Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1G9D3

Protein Details
Accession C1G9D3    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-152APVPGKMKRKRAPHDPNAPKRABasic
279-302SPEPVKAPTPPRSNKRRRTAGGTVHydrophilic
315-337VSGKKGSPEKRKGAGKKEKEEVTBasic
354-375AATEMPRGDKKGKKKRKSEAAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-147VPGKMKRKRAPHDPN
288-345PPRSNKRRRTAGGTVADAGKPAMPAGGVSGKKGSPEKRKGAGKKEKEEVTASGTKSKR
359-372PRGDKKGKKKRKSE
Subcellular Location(s) cyto_mito 12.166, mito 12, cyto 10, cyto_nucl 8.666, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG pbn:PADG_03869  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPSRAATLAPPPSLIPPSPFTQSLLDAIFNVSNPITTASHTLNTATKTSPTDPSALTYIQVIVSLATLQSAVSDLSRAYINHANTVLNRGPSTLDLGSITSSLLLENGLLGGTRGLSPGRPDALGAGAGGAPVPGKMKRKRAPHDPNAPKRALTPYFLYMQHNRATIAEELGANARPKEVADEGTRRWAEMTEEEKSIWKKLYADNLAVYHEKMRAYKAGLPVPDDDTTQAAAAQLHQGVHHATTTVLPTHTHEASTEESDESDEESADEDEEEEEEASPEPVKAPTPPRSNKRRRTAGGTVADAGKPAMPAGGVSGKKGSPEKRKGAGKKEKEEVTASGTKSKRGSTAATVAAATEMPRGDKKGKKKRKSEAAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.27
3 0.25
4 0.28
5 0.31
6 0.31
7 0.3
8 0.28
9 0.28
10 0.27
11 0.25
12 0.22
13 0.18
14 0.19
15 0.17
16 0.15
17 0.15
18 0.12
19 0.1
20 0.11
21 0.14
22 0.12
23 0.13
24 0.17
25 0.17
26 0.19
27 0.19
28 0.21
29 0.21
30 0.23
31 0.24
32 0.21
33 0.22
34 0.25
35 0.27
36 0.3
37 0.29
38 0.29
39 0.28
40 0.29
41 0.29
42 0.25
43 0.22
44 0.18
45 0.17
46 0.13
47 0.13
48 0.1
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.05
54 0.05
55 0.04
56 0.04
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.05
62 0.07
63 0.09
64 0.09
65 0.13
66 0.18
67 0.19
68 0.21
69 0.22
70 0.23
71 0.21
72 0.27
73 0.25
74 0.22
75 0.21
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.21
80 0.15
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.08
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.09
113 0.07
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.06
121 0.09
122 0.17
123 0.23
124 0.34
125 0.41
126 0.51
127 0.57
128 0.67
129 0.73
130 0.75
131 0.8
132 0.81
133 0.84
134 0.8
135 0.74
136 0.63
137 0.55
138 0.52
139 0.42
140 0.34
141 0.28
142 0.23
143 0.26
144 0.27
145 0.29
146 0.25
147 0.26
148 0.26
149 0.24
150 0.22
151 0.19
152 0.2
153 0.16
154 0.14
155 0.12
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.11
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.13
169 0.16
170 0.17
171 0.23
172 0.23
173 0.21
174 0.2
175 0.18
176 0.16
177 0.17
178 0.2
179 0.15
180 0.16
181 0.16
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.16
186 0.14
187 0.14
188 0.16
189 0.24
190 0.23
191 0.24
192 0.24
193 0.23
194 0.25
195 0.23
196 0.21
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.14
202 0.13
203 0.15
204 0.19
205 0.22
206 0.24
207 0.23
208 0.24
209 0.24
210 0.25
211 0.23
212 0.2
213 0.16
214 0.13
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.12
237 0.16
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.15
242 0.17
243 0.18
244 0.17
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.11
250 0.09
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.13
272 0.2
273 0.29
274 0.38
275 0.47
276 0.55
277 0.66
278 0.76
279 0.81
280 0.84
281 0.85
282 0.8
283 0.81
284 0.78
285 0.76
286 0.71
287 0.63
288 0.55
289 0.47
290 0.42
291 0.33
292 0.26
293 0.18
294 0.12
295 0.1
296 0.08
297 0.06
298 0.06
299 0.08
300 0.15
301 0.15
302 0.16
303 0.19
304 0.19
305 0.23
306 0.3
307 0.36
308 0.39
309 0.48
310 0.55
311 0.61
312 0.71
313 0.75
314 0.8
315 0.82
316 0.81
317 0.8
318 0.81
319 0.76
320 0.7
321 0.64
322 0.55
323 0.52
324 0.48
325 0.41
326 0.41
327 0.38
328 0.39
329 0.39
330 0.39
331 0.36
332 0.33
333 0.36
334 0.33
335 0.39
336 0.36
337 0.35
338 0.32
339 0.28
340 0.26
341 0.22
342 0.16
343 0.13
344 0.11
345 0.13
346 0.16
347 0.21
348 0.28
349 0.36
350 0.47
351 0.56
352 0.66
353 0.73
354 0.81
355 0.87