FuNGI

C1GCV6

Protein Details

Accession

C1GCV6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
982-1004	GPFVPFGKPHRRRERSGLRRSAS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
989-1003	KPHRRRERSGLRRSA

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	pbn:PADG_05092 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MLKPFLIRDLLDQPVENEQSSPNSIISPPLNDRPAMSYERTDVPAPHIGPIMVGDSVRPYSNHGISSLPSDEINGGVKSEVDNDGGPSEARSKKSANDSVPSMRNKHRHGIVRVSAEEYDETIAAHPQAKLSYMDEDDGDIITVGSSLELTQRLSEPASPNVRHRGFVSSNAWEVEPMHIFDVNRSKSILDIWRSFERRTSMGSRPLETSTTGVTTTEENTQPKPVFEKGNDDHRERWFQLCNPPQVHTSIRALGEKASSEHGNSVFTTQPSELCASGNIEPPQAMSSTSITEEGKQQAQKAGSRLSRARNVTIDAHPSIPAIPLTAENPWASFTTYPSGFGPQDLTQREPESRESPIKNSQPLLASLEAELAKIMENKRVGDSSNTEIQEQKTLENDPPHLQQSSNSEQKPEISSQHIPKPAEMLSQSMHALLGGVRHLTSELRSKLPEIERRLSNAHQQIPSTVQTTIFSTISAIGTYIHSLANAMQDTVASSRVTADRLVEADVLAAEQIVNGLRSLASDIGEMGRTLFATFETMSRGLGSSQAQPNGEPPNHGDIPDQSNPEEPVSQSTASQNVSVNIESLPGIPNSHEASLESESQAATLREKQLANSQINTLFVGNVSSAAAEKDIQDAFAKKGFLGKVNLPKDSATGTHAGFGYIEFPCSFAASAALHALNGDLIFDQAINLEFSHVSMVDSTINSAERLSVGIGRASTIVPAEGNNPQRSLVNGRIPLTGSGDARDPLRDSSDIRRTRSLGVLRRSQVHDPLRHGTRGMAKIKEMSEDLDQSNNEADGLRNRSSWEPERRRPSSLYSSATVANLLTDQDDVEPEFSARYPSLISDAHTRERRSHLLPHQTQGLPRNLSPASQMARFPSISQLEARTSKAQSQQVDQMAGRNPPTPVDVRPFPANRFPEVSTNNRQKTTYPATPPISGIRLPGSWPPEYHSAQPVGLHTSSPAATGELFRSNTTIASNPAARLSGPFVPFGKPHRRRERSGLRRSASESQHRRPLGGFFDRHRSRFEERPAIYSQSILPGIPAESLSSLPGSFPTESPPVIPPKPIHQYSNIQPEMQEQRPRNDGPASYQIERCIRHLALLGYGRNQNHPSHNLKIYAEAAGGVLDDAIEMIEEEQKAFEQRGVSQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.32
3	0.28
4	0.24
5	0.22
6	0.24
7	0.27
8	0.26
9	0.2
10	0.2
11	0.2
12	0.24
13	0.24
14	0.26
15	0.29
16	0.34
17	0.36
18	0.35
19	0.36
20	0.35
21	0.37
22	0.36
23	0.33
24	0.29
25	0.31
26	0.35
27	0.36
28	0.34
29	0.31
30	0.31
31	0.35
32	0.33
33	0.31
34	0.28
35	0.25
36	0.23
37	0.23
38	0.19
39	0.13
40	0.12
41	0.1
42	0.12
43	0.14
44	0.15
45	0.14
46	0.18
47	0.24
48	0.28
49	0.28
50	0.26
51	0.26
52	0.26
53	0.31
54	0.27
55	0.21
56	0.18
57	0.18
58	0.17
59	0.16
60	0.19
61	0.14
62	0.12
63	0.12
64	0.12
65	0.12
66	0.14
67	0.14
68	0.13
69	0.13
70	0.14
71	0.14
72	0.15
73	0.14
74	0.13
75	0.19
76	0.23
77	0.25
78	0.28
79	0.3
80	0.35
81	0.45
82	0.51
83	0.48
84	0.48
85	0.51
86	0.55
87	0.6
88	0.59
89	0.56
90	0.57
91	0.6
92	0.6
93	0.63
94	0.63
95	0.65
96	0.66
97	0.69
98	0.67
99	0.65
100	0.62
101	0.56
102	0.49
103	0.41
104	0.35
105	0.26
106	0.21
107	0.14
108	0.13
109	0.1
110	0.12
111	0.12
112	0.14
113	0.13
114	0.13
115	0.14
116	0.16
117	0.17
118	0.17
119	0.2
120	0.19
121	0.19
122	0.18
123	0.18
124	0.17
125	0.15
126	0.13
127	0.09
128	0.07
129	0.06
130	0.06
131	0.05
132	0.04
133	0.04
134	0.04
135	0.07
136	0.08
137	0.09
138	0.1
139	0.12
140	0.13
141	0.15
142	0.19
143	0.2
144	0.27
145	0.34
146	0.35
147	0.39
148	0.48
149	0.48
150	0.45
151	0.43
152	0.43
153	0.37
154	0.42
155	0.42
156	0.35
157	0.36
158	0.36
159	0.34
160	0.26
161	0.25
162	0.21
163	0.18
164	0.15
165	0.15
166	0.16
167	0.16
168	0.2
169	0.29
170	0.27
171	0.27
172	0.26
173	0.25
174	0.23
175	0.29
176	0.31
177	0.28
178	0.29
179	0.34
180	0.42
181	0.45
182	0.45
183	0.45
184	0.41
185	0.37
186	0.39
187	0.39
188	0.37
189	0.43
190	0.45
191	0.43
192	0.42
193	0.42
194	0.38
195	0.33
196	0.28
197	0.2
198	0.18
199	0.16
200	0.14
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.17
205	0.19
206	0.21
207	0.22
208	0.28
209	0.28
210	0.28
211	0.3
212	0.29
213	0.31
214	0.31
215	0.39
216	0.37
217	0.46
218	0.5
219	0.5
220	0.51
221	0.5
222	0.55
223	0.48
224	0.48
225	0.43
226	0.42
227	0.49
228	0.51
229	0.54
230	0.49
231	0.49
232	0.46
233	0.44
234	0.42
235	0.36
236	0.32
237	0.28
238	0.28
239	0.27
240	0.26
241	0.24
242	0.23
243	0.2
244	0.18
245	0.17
246	0.16
247	0.15
248	0.18
249	0.17
250	0.17
251	0.16
252	0.17
253	0.16
254	0.16
255	0.18
256	0.15
257	0.15
258	0.15
259	0.17
260	0.15
261	0.13
262	0.13
263	0.14
264	0.15
265	0.21
266	0.19
267	0.18
268	0.18
269	0.18
270	0.18
271	0.15
272	0.14
273	0.1
274	0.1
275	0.11
276	0.12
277	0.13
278	0.13
279	0.14
280	0.17
281	0.18
282	0.22
283	0.22
284	0.23
285	0.25
286	0.28
287	0.3
288	0.3
289	0.34
290	0.32
291	0.36
292	0.4
293	0.41
294	0.46
295	0.45
296	0.45
297	0.4
298	0.41
299	0.39
300	0.37
301	0.35
302	0.29
303	0.27
304	0.24
305	0.22
306	0.19
307	0.16
308	0.13
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.09
313	0.09
314	0.11
315	0.1
316	0.1
317	0.11
318	0.11
319	0.12
320	0.11
321	0.12
322	0.15
323	0.15
324	0.16
325	0.16
326	0.19
327	0.17
328	0.17
329	0.19
330	0.17
331	0.23
332	0.23
333	0.25
334	0.24
335	0.26
336	0.27
337	0.26
338	0.28
339	0.24
340	0.27
341	0.32
342	0.31
343	0.34
344	0.41
345	0.43
346	0.42
347	0.4
348	0.38
349	0.33
350	0.32
351	0.3
352	0.23
353	0.19
354	0.15
355	0.17
356	0.14
357	0.12
358	0.11
359	0.08
360	0.08
361	0.11
362	0.12
363	0.14
364	0.15
365	0.16
366	0.18
367	0.19
368	0.19
369	0.19
370	0.21
371	0.21
372	0.26
373	0.25
374	0.24
375	0.26
376	0.26
377	0.27
378	0.24
379	0.21
380	0.17
381	0.18
382	0.21
383	0.21
384	0.23
385	0.21
386	0.23
387	0.25
388	0.23
389	0.22
390	0.2
391	0.25
392	0.29
393	0.33
394	0.31
395	0.3
396	0.3
397	0.32
398	0.32
399	0.28
400	0.23
401	0.21
402	0.27
403	0.3
404	0.36
405	0.39
406	0.36
407	0.34
408	0.35
409	0.3
410	0.27
411	0.22
412	0.18
413	0.13
414	0.14
415	0.14
416	0.12
417	0.11
418	0.08
419	0.08
420	0.06
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.06
428	0.08
429	0.14
430	0.16
431	0.17
432	0.18
433	0.19
434	0.24
435	0.3
436	0.35
437	0.34
438	0.38
439	0.37
440	0.4
441	0.43
442	0.38
443	0.4
444	0.39
445	0.38
446	0.33
447	0.32
448	0.3
449	0.3
450	0.29
451	0.23
452	0.18
453	0.13
454	0.13
455	0.14
456	0.15
457	0.12
458	0.11
459	0.09
460	0.1
461	0.09
462	0.09
463	0.07
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.07
468	0.06
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.08
473	0.08
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.07
478	0.07
479	0.08
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.08
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.08
488	0.09
489	0.1
490	0.08
491	0.07
492	0.07
493	0.06
494	0.05
495	0.04
496	0.03
497	0.02
498	0.02
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.03
505	0.04
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.04
519	0.04
520	0.05
521	0.06
522	0.06
523	0.08
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.07
529	0.09
530	0.1
531	0.12
532	0.14
533	0.16
534	0.16
535	0.16
536	0.19
537	0.21
538	0.2
539	0.16
540	0.16
541	0.2
542	0.2
543	0.2
544	0.18
545	0.16
546	0.22
547	0.24
548	0.23
549	0.17
550	0.18
551	0.19
552	0.19
553	0.17
554	0.11
555	0.11
556	0.12
557	0.12
558	0.11
559	0.11
560	0.13
561	0.13
562	0.14
563	0.11
564	0.1
565	0.11
566	0.11
567	0.11
568	0.08
569	0.08
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.08
577	0.09
578	0.09
579	0.09
580	0.08
581	0.11
582	0.12
583	0.13
584	0.11
585	0.1
586	0.09
587	0.1
588	0.11
589	0.08
590	0.08
591	0.1
592	0.11
593	0.15
594	0.15
595	0.15
596	0.2
597	0.26
598	0.26
599	0.24
600	0.24
601	0.21
602	0.22
603	0.21
604	0.15
605	0.09
606	0.08
607	0.07
608	0.06
609	0.05
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.07
618	0.07
619	0.07
620	0.08
621	0.1
622	0.1
623	0.12
624	0.12
625	0.1
626	0.14
627	0.14
628	0.16
629	0.18
630	0.21
631	0.28
632	0.3
633	0.31
634	0.28
635	0.27
636	0.25
637	0.24
638	0.19
639	0.12
640	0.12
641	0.12
642	0.13
643	0.13
644	0.12
645	0.11
646	0.1
647	0.1
648	0.08
649	0.09
650	0.07
651	0.07
652	0.07
653	0.08
654	0.08
655	0.05
656	0.07
657	0.06
658	0.07
659	0.07
660	0.07
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.05
665	0.05
666	0.04
667	0.03
668	0.03
669	0.03
670	0.03
671	0.03
672	0.03
673	0.04
674	0.05
675	0.04
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.06
680	0.06
681	0.05
682	0.05
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.07
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.07
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.07
696	0.07
697	0.07
698	0.07
699	0.08
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.06
707	0.08
708	0.13
709	0.18
710	0.19
711	0.19
712	0.2
713	0.2
714	0.21
715	0.24
716	0.24
717	0.25
718	0.27
719	0.28
720	0.28
721	0.28
722	0.27
723	0.25
724	0.22
725	0.16
726	0.14
727	0.14
728	0.14
729	0.14
730	0.14
731	0.12
732	0.11
733	0.13
734	0.13
735	0.15
736	0.22
737	0.31
738	0.35
739	0.37
740	0.4
741	0.39
742	0.4
743	0.44
744	0.43
745	0.41
746	0.42
747	0.46
748	0.44
749	0.47
750	0.49
751	0.44
752	0.46
753	0.45
754	0.43
755	0.41
756	0.46
757	0.44
758	0.41
759	0.39
760	0.34
761	0.34
762	0.37
763	0.38
764	0.32
765	0.3
766	0.33
767	0.33
768	0.32
769	0.25
770	0.2
771	0.18
772	0.19
773	0.19
774	0.18
775	0.17
776	0.16
777	0.16
778	0.14
779	0.12
780	0.09
781	0.1
782	0.12
783	0.18
784	0.18
785	0.18
786	0.2
787	0.22
788	0.28
789	0.35
790	0.41
791	0.45
792	0.53
793	0.62
794	0.63
795	0.65
796	0.62
797	0.6
798	0.58
799	0.55
800	0.49
801	0.41
802	0.4
803	0.37
804	0.34
805	0.27
806	0.18
807	0.12
808	0.09
809	0.08
810	0.06
811	0.06
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.07
816	0.07
817	0.07
818	0.07
819	0.07
820	0.07
821	0.09
822	0.09
823	0.09
824	0.09
825	0.09
826	0.12
827	0.12
828	0.14
829	0.19
830	0.23
831	0.3
832	0.35
833	0.36
834	0.37
835	0.43
836	0.46
837	0.42
838	0.47
839	0.47
840	0.53
841	0.54
842	0.53
843	0.54
844	0.5
845	0.5
846	0.47
847	0.46
848	0.37
849	0.35
850	0.37
851	0.3
852	0.29
853	0.28
854	0.27
855	0.23
856	0.22
857	0.24
858	0.21
859	0.24
860	0.24
861	0.23
862	0.24
863	0.23
864	0.22
865	0.22
866	0.22
867	0.24
868	0.25
869	0.28
870	0.26
871	0.26
872	0.3
873	0.35
874	0.38
875	0.35
876	0.37
877	0.41
878	0.39
879	0.4
880	0.36
881	0.33
882	0.31
883	0.31
884	0.29
885	0.24
886	0.22
887	0.2
888	0.23
889	0.21
890	0.21
891	0.26
892	0.27
893	0.28
894	0.36
895	0.38
896	0.38
897	0.44
898	0.44
899	0.4
900	0.41
901	0.39
902	0.39
903	0.41
904	0.45
905	0.46
906	0.54
907	0.55
908	0.54
909	0.52
910	0.46
911	0.49
912	0.51
913	0.49
914	0.45
915	0.48
916	0.5
917	0.5
918	0.51
919	0.46
920	0.4
921	0.33
922	0.28
923	0.23
924	0.2
925	0.2
926	0.23
927	0.24
928	0.22
929	0.22
930	0.25
931	0.29
932	0.31
933	0.32
934	0.32
935	0.3
936	0.29
937	0.3
938	0.27
939	0.25
940	0.23
941	0.2
942	0.16
943	0.16
944	0.16
945	0.15
946	0.14
947	0.1
948	0.1
949	0.12
950	0.14
951	0.17
952	0.18
953	0.17
954	0.18
955	0.18
956	0.18
957	0.18
958	0.17
959	0.15
960	0.18
961	0.19
962	0.19
963	0.2
964	0.19
965	0.17
966	0.17
967	0.19
968	0.21
969	0.2
970	0.22
971	0.22
972	0.25
973	0.27
974	0.34
975	0.41
976	0.44
977	0.54
978	0.63
979	0.68
980	0.72
981	0.8
982	0.84
983	0.83
984	0.85
985	0.84
986	0.76
987	0.73
988	0.73
989	0.7
990	0.67
991	0.67
992	0.65
993	0.62
994	0.68
995	0.64
996	0.59
997	0.53
998	0.5
999	0.47
1000	0.45
1001	0.43
1002	0.38
1003	0.49
1004	0.53
1005	0.53
1006	0.52
1007	0.5
1008	0.48
1009	0.52
1010	0.57
1011	0.56
1012	0.52
1013	0.55
1014	0.55
1015	0.54
1016	0.48
1017	0.41
1018	0.33
1019	0.28
1020	0.27
1021	0.22
1022	0.18
1023	0.14
1024	0.15
1025	0.14
1026	0.13
1027	0.09
1028	0.09
1029	0.1
1030	0.11
1031	0.1
1032	0.1
1033	0.09
1034	0.11
1035	0.13
1036	0.14
1037	0.14
1038	0.18
1039	0.2
1040	0.21
1041	0.23
1042	0.26
1043	0.3
1044	0.3
1045	0.35
1046	0.33
1047	0.38
1048	0.47
1049	0.49
1050	0.48
1051	0.46
1052	0.52
1053	0.56
1054	0.64
1055	0.57
1056	0.48
1057	0.44
1058	0.48
1059	0.49
1060	0.49
1061	0.49
1062	0.42
1063	0.46
1064	0.53
1065	0.54
1066	0.51
1067	0.48
1068	0.43
1069	0.41
1070	0.47
1071	0.47
1072	0.45
1073	0.45
1074	0.47
1075	0.48
1076	0.48
1077	0.44
1078	0.41
1079	0.35
1080	0.33
1081	0.35
1082	0.3
1083	0.3
1084	0.34
1085	0.33
1086	0.32
1087	0.37
1088	0.36
1089	0.39
1090	0.41
1091	0.39
1092	0.41
1093	0.46
1094	0.47
1095	0.49
1096	0.52
1097	0.51
1098	0.48
1099	0.47
1100	0.42
1101	0.36
1102	0.3
1103	0.22
1104	0.17
1105	0.13
1106	0.12
1107	0.08
1108	0.06
1109	0.04
1110	0.04
1111	0.04
1112	0.03
1113	0.03
1114	0.04
1115	0.05
1116	0.09
1117	0.09
1118	0.1
1119	0.1
1120	0.12
1121	0.14
1122	0.15
1123	0.17

C1GCV6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer