Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VKT6

Protein Details
Accession A0A1D2VKT6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
458-501PSNSNKTKNNSKTKNNKSKSKSKSKSKSKSKSKSKNNDNNNNNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
466-492NNSKTKNNKSKSKSKSKSKSKSKSKSK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR039779  RFX-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MSQQPKLYQDQLLPDSSKNYQSRDSHVSLGPTSTAPFGSSHQSTTASSLQPLPPPPQVSAQHVLTQLPINFQQLYQHQNHHQPTLFYFPLSLQLTPAAPLPSLPSAAQPASVYLPPPHQSHPQSQSITTLPLPIPNKHLVSSIALQQLPSQQQLLQQIDPEQSQNQNQNQNQNQNQNQFQSQPLSRSKSHFHPQPQLQLQTQLQPSLSSQSHHQIQKLKFSSSSSYPFTSASTPQSLQSLQSLQSHYYTHSINSQYTPQYSFLSSSSATPTTSNTLSSATPFPPPPIQHNYSLQLLSAYPSHSTHSTHPPPPQLQPPSQNSIQQNSQSSLPQQSSNSSIPPISSLASNSQEFQDSHQSSESQNSQKLQQTPYQQNSSSISNTNHPAPILKQITPAKRSYSNLEINQLDPANNIITNNTSSISLLSSPSSSSSSSSSTTTTTTTITTSTSSIPASASLPSNSNKTKNNSKTKNNKSKSKSKSKSKSKSKSKSKNNDNNNNNDNNNNNSNNNNNSNNNTFSSSNSPLPSFSSLNSPSSTSLSYENKKFKNTNFNRSSEESLLLAAQKSLTNHIQIQDFAKKMQITNDFEKPSHPKAIAAKEKSKSIFAIRCLLDSVEKIQVSQPPSLTNVHSTATPRASVYNAYTYLCNISNVLPFGQSALGKLVRVIWPDLQTKRLGTRGNSKYHYIGIRLKVDIKQILDQISKNPSVLHTQFFGNFIASQPAIFKQNLFQNNFDQKNKTHSESTVYNSNNIDDFVEISSTPFLSTIGPRLYFPKDKKIMQSIAFFDINNSNDLINSIISTDLNNLIQKFKFHLLDGNYQSCCSLLLSQDEYQKDIAIYASSLNMLSPLSHTGSKKANLTNLKNLSSSFSNYFSQQLFNQKNCTLETIDTNLKKRLKYSKLFEVLLKRLLRAAETAVSVARIFSNSVEMVSIMNDWNIIINDISIISGCEIDREPERVEAENLLRNEIPNFLNVLNNELSNAVASRSDFHDDPTKGVFNTELTTIEKKLMETTVNFNILLFSKFPRTSVRLFLLFLSSILTNCLRQLQSKGARSFSACWIVRCWIDEWFGFISELYGFNSLSQDLVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.37
4 0.42
5 0.38
6 0.39
7 0.42
8 0.44
9 0.49
10 0.53
11 0.53
12 0.49
13 0.48
14 0.47
15 0.4
16 0.38
17 0.32
18 0.25
19 0.23
20 0.19
21 0.17
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.21
26 0.22
27 0.22
28 0.23
29 0.25
30 0.24
31 0.28
32 0.31
33 0.25
34 0.26
35 0.29
36 0.3
37 0.33
38 0.36
39 0.36
40 0.37
41 0.38
42 0.38
43 0.42
44 0.42
45 0.44
46 0.46
47 0.44
48 0.43
49 0.41
50 0.39
51 0.33
52 0.34
53 0.28
54 0.26
55 0.26
56 0.24
57 0.23
58 0.23
59 0.27
60 0.26
61 0.32
62 0.32
63 0.37
64 0.41
65 0.49
66 0.53
67 0.53
68 0.51
69 0.46
70 0.45
71 0.46
72 0.4
73 0.31
74 0.28
75 0.23
76 0.28
77 0.28
78 0.25
79 0.18
80 0.19
81 0.2
82 0.2
83 0.22
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.16
88 0.16
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.19
93 0.19
94 0.21
95 0.17
96 0.17
97 0.18
98 0.19
99 0.19
100 0.17
101 0.23
102 0.25
103 0.28
104 0.31
105 0.36
106 0.4
107 0.47
108 0.51
109 0.54
110 0.52
111 0.5
112 0.5
113 0.42
114 0.41
115 0.32
116 0.3
117 0.22
118 0.26
119 0.29
120 0.28
121 0.31
122 0.34
123 0.35
124 0.32
125 0.33
126 0.28
127 0.29
128 0.29
129 0.3
130 0.29
131 0.28
132 0.27
133 0.27
134 0.31
135 0.29
136 0.28
137 0.23
138 0.19
139 0.23
140 0.31
141 0.32
142 0.27
143 0.26
144 0.28
145 0.29
146 0.29
147 0.27
148 0.23
149 0.23
150 0.28
151 0.34
152 0.38
153 0.45
154 0.47
155 0.55
156 0.59
157 0.64
158 0.65
159 0.67
160 0.67
161 0.64
162 0.65
163 0.59
164 0.55
165 0.47
166 0.43
167 0.41
168 0.36
169 0.36
170 0.39
171 0.41
172 0.41
173 0.44
174 0.46
175 0.48
176 0.55
177 0.56
178 0.56
179 0.61
180 0.63
181 0.69
182 0.7
183 0.66
184 0.58
185 0.57
186 0.51
187 0.48
188 0.44
189 0.35
190 0.29
191 0.25
192 0.25
193 0.24
194 0.24
195 0.18
196 0.2
197 0.25
198 0.32
199 0.34
200 0.38
201 0.4
202 0.42
203 0.51
204 0.51
205 0.46
206 0.41
207 0.41
208 0.41
209 0.37
210 0.4
211 0.34
212 0.32
213 0.31
214 0.3
215 0.29
216 0.27
217 0.25
218 0.24
219 0.24
220 0.23
221 0.23
222 0.25
223 0.23
224 0.22
225 0.21
226 0.2
227 0.18
228 0.21
229 0.22
230 0.21
231 0.22
232 0.22
233 0.21
234 0.21
235 0.2
236 0.17
237 0.21
238 0.22
239 0.22
240 0.23
241 0.26
242 0.26
243 0.27
244 0.28
245 0.24
246 0.23
247 0.23
248 0.22
249 0.18
250 0.18
251 0.17
252 0.16
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.14
262 0.15
263 0.15
264 0.17
265 0.18
266 0.16
267 0.18
268 0.18
269 0.2
270 0.24
271 0.26
272 0.29
273 0.34
274 0.36
275 0.37
276 0.41
277 0.41
278 0.38
279 0.37
280 0.3
281 0.23
282 0.2
283 0.17
284 0.14
285 0.12
286 0.1
287 0.11
288 0.13
289 0.14
290 0.17
291 0.2
292 0.29
293 0.34
294 0.38
295 0.41
296 0.46
297 0.47
298 0.49
299 0.53
300 0.49
301 0.47
302 0.5
303 0.51
304 0.5
305 0.49
306 0.51
307 0.45
308 0.44
309 0.43
310 0.38
311 0.36
312 0.32
313 0.31
314 0.27
315 0.26
316 0.26
317 0.23
318 0.22
319 0.2
320 0.2
321 0.24
322 0.24
323 0.23
324 0.2
325 0.18
326 0.16
327 0.16
328 0.15
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.13
333 0.16
334 0.17
335 0.16
336 0.16
337 0.18
338 0.18
339 0.19
340 0.26
341 0.23
342 0.24
343 0.24
344 0.24
345 0.22
346 0.27
347 0.3
348 0.24
349 0.26
350 0.26
351 0.29
352 0.34
353 0.37
354 0.35
355 0.34
356 0.39
357 0.44
358 0.49
359 0.49
360 0.44
361 0.42
362 0.42
363 0.39
364 0.33
365 0.28
366 0.25
367 0.23
368 0.25
369 0.25
370 0.23
371 0.2
372 0.19
373 0.17
374 0.24
375 0.23
376 0.22
377 0.27
378 0.32
379 0.38
380 0.41
381 0.41
382 0.37
383 0.38
384 0.39
385 0.37
386 0.38
387 0.39
388 0.37
389 0.4
390 0.37
391 0.33
392 0.33
393 0.29
394 0.22
395 0.15
396 0.14
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.09
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.11
419 0.12
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.13
424 0.14
425 0.14
426 0.13
427 0.12
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.11
445 0.12
446 0.17
447 0.19
448 0.22
449 0.26
450 0.3
451 0.39
452 0.46
453 0.56
454 0.59
455 0.67
456 0.73
457 0.8
458 0.85
459 0.83
460 0.83
461 0.79
462 0.81
463 0.81
464 0.81
465 0.8
466 0.79
467 0.83
468 0.85
469 0.88
470 0.89
471 0.91
472 0.9
473 0.92
474 0.92
475 0.92
476 0.91
477 0.91
478 0.91
479 0.9
480 0.89
481 0.88
482 0.82
483 0.79
484 0.73
485 0.66
486 0.56
487 0.49
488 0.41
489 0.34
490 0.34
491 0.28
492 0.25
493 0.22
494 0.25
495 0.26
496 0.29
497 0.28
498 0.25
499 0.27
500 0.28
501 0.28
502 0.26
503 0.25
504 0.21
505 0.2
506 0.23
507 0.23
508 0.23
509 0.22
510 0.21
511 0.18
512 0.19
513 0.21
514 0.16
515 0.13
516 0.17
517 0.17
518 0.19
519 0.19
520 0.18
521 0.16
522 0.16
523 0.16
524 0.12
525 0.15
526 0.18
527 0.21
528 0.26
529 0.32
530 0.32
531 0.36
532 0.38
533 0.37
534 0.44
535 0.46
536 0.51
537 0.49
538 0.5
539 0.51
540 0.51
541 0.5
542 0.4
543 0.35
544 0.24
545 0.19
546 0.17
547 0.13
548 0.1
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.1
554 0.1
555 0.11
556 0.13
557 0.14
558 0.15
559 0.14
560 0.17
561 0.18
562 0.18
563 0.16
564 0.18
565 0.16
566 0.16
567 0.2
568 0.24
569 0.25
570 0.29
571 0.34
572 0.33
573 0.32
574 0.35
575 0.35
576 0.32
577 0.3
578 0.26
579 0.24
580 0.27
581 0.36
582 0.41
583 0.41
584 0.44
585 0.42
586 0.46
587 0.44
588 0.4
589 0.32
590 0.3
591 0.29
592 0.24
593 0.29
594 0.26
595 0.25
596 0.25
597 0.24
598 0.19
599 0.16
600 0.16
601 0.13
602 0.13
603 0.13
604 0.14
605 0.17
606 0.19
607 0.2
608 0.18
609 0.15
610 0.18
611 0.19
612 0.18
613 0.16
614 0.15
615 0.14
616 0.15
617 0.16
618 0.17
619 0.16
620 0.16
621 0.14
622 0.13
623 0.14
624 0.14
625 0.14
626 0.14
627 0.14
628 0.14
629 0.14
630 0.13
631 0.15
632 0.14
633 0.12
634 0.1
635 0.1
636 0.11
637 0.12
638 0.11
639 0.09
640 0.09
641 0.09
642 0.1
643 0.09
644 0.08
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.12
650 0.12
651 0.13
652 0.15
653 0.14
654 0.18
655 0.24
656 0.25
657 0.24
658 0.24
659 0.24
660 0.25
661 0.27
662 0.26
663 0.23
664 0.33
665 0.37
666 0.43
667 0.44
668 0.43
669 0.4
670 0.41
671 0.4
672 0.33
673 0.32
674 0.3
675 0.3
676 0.29
677 0.3
678 0.29
679 0.3
680 0.29
681 0.25
682 0.23
683 0.22
684 0.24
685 0.23
686 0.22
687 0.22
688 0.24
689 0.23
690 0.21
691 0.19
692 0.17
693 0.22
694 0.22
695 0.21
696 0.18
697 0.18
698 0.19
699 0.2
700 0.19
701 0.13
702 0.12
703 0.11
704 0.12
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.11
709 0.13
710 0.13
711 0.13
712 0.14
713 0.21
714 0.28
715 0.3
716 0.3
717 0.35
718 0.43
719 0.48
720 0.46
721 0.42
722 0.37
723 0.42
724 0.44
725 0.4
726 0.34
727 0.3
728 0.33
729 0.33
730 0.35
731 0.35
732 0.32
733 0.31
734 0.29
735 0.29
736 0.24
737 0.21
738 0.18
739 0.1
740 0.1
741 0.08
742 0.08
743 0.07
744 0.08
745 0.08
746 0.07
747 0.07
748 0.06
749 0.06
750 0.07
751 0.08
752 0.12
753 0.15
754 0.15
755 0.16
756 0.2
757 0.25
758 0.31
759 0.34
760 0.39
761 0.42
762 0.45
763 0.49
764 0.53
765 0.52
766 0.48
767 0.5
768 0.42
769 0.41
770 0.39
771 0.33
772 0.28
773 0.27
774 0.24
775 0.2
776 0.18
777 0.13
778 0.12
779 0.13
780 0.12
781 0.08
782 0.07
783 0.06
784 0.06
785 0.06
786 0.07
787 0.08
788 0.09
789 0.1
790 0.12
791 0.13
792 0.16
793 0.16
794 0.17
795 0.19
796 0.22
797 0.22
798 0.21
799 0.26
800 0.26
801 0.34
802 0.38
803 0.39
804 0.34
805 0.33
806 0.32
807 0.27
808 0.23
809 0.16
810 0.13
811 0.1
812 0.13
813 0.17
814 0.2
815 0.26
816 0.26
817 0.26
818 0.25
819 0.23
820 0.2
821 0.16
822 0.13
823 0.08
824 0.08
825 0.07
826 0.07
827 0.07
828 0.07
829 0.06
830 0.07
831 0.06
832 0.06
833 0.07
834 0.09
835 0.11
836 0.16
837 0.16
838 0.2
839 0.26
840 0.29
841 0.33
842 0.33
843 0.38
844 0.43
845 0.47
846 0.53
847 0.52
848 0.51
849 0.47
850 0.44
851 0.4
852 0.34
853 0.33
854 0.26
855 0.24
856 0.24
857 0.24
858 0.27
859 0.24
860 0.24
861 0.23
862 0.3
863 0.33
864 0.34
865 0.39
866 0.37
867 0.39
868 0.37
869 0.37
870 0.29
871 0.24
872 0.25
873 0.25
874 0.31
875 0.33
876 0.36
877 0.4
878 0.42
879 0.42
880 0.45
881 0.5
882 0.51
883 0.55
884 0.59
885 0.62
886 0.65
887 0.65
888 0.64
889 0.61
890 0.56
891 0.55
892 0.48
893 0.38
894 0.34
895 0.33
896 0.29
897 0.23
898 0.21
899 0.16
900 0.16
901 0.16
902 0.14
903 0.14
904 0.13
905 0.12
906 0.1
907 0.09
908 0.09
909 0.08
910 0.11
911 0.11
912 0.11
913 0.11
914 0.1
915 0.1
916 0.1
917 0.1
918 0.08
919 0.08
920 0.07
921 0.07
922 0.08
923 0.08
924 0.09
925 0.08
926 0.07
927 0.07
928 0.07
929 0.08
930 0.06
931 0.06
932 0.06
933 0.07
934 0.07
935 0.09
936 0.09
937 0.12
938 0.15
939 0.17
940 0.19
941 0.21
942 0.24
943 0.24
944 0.24
945 0.26
946 0.27
947 0.3
948 0.29
949 0.29
950 0.27
951 0.26
952 0.25
953 0.25
954 0.21
955 0.16
956 0.19
957 0.16
958 0.19
959 0.18
960 0.22
961 0.19
962 0.19
963 0.18
964 0.15
965 0.15
966 0.12
967 0.12
968 0.08
969 0.09
970 0.09
971 0.11
972 0.14
973 0.19
974 0.19
975 0.22
976 0.31
977 0.3
978 0.32
979 0.35
980 0.34
981 0.29
982 0.3
983 0.28
984 0.2
985 0.21
986 0.19
987 0.17
988 0.18
989 0.21
990 0.21
991 0.23
992 0.23
993 0.22
994 0.23
995 0.23
996 0.23
997 0.22
998 0.27
999 0.3
1000 0.31
1001 0.3
1002 0.27
1003 0.27
1004 0.25
1005 0.24
1006 0.2
1007 0.17
1008 0.23
1009 0.23
1010 0.26
1011 0.31
1012 0.34
1013 0.36
1014 0.42
1015 0.44
1016 0.39
1017 0.39
1018 0.39
1019 0.35
1020 0.3
1021 0.26
1022 0.21
1023 0.16
1024 0.14
1025 0.16
1026 0.16
1027 0.14
1028 0.15
1029 0.21
1030 0.2
1031 0.23
1032 0.27
1033 0.35
1034 0.42
1035 0.5
1036 0.53
1037 0.5
1038 0.51
1039 0.52
1040 0.51
1041 0.47
1042 0.48
1043 0.41
1044 0.39
1045 0.39
1046 0.4
1047 0.39
1048 0.37
1049 0.32
1050 0.26
1051 0.27
1052 0.26
1053 0.26
1054 0.24
1055 0.23
1056 0.21
1057 0.19
1058 0.17
1059 0.14
1060 0.15
1061 0.13
1062 0.13
1063 0.12
1064 0.12
1065 0.14
1066 0.13