Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D2VHG1

Protein Details
Accession A0A1D2VHG1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
120-165AEDINKTITKRPRGRPRGIKKKQNKVNKSGKKRGRPKKNLNLVVDSHydrophilic
252-279SNENTNKDSKKKKRGRPKKTKPGLLDNNHydrophilic
321-346LVPIVKRGKGRPKKQRDVTPNNLERRHydrophilic
376-400DEIKLVRPRGRPRKHFNGSNKDTLKBasic
415-437ISKEITGTRRRGRPRKILSNTILHydrophilic
440-465VDVSRIPTKRGRGRPRKLVGQEKITFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-157KRPRGRPRGIKKKQNKVNKSGKKRGRPKK
260-273SKKKKRGRPKKTKP
326-335KRGKGRPKKQ
382-430RPRGRPRKHFNGSNKDTLKKPHKVNGKLGILKMISKEITGTRRRGRPRK
447-456TKRGRGRPRK
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MSQNDTVSKITNEDESDKNNSQENENKHNLNHSGSPKDSSDSSDSSNESFWILSSTDEDNENINNNINNNNENEEKNKGVNIEIKERTFAEIDKTANQNLSLIDNNSRTVSNEKFQVISAEDINKTITKRPRGRPRGIKKKQNKVNKSGKKRGRPKKNLNLVVDSEKNSNCIDENKVNSQTSEANKNFAGYDTTTMTEESIYISESNESSNSSFNSSDIELISAKKISPIVETVTEARGRPRKNIIFFYNDSNENTNKDSKKKKRGRPKKTKPGLLDNNDKSKNDIEDRDKFILELSLSDITPGDDDSSDNHKTKYFKDLLVPIVKRGKGRPKKQRDVTPNNLERRTRHIFADKTETIINGNVNSNGNVNDDYISDEIKLVRPRGRPRKHFNGSNKDTLKKPHKVNGKLGILKMISKEITGTRRRGRPRKILSNTILNSVDVSRIPTKRGRGRPRKLVGQEKITFTINPIGNGMYSKEEIINSLNKLDDHFASSRVRGIIKPSEYDSGSDSDFEEITFKTTKKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.37
4 0.38
5 0.38
6 0.4
7 0.38
8 0.4
9 0.44
10 0.47
11 0.48
12 0.52
13 0.52
14 0.48
15 0.53
16 0.5
17 0.47
18 0.47
19 0.44
20 0.45
21 0.44
22 0.47
23 0.41
24 0.41
25 0.37
26 0.35
27 0.34
28 0.3
29 0.31
30 0.31
31 0.31
32 0.29
33 0.29
34 0.24
35 0.2
36 0.17
37 0.13
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.12
42 0.14
43 0.15
44 0.16
45 0.17
46 0.16
47 0.17
48 0.19
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.18
53 0.21
54 0.22
55 0.22
56 0.22
57 0.26
58 0.26
59 0.27
60 0.28
61 0.29
62 0.29
63 0.28
64 0.28
65 0.24
66 0.25
67 0.29
68 0.3
69 0.35
70 0.37
71 0.36
72 0.37
73 0.36
74 0.35
75 0.3
76 0.27
77 0.23
78 0.23
79 0.24
80 0.27
81 0.29
82 0.28
83 0.28
84 0.27
85 0.23
86 0.19
87 0.2
88 0.17
89 0.17
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.21
94 0.21
95 0.2
96 0.22
97 0.24
98 0.23
99 0.26
100 0.26
101 0.25
102 0.25
103 0.26
104 0.22
105 0.21
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.24
114 0.3
115 0.36
116 0.45
117 0.55
118 0.65
119 0.72
120 0.81
121 0.84
122 0.88
123 0.89
124 0.9
125 0.9
126 0.89
127 0.91
128 0.9
129 0.9
130 0.86
131 0.85
132 0.86
133 0.86
134 0.86
135 0.86
136 0.86
137 0.86
138 0.88
139 0.89
140 0.89
141 0.9
142 0.9
143 0.91
144 0.92
145 0.9
146 0.83
147 0.77
148 0.69
149 0.63
150 0.55
151 0.46
152 0.39
153 0.31
154 0.29
155 0.24
156 0.21
157 0.17
158 0.17
159 0.2
160 0.21
161 0.25
162 0.28
163 0.32
164 0.31
165 0.3
166 0.3
167 0.3
168 0.28
169 0.34
170 0.29
171 0.27
172 0.27
173 0.27
174 0.25
175 0.21
176 0.2
177 0.11
178 0.13
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.14
224 0.18
225 0.22
226 0.23
227 0.25
228 0.33
229 0.36
230 0.39
231 0.44
232 0.41
233 0.41
234 0.41
235 0.42
236 0.37
237 0.33
238 0.3
239 0.27
240 0.25
241 0.21
242 0.21
243 0.23
244 0.22
245 0.28
246 0.37
247 0.44
248 0.55
249 0.63
250 0.69
251 0.75
252 0.83
253 0.88
254 0.89
255 0.91
256 0.92
257 0.91
258 0.89
259 0.82
260 0.82
261 0.79
262 0.74
263 0.72
264 0.64
265 0.64
266 0.58
267 0.53
268 0.45
269 0.37
270 0.34
271 0.28
272 0.3
273 0.28
274 0.31
275 0.36
276 0.36
277 0.34
278 0.31
279 0.28
280 0.24
281 0.18
282 0.12
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.07
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.08
295 0.13
296 0.17
297 0.17
298 0.18
299 0.21
300 0.23
301 0.24
302 0.3
303 0.28
304 0.26
305 0.29
306 0.32
307 0.34
308 0.4
309 0.39
310 0.34
311 0.37
312 0.38
313 0.35
314 0.38
315 0.44
316 0.46
317 0.56
318 0.63
319 0.67
320 0.76
321 0.82
322 0.86
323 0.85
324 0.85
325 0.84
326 0.84
327 0.81
328 0.77
329 0.74
330 0.67
331 0.58
332 0.56
333 0.53
334 0.45
335 0.41
336 0.42
337 0.39
338 0.4
339 0.48
340 0.4
341 0.35
342 0.34
343 0.3
344 0.23
345 0.22
346 0.2
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.14
355 0.12
356 0.12
357 0.1
358 0.1
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.14
366 0.18
367 0.2
368 0.25
369 0.32
370 0.43
371 0.53
372 0.62
373 0.67
374 0.72
375 0.8
376 0.82
377 0.84
378 0.84
379 0.84
380 0.8
381 0.8
382 0.76
383 0.68
384 0.63
385 0.63
386 0.62
387 0.59
388 0.59
389 0.57
390 0.62
391 0.65
392 0.7
393 0.7
394 0.69
395 0.65
396 0.6
397 0.57
398 0.48
399 0.43
400 0.36
401 0.3
402 0.21
403 0.17
404 0.19
405 0.19
406 0.27
407 0.31
408 0.38
409 0.43
410 0.51
411 0.61
412 0.69
413 0.73
414 0.76
415 0.8
416 0.83
417 0.83
418 0.84
419 0.78
420 0.79
421 0.7
422 0.65
423 0.56
424 0.44
425 0.38
426 0.29
427 0.26
428 0.16
429 0.2
430 0.21
431 0.22
432 0.26
433 0.3
434 0.39
435 0.47
436 0.58
437 0.64
438 0.69
439 0.77
440 0.83
441 0.86
442 0.87
443 0.86
444 0.86
445 0.82
446 0.8
447 0.75
448 0.69
449 0.64
450 0.55
451 0.46
452 0.38
453 0.4
454 0.31
455 0.27
456 0.24
457 0.21
458 0.2
459 0.21
460 0.2
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.16
465 0.16
466 0.17
467 0.19
468 0.22
469 0.2
470 0.22
471 0.22
472 0.2
473 0.22
474 0.24
475 0.22
476 0.22
477 0.22
478 0.24
479 0.26
480 0.27
481 0.29
482 0.28
483 0.29
484 0.25
485 0.31
486 0.36
487 0.36
488 0.38
489 0.38
490 0.4
491 0.39
492 0.39
493 0.35
494 0.29
495 0.26
496 0.23
497 0.2
498 0.17
499 0.16
500 0.15
501 0.14
502 0.12
503 0.15
504 0.18