Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VJD4

Protein Details
Accession A0A1D2VJD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-144QSVRRNRKRSSKFKSFISNNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, cyto 2.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036389  RNase_III_sf  
IPR007147  TF_Vhr  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MNYIPIQPNSPDTLPVPNVQGVCDNTFSNALANNTHRHIHNNDNDASKIGITKRIRDELKFNDDRLWKRFSARRLELIDSFDLSSKKASEQDNDIKKVANTLRIEFNYDLSNLDLFDKLVRAAIQSVRRNRKRSSKFKSFISNNNDDDYNDNNYINHRSNNNNNVNNLNINITNNENNSLKRKSSFLSEFTKLTDLSSSTDYSNETYSKKKNFSSEDFMSMNVNKNKNKNKNLKLPSISSLESAGKISLTAASARIQLLSIFQKSKTCLDSTAKYSENLTFIGKSVIPIVISFILERYFTGISLSSIEYIRLKLTSDYQLAKLIRTLDKSPDIQVLPDSIASSSLYQLIGASIKDFGFDCIVKPFGEIFHEIIIRDFPLISNNNHNKSYYYYDDDNGSKLSTINRDKGAQITTRTSDEKALNSLAFTLSSLKTPFTKLVSLKFFNKVIYFSFKYLNSATPTLFEILKNGSSAFHIKFEELKLRDLNCEGKLLNNDFEVEKSFKKHGNVEFELFYPNNNTTHELTEDYDISIKKNNGSNNSRSDGSINKINANIDIGLYNQTETGRDKNPETLSSMTDLNSKYPFSNRPQERNYNKYSVYYKQQNDYKYYKSDEEEDVEMYNSNSQDSNENQPNRKKNFIPPHFEPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.32
4 0.3
5 0.29
6 0.27
7 0.31
8 0.27
9 0.27
10 0.27
11 0.24
12 0.22
13 0.23
14 0.22
15 0.19
16 0.18
17 0.17
18 0.2
19 0.23
20 0.26
21 0.28
22 0.32
23 0.31
24 0.34
25 0.38
26 0.43
27 0.47
28 0.49
29 0.51
30 0.5
31 0.5
32 0.45
33 0.41
34 0.31
35 0.28
36 0.23
37 0.28
38 0.27
39 0.34
40 0.4
41 0.48
42 0.51
43 0.5
44 0.56
45 0.56
46 0.63
47 0.59
48 0.54
49 0.53
50 0.57
51 0.59
52 0.55
53 0.52
54 0.44
55 0.48
56 0.52
57 0.52
58 0.55
59 0.55
60 0.59
61 0.57
62 0.6
63 0.55
64 0.53
65 0.47
66 0.38
67 0.34
68 0.29
69 0.25
70 0.21
71 0.2
72 0.17
73 0.18
74 0.22
75 0.25
76 0.25
77 0.34
78 0.43
79 0.49
80 0.52
81 0.5
82 0.46
83 0.43
84 0.47
85 0.41
86 0.39
87 0.33
88 0.33
89 0.4
90 0.39
91 0.44
92 0.36
93 0.35
94 0.29
95 0.26
96 0.24
97 0.17
98 0.17
99 0.12
100 0.13
101 0.12
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.13
110 0.18
111 0.26
112 0.33
113 0.43
114 0.53
115 0.61
116 0.65
117 0.69
118 0.75
119 0.77
120 0.8
121 0.8
122 0.8
123 0.77
124 0.78
125 0.81
126 0.76
127 0.74
128 0.72
129 0.69
130 0.6
131 0.57
132 0.51
133 0.41
134 0.38
135 0.32
136 0.29
137 0.23
138 0.22
139 0.2
140 0.22
141 0.27
142 0.27
143 0.28
144 0.26
145 0.31
146 0.39
147 0.49
148 0.55
149 0.53
150 0.52
151 0.5
152 0.48
153 0.42
154 0.35
155 0.27
156 0.19
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.17
162 0.2
163 0.2
164 0.21
165 0.26
166 0.28
167 0.27
168 0.26
169 0.28
170 0.25
171 0.32
172 0.33
173 0.33
174 0.36
175 0.36
176 0.35
177 0.35
178 0.35
179 0.27
180 0.23
181 0.2
182 0.14
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.13
187 0.14
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.2
194 0.26
195 0.32
196 0.35
197 0.37
198 0.42
199 0.45
200 0.49
201 0.52
202 0.48
203 0.46
204 0.42
205 0.4
206 0.36
207 0.31
208 0.32
209 0.3
210 0.33
211 0.32
212 0.4
213 0.5
214 0.57
215 0.65
216 0.68
217 0.71
218 0.76
219 0.78
220 0.78
221 0.72
222 0.65
223 0.59
224 0.52
225 0.44
226 0.34
227 0.3
228 0.23
229 0.19
230 0.17
231 0.13
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.1
246 0.12
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.17
251 0.18
252 0.21
253 0.21
254 0.19
255 0.2
256 0.23
257 0.26
258 0.28
259 0.31
260 0.29
261 0.27
262 0.27
263 0.25
264 0.22
265 0.19
266 0.16
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.11
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.1
302 0.13
303 0.15
304 0.16
305 0.16
306 0.21
307 0.2
308 0.2
309 0.19
310 0.18
311 0.17
312 0.18
313 0.19
314 0.17
315 0.2
316 0.2
317 0.2
318 0.21
319 0.19
320 0.17
321 0.16
322 0.14
323 0.11
324 0.1
325 0.09
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.08
353 0.1
354 0.11
355 0.1
356 0.11
357 0.12
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.05
365 0.09
366 0.12
367 0.13
368 0.22
369 0.28
370 0.32
371 0.33
372 0.33
373 0.3
374 0.31
375 0.34
376 0.28
377 0.27
378 0.25
379 0.25
380 0.27
381 0.27
382 0.24
383 0.2
384 0.17
385 0.12
386 0.11
387 0.13
388 0.17
389 0.21
390 0.23
391 0.25
392 0.26
393 0.26
394 0.28
395 0.29
396 0.25
397 0.24
398 0.24
399 0.23
400 0.25
401 0.26
402 0.24
403 0.26
404 0.24
405 0.23
406 0.21
407 0.21
408 0.18
409 0.16
410 0.16
411 0.12
412 0.1
413 0.09
414 0.1
415 0.09
416 0.11
417 0.11
418 0.12
419 0.13
420 0.15
421 0.17
422 0.16
423 0.2
424 0.2
425 0.27
426 0.32
427 0.34
428 0.36
429 0.37
430 0.36
431 0.33
432 0.32
433 0.27
434 0.23
435 0.27
436 0.26
437 0.24
438 0.26
439 0.25
440 0.27
441 0.27
442 0.28
443 0.24
444 0.23
445 0.22
446 0.19
447 0.2
448 0.19
449 0.18
450 0.14
451 0.13
452 0.13
453 0.14
454 0.13
455 0.12
456 0.11
457 0.12
458 0.16
459 0.15
460 0.16
461 0.16
462 0.17
463 0.19
464 0.21
465 0.28
466 0.25
467 0.28
468 0.29
469 0.29
470 0.31
471 0.31
472 0.32
473 0.25
474 0.26
475 0.22
476 0.22
477 0.26
478 0.26
479 0.25
480 0.21
481 0.22
482 0.2
483 0.2
484 0.2
485 0.19
486 0.18
487 0.2
488 0.24
489 0.27
490 0.3
491 0.36
492 0.38
493 0.44
494 0.46
495 0.45
496 0.43
497 0.39
498 0.4
499 0.33
500 0.27
501 0.22
502 0.2
503 0.18
504 0.18
505 0.21
506 0.19
507 0.22
508 0.23
509 0.21
510 0.21
511 0.22
512 0.21
513 0.18
514 0.2
515 0.18
516 0.18
517 0.22
518 0.21
519 0.23
520 0.27
521 0.32
522 0.37
523 0.43
524 0.48
525 0.48
526 0.51
527 0.48
528 0.44
529 0.42
530 0.36
531 0.34
532 0.35
533 0.31
534 0.29
535 0.3
536 0.3
537 0.28
538 0.26
539 0.21
540 0.15
541 0.14
542 0.12
543 0.13
544 0.13
545 0.12
546 0.12
547 0.12
548 0.13
549 0.16
550 0.2
551 0.23
552 0.26
553 0.28
554 0.34
555 0.37
556 0.37
557 0.38
558 0.35
559 0.31
560 0.3
561 0.29
562 0.22
563 0.24
564 0.23
565 0.22
566 0.22
567 0.22
568 0.22
569 0.26
570 0.32
571 0.35
572 0.44
573 0.5
574 0.57
575 0.64
576 0.72
577 0.76
578 0.77
579 0.77
580 0.73
581 0.66
582 0.63
583 0.6
584 0.56
585 0.57
586 0.58
587 0.56
588 0.58
589 0.62
590 0.61
591 0.63
592 0.62
593 0.58
594 0.54
595 0.54
596 0.5
597 0.48
598 0.48
599 0.45
600 0.43
601 0.39
602 0.34
603 0.3
604 0.26
605 0.23
606 0.19
607 0.19
608 0.15
609 0.15
610 0.14
611 0.15
612 0.19
613 0.22
614 0.31
615 0.36
616 0.44
617 0.51
618 0.6
619 0.68
620 0.7
621 0.74
622 0.7
623 0.71
624 0.75
625 0.76
626 0.76
627 0.72