
108 0.34
109 0.31
110 0.32
111 0.29
112 0.27
113 0.27
114 0.3
115 0.27
116 0.31
117 0.34
118 0.33
119 0.35
120 0.36
121 0.35
122 0.34
123 0.31
124 0.24
125 0.21
126 0.21
127 0.19
128 0.18
129 0.18
130 0.15
131 0.12
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.16
136 0.15
137 0.19
138 0.24
139 0.27
140 0.3
141 0.3
142 0.3
143 0.33
144 0.36
145 0.36
146 0.4
147 0.45
148 0.42
149 0.4
150 0.47
151 0.43
152 0.44
153 0.47
154 0.39
155 0.34
156 0.35
157 0.36
158 0.28
159 0.28
160 0.28
161 0.21
162 0.23
163 0.21
164 0.19
165 0.18
166 0.19
167 0.22
168 0.26
169 0.29
170 0.31
171 0.31
172 0.31
173 0.31
174 0.32
175 0.29
176 0.22
177 0.21
178 0.17
179 0.17
180 0.16
181 0.17
182 0.19
183 0.19
184 0.22
185 0.24
186 0.26
187 0.32
188 0.36
189 0.37
190 0.37
191 0.43
192 0.44
193 0.41
194 0.41
195 0.4
196 0.45
197 0.5
198 0.53
199 0.46
200 0.43
201 0.49
202 0.45
203 0.45
204 0.4
205 0.35
206 0.28
207 0.27
208 0.26
209 0.19
210 0.2
211 0.16
212 0.13
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.15
217 0.19
218 0.23
219 0.28
220 0.31
221 0.38
222 0.41
223 0.44
224 0.46
225 0.5
226 0.54
227 0.53
228 0.6
229 0.64
230 0.71
231 0.75
232 0.79
233 0.81
234 0.79
235 0.85
236 0.85
237 0.81
238 0.73
239 0.69
240 0.71
241 0.62
242 0.56
243 0.45
244 0.36
245 0.28
246 0.28
247 0.23
248 0.14
249 0.13
250 0.12
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.17
263 0.19
264 0.21
265 0.22
266 0.21
267 0.21
268 0.2
269 0.21
270 0.21
271 0.19
272 0.19
273 0.18
274 0.2
275 0.19
276 0.2
277 0.19
278 0.16
279 0.12
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.14
306 0.15
307 0.17
308 0.19
309 0.22
310 0.23
311 0.24
312 0.25
313 0.29
314 0.28
315 0.31
316 0.39
317 0.41
318 0.49
319 0.5
320 0.55
321 0.55
322 0.56
323 0.61
324 0.53
325 0.46
326 0.45
327 0.45
328 0.39
329 0.35
330 0.34
331 0.24
332 0.23
333 0.2
334 0.12
335 0.08
336 0.07
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.12
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.07
376 0.06
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.07
383 0.09
384 0.1
385 0.07
386 0.07
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.06
405 0.07
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.1
421 0.13
422 0.16
423 0.18
424 0.21
425 0.24
426 0.25
427 0.29
428 0.29
429 0.31
430 0.32
431 0.34
432 0.32
433 0.32
434 0.31
435 0.29
436 0.3
437 0.26
438 0.23
439 0.24
440 0.25
441 0.23
442 0.25
443 0.26
444 0.28
445 0.29
446 0.29
447 0.26
448 0.24
449 0.23
450 0.21
451 0.17
452 0.13
453 0.18
454 0.19
455 0.25
456 0.24
457 0.25
458 0.22
459 0.23
460 0.23
461 0.16
462 0.2
463 0.16
464 0.23
465 0.29
466 0.31
467 0.33
468 0.35
469 0.42
470 0.42
471 0.48
472 0.5
473 0.53
474 0.62
475 0.6
476 0.65
477 0.61
478 0.55
479 0.51
480 0.49
481 0.49
482 0.47
483 0.54
484 0.5
485 0.51
486 0.51
487 0.52
488 0.55
489 0.52
490 0.55
491 0.55
492 0.53
493 0.51
494 0.5
495 0.47
496 0.38
497 0.32
498 0.24
499 0.19
500 0.18
501 0.16
502 0.16
503 0.17
504 0.17
505 0.2
506 0.2
507 0.19
508 0.19
509 0.2
510 0.2
511 0.22
512 0.3
513 0.31
514 0.32
515 0.32
516 0.33
517 0.34
518 0.37
519 0.36
520 0.32
521 0.31
522 0.36
523 0.37
524 0.39
525 0.38
526 0.34
527 0.34
528 0.33
529 0.33
530 0.35
531 0.35
532 0.33
533 0.36
534 0.38
535 0.38
536 0.35
537 0.31
538 0.25
539 0.25
540 0.29
541 0.33
542 0.34
543 0.36
544 0.38
545 0.39
546 0.37
547 0.36
548 0.28
549 0.22
550 0.18
551 0.13
552 0.1
553 0.07
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.12
558 0.12
559 0.16
560 0.16
561 0.18
562 0.18
563 0.25
564 0.26
565 0.27
566 0.31
567 0.29
568 0.28
569 0.25
570 0.25
571 0.19
572 0.17
573 0.1
574 0.06
575 0.05
576 0.09
577 0.1
578 0.1
579 0.17
580 0.19
581 0.23
582 0.27
583 0.31
584 0.3
585 0.35
586 0.35
587 0.32
588 0.33
589 0.29
590 0.26
591 0.28
592 0.26
593 0.21
594 0.27
595 0.28
596 0.27
597 0.31
598 0.37
599 0.37
600 0.44
601 0.47
602 0.42
603 0.43
604 0.46
605 0.42
606 0.36
607 0.32
608 0.25
609 0.23
610 0.22
611 0.18
612 0.13
613 0.14
614 0.11
615 0.11
616 0.1
617 0.09
618 0.07
619 0.07
620 0.06
621 0.05
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.03
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.05
633 0.06
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.09
639 0.08
640 0.08
641 0.07
642 0.08
643 0.09
644 0.08
645 0.1
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.07
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.08
659 0.08
660 0.12
661 0.16
662 0.21
663 0.26
664 0.3
665 0.37
666 0.39
667 0.41
668 0.46
669 0.52
670 0.53
671 0.58
672 0.58
673 0.51
674 0.54
675 0.51
676 0.44
677 0.37
678 0.3
679 0.25
680 0.21
681 0.21
682 0.15
683 0.16
684 0.15
685 0.14
686 0.14
687 0.13
688 0.13
689 0.13
690 0.14
691 0.16
692 0.16
693 0.14
694 0.13
695 0.12
696 0.11
697 0.1
698 0.09
699 0.06
700 0.06
701 0.05
702 0.05
703 0.05
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.04
709 0.06
710 0.09
711 0.11
712 0.12
713 0.12
714 0.13
715 0.13
716 0.13
717 0.13
718 0.1
719 0.07
720 0.07
721 0.08
722 0.09
723 0.11
724 0.11
725 0.12
726 0.12
727 0.13
728 0.13
729 0.17
730 0.16
731 0.16
732 0.15
733 0.15
734 0.15
735 0.13
736 0.13
737 0.09
738 0.08
739 0.06
740 0.05
741 0.05
742 0.04
743 0.05
744 0.05
745 0.06
746 0.07
747 0.08
748 0.11
749 0.12
750 0.13
751 0.12
752 0.13
753 0.15
754 0.16
755 0.23
756 0.24
757 0.26
758 0.26
759 0.25
760 0.26
761 0.24
762 0.25
763 0.22
764 0.2
765 0.19
766 0.21
767 0.22
768 0.22
769 0.26
770 0.29
771 0.26
772 0.3
773 0.34
774 0.31
775 0.31
776 0.33
777 0.28
778 0.23
779 0.23
780 0.22
781 0.17
782 0.18
783 0.22
784 0.19
785 0.2
786 0.19
787 0.17
788 0.13
789 0.13
790 0.12
791 0.09
792 0.18
793 0.17
794 0.18
795 0.2
796 0.2
797 0.2
798 0.2
799 0.2
800 0.11
801 0.11
802 0.11
803 0.11
804 0.13
805 0.12
806 0.12
807 0.17
808 0.19
809 0.26
810 0.26
811 0.26
812 0.27
813 0.27
814 0.28
815 0.23
816 0.21
817 0.13
818 0.12
819 0.1
820 0.08
821 0.08
822 0.07
823 0.08
824 0.16
825 0.23
826 0.24
827 0.3
828 0.35
829 0.35
830 0.38
831 0.43
832 0.39
833 0.37
834 0.37
835 0.33
836 0.31
837 0.3
838 0.29
839 0.23
840 0.2
841 0.15
842 0.15
843 0.12
844 0.11
845 0.12
846 0.1
847 0.09
848 0.09
849 0.12
850 0.12
851 0.13
852 0.17
853 0.18
854 0.18
855 0.18
856 0.17
857 0.16
858 0.15
859 0.14
860 0.13
861 0.11
862 0.11
863 0.11
864 0.17
865 0.16
866 0.17
867 0.17
868 0.15
869 0.21
870 0.25
871 0.27
872 0.24
873 0.27
874 0.27
875 0.34
876 0.34
877 0.31
878 0.31
879 0.32
880 0.31
881 0.28
882 0.28
883 0.22
884 0.23
885 0.19
886 0.16
887 0.14
888 0.13
889 0.14
890 0.14
891 0.13
892 0.15
893 0.14
894 0.15
895 0.15
896 0.15
897 0.19
898 0.23
899 0.26
900 0.23
901 0.23
902 0.26
903 0.29
904 0.32
905 0.28
906 0.24
907 0.21
908 0.23
909 0.22
910 0.19
911 0.15
912 0.1
913 0.12
914 0.14
915 0.13
916 0.12
917 0.13
918 0.12
919 0.1
920 0.12
921 0.09
922 0.07
923 0.08
924 0.07
925 0.07
926 0.09
927 0.09
928 0.1
929 0.11
930 0.13
931 0.17
932 0.19
933 0.19
934 0.2
935 0.24
936 0.23
937 0.26
938 0.26
939 0.26
940 0.24
941 0.3
942 0.33
943 0.32
944 0.38
945 0.43
946 0.5
947 0.49
948 0.52
949 0.51
950 0.52
951 0.52
952 0.53
953 0.49
954 0.4
955 0.38
956 0.43
957 0.46
958 0.44
959 0.43
960 0.37
961 0.34
962 0.38
963 0.39
964 0.31
965 0.27
966 0.26
967 0.24
968 0.27
969 0.29
970 0.25
971 0.23
972 0.22
973 0.2
974 0.2
975 0.2
976 0.2
977 0.19
978 0.24
979 0.24
980 0.31
981 0.38
982 0.37
983 0.39
984 0.35
985 0.36
986 0.32
987 0.32
988 0.29
989 0.21
990 0.21
991 0.17
992 0.17
993 0.19
994 0.22
995 0.25
996 0.24
997 0.25
998 0.26
999 0.32
1000 0.42
1001 0.48
1002 0.53
1003 0.59
1004 0.6
1005 0.68
1006 0.71
1007 0.72
1008 0.66
1009 0.6
1010 0.59
1011 0.54
1012 0.5
1013 0.41
1014 0.36
1015 0.29
1016 0.25
1017 0.21
1018 0.17
1019 0.15
1020 0.17
1021 0.22
1022 0.2
1023 0.25
1024 0.26
1025 0.25
1026 0.23
1027 0.22
1028 0.25
1029 0.29
1030 0.33
1031 0.3
1032 0.32
1033 0.33
1034 0.35
1035 0.35
1036 0.35
1037 0.31
1038 0.27
1039 0.3
1040 0.28
1041 0.34
1042 0.32
1043 0.34
1044 0.39
1045 0.36
1046 0.37
1047 0.34
1048 0.33
1049 0.27
1050 0.28
1051 0.26
1052 0.21
1053 0.2
1054 0.19
1055 0.2
1056 0.21
1057 0.2
1058 0.2
1059 0.19
1060 0.17
1061 0.19
1062 0.18
1063 0.15
1064 0.14
1065 0.14
1066 0.12
1067 0.12
1068 0.09
1069 0.06
1070 0.08
1071 0.08
1072 0.08
1073 0.08
1074 0.08
1075 0.07
1076 0.07
1077 0.07
1078 0.06
1079 0.06
1080 0.06
1081 0.07
1082 0.07
1083 0.07
1084 0.07
1085 0.07
1086 0.07
1087 0.06
1088 0.06
1089 0.05
1090 0.05
1091 0.05
1092 0.05
1093 0.07
1094 0.11
1095 0.13
1096 0.18
1097 0.21
1098 0.24
1099 0.27
1100 0.33
1101 0.33
1102 0.31
1103 0.32
1104 0.28
1105 0.28
1106 0.25
1107 0.23
1108 0.21
1109 0.26
1110 0.27
1111 0.31
1112 0.38
1113 0.46
1114 0.53
1115 0.62
1116 0.68
1117 0.68
1118 0.74
1119 0.73
1120 0.7
1121 0.68
1122 0.62
1123 0.56
1124 0.5
1125 0.44
1126 0.36
1127 0.33
1128 0.28
1129 0.21
1130 0.2
1131 0.17
1132 0.19
1133 0.21
1134 0.23
1135 0.24
1136 0.26
1137 0.25
1138 0.26
1139 0.27
1140 0.24
1141 0.22
1142 0.22
1143 0.22
1144 0.2
1145 0.21
1146 0.23
1147 0.22
1148 0.19
1149 0.25
1150 0.24
1151 0.23
1152 0.25
1153 0.29
1154 0.26
1155 0.27
1156 0.27
1157 0.22
1158 0.21
1159 0.18
1160 0.19
1161 0.2
1162 0.24
1163 0.24
1164 0.27
1165 0.27
1166 0.28
1167 0.33
1168 0.35
1169 0.3
1170 0.29
1171 0.29
1172 0.24
1173 0.22
1174 0.21
1175 0.16
1176 0.15
1177 0.13
1178 0.09
1179 0.1
1180 0.11
1181 0.12
1182 0.17
1183 0.17
1184 0.17
1185 0.2
1186 0.24
1187 0.28
1188 0.3
1189 0.3
1190 0.27
1191 0.27
1192 0.28
1193 0.25
1194 0.22
1195 0.17
1196 0.16
1197 0.15
1198 0.17
1199 0.16
1200 0.13
1201 0.15
1202 0.15
1203 0.15
1204 0.14
1205 0.17
1206 0.22
1207 0.27
1208 0.33
1209 0.31
1210 0.38
1211 0.43
1212 0.47
1213 0.47
1214 0.46
1215 0.42
1216 0.37
1217 0.43
1218 0.42
1219 0.41