FuNGI

A0A1D2VK56

Protein Details

Accession

A0A1D2VK56

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-54	KINLDKKIYKKQILYNKKNSNLSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 10, mito 1, pero 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039766 Vps53 IPR038260 Vps53_C_sf IPR007234 Vps53_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0010008 C:endosome membrane GO:0000938 C:GARP complex GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF04100 Vps53_N

Amino Acid Sequences

YDPMVHLNQLFDSPESLGELNQLLDYSNNYKINLDKKIYKKQILYNKKNSNLSSKINYDDDISNLISEINETRSLAEKTQQTISNMTFNIQNLDQGKKNLVLSMTVLKRLQMLLTAYDQLNNMLSSDAKDPNSSSNDYNEMLNLISVVIQLNLHFQNYKNISEINLLSKDISKLKINLTDQIFSDFESLLGGKKKNPHSQSNASQLIKACEILDIIGQSYHDKLLNLFITLQFKEFKSIFNISDEAGSLENLSRRYIYFKKIFRNFNDYYYKFFSKSYGLKFEICKRFCEFTKDDLKLLLNNIKQDNLNNKNNNNNNSINNSGDDNDSSSNSIVNILLKTLSETLEFEDYLNKSNNNSTFFTKKISIAFEPYLSIWLDQQSSIISKNFLKYMAAPKLSPAQKDINDNSSIKQEDIITDVIPSSAELFRTYRQILNHAIKLSNGLFLLNLTDLYVKHLNDYNEKILKPLFPKNDRDLIVSEGVDYLILIFNTSDYINITIDQLVEKLKSLITPELSPKVEAKFENSKEIYVSLITDSMNKLLTKIDLDCELSWKEMTNNNWKLIRDVSDQSRYIIDLKEIILKNLRKFLFKFNRDVYVKNFMDKLVEFIIKKFLSKFISLKPISIITAEQILLDLSTLKDFFKNLPKTLAMTDSEIENELKNQAQSNRLKSFESSENKLAIKLSKSYFKTIDLQYNKFEKILKMIMIDNKDKDNLISNYFLIVGDKNFNNFLKILTLKGIVYSP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.15
4	0.13
5	0.14
6	0.14
7	0.12
8	0.12
9	0.12
10	0.09
11	0.1
12	0.14
13	0.16
14	0.22
15	0.24
16	0.24
17	0.26
18	0.31
19	0.38
20	0.42
21	0.45
22	0.47
23	0.53
24	0.63
25	0.7
26	0.72
27	0.72
28	0.73
29	0.77
30	0.79
31	0.81
32	0.81
33	0.82
34	0.82
35	0.83
36	0.77
37	0.75
38	0.7
39	0.67
40	0.63
41	0.56
42	0.53
43	0.48
44	0.45
45	0.4
46	0.35
47	0.3
48	0.26
49	0.23
50	0.18
51	0.16
52	0.15
53	0.11
54	0.12
55	0.12
56	0.12
57	0.13
58	0.13
59	0.14
60	0.19
61	0.22
62	0.22
63	0.26
64	0.28
65	0.3
66	0.36
67	0.38
68	0.35
69	0.37
70	0.38
71	0.37
72	0.33
73	0.31
74	0.28
75	0.24
76	0.26
77	0.21
78	0.24
79	0.21
80	0.26
81	0.28
82	0.27
83	0.29
84	0.29
85	0.29
86	0.27
87	0.24
88	0.21
89	0.2
90	0.27
91	0.26
92	0.27
93	0.27
94	0.24
95	0.25
96	0.25
97	0.22
98	0.17
99	0.17
100	0.15
101	0.17
102	0.2
103	0.19
104	0.2
105	0.2
106	0.17
107	0.17
108	0.14
109	0.12
110	0.1
111	0.1
112	0.1
113	0.14
114	0.18
115	0.18
116	0.19
117	0.2
118	0.25
119	0.29
120	0.29
121	0.27
122	0.26
123	0.28
124	0.28
125	0.27
126	0.22
127	0.18
128	0.15
129	0.13
130	0.1
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.05
136	0.05
137	0.06
138	0.1
139	0.11
140	0.12
141	0.13
142	0.13
143	0.22
144	0.25
145	0.26
146	0.23
147	0.23
148	0.24
149	0.26
150	0.27
151	0.23
152	0.21
153	0.2
154	0.19
155	0.21
156	0.22
157	0.21
158	0.23
159	0.21
160	0.22
161	0.26
162	0.32
163	0.32
164	0.36
165	0.35
166	0.34
167	0.32
168	0.33
169	0.29
170	0.22
171	0.22
172	0.15
173	0.12
174	0.11
175	0.11
176	0.11
177	0.15
178	0.16
179	0.17
180	0.25
181	0.34
182	0.42
183	0.47
184	0.52
185	0.56
186	0.63
187	0.67
188	0.68
189	0.67
190	0.59
191	0.56
192	0.49
193	0.44
194	0.36
195	0.29
196	0.21
197	0.13
198	0.13
199	0.1
200	0.09
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.14
212	0.14
213	0.14
214	0.14
215	0.15
216	0.18
217	0.18
218	0.19
219	0.16
220	0.16
221	0.2
222	0.19
223	0.18
224	0.2
225	0.22
226	0.22
227	0.22
228	0.22
229	0.18
230	0.18
231	0.17
232	0.13
233	0.1
234	0.09
235	0.07
236	0.08
237	0.1
238	0.1
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.17
243	0.2
244	0.26
245	0.31
246	0.36
247	0.45
248	0.52
249	0.59
250	0.57
251	0.62
252	0.56
253	0.55
254	0.59
255	0.5
256	0.47
257	0.47
258	0.45
259	0.37
260	0.36
261	0.31
262	0.27
263	0.32
264	0.31
265	0.31
266	0.31
267	0.33
268	0.36
269	0.44
270	0.47
271	0.43
272	0.42
273	0.39
274	0.41
275	0.4
276	0.44
277	0.37
278	0.35
279	0.43
280	0.41
281	0.38
282	0.35
283	0.35
284	0.28
285	0.28
286	0.27
287	0.19
288	0.22
289	0.22
290	0.22
291	0.22
292	0.23
293	0.3
294	0.32
295	0.38
296	0.39
297	0.41
298	0.48
299	0.53
300	0.53
301	0.49
302	0.44
303	0.38
304	0.37
305	0.37
306	0.29
307	0.25
308	0.22
309	0.18
310	0.16
311	0.14
312	0.11
313	0.1
314	0.1
315	0.1
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.07
331	0.08
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.11
336	0.11
337	0.13
338	0.14
339	0.13
340	0.13
341	0.16
342	0.19
343	0.19
344	0.21
345	0.21
346	0.23
347	0.23
348	0.25
349	0.23
350	0.22
351	0.2
352	0.21
353	0.19
354	0.2
355	0.2
356	0.17
357	0.16
358	0.15
359	0.14
360	0.11
361	0.11
362	0.07
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.07
367	0.06
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.09
372	0.1
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.11
377	0.12
378	0.19
379	0.22
380	0.22
381	0.21
382	0.21
383	0.29
384	0.31
385	0.29
386	0.25
387	0.24
388	0.25
389	0.31
390	0.32
391	0.27
392	0.28
393	0.29
394	0.26
395	0.25
396	0.23
397	0.18
398	0.17
399	0.14
400	0.11
401	0.13
402	0.12
403	0.09
404	0.08
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.07
412	0.08
413	0.09
414	0.1
415	0.14
416	0.16
417	0.16
418	0.16
419	0.19
420	0.25
421	0.28
422	0.3
423	0.28
424	0.27
425	0.24
426	0.26
427	0.23
428	0.17
429	0.13
430	0.1
431	0.08
432	0.08
433	0.09
434	0.06
435	0.06
436	0.05
437	0.06
438	0.06
439	0.1
440	0.13
441	0.12
442	0.14
443	0.18
444	0.19
445	0.22
446	0.26
447	0.27
448	0.28
449	0.28
450	0.28
451	0.25
452	0.27
453	0.27
454	0.31
455	0.34
456	0.35
457	0.41
458	0.44
459	0.5
460	0.47
461	0.45
462	0.39
463	0.34
464	0.3
465	0.25
466	0.2
467	0.14
468	0.12
469	0.1
470	0.08
471	0.06
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.04
476	0.04
477	0.06
478	0.06
479	0.05
480	0.05
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.1
496	0.13
497	0.13
498	0.15
499	0.19
500	0.23
501	0.24
502	0.24
503	0.24
504	0.23
505	0.25
506	0.23
507	0.25
508	0.29
509	0.3
510	0.37
511	0.35
512	0.34
513	0.31
514	0.31
515	0.26
516	0.17
517	0.16
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.12
525	0.11
526	0.11
527	0.11
528	0.12
529	0.12
530	0.13
531	0.13
532	0.13
533	0.16
534	0.16
535	0.18
536	0.18
537	0.17
538	0.16
539	0.15
540	0.16
541	0.19
542	0.23
543	0.31
544	0.34
545	0.38
546	0.41
547	0.41
548	0.4
549	0.38
550	0.38
551	0.32
552	0.33
553	0.35
554	0.37
555	0.37
556	0.36
557	0.34
558	0.3
559	0.28
560	0.23
561	0.18
562	0.13
563	0.14
564	0.21
565	0.21
566	0.22
567	0.27
568	0.31
569	0.33
570	0.39
571	0.39
572	0.36
573	0.38
574	0.47
575	0.5
576	0.5
577	0.55
578	0.5
579	0.58
580	0.56
581	0.56
582	0.5
583	0.5
584	0.46
585	0.41
586	0.38
587	0.29
588	0.3
589	0.27
590	0.26
591	0.19
592	0.23
593	0.21
594	0.21
595	0.29
596	0.25
597	0.27
598	0.25
599	0.26
600	0.26
601	0.3
602	0.33
603	0.31
604	0.41
605	0.4
606	0.39
607	0.36
608	0.34
609	0.31
610	0.28
611	0.22
612	0.13
613	0.15
614	0.14
615	0.12
616	0.1
617	0.1
618	0.08
619	0.08
620	0.08
621	0.06
622	0.07
623	0.08
624	0.09
625	0.1
626	0.12
627	0.16
628	0.26
629	0.31
630	0.32
631	0.36
632	0.36
633	0.38
634	0.39
635	0.38
636	0.29
637	0.26
638	0.25
639	0.21
640	0.21
641	0.2
642	0.19
643	0.15
644	0.15
645	0.14
646	0.15
647	0.16
648	0.2
649	0.22
650	0.3
651	0.37
652	0.44
653	0.47
654	0.47
655	0.48
656	0.44
657	0.47
658	0.47
659	0.47
660	0.45
661	0.43
662	0.46
663	0.44
664	0.43
665	0.4
666	0.35
667	0.32
668	0.32
669	0.32
670	0.37
671	0.4
672	0.45
673	0.44
674	0.43
675	0.47
676	0.46
677	0.52
678	0.5
679	0.5
680	0.51
681	0.54
682	0.52
683	0.46
684	0.45
685	0.36
686	0.35
687	0.36
688	0.31
689	0.28
690	0.32
691	0.37
692	0.4
693	0.44
694	0.4
695	0.39
696	0.39
697	0.37
698	0.33
699	0.35
700	0.32
701	0.3
702	0.3
703	0.27
704	0.26
705	0.26
706	0.25
707	0.18
708	0.17
709	0.15
710	0.19
711	0.2
712	0.22
713	0.26
714	0.26
715	0.27
716	0.26
717	0.24
718	0.25
719	0.25
720	0.24
721	0.23
722	0.24
723	0.22

A0A1D2VK56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer