Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VCW4

Protein Details
Accession A0A1D2VCW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-235DDHHPSKKSKENNKKKPAKTSRNTNKINFHydrophilic
256-277NTTMNVKKKRFKQHQINDLPNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
212-226SKKSKENNKKKPAKT
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.833, cyto 5, cyto_mito 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027786  Nse4/EID  
IPR014854  Nse4_C  
IPR029225  Nse4_Nse3-bd  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF15412  Nse4-Nse3_bdg  
PF08743  Nse4_C  
Amino Acid Sequences MFAKNISAEGADGASDLTFAKIRQDSDSSNFSLTSSLSLEKDDLQELDLDDISSNDENYDSKKNLVKRYRLLNLDTKLHRKRVLGENGLKTVKRDYQLLRFLFHETKDSKILNNVVHAIDSEVLLNVTENAEISIKNLKVDHSNKIIDVNDFLINFKRKFSSLHPQSDISNEYSDFDNDFDDHDHDGSDSFYGVHQNSNNKKYISLDDHHPSKKSKENNKKKPAKTSRNTNKINFLRVGTASLFFSKKAPTIDFLNTTMNVKKKRFKQHQINDLPNGEKITADKLTLDDLKNTSDLKKDDTAKSVHLCYKVFQKYTKEHPNDKKINIFNFFINPKSFSKTVENMFYMSFLVKDNKIRINFNNDSGFPTVEEVVPLSKLDNQDSRYRSEKKLYENDQVNHIVFRLDYESWEKLIKIYNIQDSII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.07
5 0.08
6 0.09
7 0.15
8 0.18
9 0.2
10 0.24
11 0.28
12 0.31
13 0.35
14 0.4
15 0.35
16 0.33
17 0.32
18 0.27
19 0.24
20 0.2
21 0.17
22 0.15
23 0.15
24 0.14
25 0.16
26 0.17
27 0.18
28 0.19
29 0.19
30 0.17
31 0.15
32 0.16
33 0.15
34 0.16
35 0.14
36 0.12
37 0.1
38 0.1
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.14
46 0.21
47 0.19
48 0.23
49 0.29
50 0.35
51 0.45
52 0.53
53 0.57
54 0.58
55 0.65
56 0.69
57 0.68
58 0.66
59 0.64
60 0.6
61 0.6
62 0.59
63 0.6
64 0.59
65 0.6
66 0.59
67 0.53
68 0.55
69 0.57
70 0.6
71 0.59
72 0.61
73 0.59
74 0.61
75 0.62
76 0.55
77 0.47
78 0.42
79 0.38
80 0.32
81 0.33
82 0.32
83 0.38
84 0.46
85 0.46
86 0.42
87 0.39
88 0.41
89 0.39
90 0.35
91 0.33
92 0.26
93 0.28
94 0.31
95 0.3
96 0.26
97 0.28
98 0.32
99 0.26
100 0.27
101 0.26
102 0.21
103 0.21
104 0.2
105 0.16
106 0.12
107 0.11
108 0.09
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.13
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.23
127 0.26
128 0.3
129 0.29
130 0.3
131 0.29
132 0.32
133 0.31
134 0.23
135 0.22
136 0.19
137 0.15
138 0.14
139 0.15
140 0.17
141 0.21
142 0.2
143 0.21
144 0.2
145 0.19
146 0.22
147 0.27
148 0.33
149 0.37
150 0.43
151 0.44
152 0.44
153 0.44
154 0.43
155 0.39
156 0.3
157 0.23
158 0.16
159 0.15
160 0.14
161 0.14
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.07
180 0.08
181 0.1
182 0.12
183 0.2
184 0.26
185 0.29
186 0.32
187 0.3
188 0.3
189 0.3
190 0.32
191 0.29
192 0.26
193 0.27
194 0.29
195 0.35
196 0.36
197 0.36
198 0.33
199 0.32
200 0.36
201 0.4
202 0.46
203 0.51
204 0.61
205 0.7
206 0.79
207 0.85
208 0.83
209 0.85
210 0.85
211 0.85
212 0.8
213 0.81
214 0.8
215 0.81
216 0.82
217 0.73
218 0.72
219 0.64
220 0.6
221 0.5
222 0.41
223 0.33
224 0.27
225 0.27
226 0.18
227 0.16
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.11
232 0.12
233 0.11
234 0.13
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.18
239 0.21
240 0.21
241 0.22
242 0.22
243 0.2
244 0.21
245 0.22
246 0.24
247 0.28
248 0.3
249 0.36
250 0.42
251 0.53
252 0.61
253 0.69
254 0.74
255 0.77
256 0.84
257 0.85
258 0.82
259 0.76
260 0.68
261 0.58
262 0.48
263 0.4
264 0.29
265 0.2
266 0.15
267 0.15
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.14
273 0.18
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.18
278 0.19
279 0.2
280 0.18
281 0.19
282 0.2
283 0.21
284 0.27
285 0.31
286 0.32
287 0.35
288 0.35
289 0.34
290 0.36
291 0.36
292 0.35
293 0.33
294 0.31
295 0.29
296 0.36
297 0.38
298 0.38
299 0.39
300 0.41
301 0.44
302 0.53
303 0.62
304 0.6
305 0.63
306 0.7
307 0.76
308 0.77
309 0.74
310 0.73
311 0.68
312 0.67
313 0.61
314 0.53
315 0.44
316 0.43
317 0.41
318 0.35
319 0.31
320 0.29
321 0.27
322 0.31
323 0.3
324 0.28
325 0.33
326 0.35
327 0.37
328 0.39
329 0.38
330 0.33
331 0.33
332 0.29
333 0.23
334 0.18
335 0.15
336 0.12
337 0.15
338 0.17
339 0.22
340 0.26
341 0.33
342 0.36
343 0.4
344 0.42
345 0.48
346 0.48
347 0.48
348 0.48
349 0.42
350 0.42
351 0.39
352 0.35
353 0.26
354 0.25
355 0.21
356 0.16
357 0.15
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.13
364 0.15
365 0.2
366 0.25
367 0.27
368 0.35
369 0.37
370 0.41
371 0.46
372 0.5
373 0.5
374 0.54
375 0.56
376 0.57
377 0.65
378 0.66
379 0.68
380 0.7
381 0.67
382 0.64
383 0.62
384 0.54
385 0.45
386 0.38
387 0.29
388 0.2
389 0.21
390 0.19
391 0.15
392 0.17
393 0.22
394 0.24
395 0.25
396 0.27
397 0.25
398 0.23
399 0.29
400 0.29
401 0.31
402 0.35
403 0.4