Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1G1V0

Protein Details
Accession C1G1V0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-36MGSSQKKKNEKKKDFQKTKLKVGKTKPKPSNFTDTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-28KKKNEKKKDFQKTKLKVGKTKPK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbn:PADG_02116  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSSQKKKNEKKKDFQKTKLKVGKTKPKPSNFTDTSFRSKAIVLNQQSLTISSPSASAQFTHNLSLLNSKSDSQRKDSLSYLTTAIVSRPVSSPLPQPVSVILPSLTTLILDGSSGVRTQLIKLLKSLPPPDMEGHISQLLPYVRAGMTHLAADIRLSSVEIISWLIATAGREVVSAPGGWIKTLNCFLSILGWHTEESTKWSLNKASFGKAGSDGKPMVRTLQILAEFLRSGIGPAEDNPDLDEDDLRDSKDWAFPLTQTDQHVLPTKSAPFAYLTLFGQPQNEEGEIYETREDRFRVFKEKFLSAVERGVNSTRQEGGEVGRASASLKKVLHEAMTLNVGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.93
3 0.94
4 0.9
5 0.91
6 0.88
7 0.86
8 0.83
9 0.83
10 0.84
11 0.84
12 0.86
13 0.85
14 0.86
15 0.84
16 0.81
17 0.81
18 0.74
19 0.69
20 0.66
21 0.61
22 0.6
23 0.55
24 0.49
25 0.4
26 0.37
27 0.36
28 0.35
29 0.39
30 0.34
31 0.39
32 0.39
33 0.39
34 0.38
35 0.35
36 0.3
37 0.21
38 0.18
39 0.11
40 0.12
41 0.11
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.12
46 0.16
47 0.17
48 0.18
49 0.19
50 0.18
51 0.18
52 0.23
53 0.21
54 0.2
55 0.2
56 0.2
57 0.27
58 0.33
59 0.36
60 0.36
61 0.42
62 0.42
63 0.44
64 0.44
65 0.41
66 0.35
67 0.34
68 0.29
69 0.22
70 0.2
71 0.17
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.13
76 0.13
77 0.16
78 0.16
79 0.18
80 0.22
81 0.25
82 0.29
83 0.27
84 0.27
85 0.25
86 0.26
87 0.24
88 0.21
89 0.14
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.04
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.12
108 0.14
109 0.14
110 0.16
111 0.21
112 0.22
113 0.26
114 0.27
115 0.24
116 0.23
117 0.25
118 0.24
119 0.22
120 0.22
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.15
125 0.13
126 0.15
127 0.13
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.08
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.09
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.17
190 0.2
191 0.2
192 0.27
193 0.24
194 0.24
195 0.24
196 0.24
197 0.23
198 0.23
199 0.26
200 0.21
201 0.22
202 0.2
203 0.19
204 0.21
205 0.19
206 0.18
207 0.15
208 0.14
209 0.12
210 0.16
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.07
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.08
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.17
240 0.17
241 0.15
242 0.15
243 0.15
244 0.2
245 0.22
246 0.23
247 0.22
248 0.24
249 0.22
250 0.24
251 0.31
252 0.26
253 0.24
254 0.25
255 0.24
256 0.25
257 0.24
258 0.22
259 0.17
260 0.18
261 0.18
262 0.17
263 0.16
264 0.17
265 0.18
266 0.17
267 0.17
268 0.16
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.13
273 0.12
274 0.16
275 0.15
276 0.17
277 0.18
278 0.17
279 0.18
280 0.22
281 0.22
282 0.21
283 0.27
284 0.28
285 0.35
286 0.37
287 0.41
288 0.43
289 0.44
290 0.43
291 0.41
292 0.43
293 0.35
294 0.38
295 0.35
296 0.3
297 0.3
298 0.31
299 0.31
300 0.28
301 0.29
302 0.26
303 0.23
304 0.24
305 0.22
306 0.22
307 0.26
308 0.24
309 0.22
310 0.2
311 0.19
312 0.19
313 0.23
314 0.22
315 0.21
316 0.21
317 0.22
318 0.25
319 0.28
320 0.28
321 0.25
322 0.24
323 0.21