Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VRC0

Protein Details
Accession A0A1D2VRC0    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-185SITPSFKKKTPNNPRTPSKPSPHydrophilic
307-329KQLAAIRKRKLQKKRFGSDFREAHydrophilic
367-388YRNSQRSSKPLAPTKKRRYSDDHydrophilic
473-498EEELREKLREKKRIQAKKAKLQNIKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-98KAARRSEREKEESVRKKSTASLSAKKASTK
171-197KKTPNNPRTPSKPSPPANAAQPLKKKP
312-321IRKRKLQKKR
477-498REKLREKKRIQAKKAKLQNIKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MNFGTLLSQVKNNGKVSSSSSSSSSALKSNAAKNLPSFTQVNNQSASKSNYDSRLSYSTNIDPSVARLKAARRSEREKEESVRKKSTASLSAKKASTKNSSRKPATSNANTSSNKIYKSTSFGRTKTSANDFKDQPLRPAVVRKKIKFSDLMKTAEKIDASKLSITPSFKKKTPNNPRTPSKPSPPANAAQPLKKKPITLSPKARSPIPTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSRLPNNAKSKSLPPPSSNDRHSNNRNHSHNNNMNNRSVHPAKKPNEPIPFTGPSKEVQKQLAAIRKRKLQKKRFGSDFREANEEDDDFIVSDSEDVGGDYGGAPVKRKHSSGLSGSSAYRNSQRSSKPLAPTKKRRYSDDDRYSSRPSRGNSRHRDYDDYDDYDDDDGFVENDDPGYDRDEIWNIFHGHKPRNQYYDFDDDLSDMEATGNDVFAEEAYSSKQAREEELREKLREKKRIQAKKAKLQNIKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.39
4 0.39
5 0.36
6 0.31
7 0.31
8 0.32
9 0.32
10 0.32
11 0.28
12 0.26
13 0.24
14 0.27
15 0.31
16 0.33
17 0.39
18 0.39
19 0.4
20 0.38
21 0.41
22 0.37
23 0.36
24 0.32
25 0.27
26 0.34
27 0.37
28 0.38
29 0.36
30 0.36
31 0.34
32 0.37
33 0.39
34 0.33
35 0.33
36 0.34
37 0.37
38 0.4
39 0.39
40 0.39
41 0.4
42 0.39
43 0.37
44 0.37
45 0.35
46 0.34
47 0.33
48 0.29
49 0.24
50 0.26
51 0.31
52 0.26
53 0.22
54 0.23
55 0.28
56 0.36
57 0.45
58 0.5
59 0.49
60 0.58
61 0.66
62 0.72
63 0.72
64 0.69
65 0.68
66 0.7
67 0.72
68 0.72
69 0.69
70 0.61
71 0.56
72 0.56
73 0.55
74 0.54
75 0.52
76 0.53
77 0.53
78 0.59
79 0.59
80 0.58
81 0.55
82 0.53
83 0.54
84 0.56
85 0.6
86 0.63
87 0.71
88 0.7
89 0.71
90 0.69
91 0.68
92 0.67
93 0.65
94 0.62
95 0.56
96 0.6
97 0.56
98 0.54
99 0.54
100 0.48
101 0.41
102 0.37
103 0.35
104 0.27
105 0.33
106 0.37
107 0.38
108 0.41
109 0.41
110 0.46
111 0.46
112 0.46
113 0.46
114 0.48
115 0.47
116 0.44
117 0.5
118 0.45
119 0.49
120 0.55
121 0.49
122 0.44
123 0.4
124 0.37
125 0.33
126 0.41
127 0.42
128 0.44
129 0.53
130 0.52
131 0.58
132 0.58
133 0.59
134 0.57
135 0.53
136 0.53
137 0.49
138 0.51
139 0.43
140 0.42
141 0.4
142 0.34
143 0.31
144 0.22
145 0.2
146 0.17
147 0.17
148 0.18
149 0.16
150 0.17
151 0.2
152 0.22
153 0.26
154 0.31
155 0.34
156 0.36
157 0.45
158 0.5
159 0.58
160 0.67
161 0.71
162 0.74
163 0.78
164 0.82
165 0.81
166 0.82
167 0.77
168 0.73
169 0.72
170 0.65
171 0.63
172 0.59
173 0.54
174 0.49
175 0.5
176 0.45
177 0.42
178 0.46
179 0.44
180 0.47
181 0.46
182 0.43
183 0.37
184 0.44
185 0.46
186 0.48
187 0.54
188 0.52
189 0.57
190 0.57
191 0.57
192 0.51
193 0.48
194 0.49
195 0.45
196 0.5
197 0.52
198 0.6
199 0.66
200 0.68
201 0.66
202 0.62
203 0.6
204 0.55
205 0.51
206 0.47
207 0.42
208 0.41
209 0.41
210 0.4
211 0.4
212 0.4
213 0.4
214 0.4
215 0.4
216 0.4
217 0.4
218 0.4
219 0.4
220 0.4
221 0.4
222 0.4
223 0.4
224 0.4
225 0.4
226 0.4
227 0.4
228 0.4
229 0.4
230 0.38
231 0.38
232 0.35
233 0.35
234 0.33
235 0.3
236 0.26
237 0.27
238 0.3
239 0.33
240 0.39
241 0.38
242 0.37
243 0.38
244 0.42
245 0.45
246 0.46
247 0.42
248 0.36
249 0.4
250 0.44
251 0.48
252 0.47
253 0.45
254 0.43
255 0.48
256 0.53
257 0.56
258 0.58
259 0.6
260 0.61
261 0.6
262 0.58
263 0.59
264 0.58
265 0.58
266 0.59
267 0.53
268 0.53
269 0.48
270 0.47
271 0.43
272 0.41
273 0.37
274 0.35
275 0.41
276 0.41
277 0.48
278 0.53
279 0.55
280 0.58
281 0.57
282 0.53
283 0.5
284 0.51
285 0.43
286 0.39
287 0.33
288 0.27
289 0.3
290 0.3
291 0.27
292 0.24
293 0.24
294 0.26
295 0.3
296 0.36
297 0.37
298 0.4
299 0.41
300 0.48
301 0.55
302 0.61
303 0.66
304 0.69
305 0.72
306 0.76
307 0.8
308 0.82
309 0.82
310 0.8
311 0.78
312 0.73
313 0.64
314 0.58
315 0.5
316 0.42
317 0.35
318 0.28
319 0.2
320 0.15
321 0.14
322 0.09
323 0.09
324 0.07
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.07
337 0.07
338 0.09
339 0.12
340 0.18
341 0.21
342 0.22
343 0.24
344 0.27
345 0.32
346 0.35
347 0.38
348 0.34
349 0.34
350 0.34
351 0.33
352 0.3
353 0.26
354 0.27
355 0.25
356 0.25
357 0.3
358 0.33
359 0.36
360 0.43
361 0.48
362 0.51
363 0.57
364 0.65
365 0.68
366 0.76
367 0.81
368 0.83
369 0.8
370 0.78
371 0.78
372 0.77
373 0.78
374 0.77
375 0.74
376 0.69
377 0.7
378 0.71
379 0.67
380 0.62
381 0.57
382 0.49
383 0.53
384 0.57
385 0.63
386 0.66
387 0.69
388 0.73
389 0.71
390 0.74
391 0.67
392 0.66
393 0.61
394 0.55
395 0.48
396 0.39
397 0.36
398 0.31
399 0.26
400 0.18
401 0.12
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.14
415 0.18
416 0.18
417 0.19
418 0.23
419 0.23
420 0.24
421 0.29
422 0.33
423 0.36
424 0.4
425 0.48
426 0.49
427 0.54
428 0.54
429 0.52
430 0.52
431 0.53
432 0.5
433 0.43
434 0.36
435 0.29
436 0.27
437 0.25
438 0.19
439 0.11
440 0.09
441 0.08
442 0.09
443 0.09
444 0.08
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.06
451 0.07
452 0.09
453 0.13
454 0.14
455 0.15
456 0.19
457 0.19
458 0.25
459 0.32
460 0.36
461 0.41
462 0.5
463 0.55
464 0.55
465 0.6
466 0.64
467 0.66
468 0.69
469 0.65
470 0.65
471 0.7
472 0.77
473 0.82
474 0.83
475 0.84
476 0.84
477 0.9
478 0.9