Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VDB6

Protein Details
Accession A0A1D2VDB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MARKLKGRPRSHKNPSGLKAKLBasic
32-56SSAVSPPHPTKKKKIQSSQIFIPFQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-19RKLKGRPRSHKNPSGLK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11, cyto_nucl 8.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019446  BMT5-like  
Gene Ontology GO:0070042  F:rRNA (uridine-N3-)-methyltransferase activity  
GO:0070475  P:rRNA base methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF10354  BMT5-like  
Amino Acid Sequences MARKLKGRPRSHKNPSGLKAKLLLHQASLKNSSAVSPPHPTKKKKIQSSQIFIPFQKNDKILLIGEGDFSFSLSLLKSSLIASPDNLILSSFEKSTDDLLKNYFKSFPSIYNQLINDFNFILNKNFFLNIDCTNLIQSFKSQLNDKNLSLLLNFFTNNNNNNNNNNNNDYDYDNNNNNDKNKNNNSNIILFNFPHLGNGIKDFKKNIHQHQLFLLSLFKNCKQFFNLLNKFNNNKNNNNSNNNKLVISLFNGEPYDSWNIKSLAKSLDISLQRSGDFNWRSFPLYHHRRTNSMFDTTKPSYDRSARFYLFNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.84
3 0.83
4 0.75
5 0.67
6 0.62
7 0.56
8 0.52
9 0.49
10 0.43
11 0.36
12 0.42
13 0.42
14 0.41
15 0.41
16 0.37
17 0.31
18 0.3
19 0.28
20 0.25
21 0.25
22 0.24
23 0.29
24 0.35
25 0.44
26 0.53
27 0.57
28 0.63
29 0.71
30 0.77
31 0.79
32 0.83
33 0.83
34 0.85
35 0.86
36 0.85
37 0.83
38 0.76
39 0.67
40 0.64
41 0.56
42 0.5
43 0.47
44 0.39
45 0.32
46 0.3
47 0.31
48 0.24
49 0.22
50 0.2
51 0.15
52 0.15
53 0.13
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.08
58 0.06
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.13
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.21
87 0.25
88 0.25
89 0.26
90 0.26
91 0.2
92 0.23
93 0.23
94 0.24
95 0.25
96 0.28
97 0.28
98 0.29
99 0.29
100 0.27
101 0.28
102 0.24
103 0.21
104 0.17
105 0.15
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.13
116 0.12
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.13
127 0.14
128 0.16
129 0.2
130 0.27
131 0.3
132 0.29
133 0.28
134 0.26
135 0.25
136 0.22
137 0.18
138 0.11
139 0.08
140 0.09
141 0.07
142 0.09
143 0.11
144 0.14
145 0.17
146 0.21
147 0.22
148 0.25
149 0.29
150 0.3
151 0.3
152 0.29
153 0.26
154 0.24
155 0.23
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.21
160 0.22
161 0.23
162 0.24
163 0.25
164 0.26
165 0.27
166 0.27
167 0.32
168 0.36
169 0.43
170 0.43
171 0.45
172 0.45
173 0.44
174 0.43
175 0.36
176 0.3
177 0.22
178 0.21
179 0.18
180 0.16
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.14
186 0.19
187 0.19
188 0.2
189 0.21
190 0.24
191 0.32
192 0.38
193 0.42
194 0.47
195 0.46
196 0.46
197 0.48
198 0.49
199 0.4
200 0.34
201 0.29
202 0.19
203 0.2
204 0.22
205 0.22
206 0.26
207 0.26
208 0.28
209 0.28
210 0.31
211 0.35
212 0.42
213 0.47
214 0.46
215 0.5
216 0.54
217 0.54
218 0.57
219 0.6
220 0.55
221 0.55
222 0.57
223 0.61
224 0.62
225 0.67
226 0.66
227 0.63
228 0.62
229 0.56
230 0.48
231 0.39
232 0.34
233 0.26
234 0.24
235 0.21
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.17
240 0.15
241 0.17
242 0.21
243 0.18
244 0.19
245 0.21
246 0.22
247 0.24
248 0.25
249 0.26
250 0.22
251 0.24
252 0.24
253 0.21
254 0.27
255 0.28
256 0.3
257 0.29
258 0.28
259 0.26
260 0.26
261 0.26
262 0.27
263 0.28
264 0.26
265 0.27
266 0.28
267 0.31
268 0.31
269 0.34
270 0.36
271 0.42
272 0.5
273 0.55
274 0.57
275 0.6
276 0.64
277 0.68
278 0.62
279 0.6
280 0.54
281 0.47
282 0.52
283 0.48
284 0.49
285 0.42
286 0.4
287 0.4
288 0.46
289 0.49
290 0.47
291 0.52
292 0.49