Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VDE5

Protein Details
Accession A0A1D2VDE5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSSNKRKPTDKSKTRKKYKFASSSIDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-17RKPTDKSKTRKK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 9.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MSSNKRKPTDKSKTRKKYKFASSSIDPGTIGCYATCQRNKEPVCRKELLDLFAEKFLQFYPATDDSSLIISPSPTAESLSIEDSIKNELKLLNPPKNTNHNSTTATSVSNSNSNLNPNPNPNPISTINLECDCLNFFKFKKPIIPTEFIEKICNELFQNNDFKKTKYTFKLIPMDYSCSASLPEIKKLISIALDPVFNSSSSLSPISYNYTIQFEKRNFNLFSRDDLTNLINDHISTSSSLNHNFVWKNYDKTIIVSAFKNNFGLAVVNNYSKLSKFNLQQIFLKSQSKET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.93
3 0.91
4 0.89
5 0.89
6 0.88
7 0.83
8 0.8
9 0.74
10 0.72
11 0.66
12 0.56
13 0.45
14 0.35
15 0.32
16 0.24
17 0.19
18 0.11
19 0.13
20 0.14
21 0.24
22 0.29
23 0.31
24 0.35
25 0.45
26 0.49
27 0.56
28 0.64
29 0.62
30 0.64
31 0.62
32 0.59
33 0.58
34 0.58
35 0.5
36 0.43
37 0.39
38 0.33
39 0.32
40 0.31
41 0.22
42 0.19
43 0.16
44 0.16
45 0.13
46 0.12
47 0.17
48 0.18
49 0.2
50 0.19
51 0.2
52 0.17
53 0.19
54 0.18
55 0.11
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.13
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.16
72 0.16
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.15
77 0.23
78 0.31
79 0.33
80 0.35
81 0.39
82 0.44
83 0.52
84 0.54
85 0.51
86 0.47
87 0.43
88 0.44
89 0.41
90 0.39
91 0.3
92 0.27
93 0.22
94 0.2
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.16
100 0.19
101 0.2
102 0.22
103 0.23
104 0.25
105 0.27
106 0.29
107 0.29
108 0.26
109 0.29
110 0.26
111 0.28
112 0.25
113 0.22
114 0.21
115 0.2
116 0.2
117 0.15
118 0.14
119 0.12
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.17
125 0.2
126 0.2
127 0.26
128 0.28
129 0.35
130 0.38
131 0.41
132 0.35
133 0.39
134 0.41
135 0.35
136 0.33
137 0.26
138 0.23
139 0.19
140 0.19
141 0.13
142 0.11
143 0.12
144 0.14
145 0.22
146 0.19
147 0.26
148 0.26
149 0.27
150 0.31
151 0.33
152 0.38
153 0.34
154 0.39
155 0.36
156 0.42
157 0.5
158 0.44
159 0.46
160 0.4
161 0.4
162 0.36
163 0.34
164 0.26
165 0.19
166 0.19
167 0.14
168 0.19
169 0.16
170 0.18
171 0.17
172 0.17
173 0.17
174 0.17
175 0.17
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.12
186 0.1
187 0.09
188 0.11
189 0.12
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.19
198 0.19
199 0.2
200 0.27
201 0.25
202 0.29
203 0.31
204 0.36
205 0.34
206 0.36
207 0.41
208 0.35
209 0.38
210 0.36
211 0.34
212 0.28
213 0.28
214 0.27
215 0.21
216 0.21
217 0.17
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.11
225 0.13
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.19
230 0.24
231 0.24
232 0.25
233 0.29
234 0.29
235 0.32
236 0.32
237 0.36
238 0.31
239 0.32
240 0.36
241 0.33
242 0.32
243 0.29
244 0.34
245 0.32
246 0.33
247 0.31
248 0.25
249 0.21
250 0.19
251 0.19
252 0.13
253 0.15
254 0.17
255 0.17
256 0.19
257 0.19
258 0.2
259 0.19
260 0.21
261 0.21
262 0.25
263 0.29
264 0.37
265 0.43
266 0.46
267 0.51
268 0.54
269 0.55
270 0.52
271 0.54