Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VLB0

Protein Details
Accession A0A1D2VLB0    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-325ILFNVRSSKKSKKKNEQKLSTIIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-315KSKK
491-498KKNNKKIM
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, cyto 2.5, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MKIVKLPWLAHQEETRKFEIYSINVAPDGSRLASGGLDGKIKVWSVEQITNLKEKYNLPAANNDQQQQQLDKFYPLASMARHTGAVTVVRFSPSGRFLASGSDDKVILIWEKSDDSENQNQRSQFGEAETDTEHWVVRKRLIGHSNDIEDIAWAPDSSFLISVGLDRSIIVWNGFNFEKLRRFDIHQSHVKGVAFDPANKYFATASDDRSVIIFRYHKSTTNDQLQNMNFSIETKIKAPFKGSPLTSYFRRLSWSPDGEHIAVPNATNGPLTTVAIIERGNWNSDISLIGHDLPCEVTSFSPILFNVRSSKKSKKKNEQKLSTIIATAGQDKSLAIWNSERSKPLIVATDISFKTITDLAWTLDGQTLFVSSLDGTITALFFEKNELGIPASLETINKHLHRFGVGRDSMIFPESVDQLILEDQYNKTFKKSLNHNKLLDESHMNKLMNKNTLIPNNIGLNTTANNSNNVKNFNPIISSSKNVNILIPRSKKNNKKIMPTLKKVNHLAPKKIIDQKIIITKDGKKRVSPTLISTSSSLSKSFSSVIATNIKIQKQLENLSYPNSKLPRFGVQTYVSGLREKNDNSGEGFDKEDDDDNEEILSTTTQKKSNILFDHKSSGITKFKEVEVNDKTITTNLKVYLSKTDVNNYRPKSVLQVIHPNQNKPVLPRIFNSKKVDVFEDNSDIPTKILINSFNCSDNCEFFIEDRVIQAVSVESKELWIIATSTNSLHFISFTGRLIYPKIQLRNNEDRSISFMNCFKDKYLVIILNIGIIHVWNIHSFQSLYDGGISLAPVLNTPISKFLSNSDIRNNNDGKPYVALENGEVYMWSTDMEVWLRIIDPWYLKSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.51
3 0.45
4 0.43
5 0.42
6 0.41
7 0.36
8 0.36
9 0.32
10 0.31
11 0.3
12 0.3
13 0.26
14 0.21
15 0.2
16 0.14
17 0.12
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.14
23 0.13
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.14
31 0.18
32 0.21
33 0.25
34 0.28
35 0.31
36 0.33
37 0.39
38 0.38
39 0.34
40 0.33
41 0.31
42 0.33
43 0.37
44 0.39
45 0.34
46 0.43
47 0.48
48 0.53
49 0.55
50 0.51
51 0.45
52 0.44
53 0.45
54 0.41
55 0.37
56 0.34
57 0.31
58 0.31
59 0.29
60 0.26
61 0.24
62 0.22
63 0.22
64 0.18
65 0.2
66 0.2
67 0.2
68 0.21
69 0.19
70 0.18
71 0.18
72 0.21
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.18
79 0.2
80 0.19
81 0.2
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.22
86 0.25
87 0.24
88 0.23
89 0.23
90 0.22
91 0.21
92 0.21
93 0.17
94 0.15
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.14
100 0.17
101 0.18
102 0.22
103 0.31
104 0.38
105 0.4
106 0.44
107 0.44
108 0.42
109 0.42
110 0.38
111 0.3
112 0.24
113 0.23
114 0.19
115 0.2
116 0.2
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.14
122 0.2
123 0.2
124 0.23
125 0.27
126 0.29
127 0.37
128 0.43
129 0.45
130 0.47
131 0.49
132 0.48
133 0.43
134 0.39
135 0.31
136 0.24
137 0.21
138 0.14
139 0.1
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.19
165 0.26
166 0.26
167 0.3
168 0.3
169 0.35
170 0.42
171 0.48
172 0.52
173 0.53
174 0.54
175 0.52
176 0.53
177 0.48
178 0.4
179 0.32
180 0.31
181 0.25
182 0.24
183 0.27
184 0.25
185 0.26
186 0.24
187 0.25
188 0.18
189 0.18
190 0.22
191 0.18
192 0.2
193 0.22
194 0.22
195 0.21
196 0.22
197 0.21
198 0.15
199 0.19
200 0.18
201 0.16
202 0.22
203 0.24
204 0.29
205 0.34
206 0.4
207 0.42
208 0.5
209 0.52
210 0.48
211 0.52
212 0.47
213 0.45
214 0.39
215 0.32
216 0.21
217 0.19
218 0.2
219 0.16
220 0.17
221 0.15
222 0.2
223 0.22
224 0.23
225 0.26
226 0.27
227 0.3
228 0.35
229 0.34
230 0.32
231 0.34
232 0.37
233 0.36
234 0.37
235 0.35
236 0.29
237 0.32
238 0.28
239 0.31
240 0.34
241 0.35
242 0.31
243 0.33
244 0.36
245 0.33
246 0.33
247 0.26
248 0.2
249 0.17
250 0.15
251 0.13
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.11
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.17
294 0.21
295 0.25
296 0.29
297 0.4
298 0.46
299 0.56
300 0.65
301 0.7
302 0.77
303 0.84
304 0.9
305 0.87
306 0.84
307 0.79
308 0.72
309 0.62
310 0.51
311 0.39
312 0.3
313 0.23
314 0.2
315 0.14
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.13
321 0.12
322 0.11
323 0.13
324 0.17
325 0.22
326 0.24
327 0.24
328 0.2
329 0.21
330 0.21
331 0.2
332 0.19
333 0.15
334 0.15
335 0.15
336 0.2
337 0.19
338 0.2
339 0.18
340 0.15
341 0.16
342 0.15
343 0.13
344 0.08
345 0.09
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.07
357 0.06
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.09
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.17
389 0.17
390 0.16
391 0.19
392 0.18
393 0.18
394 0.18
395 0.19
396 0.17
397 0.16
398 0.14
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.09
412 0.12
413 0.11
414 0.12
415 0.15
416 0.18
417 0.23
418 0.34
419 0.42
420 0.5
421 0.57
422 0.57
423 0.55
424 0.55
425 0.5
426 0.41
427 0.34
428 0.27
429 0.23
430 0.25
431 0.24
432 0.23
433 0.26
434 0.28
435 0.26
436 0.24
437 0.25
438 0.25
439 0.28
440 0.28
441 0.24
442 0.23
443 0.21
444 0.21
445 0.18
446 0.14
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.12
451 0.11
452 0.14
453 0.15
454 0.18
455 0.19
456 0.22
457 0.21
458 0.21
459 0.21
460 0.19
461 0.18
462 0.16
463 0.19
464 0.17
465 0.19
466 0.18
467 0.2
468 0.21
469 0.2
470 0.2
471 0.18
472 0.2
473 0.26
474 0.29
475 0.3
476 0.36
477 0.44
478 0.52
479 0.59
480 0.66
481 0.63
482 0.67
483 0.73
484 0.76
485 0.77
486 0.74
487 0.74
488 0.68
489 0.69
490 0.63
491 0.6
492 0.58
493 0.54
494 0.52
495 0.48
496 0.46
497 0.47
498 0.51
499 0.46
500 0.4
501 0.37
502 0.36
503 0.38
504 0.36
505 0.31
506 0.28
507 0.33
508 0.39
509 0.45
510 0.44
511 0.38
512 0.41
513 0.47
514 0.49
515 0.44
516 0.4
517 0.4
518 0.39
519 0.38
520 0.35
521 0.3
522 0.27
523 0.26
524 0.21
525 0.15
526 0.14
527 0.14
528 0.14
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.15
533 0.18
534 0.18
535 0.22
536 0.25
537 0.25
538 0.26
539 0.26
540 0.26
541 0.25
542 0.29
543 0.26
544 0.25
545 0.25
546 0.27
547 0.28
548 0.25
549 0.27
550 0.27
551 0.25
552 0.24
553 0.26
554 0.28
555 0.31
556 0.31
557 0.31
558 0.29
559 0.3
560 0.3
561 0.31
562 0.24
563 0.22
564 0.21
565 0.17
566 0.2
567 0.2
568 0.22
569 0.21
570 0.21
571 0.2
572 0.23
573 0.24
574 0.2
575 0.21
576 0.16
577 0.15
578 0.15
579 0.16
580 0.14
581 0.15
582 0.15
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.11
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.12
591 0.16
592 0.19
593 0.2
594 0.24
595 0.26
596 0.34
597 0.39
598 0.41
599 0.42
600 0.41
601 0.45
602 0.42
603 0.41
604 0.35
605 0.33
606 0.32
607 0.3
608 0.3
609 0.27
610 0.29
611 0.32
612 0.31
613 0.34
614 0.31
615 0.33
616 0.31
617 0.29
618 0.28
619 0.25
620 0.27
621 0.2
622 0.19
623 0.17
624 0.2
625 0.21
626 0.22
627 0.26
628 0.27
629 0.29
630 0.28
631 0.34
632 0.37
633 0.41
634 0.48
635 0.45
636 0.45
637 0.42
638 0.41
639 0.39
640 0.4
641 0.39
642 0.36
643 0.44
644 0.43
645 0.52
646 0.55
647 0.5
648 0.47
649 0.47
650 0.44
651 0.36
652 0.43
653 0.39
654 0.38
655 0.39
656 0.47
657 0.48
658 0.54
659 0.57
660 0.53
661 0.51
662 0.51
663 0.53
664 0.46
665 0.43
666 0.39
667 0.36
668 0.31
669 0.29
670 0.28
671 0.24
672 0.2
673 0.17
674 0.14
675 0.12
676 0.14
677 0.17
678 0.18
679 0.21
680 0.23
681 0.26
682 0.25
683 0.28
684 0.28
685 0.25
686 0.25
687 0.23
688 0.22
689 0.18
690 0.23
691 0.2
692 0.18
693 0.17
694 0.16
695 0.14
696 0.13
697 0.13
698 0.1
699 0.1
700 0.1
701 0.1
702 0.09
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.09
707 0.07
708 0.08
709 0.08
710 0.1
711 0.1
712 0.11
713 0.12
714 0.13
715 0.13
716 0.12
717 0.11
718 0.11
719 0.14
720 0.15
721 0.15
722 0.17
723 0.17
724 0.18
725 0.22
726 0.24
727 0.27
728 0.32
729 0.38
730 0.4
731 0.46
732 0.53
733 0.6
734 0.63
735 0.61
736 0.55
737 0.49
738 0.51
739 0.48
740 0.41
741 0.34
742 0.32
743 0.32
744 0.34
745 0.34
746 0.29
747 0.29
748 0.28
749 0.29
750 0.31
751 0.3
752 0.27
753 0.29
754 0.27
755 0.24
756 0.24
757 0.19
758 0.12
759 0.1
760 0.09
761 0.08
762 0.09
763 0.08
764 0.09
765 0.1
766 0.12
767 0.13
768 0.12
769 0.16
770 0.16
771 0.15
772 0.15
773 0.14
774 0.13
775 0.13
776 0.13
777 0.09
778 0.09
779 0.08
780 0.08
781 0.09
782 0.11
783 0.11
784 0.12
785 0.16
786 0.18
787 0.19
788 0.2
789 0.21
790 0.28
791 0.31
792 0.34
793 0.38
794 0.43
795 0.46
796 0.53
797 0.53
798 0.48
799 0.51
800 0.49
801 0.41
802 0.37
803 0.35
804 0.3
805 0.29
806 0.26
807 0.2
808 0.21
809 0.2
810 0.17
811 0.14
812 0.13
813 0.12
814 0.11
815 0.1
816 0.08
817 0.08
818 0.1
819 0.12
820 0.11
821 0.11
822 0.12
823 0.12
824 0.13
825 0.14
826 0.16
827 0.17