FuNGI

A0A1D2VLS2

Protein Details

Accession

A0A1D2VLS2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
900-925	FDSKISKSLEQRKKSLKKQFVFIRDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 6, mito 5, pero 2, E.R. 1, golg 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MSNLFAQSLLAHPVFKKLDTSANFFGLKSSQSTASGVGNLQSGPKLVNSNSIASRNGNELFIAYENTIRYTIMDNDNGIDTKPNKTYKLLNLPKIDFVISSLLINNSATFLAAIGENQVYIISLPRFSILSSFLNDDSKNLINVDYFSIANSIYYNTTNNNINLKILNVIWNPISLNDSNLIILSSDSIIRTFDLNLSNDYPFESYNLLNKIKNPISITFGSNFNSNDNPISNLSLYILNQDGKIYSLFPFYPRILSISKKFLLNLLNDLKFNSKKLNSNNNNNKNSNSLVTMINNQFIWLNHLINQINVPNPAFQYNHSNSLEKLYILYPLSNNLYKISNLNLIGPLKFNPLPESLNEVYSNNIISVNSGTINLLVISFNNSSILIVFPSNNNIMQWNLHNKNKNYKNYNYSYIDNNFNNGSHDIIKINNHAESIDQDIDNFSNEISIVEIKTDDNNRKNGFSFNFEYEIVDNIEDKSDDNTNNGQKLLGYNNNNNNDLNQSTLVYDFKGDGIVTTSNHDYNYDYNINNFEFSNLTVISCIKLPYGDEYNGNGELLLIEPNDNIPCLFFVIYNNGIIKFDFYKLGKILNDSIVDNNLEFLDKFLNSNSYHDYLTQNYIDLLLINEFDNSFGKRFKFDGINILNDNNGDNYVLSIINSKVDVFKIDDDENEIDEKYYQENYDFNDDDNLLNLEKMANELDEIDESEKIKDKVNEEHKKKGYETILVNRPNEELNLIQNLINRQKNIISELNNNANVQLNLNQRLNLKLNPKDIDNFEDENRNEQLLKIIGIISNEFYARILNFYKFEMNLRMNLELQKKEFENELVKLNEINYKVENLNRINNKYEDKENENDKRISSILERQERIDSRIEKIIKNTRNLKVNLPINKKEEQWFKELELFDSKISKSLEQRKKSLKKQFVFIRDELEYNKRINKPGNGNNVNLKELDLVNKYIENEDNLIKGASKDLSDSLFEIENQLRGINLED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.25
3	0.26
4	0.24
5	0.32
6	0.34
7	0.41
8	0.38
9	0.4
10	0.41
11	0.38
12	0.37
13	0.3
14	0.28
15	0.23
16	0.22
17	0.2
18	0.2
19	0.22
20	0.22
21	0.22
22	0.22
23	0.19
24	0.17
25	0.16
26	0.15
27	0.15
28	0.14
29	0.13
30	0.12
31	0.14
32	0.17
33	0.16
34	0.24
35	0.25
36	0.29
37	0.33
38	0.35
39	0.35
40	0.33
41	0.34
42	0.31
43	0.3
44	0.25
45	0.21
46	0.19
47	0.18
48	0.17
49	0.17
50	0.13
51	0.15
52	0.15
53	0.17
54	0.17
55	0.15
56	0.15
57	0.16
58	0.21
59	0.23
60	0.25
61	0.23
62	0.25
63	0.27
64	0.26
65	0.23
66	0.24
67	0.21
68	0.24
69	0.31
70	0.34
71	0.34
72	0.38
73	0.45
74	0.48
75	0.57
76	0.61
77	0.61
78	0.64
79	0.64
80	0.63
81	0.57
82	0.48
83	0.37
84	0.29
85	0.25
86	0.18
87	0.16
88	0.15
89	0.14
90	0.14
91	0.14
92	0.13
93	0.1
94	0.1
95	0.09
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.07
100	0.07
101	0.08
102	0.08
103	0.07
104	0.07
105	0.07
106	0.06
107	0.06
108	0.1
109	0.1
110	0.1
111	0.11
112	0.12
113	0.12
114	0.12
115	0.14
116	0.13
117	0.15
118	0.16
119	0.19
120	0.19
121	0.22
122	0.22
123	0.22
124	0.22
125	0.21
126	0.2
127	0.18
128	0.17
129	0.15
130	0.16
131	0.17
132	0.15
133	0.13
134	0.12
135	0.13
136	0.12
137	0.11
138	0.1
139	0.09
140	0.09
141	0.11
142	0.12
143	0.13
144	0.16
145	0.2
146	0.22
147	0.25
148	0.24
149	0.25
150	0.24
151	0.23
152	0.21
153	0.18
154	0.22
155	0.18
156	0.19
157	0.18
158	0.18
159	0.18
160	0.16
161	0.19
162	0.13
163	0.14
164	0.14
165	0.14
166	0.13
167	0.12
168	0.12
169	0.08
170	0.08
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.09
178	0.1
179	0.09
180	0.12
181	0.15
182	0.16
183	0.19
184	0.21
185	0.21
186	0.2
187	0.2
188	0.18
189	0.14
190	0.14
191	0.13
192	0.12
193	0.17
194	0.23
195	0.24
196	0.25
197	0.27
198	0.34
199	0.34
200	0.36
201	0.34
202	0.3
203	0.33
204	0.34
205	0.34
206	0.28
207	0.28
208	0.25
209	0.25
210	0.24
211	0.21
212	0.2
213	0.19
214	0.19
215	0.17
216	0.18
217	0.17
218	0.18
219	0.16
220	0.15
221	0.15
222	0.14
223	0.14
224	0.13
225	0.14
226	0.13
227	0.12
228	0.13
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.09
234	0.11
235	0.12
236	0.13
237	0.17
238	0.17
239	0.18
240	0.17
241	0.19
242	0.19
243	0.24
244	0.27
245	0.29
246	0.31
247	0.3
248	0.3
249	0.3
250	0.31
251	0.28
252	0.3
253	0.3
254	0.29
255	0.29
256	0.3
257	0.32
258	0.29
259	0.29
260	0.3
261	0.27
262	0.32
263	0.41
264	0.51
265	0.53
266	0.63
267	0.73
268	0.76
269	0.79
270	0.74
271	0.67
272	0.59
273	0.53
274	0.43
275	0.33
276	0.25
277	0.2
278	0.19
279	0.24
280	0.22
281	0.21
282	0.2
283	0.18
284	0.17
285	0.16
286	0.19
287	0.15
288	0.15
289	0.16
290	0.21
291	0.21
292	0.2
293	0.22
294	0.18
295	0.18
296	0.18
297	0.16
298	0.12
299	0.13
300	0.15
301	0.15
302	0.15
303	0.22
304	0.23
305	0.3
306	0.3
307	0.3
308	0.28
309	0.31
310	0.3
311	0.21
312	0.2
313	0.13
314	0.14
315	0.14
316	0.15
317	0.11
318	0.13
319	0.16
320	0.16
321	0.16
322	0.15
323	0.16
324	0.16
325	0.16
326	0.16
327	0.16
328	0.15
329	0.16
330	0.18
331	0.17
332	0.17
333	0.17
334	0.16
335	0.17
336	0.17
337	0.17
338	0.16
339	0.17
340	0.18
341	0.17
342	0.24
343	0.2
344	0.21
345	0.21
346	0.19
347	0.18
348	0.17
349	0.17
350	0.09
351	0.09
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.09
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.11
384	0.13
385	0.2
386	0.24
387	0.29
388	0.36
389	0.38
390	0.47
391	0.54
392	0.6
393	0.57
394	0.58
395	0.6
396	0.58
397	0.62
398	0.55
399	0.49
400	0.45
401	0.42
402	0.42
403	0.34
404	0.31
405	0.25
406	0.22
407	0.22
408	0.18
409	0.16
410	0.11
411	0.12
412	0.11
413	0.12
414	0.13
415	0.13
416	0.14
417	0.13
418	0.12
419	0.11
420	0.11
421	0.1
422	0.13
423	0.12
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.11
428	0.11
429	0.1
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.08
441	0.13
442	0.19
443	0.22
444	0.27
445	0.28
446	0.29
447	0.3
448	0.31
449	0.28
450	0.27
451	0.26
452	0.23
453	0.24
454	0.22
455	0.22
456	0.19
457	0.18
458	0.13
459	0.11
460	0.09
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.09
467	0.09
468	0.11
469	0.15
470	0.17
471	0.18
472	0.17
473	0.16
474	0.13
475	0.15
476	0.16
477	0.18
478	0.19
479	0.23
480	0.3
481	0.32
482	0.33
483	0.32
484	0.29
485	0.25
486	0.22
487	0.18
488	0.11
489	0.09
490	0.08
491	0.09
492	0.09
493	0.07
494	0.07
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.05
499	0.05
500	0.06
501	0.07
502	0.07
503	0.09
504	0.1
505	0.1
506	0.1
507	0.11
508	0.1
509	0.1
510	0.15
511	0.15
512	0.14
513	0.15
514	0.17
515	0.16
516	0.16
517	0.15
518	0.11
519	0.09
520	0.09
521	0.1
522	0.08
523	0.07
524	0.07
525	0.07
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.09
533	0.12
534	0.12
535	0.13
536	0.14
537	0.16
538	0.16
539	0.15
540	0.12
541	0.08
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.05
549	0.06
550	0.06
551	0.05
552	0.05
553	0.05
554	0.06
555	0.06
556	0.05
557	0.06
558	0.1
559	0.11
560	0.12
561	0.12
562	0.11
563	0.11
564	0.11
565	0.12
566	0.1
567	0.1
568	0.13
569	0.12
570	0.15
571	0.15
572	0.18
573	0.17
574	0.17
575	0.18
576	0.17
577	0.17
578	0.16
579	0.16
580	0.14
581	0.14
582	0.12
583	0.1
584	0.08
585	0.07
586	0.06
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.08
591	0.08
592	0.12
593	0.12
594	0.14
595	0.17
596	0.17
597	0.17
598	0.18
599	0.19
600	0.17
601	0.19
602	0.18
603	0.14
604	0.13
605	0.13
606	0.11
607	0.09
608	0.08
609	0.05
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.08
616	0.08
617	0.09
618	0.12
619	0.12
620	0.14
621	0.15
622	0.18
623	0.21
624	0.21
625	0.28
626	0.28
627	0.31
628	0.3
629	0.29
630	0.26
631	0.22
632	0.21
633	0.12
634	0.1
635	0.07
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.08
642	0.07
643	0.08
644	0.08
645	0.08
646	0.08
647	0.09
648	0.1
649	0.1
650	0.11
651	0.14
652	0.14
653	0.14
654	0.17
655	0.17
656	0.17
657	0.16
658	0.14
659	0.11
660	0.11
661	0.12
662	0.1
663	0.11
664	0.1
665	0.1
666	0.12
667	0.14
668	0.19
669	0.19
670	0.18
671	0.18
672	0.19
673	0.18
674	0.17
675	0.16
676	0.1
677	0.09
678	0.09
679	0.07
680	0.07
681	0.08
682	0.07
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.07
687	0.07
688	0.08
689	0.08
690	0.09
691	0.1
692	0.11
693	0.15
694	0.15
695	0.19
696	0.22
697	0.24
698	0.32
699	0.42
700	0.51
701	0.52
702	0.61
703	0.62
704	0.62
705	0.6
706	0.58
707	0.5
708	0.46
709	0.46
710	0.45
711	0.48
712	0.49
713	0.49
714	0.43
715	0.4
716	0.35
717	0.3
718	0.23
719	0.16
720	0.13
721	0.15
722	0.15
723	0.15
724	0.17
725	0.21
726	0.27
727	0.29
728	0.27
729	0.26
730	0.28
731	0.28
732	0.31
733	0.31
734	0.27
735	0.29
736	0.34
737	0.38
738	0.37
739	0.36
740	0.31
741	0.29
742	0.26
743	0.22
744	0.23
745	0.22
746	0.26
747	0.27
748	0.28
749	0.27
750	0.31
751	0.33
752	0.33
753	0.35
754	0.36
755	0.41
756	0.4
757	0.41
758	0.41
759	0.4
760	0.39
761	0.36
762	0.33
763	0.29
764	0.35
765	0.34
766	0.33
767	0.32
768	0.29
769	0.24
770	0.22
771	0.23
772	0.16
773	0.16
774	0.13
775	0.12
776	0.13
777	0.13
778	0.14
779	0.11
780	0.11
781	0.11
782	0.1
783	0.09
784	0.1
785	0.09
786	0.12
787	0.13
788	0.14
789	0.16
790	0.17
791	0.2
792	0.2
793	0.22
794	0.26
795	0.25
796	0.27
797	0.28
798	0.28
799	0.27
800	0.33
801	0.36
802	0.33
803	0.33
804	0.33
805	0.32
806	0.31
807	0.31
808	0.29
809	0.28
810	0.27
811	0.31
812	0.27
813	0.27
814	0.26
815	0.25
816	0.26
817	0.23
818	0.23
819	0.18
820	0.21
821	0.22
822	0.24
823	0.3
824	0.28
825	0.36
826	0.41
827	0.43
828	0.44
829	0.47
830	0.49
831	0.47
832	0.51
833	0.48
834	0.46
835	0.5
836	0.55
837	0.59
838	0.6
839	0.57
840	0.5
841	0.47
842	0.42
843	0.38
844	0.32
845	0.33
846	0.36
847	0.43
848	0.44
849	0.43
850	0.51
851	0.5
852	0.48
853	0.48
854	0.41
855	0.37
856	0.44
857	0.45
858	0.4
859	0.46
860	0.53
861	0.5
862	0.57
863	0.61
864	0.6
865	0.65
866	0.65
867	0.62
868	0.62
869	0.64
870	0.65
871	0.64
872	0.64
873	0.6
874	0.61
875	0.59
876	0.58
877	0.6
878	0.54
879	0.51
880	0.47
881	0.45
882	0.48
883	0.46
884	0.41
885	0.37
886	0.34
887	0.31
888	0.32
889	0.29
890	0.28
891	0.29
892	0.3
893	0.34
894	0.43
895	0.52
896	0.55
897	0.64
898	0.69
899	0.77
900	0.83
901	0.84
902	0.84
903	0.78
904	0.81
905	0.82
906	0.8
907	0.77
908	0.68
909	0.63
910	0.55
911	0.52
912	0.47
913	0.44
914	0.38
915	0.35
916	0.42
917	0.4
918	0.44
919	0.49
920	0.53
921	0.57
922	0.63
923	0.7
924	0.66
925	0.66
926	0.69
927	0.65
928	0.58
929	0.48
930	0.4
931	0.31
932	0.29
933	0.3
934	0.24
935	0.23
936	0.23
937	0.25
938	0.25
939	0.25
940	0.26
941	0.23
942	0.24
943	0.24
944	0.23
945	0.22
946	0.21
947	0.18
948	0.17
949	0.18
950	0.16
951	0.15
952	0.16
953	0.17
954	0.18
955	0.19
956	0.19
957	0.18
958	0.18
959	0.18
960	0.2
961	0.2
962	0.2
963	0.19
964	0.18
965	0.15

A0A1D2VLS2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer